Цитохром b

Цитохром b, С-концевой домен
Цитохром b, С-концевой домен
	митохондриального цитохрома bc1 Комплекс
Идентификаторы
Символ	Цитохром_B_C
Пфам	PF00032
ИнтерПро	ИПР005798
Pfam
показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

Цитохром b, N-концевой трансмембранный домен
Цитохром b, N-концевой трансмембранный домен
	митохондриального цитохрома bc1 Комплекс
Идентификаторы
Символ	Цитохром_B_N
Пфам	PF00033
ИнтерПро	ИПР005797
PROSITE	PDOC00171
ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ 2	3bcc / SCOPe / СУПФАМ
TCDB	3.D.3
Суперсемейство OPM	3
белок OPM	3h1j
CDD	cd00284
Pfam
показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

Цитохром b как в молекулярной , так и в клеточной биологии представляет собой белок, обнаруженный в мембранах аэробных клеток. В эукариот митохондриях (внутренняя мембрана) и у аэробных прокариот цитохром b является компонентом дыхательной цепи комплекса III ( EC 1.10.2.2 ), также известного как комплекс bc1 или убихинол-цитохром c-редуктаза. В хлоропластах растений и цианобактериях имеется гомологичный белок цитохром b6, компонент пластохинон -пластоцианинредуктазы ( EC 1.10.99.1 ), также известный как комплекс b6f. Эти комплексы участвуют в транспорте электронов, накачке протонов для создания протон-движущей силы ( ПМФ ). Этот протонный градиент используется для генерации АТФ . Эти комплексы играют жизненно важную роль в клетках. ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]}^{[ 3 ]}

Структура и функции

b/b6 представляет собой интегральный мембранный белок , состоящий примерно из 400 аминокислотных остатков и, вероятно, имеющий 8 трансмембранных сегментов . У растений и цианобактерий цитохром b6 состоит из двух белковых субъединиц, кодируемых генами petB и petD. Цитохром b/b6 нековалентно связывает две гемовые группы, известные как b562 и b566. Предполагается, что четыре консервативных остатка гистидина являются лигандами атомов железа этих двух гемовых групп. ^{[ 2 ]}^{[ 3 ]}

Гемовые группы являются ключевыми частями внутреннего пути переноса электронов и незаменимы для функционирования двух хинол-окисляющих комплексов. Две единицы b/b6 также образуют путь входа хинолов. ^{[ 4 ]}

Использование в филогенетике

Цитохром b обычно используется в качестве участка митохондриальной ДНК для определения филогенетических связей между организмами из-за вариабельности его последовательности. Считается, что он наиболее полезен при определении взаимоотношений внутри семей и родов . Сравнительные исследования с участием цитохрома b привели к созданию новых схем классификации и использовались для отнесения недавно описанных видов к роду, а также для углубления понимания эволюционных взаимоотношений. ^{[ 5 ]}

Клиническое значение

Мутации цитохрома b в первую очередь приводят к непереносимости физической нагрузки у пациентов-людей; хотя также сообщалось о более редких, тяжелых мультисистемных патологиях. ^{[ 6 ]}

Одноточечные мутации цитохрома b Plasmodium falciparum и P. berghei связаны с устойчивостью к противомалярийному препарату атоваквону . ^{[ 7 ]}

Человеческие гены

Гены человека, кодирующие белки цитохрома b, включают:

CYB5A – цитохром b5 типа А (микросомальный)
CYB5B – цитохром b5 типа B (внешняя мембрана митохондрий)
CYBASC3 - цитохром b, аскорбатзависимый 3
MT-CYB - митохондриально кодируемый цитохром b

Цель фунгицида

На Cyt b воздействует Q _o I фунгицид класса , группа 11 Комитета по борьбе с фунгицидной устойчивостью. Мутации cyt b G143A и F129L обеспечивает устойчивость к основной части группы 11, хотя G143A не действует против метилтетрапрола (11А). ^{[ 8 ]} G143A является значимым для Botrytis cinerea при выращивании клубники в Калифорнии . ^{[ 9 ]}

