Псевдомонада

Псевдомонада
	P. aeruginosa Колонии на чашке с агаром
Научная классификация
Домен:	Бактерии
Тип:	Псевдомонадота
Сорт:	Гаммапротеобактерии
Заказ:	Псевдомонады
Семья:	псевдомонадные
Род:	Псевдомонада ; Выпущен в 1894 г.
Типовой вид
	синегнойная палочка ;
Разновидность
	См. текст.
Синонимы
	« Штуцеримонас » Lalucat et al. 2022 год ; Флавимонас Холмс и др. 1987 год ; Хрисеомонас Холмс и др. 1986 год ; Змея Хеспелл 1977 г. (утвержденные списки 1980 г.) ;

Pseudomonas — род грамотрицательных бактерий, принадлежащих к семейству Pseudomonadaceae класса Gammaproteobacteria . 313 представителей рода ^[2]^[3] демонстрируют большое метаболическое разнообразие и, следовательно, способны колонизировать широкий спектр ниш. ^[4] Легкость культивирования in vitro и доступность растущего числа Pseudomonas штамма последовательностей генома сделали этот род отличным объектом научных исследований; наиболее изученные виды включают P. aeruginosa в роли оппортунистического патогена человека , патоген растений P. syringae , почвенную бактерию P. putida и стимулирующий рост растений P. fluorescens , P. lini , P. migulae и П. граминис . ^[5]^[6]

Из-за их широкого распространения в воде и семенах растений, таких как двудольные , псевдомонады были обнаружены на ранних этапах истории микробиологии . Родовое название Pseudomonas, созданное для этих организмов, было довольно расплывчато определено Вальтером Мигулой в 1894 и 1900 годах как род грамотрицательных, палочковидных и полярножгутиковых бактерий с некоторыми спорулирующими видами. ^[7]^[8] Последнее утверждение позже оказалось неверным и объяснялось преломляющими гранулами резервных материалов. ^[9] типовой вид Pseudomonas pyocyanea ( базионим Pseudomonas aeruginosa ). Несмотря на расплывчатое описание, лучшим дескриптором оказался ^[9]

История классификации

Как и большинство родов бактерий, псевдомонада ^{[примечание 1]} последний общий предок жил сотни миллионов лет назад. Первоначально они были классифицированы в конце 19 века, когда впервые идентифицированы Уолтером Мигулой . Этимология названия в то время не была уточнена и впервые появилась в седьмом издании « Руководства по систематической бактериологии» Берджи (главного авторитета в бактериальной номенклатуре) как греческие псевдонимы (ψευδής) «ложный» и -monas (μονάς/μονάδος)». единая единица», что может означать ложную единицу; однако Мигула, возможно, имел в виду ложную Монасу , простейшего с наножгутиками. ^[9] (впоследствии термин «монада» использовался в ранней истории микробиологии для обозначения одноклеточных организмов). Вскоре другие виды, соответствующие несколько расплывчатому первоначальному описанию Мигулы, были изолированы из многих природных ниш, и в то время многие из них были отнесены к этому роду . Однако с тех пор многие штаммы были реклассифицированы на основе более современной методологии и использования подходов, включающих изучение консервативных макромолекул. ^[10]

Недавно анализ последовательности 16S рРНК изменил таксономию многих видов бактерий. ^[11] В результате род Pseudomonas включает штаммы, ранее отнесенные к родам Chryseomonas и Flavimonas . ^[12] Другие штаммы, ранее отнесенные к роду Pseudomonas , теперь отнесены к родам Burkholderia и Ralstonia . ^[13]^[14]

В 2020 году филогеномный анализ 494 полных геномов Pseudomonas выявил два четко определенных вида ( P. aeruginosa и P. chromraphis ) и четыре более широкие филогенетические группы ( P. fluorescens, P. stutzeri, P. syringae, P. putida ) с достаточное количество доступных протеомов. ^[15] Четыре более широкие эволюционные группы включают более одного вида, что основано на определении видов по средним уровням идентичности нуклеотидов. ^[16] Кроме того, филогеномный анализ выявил несколько штаммов, которые были ошибочно отнесены к неправильному виду или эволюционной группе. ^[15] Об этой проблеме с неправильным аннотированием сообщалось и в других анализах. ^[17]

Геномика

полная последовательность генома вида Pseudomonas В 2000 году была определена ; совсем недавно была определена последовательность других штаммов, включая штаммы P. aeruginosa PAO1 (2000), P. putida KT2440 (2002), P. protegens Pf-5 (2005), P. syringae pathovar tomato DC3000 (2003), P. syringae pathovar syringae B728a (2005), P. syringae pathovarphaseolica 1448A (2005), P. fluorescens Pf0-1 и P. entomophila L48. ^[10]

более 400 штаммов Pseudomonas . К 2016 году было секвенировано ^[18] Секвенирование геномов сотен штаммов выявило сильно различающиеся виды внутри рода. Фактически, многие геномы Pseudomonas имеют только 50-60% общих генов, например, P. aeruginosa и P. putida имеют общий только 2971 белок из 5350 (или ~55%). ^[18]

более 500 полных геномов Pseudomonas К 2020 году в банке генов было доступно . В филогеномном анализе было использовано 494 полных протеома и идентифицировано 297 основных ортологов, общих для всех штаммов. ^[15] Этот набор основных ортологов на уровне рода был обогащен белками, участвующими в метаболизме, трансляции и транскрипции, и использовался для создания филогеномного дерева всего рода, чтобы очертить отношения между основными эволюционными группами Pseudomonas . ^[15] Кроме того, для большинства эволюционных групп были идентифицированы группоспецифичные коровые белки, а это означает, что они присутствовали у всех членов конкретной группы, но отсутствовали у других псевдомонад. Например, было идентифицировано несколько специфичных для P. aeruginosa коровых белков, которые, как известно, играют важную роль в патогенности этого вида, такие как CntL, CntM, PlcB, Acp1, MucE, SrfA, Tse1, Tsi2, Tse3 и EsrC . ^[15]

Характеристики

Представители рода демонстрируют следующие определяющие характеристики: ^[19]

Другие характеристики, которые обычно ассоциируются с видами Pseudomonas (за некоторыми исключениями), включают секрецию пиовердина , флуоресцентного желто-зеленого сидерофора. ^[20] в условиях ограничения по железу. Некоторые виды Pseudomonas могут также производить дополнительные типы сидерофоров, такие как пиоцианин Pseudomonas aeruginosa. ^[21] и тиохинолобактин Pseudomonas fluorescens . ^[22] Виды Pseudomonas также обычно дают положительный результат в тесте на оксидазу , отсутствие газообразования из глюкозы, глюкоза окисляется в тесте на окисление/ферментацию с использованием теста Хью и Лейфсона O/F, бета- гемолитический (на кровяном агаре ), индол- отрицательный, метиловый красный отрицательный, тест Фогеса-Проскауэра отрицательный и положительный на цитрат . ^{[ нужна ссылка ]}

Pseudomonas, возможно, является наиболее распространенным зародышечником кристаллов льда в облаках, поэтому они имеют первостепенное значение для образования снега и дождя во всем мире. ^[23]

Образование биопленки

Все виды и штаммы Pseudomonas исторически были отнесены к строгим аэробам . Исключения из этой классификации недавно были обнаружены в Pseudomonas биопленках . ^[24] Значительное количество клеток может продуцировать экзополисахариды, связанные с образованием биопленок. Секреция экзополисахаридов , таких как альгинат, затрудняет фагоцитоз псевдомонад млекопитающих лейкоцитами . ^[25] Производство экзополисахаридов также способствует образованию на поверхности биопленок , которые трудно удалить с поверхностей для приготовления пищи. Рост псевдомонад на портящихся продуктах может привести к появлению «фруктового» запаха. ^{[ нужна ссылка ]}

