Локус β-глобина человека

Локус β-глобина человека состоит из пяти генов, расположенных на коротком участке хромосомы 11 , ответственных за создание бета-частей (примерно половины) белка-переносчика кислорода гемоглобина . Этот локус содержит не только ген бета-глобина , но также дельта- , гамма-А , гамма-G и эпсилон- глобин. Экспрессия всех этих генов контролируется единой локусной контрольной областью (LCR), и гены дифференциально экспрессируются на протяжении всего развития. ^{[ 1 ]}

Порядок генов в кластере бета-глобина следующий: 5' - эпсилон - гамма-G - гамма-А - дельта - бета - 3'.

Расположение генов напрямую отражает временную дифференциацию их экспрессии во время развития, при этом версия гена на ранней эмбриональной стадии расположена ближе всего к LCR. Если гены перестраиваются, продукты генов экспрессируются на неправильных стадиях развития.

Экспрессия этих генов регулируется в эмбриональном эритропоэзе многими факторами транскрипции , включая KLF1 , ^{[ 2 ]} который связан с активацией взрослого гемоглобина во взрослых дефинитивных эритроцитах и KLF2 , ^{[ 3 ]} который жизненно важен для экспрессии эмбрионального гемоглобина .

Комплекс ГББ

Многие CRM были картированы в кластере генов, кодирующих β-подобные глобины, экспрессируемые в эмбриональных (HBE1), фетальных (HBG1 и HBG2) и взрослых (HBB и HBD) эритроидных клетках. Все они отмечены гиперчувствительными участками и следами ДНКазы I , и многие из них связаны с GATA1 в эритробластах периферической крови (ПБДЭ). Сегмент ДНК, расположенный между генами HBG1 и HBD, является одним из сегментов ДНК, связанных с BCL11A и несколькими другими белками, которые отрицательно регулируют HBG1 и HBG2. Он чувствителен к ДНКазе I , но не сохраняется у млекопитающих . Энхансер , расположенный 3'-конца гена HBG1, связывается с несколькими белками в клетках PBDE и K562 и чувствителен к ДНКазе I, но практически не проявляет сигнала для ограничения у млекопитающих. ^{[ 4 ]}

Ссылки

^ Левингс П.П., Бунгерт Дж. (март 2002 г.). «Контрольная область локуса бета-глобина человека» . Европейский журнал биохимии . 269 (6): 1589–99. дои : 10.1046/j.1432-1327.2002.02797.x . ПМИД 11895428 .
^ Ходж Д., Когхилл Э., Киз Дж., Магуайр Т., Хартманн Б., Макдауэлл А., Вайс М., Гриммонд С., Перкинс А. (апрель 2006 г.). «Глобальная роль EKLF в окончательном и примитивном эритропоэзе» . Кровь . 107 (8): 3359–70. дои : 10.1182/кровь-2005-07-2888 . ПМЦ 1895762 . ПМИД 16380451 .
^ Басу П., Моррис П.Е., Хаар Дж.Л., Вани М.А., Лингрел Дж.Б., Генслер К.М., Ллойд Дж.А. (октябрь 2005 г.). «KLF2 необходим для примитивного эритропоэза и регулирует человеческие и мышиные эмбриональные гены бета-подобного глобина in vivo» . Кровь . 106 (7): 2566–2571. дои : 10.1182/кровь-2005-02-0674 . ПМК 1895257 . ПМИД 15947087 .
^ [ Бесплатная статья PMC ] [ PubMed ] Келлис М., Уолд Б., Снайдер М.П., Бернштейн Б.Е., Кундадже А., Маринов Г.К., Уорд Л.Д., Бирни Э., Кроуфорд Дж.Е., Деккер Дж., Данхэм И., Эльницки Л.Л., Фарнем П.Дж., Фейнгольд Э.А., Герштейн М., Гиддингс М.К., Гилберт Д.М., Гингерас Т.Р., Грин Э.Д., Гиго Р., Хаббард Т., Кент Дж., Либ Дж.Д., Майерс Р.М., Пазин М.Дж., Рен Б., Стаматояннопулос Дж.А. , Венг З., Уайт К.П., Хардисон Р.К. (апрель 2014 г.). «Определение функциональных элементов ДНК в геноме человека» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 111 (17): 6131–8. Бибкод : 2014PNAS..111.6131K . дои : 10.1073/pnas.1318948111 . ПМК 4035993 . ПМИД 24753594 .