Ссылки

^ Бланкеншип, Роберт (2009). Молекулярные механизмы фотосинтеза . Издательство Блэквелл. стр. 124–132.
^ Jump up to: ^а ^б Хауэлл Н. (август 1989 г.). «Эволюционная консервативность белковых областей в протонмотивном цитохроме b и их возможная роль в окислительно-восстановительном катализе». Дж. Мол. Эвол . 29 (2): 157–69. Бибкод : 1989JMolE..29..157H . дои : 10.1007/BF02100114 . ПМИД 2509716 . S2CID 7298013 .
^ Jump up to: ^а ^б Эспости М.Д., Де Врис С., Крими М., Гелли А., Патарнелло Т., Мейер А. (июль 1993 г.). «Митохондриальный цитохром b: эволюция и структура белка» (PDF) . Биохим. Биофиз. Акта . 1143 (3): 243–71. дои : 10.1016/0005-2728(93)90197-Н . ПМИД 8329437 .
^ Саревич, М; Пинчер, С; Пьетрас, Р; Борек, А; Буйнович, Л.; Ханке, Г; Крамер, Вашингтон; Финацци, Дж; Осичка, А (24 февраля 2021 г.). «Каталитические реакции и сохранение энергии в цитохромных комплексах bc(1) и b(6)f энергопередающих мембран» . Химические обзоры . 121 (4): 2020–2108. doi : 10.1021/acs.chemrev.0c00712 . ПМК 7908018 . ПМИД 33464892 .
^ Кастресана, Дж. (2001). «Цитохром b Филогения и систематика человекообразных обезьян и млекопитающих» . Молекулярная биология и эволюция . 18 (4): 465–471. doi : 10.1093/oxfordjournals.molbev.a003825 . ПМИД 11264397 .
^ Блейкли Э.Л., Митчелл А.Л., Фишер Н., Менье Б., Нейтманс Л.Г., Шефер А.М., Джексон М.Дж., Тернбулл Д.М., Тейлор Р.В. (июль 2005 г.). «Мутация митохондриального цитохрома b, вызывающая серьезную недостаточность ферментов дыхательной цепи у людей и дрожжей» . ФЕБС Дж . 272 (14): 3583–92. дои : 10.1111/j.1742-4658.2005.04779.x . ПМИД 16008558 . S2CID 13938075 .
^ Сирегар Дж. Э., Сяфруддин Д., Мацуока Х., Кита К., Марзуки С. (июнь 2008 г.). «Мутация, лежащая в основе устойчивости Plasmodium berghei к атоваквону в хинонсвязывающем домене 2 (Qo (2)) гена цитохрома b». Международная Паразитология . 57 (2): 229–32. дои : 10.1016/j.parint.2007.12.002 . ПМИД 18248769 .
^ FRAC ( Комитет по борьбе с устойчивостью к фунгицидам ) (март 2021 г.). «Список кодов FRAC © * 2021: Средства борьбы с грибком, отсортированные по характеру перекрестной устойчивости и способу действия (включая кодировку групп FRAC на этикетках продуктов)» (PDF) . Архивировано из оригинала (PDF) 5 ноября 2021 г. Проверено 16 июня 2021 г.
^
- Петраш, Стефан; Кнапп, Стивен Дж.; ван Кан, Ян А.Л.; Бланко-Улате, Барбара (04 апреля 2019 г.). «Серая плесень клубники — разрушительное заболевание, вызываемое распространенным некротрофным грибковым возбудителем Botrytis cinerea » . Молекулярная патология растений . 20 (6). Британское общество патологии растений ( ВБ ): 877–892. дои : 10.1111/mpp.12794 . ISSN 1464-6722 . ПМК 6637890 . ПМИД 30945788 . S2CID 93002697 .
- Коссебум, Скотт Д.; Айворс, Келли Л.; Шнабель, Гвидо; Брайсон, Патрисия К.; Холмс, Джеральд Дж. (2019). «Внутрисезонный сдвиг профилей устойчивости Botrytis cinerea к фунгицидам на клубничных полях Калифорнии» . Болезни растений . 103 (1). Американское фитопатологическое общество : 59–64. doi : 10.1094/pdis-03-18-0406-re . ISSN 0191-2917 . ПМИД 30422743 . S2CID 205345358 .

Внешние ссылки

Цитохромы + b в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

[1] Бланкеншип, Роберт (2009). Молекулярные механизмы фотосинтеза . Издательство Блэквелл. стр. 124–132.

[pmid2509716-2] Jump up to: ^а ^б Хауэлл Н. (август 1989 г.). «Эволюционная консервативность белковых областей в протонмотивном цитохроме b и их возможная роль в окислительно-восстановительном катализе». Дж. Мол. Эвол . 29 (2): 157–69. Бибкод : 1989JMolE..29..157H . дои : 10.1007/BF02100114 . ПМИД 2509716 . S2CID 7298013 .

[pmid8329437-3] Jump up to: ^а ^б Эспости М.Д., Де Врис С., Крими М., Гелли А., Патарнелло Т., Мейер А. (июль 1993 г.). «Митохондриальный цитохром b: эволюция и структура белка» (PDF) . Биохим. Биофиз. Акта . 1143 (3): 243–71. дои : 10.1016/0005-2728(93)90197-Н . ПМИД 8329437 .

[4] Саревич, М; Пинчер, С; Пьетрас, Р; Борек, А; Буйнович, Л.; Ханке, Г; Крамер, Вашингтон; Финацци, Дж; Осичка, А (24 февраля 2021 г.). «Каталитические реакции и сохранение энергии в цитохромных комплексах bc(1) и b(6)f энергопередающих мембран» . Химические обзоры . 121 (4): 2020–2108. doi : 10.1021/acs.chemrev.0c00712 . ПМК 7908018 . ПМИД 33464892 .

[2001Castresana-5] Кастресана, Дж. (2001). «Цитохром b Филогения и систематика человекообразных обезьян и млекопитающих» . Молекулярная биология и эволюция . 18 (4): 465–471. doi : 10.1093/oxfordjournals.molbev.a003825 . ПМИД 11264397 .

[pmid16008558-6] Блейкли Э.Л., Митчелл А.Л., Фишер Н., Менье Б., Нейтманс Л.Г., Шефер А.М., Джексон М.Дж., Тернбулл Д.М., Тейлор Р.В. (июль 2005 г.). «Мутация митохондриального цитохрома b, вызывающая серьезную недостаточность ферментов дыхательной цепи у людей и дрожжей» . ФЕБС Дж . 272 (14): 3583–92. дои : 10.1111/j.1742-4658.2005.04779.x . ПМИД 16008558 . S2CID 13938075 .

[pmid18248769-7] Сирегар Дж. Э., Сяфруддин Д., Мацуока Х., Кита К., Марзуки С. (июнь 2008 г.). «Мутация, лежащая в основе устойчивости Plasmodium berghei к атоваквону в хинонсвязывающем домене 2 (Qo (2)) гена цитохрома b». Международная Паразитология . 57 (2): 229–32. дои : 10.1016/j.parint.2007.12.002 . ПМИД 18248769 .

[FRAC-MoAs-8] FRAC ( Комитет по борьбе с устойчивостью к фунгицидам ) (март 2021 г.). «Список кодов FRAC © * 2021: Средства борьбы с грибком, отсортированные по характеру перекрестной устойчивости и способу действия (включая кодировку групп FRAC на этикетках продуктов)» (PDF) . Архивировано из оригинала (PDF) 5 ноября 2021 г. Проверено 16 июня 2021 г.

[Cosseboom-et-al-2019-bundle-9] 
Петраш, Стефан; Кнапп, Стивен Дж.; ван Кан, Ян А.Л.; Бланко-Улате, Барбара (04 апреля 2019 г.). «Серая плесень клубники — разрушительное заболевание, вызываемое распространенным некротрофным грибковым возбудителем Botrytis cinerea » . Молекулярная патология растений . 20 (6). Британское общество патологии растений ( ВБ ): 877–892. дои : 10.1111/mpp.12794 . ISSN 1464-6722 . ПМК 6637890 . ПМИД 30945788 . S2CID 93002697 .
Коссебум, Скотт Д.; Айворс, Келли Л.; Шнабель, Гвидо; Брайсон, Патрисия К.; Холмс, Джеральд Дж. (2019). «Внутрисезонный сдвиг профилей устойчивости Botrytis cinerea к фунгицидам на клубничных полях Калифорнии» . Болезни растений . 103 (1). Американское фитопатологическое общество : 59–64. doi : 10.1094/pdis-03-18-0406-re . ISSN 0191-2917 . ПМИД 30422743 . S2CID 205345358 .

[10] Петраш, Стефан; Кнапп, Стивен Дж.; ван Кан, Ян А.Л.; Бланко-Улате, Барбара (04 апреля 2019 г.). «Серая плесень клубники — разрушительное заболевание, вызываемое распространенным некротрофным грибковым возбудителем Botrytis cinerea » . Молекулярная патология растений . 20 (6). Британское общество патологии растений ( ВБ ): 877–892. дои : 10.1111/mpp.12794 . ISSN 1464-6722 . ПМК 6637890 . ПМИД 30945788 . S2CID 93002697 .

[11] Коссебум, Скотт Д.; Айворс, Келли Л.; Шнабель, Гвидо; Брайсон, Патрисия К.; Холмс, Джеральд Дж. (2019). «Внутрисезонный сдвиг профилей устойчивости Botrytis cinerea к фунгицидам на клубничных полях Калифорнии» . Болезни растений . 103 (1). Американское фитопатологическое общество : 59–64. doi : 10.1094/pdis-03-18-0406-re . ISSN 0191-2917 . ПМИД 30422743 . S2CID 205345358 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]