Устойчивость к антибиотикам

Большинство видов Pseudomonas . от природы устойчивы к пенициллину и большинству родственных бета-лактамных антибиотиков , но некоторые из них чувствительны к пиперациллину , имипенему , тикарциллину или ципрофлоксацину . ^[25] Аминогликозиды, такие как тобрамицин , гентамицин и амикацин, являются другими вариантами терапии. ^{[ нужна ссылка ]}

Эта способность процветать в суровых условиях является результатом их выносливых клеточных стенок , содержащих порины . Их устойчивость к большинству антибиотиков объясняется наличием откачивающих насосов , которые откачивают некоторые антибиотики до того, как они начнут действовать. ^{[ нужна ссылка ]}

Pseudomonas aeruginosa все чаще признается как новый условно-патогенный микроорганизм, имеющий клиническое значение. Одной из его наиболее тревожных характеристик является низкая чувствительность к антибиотикам. ^[26] Такая низкая чувствительность объясняется согласованным действием насосов оттока нескольких лекарств с хромосомно-кодируемыми устойчивости к антибиотикам генами (например, mexAB-oprM , mexXY и т. д.). ^[27]) и низкой проницаемостью бактериальных клеточных оболочек. Помимо внутренней устойчивости, P. aeruginosa легко развивает приобретенную устойчивость либо в результате мутации в хромосомно-кодируемых генах, либо в результате горизонтального переноса генов , детерминант устойчивости к антибиотикам. Развитие множественной лекарственной устойчивости изолятов P. aeruginosa требует нескольких различных генетических событий, которые включают приобретение различных мутаций и/или горизонтальный перенос генов устойчивости к антибиотикам. Гипермутация способствует отбору обусловленной мутациями устойчивости к антибиотикам у штаммов P. aeruginosa , вызывающих хронические инфекции, тогда как кластеризация нескольких различных генов устойчивости к антибиотикам в интегронах способствует согласованному приобретению детерминант устойчивости к антибиотикам. Некоторые недавние исследования показали фенотипическую устойчивость, связанную с образованием биопленок или появлением вариантов с небольшими колониями, что может иметь важное значение для ответа популяций P. aeruginosa на лечение антибиотиками . ^[10]

Чувствительность к галлию

Хотя галлий не имеет естественной биологической функции, ионы галлия взаимодействуют с клеточными процессами аналогично железу(III). Когда ионы галлия ошибочно поглощаются бактериями, такими как Pseudomonas , вместо железа(III) , ионы мешают дыханию, и бактерии погибают. Это происходит потому, что железо обладает окислительно-восстановительной активностью, позволяя переносить электроны во время дыхания, а галлий неактивен в окислительно-восстановительном процессе. ^[28]^[29]

Патогенность

Патогены животных

Инфекционные виды включают P. aeruginosa , P. oryzihabitans и P. plecoglossicida . P. aeruginosa процветает в условиях больниц и представляет собой особую проблему в этой среде, поскольку является второй по распространенности инфекцией среди госпитализированных пациентов ( внутрибольничные инфекции ). ^[30] Этот патогенез частично может быть обусловлен белками, секретируемыми P. aeruginosa . Бактерия обладает широким спектром систем секреции , которые экспортируют многочисленные белки, имеющие отношение к патогенезу клинических штаммов. ^[31] Интересно, что несколько генов, участвующих в патогенезе P. aeruginosa, таких как CntL, CntM, PlcB, Acp1, MucE, SrfA, Tse1, Tsi2, Tse3 и EsrC , специфичны для основной группы. ^[15] это означает, что они свойственны подавляющему большинству штаммов P. aeruginosa , но отсутствуют у других псевдомонад .

Фитопатогены

P. syringae — плодовитый патоген растений . Существует более 50 различных патоваров , многие из которых демонстрируют высокую степень специфичности растения-хозяина. Многие другие виды Pseudomonas могут действовать как патогены растений, особенно все остальные представители подгруппы P. syringae , но P. syringae является наиболее распространенным и наиболее изученным. ^{[ нужна ссылка ]}

Возбудители грибков

P. tolaasii может представлять собой серьезную проблему для сельского хозяйства, поскольку может вызывать бактериальную пятнистость культивируемых грибов . ^[32] Аналогичным образом, P. agarici может вызвать появление капель в жабрах у культивируемых грибов. ^[33]

Использование в качестве агентов биоконтроля.

С середины 1980-х годов некоторые представители рода Pseudomonas вносятся в семена зерновых культур или вносятся непосредственно в почву в качестве способа предотвращения роста или распространения патогенов сельскохозяйственных культур. Эта практика в целом называется биоконтролем . Свойства биоконтроля штаммов P. fluorescens и P. protegens (например, CHA0 или Pf-5) в настоящее время лучше всего изучены, хотя неясно, как именно свойства P. fluorescens достигаются , способствующие росту растений. Теории включают в себя: бактерии могут вызывать системную устойчивость растения-хозяина, чтобы оно могло лучше противостоять атаке настоящего патогена; бактерии могут превзойти другие (патогенные) почвенные микробы, например, с помощью сидерофоров, давая конкурентное преимущество при улавливании железа; бактерии могут производить соединения, антагонистические по отношению к другим почвенным микробам, такие как феназинового антибиотики типа или цианистый водород . Экспериментальные данные подтверждают все эти теории. ^[34]

Другие известные виды Pseudomonas со свойствами биоконтроля включают P. chromraphis , который производит феназинового типа антибиотик активный против некоторых грибковых патогенов растений. ^[35] и близкородственный вид P. aurantiaca , который производит ди-2,4-диацетилфторглюцилметан , соединение, обладающее антибиотической активностью против грамположительных микроорганизмов. ^[36]

Использование в качестве средств биоремедиации.

Некоторые представители этого рода способны метаболизировать химические загрязнители окружающей среды и, как следствие, могут использоваться для биоремедиации . Известные виды, продемонстрировавшие свою пригодность для использования в качестве средств биоремедиации, включают:

P. alcaligenes , способный разлагать полициклические ароматические углеводороды . ^[37]
P. mendocina , способная разлагать толуол . ^[38]
P. pseudoalcaligenes , способный использовать цианид в качестве источника азота . ^[39]
P.resinovorans , способный разлагать карбазол . ^[40]
P. aeruginosa , P. putida , P. desmolyticum и P. nitroreducens могут разлагать хлорпирифос . ^[41]
P. veronii , который, как было показано, разлагает множество простых ароматических органических соединений . ^[42]^[43]
P. putida , которая обладает способностью разлагать органические растворители, такие как толуол . ^[44] По крайней мере, один штамм этой бактерии способен превращать морфин в водном растворе в более сильный и довольно дорогой в производстве препарат гидроморфон (Дилаудид).
Штамм КС P. stutzeri , способный разлагать четыреххлористый углерод . ^[45]

Риски, связанные с псевдомонадой

Pseudomonas — это род бактерий, которые, как известно, связаны с рядом заболеваний, поражающих людей, растения и животных.

