Белок-переносчик фосфата, митохондриальный
| SLC25A3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Псевдонимы | SLC25A3 , PHC, PTP, OK/SW-кл.48, семейство растворенных носителей 25, член 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Внешние идентификаторы | Опустить : 600370 ; МГИ : 1353498 ; Гомологен : 37649 ; Генные карты : SLC25A3 ; OMA : SLC25A3 — ортологи | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Викиданные | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Белок-носитель фосфата, митохондриальный, представляет собой белок , который у человека кодируется SLC25A3 геном . [5] [6] Кодируемый белок представляет собой трансмембранный белок, во внутренней мембране митохондрий и катализирующий транспорт расположенный ионов фосфата через нее с целью окислительного фосфорилирования . [7] [8] две важные изоформы этого гена В клетках человека экспрессируются , которые незначительно отличаются по структуре и функциям. [9] Мутации в этом гене могут вызывать дефицит митохондриального фосфатного переносчика (MPCD), фатальное нарушение окислительного фосфорилирования, проявляющееся лактоацидозом , неонатальной гипотонией , гипертрофической кардиомиопатией и смертью в течение первого года жизни. [7] [8]
Структура
[ редактировать ]Ген SLC25A3 расположен на q-плече хромосомы 12 в положении 23.1 и охватывает 8376 пар оснований. [6] Ген имеет 9 экзонов и производит белок массой 40,1 кДа, состоящий из 362 аминокислот . [10] [11] [9] Кодируемый белок (PHC) представляет собой многопроходной трансмембранный белок, расположенный во внутренней мембране митохондрий; он содержит шесть трансмембранных сегментов, образующих большую экстрамембранозную петлю. [7] [8] [12] И N-концевая , и С-концевая области этого белка выступают в сторону цитозоля . PHC содержит три родственных сегмента, расположенных тандемно, которые родственны сегментам, обнаруженным у других охарактеризованных членов митохондриальных носителей семейства . [6] Существуют два варианта транскрипта этого белка: PHC-A и PHC-B, которые различаются 13 аминокислотами. [12] Изоформа A содержит 42 аминокислоты, а изоформа B — 41. In vitro изоформы различаются по сродству к субстрату и скорости транспорта. [13] [9]
Функция
[ редактировать ]Кодируемый белок (PHC) катализирует транспорт фосфата из цитозоля в митохондриальный матрикс либо путем котранспорта протонов , либо в обмен на гидроксильные ионы . [6] На заключительных этапах окислительного фосфорилирования этот белок катализирует поглощение иона фосфата протоном через внутреннюю мембрану митохондрий. [9] Доступность неорганического фосфата для окислительного фосфорилирования в основном зависит от активности PHC. [13] Чтобы существенно повлиять на окислительное фосфорилирование, истощение PHC должно быть серьезным и превышать 85%. [14] Этот белок может участвовать в регуляции переходной поры проницаемости митохондрий (mPTP). [7] [8]
Клиническое значение
[ редактировать ]Мутации в этом гене могут вызвать дефицит митохондриального фосфатного переносчика (MPCD), фатальное нарушение окислительного фосфорилирования. Симптомы включают лактоацидоз, гипертрофическую кардиомиопатию и неонатальную гипотонию; Заболевшие пациенты умирают в течение первого года жизни. [7] [8]
Изоформа А этого гена экспрессируется на высоких уровнях в клетках сердца , поджелудочной железы и скелетных мышц , тогда как изоформа B экспрессируется во всех тканях, хотя и слабо. [13] [9]
В единственном зарегистрированном случае мутации в этом гене гомозиготная мутация (c.215G>A) в альтернативно сплайсированном экзоне 3А этого гена вызвала замену аминокислоты (G72E) в изоформе А. Это приводит к АТФ-синтазы дефициту у мышечные клетки , которые экспрессируют изоформу А, но не фибробласты , которые экспрессируют изоформу B, вызывая MPCD и вышеупомянутые стандартные симптомы. [15] [9]
Взаимодействия
[ редактировать ]Кодируемый белок взаимодействует с PPIF ; это взаимодействие нарушается CsA . [7] [8]
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Перейти обратно: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000075415 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ Перейти обратно: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000061904 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Джабс Э.В., Томас П.Дж., Бернштейн М., Косс С., Феррейра Г.К., Педерсен П.Л. (май 1994 г.). «Хромосомная локализация генов, необходимых для конечных этапов окислительного метаболизма: альфа- и гамма-субъединицы АТФ-синтазы и фосфатный переносчик». Генетика человека . 93 (5): 600–2. дои : 10.1007/bf00202832 . ПМИД 8168843 . S2CID 39597611 .