Дальнейшее чтение

Фришкнехт Х., Дутли Ф (март 2007 г.). «Дупликация/вставка длиной 65 п.н. в экзон II гена бета-глобина, вызывающая бета0-талассемию» . Гематологическая . 92 (3): 423–4. дои : 10.3324/гематол.10785 . ПМИД 17339197 .
Джардина Б., Мессана И., Скатена Р., Кастаньола М. (1995). «Множественные функции гемоглобина». Критические обзоры по биохимии и молекулярной биологии . 30 (3): 165–96. дои : 10.3109/10409239509085142 . ПМИД 7555018 .
Хиггс Д.Р., Викерс М.А., Уилки А.О., Преториус И.М., Джарман А.П., Weatherall DJ (апрель 1989 г.). «Обзор молекулярной генетики кластера генов альфа-глобина человека» . Кровь . 73 (5): 1081–104. дои : 10.1182/blood.V73.5.1081.1081 . ПМИД 2649166 .
Сальзано А.М., Карбоне В., Пагано Л., Буффарди С., Де Р.К., Пуччи П. (февраль 2002 г.). «Hb Vila Real [beta36(C2)Pro→His] в Италии: характеристика аминокислотной замены и мутации ДНК». Гемоглобин . 26 (1): 21–31. дои : 10.1081/HEM-120002937 . ПМИД 11939509 . S2CID 40757080 .

[pmid11895428-1] Левингс П.П., Бунгерт Дж. (март 2002 г.). «Контрольная область локуса бета-глобина человека» . Европейский журнал биохимии . 269 (6): 1589–99. дои : 10.1046/j.1432-1327.2002.02797.x . ПМИД 11895428 .

[pmid16380451-2] Ходж Д., Когхилл Э., Киз Дж., Магуайр Т., Хартманн Б., Макдауэлл А., Вайс М., Гриммонд С., Перкинс А. (апрель 2006 г.). «Глобальная роль EKLF в окончательном и примитивном эритропоэзе» . Кровь . 107 (8): 3359–70. дои : 10.1182/кровь-2005-07-2888 . ПМЦ 1895762 . ПМИД 16380451 .

[Basu05-3] Басу П., Моррис П.Е., Хаар Дж.Л., Вани М.А., Лингрел Дж.Б., Генслер К.М., Ллойд Дж.А. (октябрь 2005 г.). «KLF2 необходим для примитивного эритропоэза и регулирует человеческие и мышиные эмбриональные гены бета-подобного глобина in vivo» . Кровь . 106 (7): 2566–2571. дои : 10.1182/кровь-2005-02-0674 . ПМК 1895257 . ПМИД 15947087 .

[4] [ Бесплатная статья PMC ] [ PubMed ] Келлис М., Уолд Б., Снайдер М.П., Бернштейн Б.Е., Кундадже А., Маринов Г.К., Уорд Л.Д., Бирни Э., Кроуфорд Дж.Е., Деккер Дж., Данхэм И., Эльницки Л.Л., Фарнем П.Дж., Фейнгольд Э.А., Герштейн М., Гиддингс М.К., Гилберт Д.М., Гингерас Т.Р., Грин Э.Д., Гиго Р., Хаббард Т., Кент Дж., Либ Дж.Д., Майерс Р.М., Пазин М.Дж., Рен Б., Стаматояннопулос Дж.А. , Венг З., Уайт К.П., Хардисон Р.К. (апрель 2014 г.). «Определение функциональных элементов ДНК в геноме человека» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 111 (17): 6131–8. Бибкод : 2014PNAS..111.6131K . дои : 10.1073/pnas.1318948111 . ПМК 4035993 . ПМИД 24753594 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]