ABCC11
ABCC11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Псевдонимы | ABCC11 , АТФ-связывающая кассета, подсемейство C (CFTR/MRP), член 11, EWWD, MRP8, WW, член 11 подсемейства C АТФ-связывающей кассеты, член 1 подсемейства C транспортера АТФ-связывающей кассеты | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Внешние идентификаторы | Опустить : 607040 ; Гомологен : 69511 ; Генные карты : ABCC11 ; ОМА : ABCC11 — ортологи | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Викиданные | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Вы можете помочь дополнить эту статью текстом, переведенным из соответствующей статьи на немецком языке . (Октябрь 2018 г.) Нажмите [показать], чтобы просмотреть важные инструкции по переводу. |
Член подсемейства C 11 АТФ-связывающего кассетного транспортера , также MRP8 ( белок 8, связанный с множественной лекарственной устойчивостью ), представляет собой мембранный транспортер , который экспортирует определенные молекулы изнутри клетки. Это белок , который у человека кодируется геном ABCC11 . [ 3 ] [ 4 ] [ 5 ]
Этот ген отвечает за определение типа серы человека (влажная или сухая ушная сера) и наличие осмидроза подмышек (запах, связанный с потом, вызванный секрецией апокрина ), а также связан с секрецией молозива . [ 6 ]
Функция
[ редактировать ]Белок, кодируемый этим геном, является членом суперсемейства транспортеров АТФ-связывающей кассеты (ABC). Белки ABC транспортируют различные молекулы через вне- и внутриклеточные мембраны. Гены ABC разделены на семь отдельных подсемейств (ABC1, MDR/TAP, MRP, ALD, OABP, GCN20, White). Транспортер ABCC11 является членом подсемейства MRP, которое участвует в множественной лекарственной устойчивости. Продукт этого гена участвует в физиологических процессах с участием желчных кислот, конъюгированных стероидов и циклических нуклеотидов. Кроме того, однонуклеотидный полиморфизм (SNP) в этом гене отвечает за определение типа ушной серы человека и наличие запаха из подмышек. Установлено, что этот ген и член семейства ABCC12 произошли путем дупликации и оба локализованы на хромосоме 16q12.1. Для этого гена описано множество вариантов альтернативно сплайсированных транскриптов. [ 5 ]
Молекулярная генетика
[ редактировать ]Ген ABCC11 также присутствует в геноме человека в виде двух аллелей , отличающихся одним нуклеотидом, известным как однонуклеотидный полиморфизм (SNP) . [ 7 ] SNP в гене ABCC11 на хромосоме 16 в положении основания 538 гуанина или аденина определяет две отдельные группы фенотипов . [ 7 ] [ 8 ] Они соответственно кодируют глицин и аргинин продукте гена в белковом . доминантное наследование GG или GA, генотипа Наблюдается тогда как генотип АА является рецессивным. Фенотипы, выраженные генотипами, включают серы тип (влажная или сухая ушная сера), осмидроз (запах, связанный с потом, вызванный чрезмерной апокринной секрецией) и, возможно, риск рака молочной железы , хотя продолжаются споры о том, существует ли реальная корреляция между фенотип влажной ушной серы на восприимчивость к раку молочной железы. [ 9 ] [ 10 ] Генотип GG или GA вызывает фенотип влажной ушной серы (липкой и коричневого цвета) и едкий запах пота и является доминантным аллелем. [ 9 ] Обратите внимание, что этот фенотип требует присутствия только одного гуанина. Гомозиготный . рецессивный генотип АА вызывает фенотип сухой ушной серы (сухой и шелушащийся) и пот со слабым запахом [ 9 ]
белок Аллели, содержащие гуанин, производят гликозилированный , но аллели, содержащие аденин, не гликозилируются. Полученный белок лишь частично расщепляется протеасомами . [ 7 ] Этот эффект локализуется на мембранах церуминозных желез . [ 7 ] Поскольку аденин-содержащий аллельный белковый продукт разлагается лишь частично, оставшийся функциональный белок располагается на клеточной поверхности мембраны, роль гена ABCC11 в запахе пота, вероятно, частично обусловлена количественной дозировкой белка ABCC11. [ 7 ]
С эволюционной точки зрения влияние типа серной серы на приспособленность неизвестно. , что пот без запаха у древних популяций Северной Евразии Однако предполагается имеет адаптивное преимущество в холодную погоду. [ 8 ] У некоторых млекопитающих , кроме человека , сигналы спаривания посредством выделения запаха, усиленного повышенной секрецией апокрина, могут быть фактором полового отбора . [ 8 ]
Физические человеческие черты, которые контролируются одним геном, встречаются редко . Большинство характеристик человека контролируются множеством генов ( полигенов ); ABCC11 представляет собой своеобразный пример гена с однозначным фенотипом, контролируемого SNP. Кроме того, он считается плейотропным геном.