- ^ Перейти обратно: а б с д «Ген Энтрез: семейство 25 растворенных носителей SLC25A3 (митохондриальный носитель; фосфатный носитель), член 3» .
В данную статью включен текст из этого источника, находящегося в свободном доступе . - ^ Перейти обратно: а б с д и ж «SLC25A3 - Белок-фосфат-носитель, митохондриальный предшественник - Homo sapiens (Человек) - Ген и белок SLC25A46» . www.uniprot.org . Проверено 20 августа 2018 г.
В эту статью включен текст, доступный по лицензии CC BY 4.0 . - ^ Перейти обратно: а б с д и ж «UniProt: универсальная база знаний о белках» . Исследования нуклеиновых кислот . 45 (Д1): Д158–Д169. Январь 2017 г. doi : 10.1093/nar/gkw1099 . ПМК 5210571 . ПМИД 27899622 .
- ^ Перейти обратно: а б с д и ж Онлайн-менделевское наследование у человека (OMIM): SLC25A3 - 600370
- ^ Зонг NC, Ли Х, Ли Х, Лам МП, Хименес Р.К., Ким С.С., Денг Н., Ким АК, Чой Дж.Х., Селайя И., Лием Д., Мейер Д., Одеберг Дж., Фанг С., Лу Х.Дж., Сюй Т., Вайс Дж. , Дуан Х., Улен М., Йейтс-младший, Апвейлер Р., Ге Дж., Хермякоб Х., Пинг П. (октябрь 2013 г.). «Интеграция биологии и медицины сердечного протеома с помощью специализированной базы знаний» . Исследование кровообращения . 113 (9): 1043–53. дои : 10.1161/CIRCRESAHA.113.301151 . ПМК 4076475 . ПМИД 23965338 .
- ^ «SLC25A3 — Белок-переносчик фосфата, митохондриальный» . База знаний Атласа органических белков сердца (COPaKB) .
- ^ Перейти обратно: а б Дольче В., Якобацци В., Палмьери Ф., Уокер Дж. Э. (апрель 1994 г.). «Последовательности человеческих и бычьих генов переносчика фосфата из митохондрий содержат доказательства альтернативно сплайсированных форм» . Журнал биологической химии . 269 (14): 10451–60. дои : 10.1016/S0021-9258(17)34081-4 . ПМИД 8144629 .
- ^ Перейти обратно: а б с Хейзинг М., Руитенбек В., ван ден Хеувел Л.П., Дольче В., Якобацци В., Смейтинк Дж.А., Палмиери Ф., Трийбельс Дж.М. (июнь 1998 г.). «Носители митохондриальных трансмембранных метаболитов человека: распределение в тканях и его влияние на митохондриальные нарушения». Журнал биоэнергетики и биомембран . 30 (3): 277–84. дои : 10.1023/A:1020501021222 . ПМИД 9733094 . S2CID 45811751 .
- ^ Зайферт Э.Л., Гал А., Акоба М.Г., Ли К., Андерсон-Пуллинджер Л., Голенар Т., Моффат С., Сондхаймер Н., Клейпул С.М., Хайночки Г. (декабрь 2016 г.). «Естественная и индуцированная потеря митохондриального фосфатного носителя: ДИФФЕРЕНЦИАЛЬНАЯ ЗАВИСИМОСТЬ МИТОХОНДРИАЛЬНОГО МЕТАБОЛИЗМА И ДИНАМИКИ И ВЫЖИВАНИЯ КЛЕТОК ОТ СТЕПЕНИ Истощения» . Журнал биологической химии . 291 (50): 26126–26137. дои : 10.1074/jbc.M116.744714 . ПМК 5207081 . ПМИД 27780865 .
- ^ Майр Дж.А., Меркель О., Кольвайн С.Д., Гебхардт Б.Р., Бёлеш Х., Фётшль У., Кох Дж., Якш М., Лохмюллер Х., Хорват Р., Фрейзингер П., Сперл В. (март 2007 г.). «Дефицит митохондриального фосфатного переносчика: новое нарушение окислительного фосфорилирования» . Американский журнал генетики человека . 80 (3): 478–84. дои : 10.1086/511788 . ПМК 1821108 . ПМИД 17273968 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Дольче В., Фьермонте Г., Мессина А., Палмьери Ф. (1992). «Нуклеотидная последовательность кДНК сердца человека, кодирующая митохондриальный фосфатный носитель». Последовательность ДНК . 2 (2): 133–5. дои : 10.3109/10425179109039683 . ПМИД 1777677 .
- Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД 8125298 .