Люди и животные

Одним из наиболее опасных штаммов Pseudomonas является Pseudomonas aeruginosa , который является причиной значительного числа внутрибольничных инфекций. Многие больницы и медицинские учреждения сталкиваются с постоянными проблемами в борьбе с инфекциями, вызванными Pseudomonas . Симптомы этих инфекций вызваны белками, выделяемыми бактериями, и могут включать пневмонию , заражение крови и инфекции мочевыводящих путей . ^[46] Pseudomonas aeruginosa очень заразна и устойчива к лечению антибиотиками, что затрудняет эффективную борьбу с ней. некоторые штаммы Pseudomonas Известно, что поражают лейкоциты различных видов млекопитающих , создавая риск для людей, крупного рогатого скота, овец и собак. ^[47]

Рыба

Хотя Pseudomonas aeruginos a, по-видимому, является патогеном, поражающим в первую очередь людей, другой штамм, известный как Pseudomonas plecoglossicida, представляет опасность для рыб. Этот штамм может вызывать отек желудка и кровотечение у рыб. ^[47]

Растения и грибы

Различные штаммы Pseudomonas признаны патогенами в царстве растений. Примечательно, что семейство Pseudomonas syringae связано с болезнями, поражающими широкий спектр сельскохозяйственных растений, причем различные штаммы демонстрируют адаптацию к конкретным видам-хозяевам. В частности, вирулентный штамм Pseudomonas tolaasii вызывает фитофтороз и деградацию съедобных видов грибов. ^[47]

Обнаружение возбудителей порчи пищевых продуктов в молоке

Одним из способов идентификации и классификации нескольких бактериальных организмов в образце является использование риботипирования. ^[48] При риботипировании из образцов, содержащих виды бактерий, выделяют хромосомную ДНК разной длины и расщепляют на фрагменты. ^[48] Подобные типы фрагментов из разных организмов визуализируются и их длины сравниваются друг с другом с помощью Саузерн-блоттинга или гораздо более быстрого метода полимеразной цепной реакции (ПЦР) . ^[48] Затем фрагменты можно сопоставить с последовательностями, обнаруженными у видов бактерий. ^[48] Показано, что риботипирование является методом выделения бактерий, способных к порче. ^[49] Около 51% бактерий Pseudomonas , обнаруженных на предприятиях по переработке молока, представляют собой P. fluorescens , при этом 69% этих изолятов обладают протеазами, липазами и лецитиназами, которые способствуют разложению компонентов молока и последующей порче. ^[49] Другие виды Pseudomonas могут обладать любой из протеаз, липаз или лецитиназ или вообще не иметь их. ^[49] Аналогичную ферментативную активность проявляют Pseudomonas одного и того же риботипа, причем каждый риботип демонстрирует различную степень порчи молока и влияет на вкус. ^[49] неферментативных видов Pseudomonas способствует порче. Количество бактерий влияет на интенсивность порчи, причем большое количество ^[49]

Порча пищевых продуктов наносит ущерб пищевой промышленности из-за образования летучих соединений организмами, метаболизирующими различные питательные вещества, содержащиеся в пищевых продуктах. ^[50] Загрязнение приводит к опасности для здоровья из-за производства токсичных соединений, а также неприятного запаха и вкуса. ^[50] Технология электронного носа позволяет быстро и непрерывно измерять микробную порчу пищевых продуктов путем определения запахов, производимых этими летучими соединениями. ^[50] Таким образом, технология электронного носа может быть применена для обнаружения следов порчи молока Pseudomonas и выделения ответственных видов Pseudomonas . ^[51] Датчик газа состоит из носовой части, состоящей из 14 модифицируемых полимерных датчиков, которые могут обнаруживать определенные продукты разложения молока, вырабатываемые микроорганизмами. ^[51] Данные датчика производятся путем изменения электрического сопротивления 14 полимеров при контакте с целевым соединением, а четыре параметра датчика можно настроить для дальнейшего уточнения реакции. ^[51] Затем ответы могут быть предварительно обработаны нейронной сетью, которая затем сможет различать микроорганизмы, вызывающие порчу молока, такие как P. fluorescens и P. aureofaciens . ^[51]

Разновидность

Pseudomonas включает следующие виды: ^[52] организованы в группы геномного сродства: ^[53]^[54]^[55]^[56]^[57]^[58]^[59]

P. aeruginosa Группа

P. aeruginosa (Schroeter 1872) 1900 чашек (утвержденные списки 1980 г.)
P. citronellolis Seubert 1960 (утвержденные списки 1980 г.)
P. delhiensis Prakash et al. 2007 год
P. denitrificans Bergey et al. 1961 год
P. jinjuensis Kwon et al. 2003 г.
P. knackmussii Stolz et al. 2007 год
P. nicosulfuronedens Li et al. 2021 год
P. nitroreducens Iizuka и Komagata 1964 (утвержденные списки 1980 г.)
P. panipatensis Gupta et al. 2008 год

P. anguilliseptica Группа

P. anguilliseptica Wakabayashi и Egusa 1972 (утвержденные списки 1980 г.)
P. Benzenivorans Lang et al. 2012 год
P. borbori Vanparys et al. 2006 г.
П. Филд Тимси и др. 2021 год
P. fourcienegasensis Escalante et al. 2009 год
П. гравий Романенко и др. 2015 год
P. guineae Bozal et al. 2007 год
P. guriensis Kim et al. 2021 год
P. lalucatii Busquets et al. 2021 год
P. leptonychotis Novákova et al. 2020 год
P. marincola Романенко и др. 2008 год
P. peli Vanparys et al. 2006 г.
P. sengitis Park et al. 2006 г.
P. taeanensis Lee et al. 2010 год
P. ullengensis Kim et al. 2021 год

P. fluorescens Группа

P. asplenii Подгруппа

P. agarici Young 1970 (утвержденные списки 1980 г.)
P. asplenii (Арк и Томпкинс, 1946 г.) Савулеску, 1947 г. (утвержденные списки, 1980 г.)
P. batumici Киприанова и др. 2011 г.
P. fuscovaginae (из Tanii et al., 1976) Miyajima et al. 1983 год
P. gingeri Cutri et al. 1984 г.
P. vanderleydeniana Girard et al. 2022 год

P. chromraphis Подгруппа

P. aurantiaca Нахимовская 1948 г. (утвержденные списки 1980 г.)
P. aureofaciens Kluyver 1956 (утвержденные списки 1980 г.)
P. chromraphis (Guignard and Sauvageau 1894) Bergey et al. 1930 г. (утвержденные списки 1980 г.)
P. piscium (Burr et al. 2010) Chen et al. 2018 год

P. corrugata Подгруппа

P. alvandae Girard et al. 2022 год
P. bijieensis Liang et al. 2021 год
P. brassicacearum Achouak et al. 2000 г.
P. canavaninivorans Hauth et al. 2022 год
P. corrugata Робертс и Скарлетт, 1981 г.
P. kilonensis Sikorski et al. 2001 г.
P. marvdashtae Girard et al. 2022 год
P. mediterranea Catara et al. 2002 г.
P. ogarae Гарридо-Санс и др. 2022 год
P. tehranensis Girard et al. 2022 год
P. thivervalensis Achouak et al. 2000 г.
P. viciae Zhao et al. 2020 год
P. zanjanensis Girard et al. 2022 год
P. zarinae Girard et al. 2022 год

P. fluorescens Подгруппа

P. allii Sawada et al. 2021 год
P. antarctica Reddy et al. 2004 г.
P. asgharzadehiana Girard et al. 2022 год
P. aylmerensis corrig. Чаганг и др. 2021 год
P. azadiae Girard et al. 2022 год
P. azotoformans Iizuka и Komagata 1963 (утвержденные списки 1980 г.)
P. canadensis Tambong et al. 2017 год
П. Карнис Лик и др. 2020 год
П. cedrina корриг. Даббусси и др. 2002 г.
P. costantinii Munsch et al. 2002 г.
P. cremoris Hofmann et al. 2021 год
P. cyclaminis Sawada et al. 2021 год
P. edaphica Рамирес-Бахена и др. 2019 год
P. extremustralis Лопес и др. 2010 год
P. extremorientalis Иванова и др. 2002 г.
P. fildesensis Павлов и др. 2020 год
P. fluorescens Migula 1895 (утвержденные списки 1980 г.)
P. fulgida Naureen et al. 2005 г.
P. grimontii Baida et al. 2002 г.
P. haemolytica Hofmann et al. 2020 год
P. kairouanensis Oueslati et al. 2020 год
P. karstica Švec et al. 2020 год
П. хавазиана Girard et al. 2022 год
P. kitaguniensis Sawada et al. 2020 год
P.lactis von Neubeck et al. 2017 год
P. салат Савада и др. 2021 год
P. libanensis Dabboussi et al. 1999 год
P. lurida Behrendt et al. 2007 год
P. Marginalis (Браун, 1918 г.) Стивенс, 1925 г. (Утвержденные списки, 1980 г.)
P. nabeulensis Oueslati et al. 2020 год
P. orientalis Dabboussi et al. 2002 г.
P. palleroniana Gardan et al. 2002 г.
P. panacis Park et al. 2005 г.
P. paracarnis Lick et al. 2021 год
P. paralactis von Neubeck et al. 2017 год
П. рыбоводство Думан и др. 2021 год
P. poae Behrendt et al. 2003 г.
P. rhodesiae Coroler et al. 1997 год
P. salmasensis Girard et al. 2022 год
P. salomonii Gardan et al. 2002 г.
P. simiae Vela et al. 2006 г.
P. sivasensis Duman et al. 2020 год
П. spelaei Швец и др. 2020 год
P. synxantha (Эренберг, 1840 г.), Голландия, 1920 г. (утвержденные списки, 1980 г.)
P. tolaasii Paine 1919 (утвержденные списки 1980 г.)
P. tritici Girard et al. 2022 год
P. trivyis Behrendt et al. 2003 г.
P. veronii Elomari et al. 1996 год
P. yamanorum Arnau et al. 2015 год

P. fragi Подгруппа

P. говядина Lick et al. 2020 год
P. deceptionensis Carrion et al. 2011 г.
P. эндофитика Рамирес-Бахена и др. 2015 год
P. fragi (Eichholz 1902) Gruber 1905 (утвержденные списки 1980 г.)
П. Хеллери фон Нойбек и др. 2016 год
P. lundensis Molin et al. 1986 год
P. paraversuta Lick et al. 2021 год
P. psychrophila Yumoto et al. 2002 г.
P. saxonica Hofmann et al. 2020 год
P. taetrolens Haynes 1957 (утвержденные списки 1980 г.)
P. versuta See-Too et al. 2017 год
P. weihenstephanensis von Neubeck et al. 2016 год

P. gessardii Подгруппа

P. brenneri Baïda et al. 2002 г.
P. gessardii Verhille et al. 1999 год
P. meridiana Reddy et al. 2004 г.
P. mucidolens Levine и Anderson 1932 (утвержденные списки 1980 г.)
P. proteolytica Reddy et al. 2004 г.
P. shahriarae Girard et al. 2022 год

P. jessenii Подгруппа

P. azerbaijanoccidentalis corrig. Жирар и др. 2022 год
P. azerbaijanorientalis corrig. Жирар и др. 2022 год
P. izuensis Lu et al. 2020 год
P. jessenii Verhille et al. 1999 год
P. laurylsulfatiphila corrig. Фурманчик и др. 2019 год
P. laurylsulfativorans corrig. Фурманчик и др. 2019 год
P. mohnii Cámara et al. 2007 год
П. Мурей Камара и др. 2007 год
P. purekei Cámara et al. 2007 год
P. umsongensis Kwon et al. 2003 г.
P. vancouverensis Mohn et al. 1999 год

P. koreensis Подгруппа

P. allokribbensis Morimoto et al. 2021 год
P. anatoliensis Duman et al. 2021 год
P. atacamensis Poblete-Morales et al. 2021 год
P. atagonensis corrig. Моримото и др. 2020 год
P. baetica López et al. 2012 год
P. Bananamidigenes Girard et al. 2021 год
P. botevensis Girard et al. 2021 год
P. crudilactis Schlusselhuber et al. 2021 год
P. ekonensis Girard et al. 2022 год
P. glecinae Jia et al. 2021 год
P. gozinkensis Morimoto et al. 2021 год
P. granadensis Pascual et al. 2015 год
P. hamedanensis Girard et al. 2022 год
P. helmanticensis Рамирес-Бахена и др. 2014 год
P. iranensis Girard et al. 2022 год
П. Ирис Думан и др. 2021 год
P. khorasanensis Girard et al. 2022 год
P. coreensis Kwon et al. 2003 г.
P. kribbensis Chang et al. 2016 год
P. monsensis Girard et al. 2022 год
P. moraviensis Tvrzová et al. 2006 г.
P. Neuropathica Duman et al. 2021 год
P. siliginis Girard et al. 2022 год
P. tensinigenes Girard et al. 2022 год
P. triticicola Girard et al. 2022 год
P. zeae Girard et al. 2022 год

P. mandelii Подгруппа

P. arsenicoxydans Campos et al. 2011 г.
П. Фаррис Жирар и др. 2022 год
P. frederiksbergensis Andersen et al. 2000 г.
P. gregormendelii Kosina et al. 2016 год
П. Лини Делорм и др. 2002 г.
P. mandelii Verhille et al. 1999 год
P. migulae Verhille et al. 1999 год
P. mucoides Duman et al. 2021 год
P. piscicola Duman et al. 2021 год
P. prosekii Kosina et al. 2014 год
P. silesiensis Kaminski et al. 2018 год

P. protegens Подгруппа

P. tide Vasconcellos et al. 2017 год
П. рыба Лю и др. 2020 год
П. защищает Раметт и др. 2012 год
P. saponiphila Lang et al. 2012 год
P. sessilinigenes Girard et al. 2021 год

неопределенное место

P. blatchfordae Блатчфорд и Шустер 1980 г.
P. kielensis Gieschler et al. 2021 год

P. linyingensis Группа

P. guangdongensis Yang et al. 2013 год
P. linyingensis He et al. 2015 год
P. oryzae Yu et al. 2013 год
P. sagittaria Lin et al. 2013 год

П. желтого Группа

P. abietaniphila Mohn et al. 1999 год
P. bohemica Саати-Сантамария и др. 2018 год
П. трава Behrendt et al. 1999 год
P. lutea Peix et al. 2004 г.

P. Massiliensis Группа

P. Massiliensis Bardet et al. 2018 год
P. typophila Peral-Aranega et al. 2021 год

P. oleovorans Группа

P. alcaliphila Yumoto et al. 2001 г.
P. chaetocerotis Girard et al.
P. chengduensis Tao et al. 2014 год
P. composti Gibello et al. 2011 г.
P. guguanensis Liu et al. 2013 год
P. Hydrolytica Zhou et al. 2020 год
P. indoloxydans Manickam et al. 2008 год
P. khazarica Tarhriz et al. 2020 год
P. mendocina Palleroni 1970 (утвержденные списки 1980 г.)
P. oleovorans Lee and Chandler 1941 (утвержденные списки 1980 г.)
P. sediminis Behera et al. 2018 год
P. sihuiensis Wu et al. 2014 год
P. toyotomiensis Hirota et al. 2011 г.

P. oryzihabitans Группа

P. asuensis Редди и Гарсия-Пишель, 2015 г.
P. duriflava Liu et al. 2008 год
P. luteola Kodama et al. 1985 год
P. oryzihabitans Kodama et al. 1985 год
P. rhizoryzae Wang et al. 2020 год

P. pohangensis Группа

P. mangrovi Ye et al. 2019 год
P. pohangensis Weon et al. 2006 г.

П. Путида Группа

P. akappaensis corrig. Моримото и др. 2020 год
P. алкилфенолика Мулет и др. 2015 год
P. alloputida Keshavarz-Tohid et al. 2020 год
P. anuradhapurensis Girard et al. 2022 год
P. arcuscaelestis Mulet et al. 2021 год
P. asiatica Tohya et al. 2019 год
P. brassicae Sawada et al. 2020 год
P. capeferrum Berendsen et al. 2015 год
P. cremoricolorata Uchino et al. 2002 г.
P. fluvii Qin et al. 2020 год
P. donghuensis Gao et al. 2015 год
P. entomophila Mulet et al. 2012 год
P. fakonensis Girard et al. 2022 год
P. Farsensis Girard et al. 2022 год
P. fulva Iizuka и Komagata 1963 (утвержденные списки 1980 г.)
P. guariconensis Toro et al. 2013 год
P. huaxiensis Qin et al. 2019 год
P. hunanensis Gao et al. 2014 год
P. hutmensis Xiang et al. 2019 год
П. неэффективный Кешаварц-Тохид и др. 2019 год
P. japonica Pungrasmi et al. 2008 год
P. juntendi Tohya et al. 2019 год
P. kermanshahensis Girard et al. 2022 год
P. kurunegalensis Girard et al. 2022 год
P. laurentiana Wright et al. 2019 год
P. maumuensis Girard et al. 2022 год
P. monteilii Elomari et al. 1997 год
P. mosselii Daboussi et al. 2002 г.
P. muyukensis Girard et al. 2022 год
P. oryzicola Girard et al. 2022 год
P. oryziphila Yang et al. 2021 год
P. palmensis Gutierrez-Albanchez et al. 2022 год
P. parafulva Uchino et al. 2002 г.
P. peradeniyensis Girard et al. 2022 год
P. persica Кешаварц-Тохид и др. 2020 год
P. plecoglossicida Nishimori et al. 2000 г.
P. promysalinigenes Girard et al. 2022
P. putida (Тревизан, 1889 г.) Мигула, 1895 г. (утвержденные списки, 1980 г.)
P. pyomelaminifaciens Chakraborty et al.
P. qingdaonensis Wang et al. 2019 год
P. reidholzensis Frasson et al. 2017 год
P. shirazensis Girard et al. 2022 год
P. shirazica Keshavarz-Tohid et al. 2020 год
P. sichuanensis Qin et al. 2019 год
P. soli Pascual et al. 2015 год
P. taiwanensis Wang et al. 2010 год
П. форель Oh et al. 2019 год
P. urmiensis Girard et al. 2022 год
P. vlassakiae Girard et al. 2021 год
P. vranovensis Tvrzová et al. 2006 г.
P. wadenswilerensis Frasson et al. 2017 год
P. wayambapalatensis Girard et al. 2021 год
P. xantholysinigenes Girard et al. 2022 год
P. xanthosomatis corrig. Жирар и др. 2022 год

П. резиноворанс Группа

P. Furukawaii Kimura et al. 2018 год
P. lalkuanensis Thorat et al. 2020 год
P. mangiferae Anurat et al. 2019 год
P. otidis Clark et al. 2006 г.
P. resinovorans Delaporte et al. 1961 г. (утвержденные списки 1980 г.)

P. rhizosphaerae Группа

P. baltica Gischler et al. 2021 год
P. coleopterorum Menéndez et al. 2015 год
P. eucalypticola Liu et al. 2021 год
P. ризосфера Peix et al. 2003 г.

P. straminea Группа

P. argentinensis Peix et al. 2005 г.
P. daroniae Bueno-Gonzalez et al. 2019 год
P. Dryadis Bueno-Gonzalez et al. 2019 год
P. flavescens Hildebrand et al. 1994 г.
P. punonensis Ramos et al. 2013 год
P. seleniipraecipitans corrig. Охотник и Мантер 2011
P. straminea corrig. Иизука и Комагата 1963 г. (утвержденные списки 1980 г.)

П. Штуцери Группа

P. azotifigens Hatayama et al. 2005 г.
P. balearica Bennasar et al. 1996 год
P. loritidismutans Wolterink et al. 2002 г.
P. kirkiae Bueno-Gonzalez et al. 2020 год
Толерантность к нитриту P. Peng et al. 2019 год
P. nosocomialis Mulet et al. 2019 год
P. saudiphocaensis Azhar et al. 2017 год
P. songnenensis Zhang et al. 2015 год
P. stutzeri (Леманн и Нейман, 1896 г.) Сидериус, 1946 г. (утвержденные списки, 1980 г.)
P. urumqiensis Zou et al. 2019 год
П. xanthomarina Романенко и др. 2005 г.
P. zhaodongensis Чжан и др. 2015 г.

P. syringae Группа

P. alliivorans Zhao et al. 2021 год
P. amygdali Psallidas и Panagopoulos 1975 (утвержденные списки 1980 г.)
P. asturiensis González et al. 2013 год
P. avellanae Janse et al. 1997 год
P. cannabina (бывший Шутич и Доусон, 1959) Gardan et al. 1999 год
P. capsici Zhao et al. 2021 год
P. caricapapayae Роббс, 1956 г. (утвержденные списки, 1980 г.)
P. caspiana Busquets et al. 2017 год
P. cerasi Kałuzna et al. 2017 год
P. cichorii (Swingle 1925) Stapp 1928 (утвержденные списки 1980 г.)
P. congelans Behrendt et al. 2003 г.
P. coronafaciens (Эллиотт, 1920) Стивенс, 1958 г.
P. ficerectae Гото 1983 г.
P. floridensis Timilsina et al. 2018 год
P. foliumensis Tambong et al. 2021 год
P. helianthi Elasri et al. 2001 г.
P. meliae Огими 1981 г.
P. ovata Rao et al. 2021 год
P. savastanoi (Janse 1982) Gardan et al. 1992 год
P. syringae van Hall 1902 (утвержденные списки 1980 г.)
P. томат Гардан и др. 1999 год
P. tremae Gardan et al. 1999 год
P. triticumensis Tambong et al. 2021 год
P. viridiflava (Буркхолдер, 1930 г.) Доусон, 1939 г. (утвержденные списки, 1980 г.)

неопределенное место

P. acephalitica Tapia-Paniagua et al. 2014 год
P. acidophila Imada et al. 1981 год
« Ca. P. adelgestsugas » von Dohlen et al. 2013 год
P. alcaligenes Monias 1928 (утвержденные списки 1980 г.)
P. alginovora Boyen et al. 1990 год
P. alkanolytica Накао и Куно 1972 г.
P. amyloderamosa Норман и Вобер, 1975 г.
P. andersonii Han et al. 2001 г.
P. Bathycetes Куигли и Колвелл, 1968 г.
P. Borealis Wilson et al. 2006 г.
P. Cavernae Zhu et al. 2022 год
P. Cavernicola Zhu et al. 2022 год
P. cellulosa Эндрюс и др. 2000 г.
P. clementa Rahman et al. 2010 год
P. coenobios Зобелл и Апхэм, 1944 г.
P.diazotropicus Watanabe et al. 1987 год
P. diterpeniphila Морган и Виндхэм, 2002 г.
P. elodea Fialho et al. 1991 год
П. эксцибис Штайнхаус
П. гибкий (Hespell 1977) Shin et al. 2016 год
P. fluvialis Судан и др. 2018 год
P. gelidicola Kadota 1951 (утвержденные списки 1980 г.)
P. guezennei Simon-Colin et al. 2008 год
P. halodenitrificans Alonso et al. 2001 г.
P. halodurans Cuhel et al. 1981 год
P. halosaccharolytica Ohno et al. 1976 год
P. halosensibilis Цзоу и Цай, 1994 г.
P. Hydrogenothermophila Goto et al. 1978 год
P. Hydrogenovora Igarashi et al. 1980 год
P. indica Pandey et al. 2002 г.
P. jinanensis Cai et al. 1989 год
P. kuykendallii Hunter and Manter 2012 г.
P. lopnurensis Mamtimin et al. 2021 год
P. lubricans Rehman et al. 2010 год
P. matsuisoli Lin et al. 2015 год
" P. melophthora Аллен и Райкер 1932 г.
P. mesoacidophila Kintaka et al. 1981 год
P. multiresinovorans Hernandez et al. 2008 год
П. пероленс Шибальский 1950 г.
P. фармакофабрика корриг. Ю и др. 2019 год
P. pratensis Zhang et al. 2021 год
П. дуб Ли и др. 2021 год
P. raguenesii Simon-Colin et al. 2009 год
P. reactans Прис и Вонг, 1982 г.
P. Reptilivora Колдуэлл и Райерсон, 1940 г.
P. rhizophila Hassen et al. 2018 год
P. rhizovicinus He et al. 2021 год
П. рубесценс Пивник 1955 г.
P. schmalbachii Shelomi et al. 2021 год
P. septica Bergey et al. 1930 год
П. Сесами Мадхайян и др. 2017 год
P.siderocapsa Фаламин и Пиневич 2006 г.
П. Суис Вудс, 1930 г.
P. tamsuii Liang et al. 2015 год
P. tarimensis Anwar et al. 2017 год
P. teessidea Rahman et al. 2010 год
P. thermocarboxydovorans Lyons et al. 1984 г.
P. thermotolerans Манайя и Мур 2002 г.
P. tianjinensis Chen et al. 2018 год
P. tohonis Yamada et al. 2021 год
P.turbellae Шринивасан 1956 г.
P. turukhanskensis Korshunova et al. 2016
P. tuticorinensis Шринивасан 1956 г.
P. wenzhouensis Zhang et al. 2021 год
P. xionganensis Zhao et al. 2020 год
P. yangonensis Tohya et al. 2020 год

Виды, ранее отнесенные к этому роду

Недавно анализ последовательности 16S рРНК переопределил таксономию многих видов бактерий, ранее отнесенных к роду Pseudomonas . ^[11] Виды, удаленные от Pseudomonas , перечислены ниже; нажатие на вид покажет его новую классификацию. Термин «псевдомонада» не применяется строго только к роду Pseudomonas и может использоваться для обозначения предыдущих представителей, таких как роды Burkholderia и Ralstonia .

протеобактерии: P. abikonensis , P.aminovorans , P.azotocolligans , P.carboxydo Hydrogena , P.compransoris P.carboxidovorans , P.diminuta , α - , P.echinoides , P.extorquens , P.lindneri , P.mesophilica , P.paucimobilis , P. radiora , P. rhodos , P. рибофлавин , P. rosea , P. vesicleis .

β-протеобактерии: P. acidovorans , P. alliicola , P. antimicrobial , P. avenae , P.butanovora , P. caryophylli , P. Cattleyae , P. cepacia , P. cocovenenans , P. delafieldii , P. facilis , P. flava , P. гладиолусы , P. glathei , P. glumae , P. huttiensis , P. indigofera , P. lanceolata , P. lemoignei , B. mallei , P. mephitica , P. mixta , P. palleronii , P. phenazinium , P . P. plantarii, P. pseudoflava, B. pseudomallei, P. pyrrocinia, P. rubrilineans, P. rubrisubalbicans, P. saccharophila, P. solanacearum, P. spinosa, P. syzygii, P. taeniospiralis, P. terrigena, П. тестостерон

γ-β протеобактерии: P.boreopolis , P.cissicola , P.geniculata , P.hibiscicola , P.maltophilia , P.pictorum .

γ-протеобактерии: P. beijerinckii , P. diminuta , P. doudoroffii , P. elongata , P. flectens , P. marinus , P. halophila , P. iners , P. marina , P. nautica , P. nigrifaciens , P. pavonacea. , ^[60] P. piscicida , P. stanieri .

δ-протеобактерии: P. formicans .

Филогенетика

были определены следующие отношения между группами геномного сродства С помощью филогенетического анализа : ^[61]^[62]

Псевдомонада

Pseudomonas fluorescens Группа

	Pseudomonas syringae Группа

	псевдомонас желтой Группа

псевдомонас путида Группа

Pseudomonas rhizosphaerae Группа

Pseudomonas Massiliensis Группа

	Pseudomonas anguilliseptica Группа

	Pseudomonas straminea Группа

Pseudomonas oleovorans Группа

	Псевдомонас флювиалис

	Pseudomonas alcaligenes

Pseudomonas pohangensis Группа

	Pseudomonas linyingensis Группа

	Псевдомонада гибкая

Псевдомонада термотолеранс

Pseudomonas stutzeri Группа

	Псевдомонас мацуизоли

	Псевдомонас куйкендаллии

Псевдомонас индийский

Pseudomonasresinivorans Группа

синегнойной палочки Группа

Pseudomonas oryzihabitans Группа

Halopseudomonas (ранее группа P. pertucinogena )

Cellvibrio japonicus (внешняя группа)

Бактериофаги

Существует ряд бактериофагов , инфицирующих Pseudomonas , например:

См. также

Коллекция культур для списка коллекций культур

Сноски

^ Чтобы облегчить изложение прозы на английском языке, названия родов можно «упрощать», чтобы сформировать просторечное название для обозначения члена рода: для рода Pseudomonas это «псевдомонада» (множественное число: «псевдомонады»), вариант неименительного падежа в греческом склонении моны , monada . ^[67] По историческим причинам представители нескольких родов, которые ранее классифицировались как виды Pseudomonas , могут называться псевдомонадами, в то время как термин «флуоресцентная псевдомонада» относится исключительно к нынешним членам рода Pseudomonas , поскольку они производят пиовердин , флуоресцентный сидерофор . ^[4]^{[ нужна страница ]} Последний термин, флуоресцентная псевдомонада, отличается от термина группа P. fluorescens , который используется для различения подмножества членов Pseudomonas sensu stricto , а не в целом.

Ссылки

^ Лалукат, Хорхе; Гомила, Маргарита; Мулет, Магдалена; Зарума, Андерсон; Гарсиа-Вальдес, Елена (2021). «Прошлое, настоящее и будущее границ рода Pseudomonas : предложение Stutzerimonas gen. nov». Syst Appl Микробиол . 45 (1): 126289. doi : 10.1016/j.syapm.2021.126289 . hdl : 10261/311157 . ПМИД 34920232 . S2CID 244943909 .
^ Парте, Эйдан К.; Сарда Карбасс, Хоаким; Мейер-Колтхофф, Ян П.; Реймер, Лоренц К.; Гёкер, Маркус (2020). «Список названий прокариот, имеющих номенклатурное положение (ЛПСН), перемещается в ДСМЗ» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 70 (11): 5607–5612. дои : 10.1099/ijsem.0.004332 . ПМЦ 7723251 . ПМИД 32701423 .
^ «Род Псевдомонас » . LPSN.dsmz.de. Проверено 4 апреля 2023 г. Частичное цитирование, см. в Parte et al., 2020. ссылку на проект
^ Перейти обратно: ^а ^б Мэдиган М; Мартинко Дж., ред. (2006). Брок Биология микроорганизмов (11-е изд.). Прентис Холл. ISBN 0-13-144329-1 .
^ Падда, Киран Прит; Пури, Акшит; Чанвей, Крис (01 ноября 2019 г.). «Эндофитная фиксация азота – возможный «скрытый» источник азота для сосен ложчатых, растущих на неутилизированных участках добычи гравия» . ФЭМС Микробиология Экология . 95 (11). дои : 10.1093/femsec/fiz172 . ISSN 0168-6496 . PMID 31647534 .
^ Падда, Киран Прит; Пури, Акшит; Чанвей, Крис П. (20 сентября 2018 г.). «Выделение и идентификация эндофитных диазотрофов из лежачих сосен, растущих на неутилизированных гравийных карьерах в центральной части Британской Колумбии, Канада». Канадский журнал лесных исследований . 48 (12): 1601–1606. doi : 10.1139/cjfr-2018-0347 . hdl : 1807/92505 . ISSN 0045-5067 . S2CID 92275030 .
^ Мигула, В. (1894) О новой системе бактерий. Arb Bacteriol Inst Карлсруэ 1: 235–238.
^ Мигула, В. (1900) Система бактерий, Том 2. Йена, Германия: Густав Фишер.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с Паллерони, Нью-Джерси (2010). «История Псевдомонады» . Экологическая микробиология . 12 (6): 1377–1383. Бибкод : 2010EnvMi..12.1377P . дои : 10.1111/j.1462-2920.2009.02041.x . ПМИД 20553550 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с Корнелис, Пьер, изд. (2008). Pseudomonas: геномика и молекулярная биология (1-е изд.). Кайстер Академик Пресс. ISBN 978-1-904455-19-6 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Анзай, Ю.; Ким, Х.; Пак, JY; Вакабаяси, Х. (2000). «Филогенетическая принадлежность псевдомонад на основе последовательности 16S рРНК». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 50 (4): 1563–89. дои : 10.1099/00207713-50-4-1563 . ПМИД 10939664 .
^ Анзай, Ёдзиро; Кудо, Юко; Ояизу, Хироши (1997). «Филогения родов Chryseomonas , Flavimonas и Pseudomonas подтверждает синонимию этих трех родов» . Международный журнал систематической бактериологии . 47 (2): 249–251. дои : 10.1099/00207713-47-2-249 . ПМИД 9103607 .
^ Ябуучи, Эйко; Косако, Ёсимаса; Ояизу, Хироши; Яно, Икуя; Хотта, Хисако; Хашимото, Ясухиро; Эзаки, Такаюки; Аракава, Мичио (1992). «Предложение Burkholderia gen. Nov. И перевод семи видов рода Pseudomonas группы гомологии II в новый род с типовым видом Burkholderia cepacia (Palleroni and Holmes 1981) comb. Nov» . Микробиология и иммунология . 36 (12): 1251–1275. дои : 10.1111/j.1348-0421.1992.tb02129.x . ПМИД 1283774 . S2CID 46648461 .
^ Ябуучи, Эйко; Косако, Ёсимаса; Яно, Икуя; Хотта, Хисако; Нисиучи, Юкико (1995). «Перенос двух видов Burkholderia и Alcaligenes в род Ralstonia. Ноябрь: Предложение о гребне Ralstonia Pickettii (Ralston, Palleroni and Doudoroff 1973). Ноябрь, гребешок Ralstonia solanacearum (Smith 1896). Ноябрь. И Ralstonia eutropa (Дэвис 1969). ." гребень . Микробиология и иммунология . 39 (11): 897–904. дои : 10.1111/j.1348-0421.1995.tb03275.x . ПМИД 8657018 . S2CID 28187828 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж Николаидис, Мариос; Моссиалос, Димитрис; Оливер, Стивен Г.; Амуциас, Григориос Д. (24 июля 2020 г.). «Сравнительный анализ основных протеомов основных эволюционных групп Pseudomonas выявляет видоспецифические адаптации Pseudomonas aeruginosa и Pseudomonas chromraphis » . Разнообразие . 12 (8): 289. дои : 10.3390/d12080289 . ISSN 1424-2818 .
^ Рихтер, Майкл; Росселло-Мора, Рамон (10 ноября 2009 г.). «Изменение золотого стандарта генома для определения видов прокариот» . Труды Национальной академии наук . 106 (45): 19126–19131. Бибкод : 2009PNAS..10619126R . дои : 10.1073/pnas.0906412106 . ISSN 0027-8424 . ПМЦ 2776425 . ПМИД 19855009 .
^ Тран, Фуонг Н.; Савка, Михаил А.; Ган, Хан Мин (12 июля 2017 г.). «Таксономическая классификация 373 геномов in silico выявляет ошибочную идентификацию видов и новые геновиды внутри рода Pseudomonas » . Границы микробиологии . 8 : 1296. дои : 10.3389/fmicb.2017.01296 . ISSN 1664-302X . ПМК 5506229 . ПМИД 28747902 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Кохорст, Джаспер Дж.; Дам, Джесси Си Джей; ван Хек, Рубен Г.А.; ван Сакченти, Эдоардо; Мартинс душ Сантос, Витор А.П.; Суарес-Диес, Мария; Шаап, Питер Дж. (06 декабря 2016 г.). «Сравнение 432 штаммов Pseudomonas посредством интеграции геномных, функциональных, метаболических и экспрессионных данных» . Научные отчеты . 6 (1): 38699. Бибкод : 2016НатСР...638699К . дои : 10.1038/srep38699 . ISSN 2045-2322 . ПМК 5138606 . ПМИД 27922098 .
^ Криг, Ноэль (1984). Руководство Берджи по систематической бактериологии, Том 1 . Балтимор: Уильямс и Уилкинс. ISBN 0-683-04108-8 .
^ Мейер, Жан-Мари; Жоффруа, Валери А.; Байда, Надер; Гардан, Луи; Изард, Дэниел; Лемансо, Филипп; Ашуак, Вафа; Паллерони, Норберто Дж. (2002). «Типирование сидерофора — мощный инструмент для идентификации флуоресцентных и нефлуоресцентных псевдомонад» . Прикладная и экологическая микробиология . 68 (6): 2745–2753. Бибкод : 2002ApEnM..68.2745M . дои : 10.1128/АЕМ.68.6.2745-2753.2002 . ПМК 123936 . ПМИД 12039729 .
^ Лау, Джи В.; Хассетт, Дэниел Дж.; Ран, Хуйминь; Конг Ф, Фаньшэн (2004). «Роль пиоцианина в инфекции Pseudomonas aeruginosa». Тенденции молекулярной медицины . 10 (12): 599–606. doi : 10.1016/j.molmed.2004.10.002 . PMID 15567330 .
^ Маттейс, Сандра; Тегерани, Курош Аббаспур; Лаус, Джордж; Джексон, Роберт В.; Купер, Ричард М.; Корнелис, Пьер (2007). «Тиохинолобактин, сидерофор Pseudomonas с противогрибковой и антипитиевой активностью». Экологическая микробиология . 9 (2): 425–434. Бибкод : 2007EnvMi...9..425M . дои : 10.1111/j.1462-2920.2006.01154.x . ПМИД 17222140 .
^ Бьелло, Дэвид (28 февраля 2008 г.). «Микробы делают снег?» . Научный американец .