Демография
[ редактировать ]Историю миграции человека можно проследить по аллелям гена ABCC11 . Различия между ушной серой у разных этнических групп во всем мире обусловлены, в частности, аллелями гена ABCC11 . [ 8 ] Считается, что производный аллель возник у древнего населения Восточной Азии . [ 11 ] Ген мог распространиться в результате полезной адаптации или в результате эволюционно-нейтрального механизма мутации , который прошел через события генетического дрейфа , или в результате полового отбора. [ 12 ]
Анализ древней ДНК восточноевропейских охотников-собирателей , скандинавских охотников-собирателей , западных охотников-собирателей и ранних европейских фермеров . Исследование показало, что производный аллель ABCC11, связанный с сухой ушной серой и уменьшенным запахом тела, отсутствовал у всех европейских охотников-собирателей, за исключением западного охотника-собирателя из мезолитической Центральной Европы. Производный аллель отсутствовал у палеолитического охотника-собирателя Костенок 14 , глубоко родственного древним северным евразийцам . [ 13 ]
Частота аллелей сухой ушной серы наиболее сконцентрирована в Восточной Азии ; в первую очередь Китай , Япония , Корея и Монголия . Частота аллелей наиболее высока среди северных ханьских китайцев и корейцев ; за ними следуют монголы , южные ханьцы и ямато соответственно. Частота низкая у рюкюанцев и айнов . [ 8 ] Производный аллель не является редкостью в Южной Азии : 54% дравидов из Тамилнада являются носителями генотипа АА. [ 8 ] Нисходящий градиент фенотипов аллелей сухой ушной серы можно провести от северного Китая до южной Азии, а градиент с востока на запад также можно провести от восточной Сибири до Западной Европы. [ 8 ] Частоты аллелей внутри этнических групп продолжали сохраняться, поскольку ген ABCC11 наследуется как гаплотип — группа генов или аллелей, которые, как правило, наследуются как одна единица. [ 8 ] [ 14 ]
Было обнаружено, что количество летучих органических соединений (ЛОС) в ушной сере связано с вариациями генотипа ABCC11 , который, в свою очередь, зависит от этнического происхождения. В частности, генотип rs17822931, который особенно распространен среди жителей Восточной Азии, коррелирует с более низкими уровнями ЛОС. не было обнаружено существенных качественных или количественных различий уровней ЛОС для большинства органических соединений в зависимости от расовой группы Однако после поправок Бонферрони , что позволяет предположить, что это не приводит к этническим различиям. [ 15 ]
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]Цитаты
[ редактировать ]- ^ Перейти обратно: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000121270 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Таммур Дж., Прадес С., Арнульд И., Ржецкий А., Хатчинсон А., Адачи М. и др. (июль 2001 г.). «Два новых гена из суперсемейства человеческих АТФ-связывающих кассетных транспортеров, ABCC11 и ABCC12, тандемно дублируются на хромосоме 16q12». Джин . 273 (1): 89–96. дои : 10.1016/S0378-1119(01)00572-8 . ПМИД 11483364 .
- ^ Дин М., Ржецкий А., Алликметс Р. (июль 2001 г.). «Суперсемейство транспортеров АТФ-связывающей кассеты человека (ABC)» . Геномные исследования . 11 (7): 1156–66. дои : 10.1101/гр.184901 . ПМИД 11435397 . S2CID 9528197 .
- ^ Перейти обратно: а б «Ген Энтрез: АТФ-связывающая кассета ABCC11, подсемейство C (CFTR/MRP), член 11» .
- ^ Миура К., Ёсиура Ки, Миура С., Симада Т., Ямасаки К., Ёсида А. и др. (июнь 2007 г.). «Сильная связь между типом человеческой ушной серы и апокринной секрецией молозива из молочной железы» . Генетика человека . 121 (5): 631–633. дои : 10.1007/s00439-007-0356-9 . ISSN 0340-6717 . ПМИД 17394018 . S2CID 575882 .
- ^ Перейти обратно: а б с д и Тойода Ю., Сакураи А., Митани Ю., Накашима М., Ёсиура К., Накагава Х. и др. (июнь 2009 г.). «Ушная сера, осмидроз и рак молочной железы: почему один SNP (538G>A) в гене человеческого транспортера ABC ABCC11 определяет тип ушной серы?» . Журнал ФАСЭБ . 23 (6): 2001–13. дои : 10.1096/fj.09-129098 . ПМИД 19383836 . S2CID 26853548 .
- ^ Перейти обратно: а б с д и ж г час Ёсиура К., Киносита А., Исида Т., Ниноката А., Исикава Т., Канаме Т. и др. (март 2006 г.). «SNP в гене ABCC11 является определяющим фактором типа ушной серы человека» . Природная генетика . 38 (3): 324–30. дои : 10.1038/ng1733 . ПМИД 16444273 . S2CID 3201966 .
- ^ Перейти обратно: а б с Родригес С., Стир К.Д., Фэрроу А., Голдинг Дж., Day IN (июль 2013 г.). «Зависимость использования дезодоранта от генотипа ABCC11: возможности персонализированной генетики в личной гигиене» . Журнал исследовательской дерматологии . 133 (7): 1760–7. дои : 10.1038/jid.2012.480 . ПМЦ 3674910 . ПМИД 23325016 .
- ^ Пак Ю.Дж., Шин М.С. (сентябрь 2001 г.). «Какой метод лечения осмидроза лучше всего?». Анналы пластической хирургии . 47 (3): 303–9. дои : 10.1097/00000637-200109000-00014 . ПМИД 11562036 . S2CID 25590802 .
- ^ Хори Ю.С., Ямада А., Мацуда Н., Оно Ю., Старенки Д., Сосонкина Н. и др. (2017). «Новая ассоциация между делецией 27 п.н. и мутацией 538G>A в гене ABCC11» . Биология человека . 89 (4): 305–307. doi : 10.13110/humanbiology.89.4.04 . ISSN 1534-6617 . ПМИД 30047321 . S2CID 51721105 . «были самыми высокими в Восточной Азии, с уменьшением частоты в направлении Европы и Южной Азии, что позволяет предположить восточноазиатское происхождение».
- ^ Мартин А., Саатофф М., Кун Ф., Макс Х., Терстеген Л., Натч А. (февраль 2010 г.). «Функциональный аллель ABCC11 важен для биохимического формирования подмышечного запаха человека» . Журнал исследовательской дерматологии . 130 (2): 529–540. дои : 10.1038/jid.2009.254 . ПМИД 19710689 . S2CID 36754463 .
- ^ Гюнтер Т., Мальмстрем Х., Свенссон Э.М. (январь 2018 г.). «Популяционная геномика мезолитической Скандинавии: исследование маршрутов ранней послеледниковой миграции и адаптации к высоким широтам» . ПЛОС Биология . 16 (1): e2003703. дои : 10.1371/journal.pbio.2003703 . ПМК 5760011 . ПМИД 29315301 . Из файла вспомогательной информации S8 , стр. 17/28: «Кроме того, SF9, SBj, Hum2 и SF12, а также все другие протестированные HG (за исключением KO1), несли аллельные варианты гена ABCC1, связанные с влажной ушной серой, нормальным запахом тела. и нормальный молозиво [69].» См. также: Файл вспомогательной информации S1.
- ^ Прокоп-Пригге К.А., Мэнсфилд С.Дж., Паркер М.Р., Талер Э., Грайс Э.А., Высоцкий С.Дж. и др. (январь 2015 г.). «Этнические/расовые и генетические влияния на профили запахов церумы» . Журнал химической экологии . 41 (1): 67–74. Бибкод : 2015JCEco..41...67P . дои : 10.1007/s10886-014-0533-y . ПМЦ 4304888 . ПМИД 25501636 .
- ^ Прокоп-Пригге К.А., Грин К., Варалло Л., Высоцкий С.Дж., Прети Дж. (2016). «Влияние этнической принадлежности на производство подмышечных запахов человека» . Журнал химической экологии . 42 (1): 33–9. Бибкод : 2016JCEco..42...33P . дои : 10.1007/s10886-015-0657-8 . ПМЦ 4724538 . ПМИД 26634572 .
Источники
[ редактировать ]- Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Бера Т.К., Ли С., Сальваторе Дж., Ли Б., Пастан И. (август 2001 г.). «MRP8, новый член суперсемейства транспортеров ABC, идентифицированный с помощью программы анализа базы данных EST и прогнозирования генов, высоко экспрессируется при раке молочной железы» . Молекулярная медицина . 7 (8): 509–16. дои : 10.1007/BF03401856 . ПМК 1950066 . ПМИД 11591886 .
- Ябуучи Х., Симидзу Х., Такаянаги С., Исикава Т. (ноябрь 2001 г.). «Множественные варианты сплайсинга двух новых человеческих АТФ-связывающих кассетных переносчиков, ABCC11 и ABCC12». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 288 (4): 933–9. дои : 10.1006/bbrc.2001.5865 . ПМИД 11688999 .
- Лай Л., Тан ТМ (февраль 2002 г.). «Роль глутатиона в белке 4 множественной лекарственной устойчивости (MRP4/ABCC4), опосредованном оттоке цАМФ и устойчивости к аналогам пурина» . Биохимический журнал . 361 (Часть 3): 497–503. дои : 10.1042/0264-6021:3610497 . ПМЦ 1222332 . ПМИД 11802779 .
- Стриз И., Яресова М., Лаха Дж., Седлачек Дж., Витко С. (2002). «MRP 8/14 и уровни прокальцитонина в сыворотке крови при трансплантации органов». Анналы трансплантологии . 6 (2): 6–9. ПМИД 11803621 .
- Томита Х., Ямада К., Гадами М., Огура Т., Янаи Ю., Накатоми К. и др. (июнь 2002 г.). «Картирование локуса влажной/сухой ушной серы с прицентромерной областью хромосомы 16». Ланцет . 359 (9322): 2000–2. дои : 10.1016/S0140-6736(02)08835-9 . ПМИД 12076558 . S2CID 20226277 .
- Турризиани О., Шуец Дж.Д., Фошер Ф., Сканьолари С., Сампат Дж., Адачи М. и др. (ноябрь 2002 г.). «Нарушение накопления 2',3'-дидезокси-3'-тиацитидина в Т-лимфобластоидных клетках как механизм приобретенной устойчивости, независимый от белка 4 множественной лекарственной устойчивости с возможной ролью АТФ-связывающей кассеты C11» . Биохимический журнал . 368 (Часть 1): 325–32. дои : 10.1042/BJ20020494 . ПМЦ 1222956 . ПМИД 12133003 .
- Го Ю, Котова Е, Чен З.С., Ли К., Хоппер-Борге Э., Белинский М.Г. и др. (август 2003 г.). «MRP8, АТФ-связывающая кассета C11 (ABCC11), представляет собой насос оттока циклических нуклеотидов и фактор устойчивости к фторпиримидинам, 2',3'-дидезоксицитидину и 9'-(2'-фосфонилметоксиэтил)аденину» . Журнал биологической химии . 278 (32): 29509–14. дои : 10.1074/jbc.M304059200 . ПМИД 12764137 . S2CID 6081066 .
- Баума Г., Лам-Це В.К., Виренга-Вольф А.Ф., Дрексхаге Х.А., Верснель М.А. (август 2004 г.). «Повышенные уровни MRP-8/14 в сыворотке крови при диабете 1 типа вызывают повышенную экспрессию CD11b и усиленную адгезию циркулирующих моноцитов к фибронектину» . Диабет . 53 (8): 1979–86. дои : 10.2337/диабет.53.8.1979 . hdl : 1765/10354 . ПМИД 15277376 .
- Фогль Т., Людвиг С., Гебелер М., Стрей А., Тори И.С., Райхельт Р. и др. (декабрь 2004 г.). «MRP8 и MRP14 контролируют реорганизацию микротрубочек во время трансэндотелиальной миграции фагоцитов» . Кровь . 104 (13): 4260–8. дои : 10.1182/кровь-2004-02-0446 . ПМИД 15331440 . S2CID 5407110 .
- Чен З.С., Го Ю., Белинский М.Г., Котова Е., Круг Г.Д. (февраль 2005 г.). «Транспорт желчных кислот, сульфатированных стероидов, 17-бета-D-глюкуронида эстрадиола и лейкотриена C4 с помощью белка 8 множественной лекарственной устойчивости человека (ABCC11)». Молекулярная фармакология . 67 (2): 545–57. дои : 10.1124/моль.104.007138 . ПМИД 15537867 . S2CID 18527978 .
- Бортфельд М., Риус М., Кениг Дж., Херольд-Менде С., Нис А.Т., Кепплер Д. (2006). «Белок 8 множественной лекарственной устойчивости человека (MRP8 / ABCC11), апикальный насос оттока стероидных сульфатов, представляет собой аксональный белок ЦНС и периферической нервной системы». Нейронаука . 137 (4): 1247–57. doi : 10.1016/j.neuroscience.2005.10.025 . ПМИД 16359813 . S2CID 22719472 .
- Виманн Д., Барчик К., Фогль Т., Фишер У., Сундеркоттер С., Шульце-Остхофф К. и др. (март 2007 г.). «MRP8/MRP14 нарушает целостность эндотелия и индуцирует каспазозависимую и независимую программу гибели клеток» . Кровь . 109 (6): 2453–60. дои : 10.1182/blood-2006-08-040444 . ПМИД 17095618 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- ABCC11+белок+человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
- Расположение генома человека ABCC11 и ABCC11 страница сведений о гене в браузере генома UCSC .