- Дольче В., Якобацци В., Палмьери Ф., Уокер Дж. Э. (апрель 1994 г.). «Последовательности человеческих и бычьих генов переносчика фосфата из митохондрий содержат доказательства альтернативно сплайсированных форм» . Журнал биологической химии . 269 (14): 10451–60. дои : 10.1016/S0021-9258(17)34081-4 . ПМИД 8144629 .
- Марш С., Картер Н.П., Дольче В., Якобацци В., Палмьери Ф. (октябрь 1995 г.). «Хромосомная локализация митохондриального гена-переносчика фосфата PHC на 12q23». Геномика . 29 (3): 814–5. дои : 10.1006/geno.1995.9924 . ПМИД 8575787 .
- Сузуки Ю, Ёситомо-Накагава К, Маруяма К, Суяма А, Сугано С (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . ПМИД 9373149 .
- Хейзинг М., Руитенбек В., ван ден Хеувел Л.П., Дольче В., Якобацци В., Смейтинк Дж.А., Палмиери Ф., Трийбельс Дж.М. (июнь 1998 г.). «Носители митохондриальных трансмембранных метаболитов человека: распределение в тканях и его влияние на митохондриальные нарушения». Журнал биоэнергетики и биомембран . 30 (3): 277–84. дои : 10.1023/A:1020501021222 . ПМИД 9733094 . S2CID 45811751 .
- Баумистер Т , Баух А , Раффнер Х , Ангранд ПО , Бергамини Г , Кротон К , Круциат С , Эберхард Д , Гагнер Дж , Гиделли С , Хопф С , Хузе Б , Мангано Р , Мишон А.М. , Ширле М , Шлегль Дж , Шваб М , Стейн М.А., Бауэр А., Казари Г., Древес Г., Гэвин А.С., Джексон Д.Б., Джоберти Г., Нойбауэр Г., Рик Дж., Кастер Б., Суперти-Фурга Г. (февраль 2004 г.). «Физическая и функциональная карта пути передачи сигнала TNF-альфа / NF-каппа B человека». Природная клеточная биология . 6 (2): 97–105. дои : 10.1038/ncb1086 . ПМИД 14743216 . S2CID 11683986 .
- Джин Дж., Смит Ф.Д., Старк С., Уэллс К.Д., Фосетт Дж.П., Кулкарни С., Металников П., О'Доннелл П., Тейлор П., Тейлор Л., Зугман А., Вуджетт Дж.Р., Лангеберг Л.К., Скотт Дж.Д., Поусон Т. (август 2004 г.) . «Протеомный, функциональный и доменный анализ in vivo 14-3-3-связывающих белков, участвующих в регуляции цитоскелета и клеточной организации» . Современная биология . 14 (16): 1436–50. Бибкод : 2004CBio...14.1436J . дои : 10.1016/j.cub.2004.07.051 . ПМИД 15324660 .
- Якобацци В., Инфантино В., Костанцо П., Иззо П., Палмьери Ф. (ноябрь 2005 г.). «Функциональный анализ промотора гена митохондриального фосфатного переносчика человека: идентификация активаторных и репрессорных элементов и их факторов транскрипции» . Биохимический журнал . 391 (Часть 3): 613–21. дои : 10.1042/BJ20050776 . ПМК 1276962 . ПМИД 15984930 .
- Оцуки Т, Ота Т, Нисикава Т, Хаяси К, Судзуки Ю, Ямамото Дж, Вакамацу А, Кимура К, Сакамото К, Хатано Н, Кавай Ю, Исии С, Сайто К, Кодзима С, Сугияма Т, Оно Т, Окано К , Ёсикава Ю, Аоцука С, Сасаки Н, Хаттори А, Окумура К, Нагаи К, Сугано С, Исогай Т (2007). «Сигнальная последовательность и ловушка ключевых слов in silico для отбора полноразмерных кДНК человека, кодирующих секреторные или мембранные белки из библиотек кДНК с олигокепками» . Исследование ДНК . 12 (2): 117–26. дои : 10.1093/dnares/12.2.117 . ПМИД 16303743 .
- Майр Дж.А., Меркель О., Кольвайн С.Д., Гебхардт Б.Р., Бёлеш Х., Фётшль У., Кох Дж., Якш М., Лохмюллер Х., Хорват Р., Фрейзингер П., Сперл В. (март 2007 г.). «Дефицит митохондриального фосфатного переносчика: новое нарушение окислительного фосфорилирования» . Американский журнал генетики человека . 80 (3): 478–84. дои : 10.1086/511788 . ПМК 1821108 . ПМИД 17273968 .
Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .