Семья HRPZ

Семейство катионных каналов Pseudomonas Syringae HRPZ (HRPZ) ( TC# 1.C.56 ) является членом суперсемейства RTX-токсина . Белок Arpin-PSS (HRPZ; TC# 1.C.56.1.1 ) секретируется Pseudomonas Syringae через систему секреции HRP (IIISP; TC# 3.A.6 ) и вызывает гиперчувствительный ответ (HR) в не в течение растения -хозяева при инфекции и патогенности у хозяев. ^{[ 1 ]} Он содержит несколько повторяющихся областей и демонстрирует две расширенные (20 остатков) областей умеренной гидрофобности, которые могут служить α-спиральной TMS. Предполагается, что катионный канал HRPZ в основном имеет α-структуру. HRPZ - Arpin - представляет собой очень термостабильный белок, который демонстрирует многофункциональные способности, например, он вызывает гиперчувствительный ответ (HR), усиливает рост растений, действует как фактор вирулентности и образует поры в плазматических мембранах растений, а также искусственные мембраны. ^{[ 2 ]} Гомологи не встречаются в организмах, кроме P. syringae . ^{[ 3 ]}^{[ 4 ]}

Функция

При вставке в липосомы и синтетические бислои при низких концентрациях (2 нм) он провоцирует катионо-селективный ионный ток с большой унитарной проводимостью. Хлорид не транспортируется. Было выдвинуто предположение, что такие каналы могут позволить высвобождение питательных веществ и/или доставку факторов вирулентности во время бактериальной колонизации растений -хозяев. Мотивы, подобные лейцине, могут принять участие в формировании олигомерных агрегатов, и олигомеризация может быть связана с HR-выявлением. ^{[ 3 ]}

Транспортная реакция

Обобщенная реакция транспорта, как считается, катализируется HRPZ: ^{[ 4 ]}

Маленькие молекулы (в) → Маленькие молекулы (Out)

Ссылки

^ Хаапалайнен, Минна; Энгельхардт, Стефан; Кюфнер, Изабелл; Ли, Чун-Мей; Нюрнбергер, Торстен; Ли, Джастин; Romantschuk, Martin; Тайра, Суви (2011-02-01). «Функциональное картирование HRPZ HRPZ Pseudomonas Syringae выявляет сайты, ответственные за олигомеризацию белка, липидные взаимодействия и индукцию защиты растений» . Патология молекулярного растения . 12 (2): 151–166. doi : 10.1111/j.1364-3703.2010.00655.x . ISSN 1364-3703 . PMC 6640321 . PMID 21199565 .
^ Чой, Мин-Сеон; Ким, Вуки; Ли, Чанхуй; О, Чанг-Сик (2013-10-01). «Арпины, многофункциональные белки, секретируемые грамотрицательными растительными патогенными бактериями» . Молекулярные взаимодействия растений-микробов . 26 (10): 1115–1122. doi : 10.1094/mpmi-02-13-0050-cr . ISSN 0894-0282 . PMID 23745678 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Ли, Дж.; Klusener, B.; Tsiamis, G.; Стивенс, С.; Neyt, C.; Тампакаки, AP; Panopoulos, NJ; Nöller, J.; Weiler, EW (2001-01-02). «HRPZ (PSPH) из растительного патогена Pseudomonas Syringae pv. Фазолиолола связывается с липидными бислоями и образует ионную пор in vitro» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 98 (1): 289–294. doi : 10.1073/pnas.011265298 . ISSN 0027-8424 . PMC 14583 . PMID 11134504 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Saier, MH Jr. "1.C.56 Семейство катионного канала Pseudomonas Syringae HRPZ -мембраны мишени -клеточной мембраны (HRPZ)" . База данных классификации Transporter . Saier Lab Bioinformatics Group / SDSC.

Дальнейшее чтение

Чен, Джонатан С.; Редди, Вамси; Чен, Джошуа Х.; Шликов, Максим А.; Чжэн, Вэй Хао; Чо, Jaehoon; Йен, Мин Рен; Saier, Milton H. (2011). «Филогенетическая характеристика суперсемейств транспортного белка: превосходство программ суперфамилитри по сравнению с теми, которые основаны на множественных выравниваниях» . Журнал молекулярной микробиологии и биотехнологии . 21 (3–4): 83–96. doi : 10.1159/000334611 . PMC 3290041 . PMID 22286036 .

[1] Хаапалайнен, Минна; Энгельхардт, Стефан; Кюфнер, Изабелл; Ли, Чун-Мей; Нюрнбергер, Торстен; Ли, Джастин; Romantschuk, Martin; Тайра, Суви (2011-02-01). «Функциональное картирование HRPZ HRPZ Pseudomonas Syringae выявляет сайты, ответственные за олигомеризацию белка, липидные взаимодействия и индукцию защиты растений» . Патология молекулярного растения . 12 (2): 151–166. doi : 10.1111/j.1364-3703.2010.00655.x . ISSN 1364-3703 . PMC 6640321 . PMID 21199565 .

[2] Чой, Мин-Сеон; Ким, Вуки; Ли, Чанхуй; О, Чанг-Сик (2013-10-01). «Арпины, многофункциональные белки, секретируемые грамотрицательными растительными патогенными бактериями» . Молекулярные взаимодействия растений-микробов . 26 (10): 1115–1122. doi : 10.1094/mpmi-02-13-0050-cr . ISSN 0894-0282 . PMID 23745678 .

[:0-3] Jump up to: ^а ^{беременный} Ли, Дж.; Klusener, B.; Tsiamis, G.; Стивенс, С.; Neyt, C.; Тампакаки, AP; Panopoulos, NJ; Nöller, J.; Weiler, EW (2001-01-02). «HRPZ (PSPH) из растительного патогена Pseudomonas Syringae pv. Фазолиолола связывается с липидными бислоями и образует ионную пор in vitro» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 98 (1): 289–294. doi : 10.1073/pnas.011265298 . ISSN 0027-8424 . PMC 14583 . PMID 11134504 .

[:1-4] Jump up to: ^а ^{беременный} Saier, MH Jr. "1.C.56 Семейство катионного канала Pseudomonas Syringae HRPZ -мембраны мишени -клеточной мембраны (HRPZ)" . База данных классификации Transporter . Saier Lab Bioinformatics Group / SDSC.

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]