^ Хассетт, Дэниел Дж.; Купполетти, Джон; Трапнелл, Брюс; Лымарь Сергей В.; и др. (2002). «Анаэробный метаболизм и определение кворума биопленками Pseudomonas aeruginosa в дыхательных путях при хроническом муковисцидозе: переосмысление стратегий лечения антибиотиками и целей применения лекарств». Обзоры расширенной доставки лекарств . 54 (11): 1425–1443. дои : 10.1016/S0169-409X(02)00152-7 . ПМИД 12458153 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Райан, Кеннет Дж.; Рэй, К. Джордж; Шеррис, Джон К., ред. (2004). Медицинская микробиология Шерриса (4-е изд.). МакГроу Хилл. ISBN 0-8385-8529-9 .
^ Ван Элдере, Йохан (февраль 2003 г.). «Многоцентровый надзор за Pseudomonas aeruginosa чувствительностью к при внутрибольничных инфекциях» . Журнал антимикробной химиотерапии . 51 (2): 347–352. дои : 10.1093/jac/dkg102 . ПМИД 12562701 .
^ Пул, К. (январь 2004 г.). «Мультирезистентность, опосредованная оттоком, у грамотрицательных бактерий» . Клиническая микробиология и инфекции . 10 (1): 12–26. дои : 10.1111/j.1469-0691.2004.00763.x . ПМИД 14706082 .
^ «Ученые открыли глину для борьбы со смертельными бактериями» . www.infoniac.com . 16 марта 2007 г. Проверено 20 ноября 2008 г.
^ Смит, Майкл (16 марта 2007 г.). «Галлий может иметь свойства, подобные антибиотикам» . МедПейдж сегодня . Архивировано из оригинала 18 сентября 2008 г.
^ Боди, Джеральд П.; Боливар, Рикардо; Файнштейн, Виктор; Джадеджа, Лина (1 марта 1983 г.). «Инфекции, вызываемые Pseudomonas aeruginosa » . Клинические инфекционные болезни . 5 (2): 279–313. дои : 10.1093/clinids/5.2.279 . ISSN 1058-4838 . ПМИД 6405475 .
^ Харди, Ким Р.; Помье, Стефани; Вильгельм, Сюзанна (2009). «Секретируемые белки Pseudomonas aeruginosa : механизмы их экспорта и как они способствуют патогенезу». Бактериальные секретируемые белки: секреторные механизмы и роль в патогенезе . Кайстер Академик Пресс. ISBN 978-1-904455-42-4 .
^ Броуди, Кэтрин Л.; Рейни, Пол Б.; Тестер, Марк; Джонстон, Кейт (1991). «Бактериальная пятнистость культивируемых грибов вызвана ионным каналом, образующим липодепсипептидный токсин». Молекулярные растительно-микробные взаимодействия . 1 (4): 407–411. дои : 10.1094/MPMI-4-407 .
^ Янг, Дж. М. (1970). «Качающиеся жабры: бактериальное заболевание культурных грибов, вызываемое Pseudomonas agarici n. sp» . Новозеландский журнал сельскохозяйственных исследований . 13 (4): 977–90. Бибкод : 1970NZJAR..13..977Y . дои : 10.1080/00288233.1970.10430530 .
^ Хаас, Дитер; Дефаго, Женевьева (2005). «Биологический контроль почвенных патогенов с помощью флуоресцентных псевдомонад». Обзоры природы Микробиология . 3 (4): 307–319. дои : 10.1038/nrmicro1129 . ПМИД 15759041 . S2CID 18469703 .
^ Чин-А-Военг ТФ; Блумберг, Гвидо В.; Малдерс, Ине Х.М.; Деккерс, Линда С.; и др. (2000). «Колонизация корня бактерией Pseudomonas chromaphis PCL1391, продуцирующей феназин-1-карбоксамид, необходима для биоконтроля ножки томата и корневой гнили» . Мол Растительный Микроб Взаимодействие . 13 (12): 1340–1345. дои : 10.1094/MPMI.2000.13.12.1340 . hdl : 1887/62881 . ПМИД 11106026 .
^ Esipov, SE; Adanin, VM; Baskunov, BP; Kiprianova, EA; et al. (1975). "Novyĭ antibioticheski aktivnyĭ florogliutsid iz Pseudomonas aurantiaca" [New antibiotically active fluoroglucide from Pseudomonas aurantiaca ]. Antibiotiki (in Russian). 20 (12): 1077–81. PMID 1225181 .
^ О'Махони, Марк М.; Добсон, Алан Д.В.; Барнс, Джереми Д.; Синглтон, Ян (2006). «Использование озона для очистки почвы, загрязненной полициклическими ароматическими углеводородами». Хемосфера . 63 (2): 307–314. Бибкод : 2006Chmsp..63..307O . doi : 10.1016/j.chemSphere.2005.07.018 . ПМИД 16153687 .
^ Йена, КМ; Карл, MR; Блатт, LM; Саймон, MJ; Зима, РБ; Фауссет, PR; Лу, ХС; Харкорт, А.А.; Чен, К.К. (1991). «Клонирование и характеристика кластера генов Pseudomonas mendocina KR1, кодирующего толуол-4-монооксигеназу» . Журнал бактериологии . 173 (17): 5315–27. дои : 10.1128/jb.173.17.5315-5327.1991 . ПМК 208241 . ПМИД 1885512 .
^ Уэртас, М.-Ж.; Люке-Альмагро, ВМ; Мартинес-Люке, М.; Бласко, Р.; Морено-Вивиан, К.; Кастильо, Ф.; Ролдан, доктор медицинских наук (2006). «Цианидный метаболизм Pseudomonas pseudoalcaligenes CECT5344: роль сидерофоров». Труды Биохимического общества . 34 (1): 152–5. дои : 10.1042/BST0340152 . ПМИД 16417508 .
^ Нодзири, Хидеаки; Маэда, Кана; Секигути, Хиройо; Урата, Масааки; Синтани, Масаки; Ёсида, Такако; Хабе, Хироши; Омори, Тосио (2002). «Организация и транскрипционная характеристика генов деградации катехолов, участвующих в деградации карбазола штаммом Pseudomonas resinovorans CA10» . Бионауки, биотехнологии и биохимия . 66 (4): 897–901. дои : 10.1271/bbb.66.897 . ПМИД 12036072 .
^ Гилани, Разия Алам; Рафик, Мажар; Рехман, Абдул; Мунис, Мухаммад Фарук Хусейн; Рехман, Шафик ур; Чаудхари, Хасан Джавед (2016). «Биодеградация хлорпирифоса бактериями рода Pseudomonas ». Журнал фундаментальной микробиологии . 56 (2): 105–119. дои : 10.1002/jobm.201500336 . ISSN 1521-4028 . ПМИД 26837064 . S2CID 1373984 .
^ Нам, И.Х.; Чанг, Ю.С.; Хонг, HB; Ли, Ю.Е. (2003). «Новая катаболическая активность Pseudomonas veronii в биотрансформации пентахлорфенола». Прикладная микробиология и биотехнология . 62 (2–3): 284–290. дои : 10.1007/s00253-003-1255-1 . ПМИД 12883877 . S2CID 31700132 .
^ Онака, Кристина; Кинингер, Мартин; Энгессер, Карл Х.; Альтенбухнер, Йозеф (май 2007 г.). «Разложение алкилметилкетонов Pseudomonas veronii » . Журнал бактериологии . 189 (10): 3759–3767. дои : 10.1128/JB.01279-06 . ЧВК 1913341 . ПМИД 17351032 .
^ Маркес, Сильвия; Рамос, Хуан Л. (1993). «Транскрипционный контроль катаболических путей плазмиды Pseudomonas putida TOL». Молекулярная микробиология . 9 (5): 923–929. дои : 10.1111/j.1365-2958.1993.tb01222.x . ПМИД 7934920 . S2CID 20663917 .
^ Сепульведа-Торрес, Лицели Дель К.; Раджендран, Нараянан; Дайбас, Майкл Дж.; Криддл, Крейг С. (1999). «Поколение и первоначальная характеристика мутантов Pseudomonas stutzeri KC с нарушенной способностью разлагать четыреххлористый углерод». Архив микробиологии . 171 (6): 424–429. Бибкод : 1999ArMic.171..424D . дои : 10.1007/s002030050729 . ПМИД 10369898 . S2CID 19916486 .
^ «Что такое синегнойная палочка ?» . ВебМД . 27 октября 2022 г. . Проверено 7 августа 2023 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с Вуд, Питер (16 марта 2021 г.). «Псевдомонада: как лечить и предотвращать в коммерческих системах водоснабжения» . Системы водоснабжения Уичвуда . Проверено 7 августа 2023 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д Дасен, SE; ЛиПума, Джей-Джей; Костман-младший; Сталл, TL (1 октября 1994 г.). «Характеристика ПЦР-риботипирования Burkholderia (Pseudomonas) cepacia» . Журнал клинической микробиологии . 32 (10): 2422–2424. doi : 10.1128/JCM.32.10.2422-2424.1994 . ISSN 0095-1137 . ПМК 264078 . ПМИД 7529239 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и Доган, Белгин; Бур, Кэтрин Дж. (1 января 2003 г.). «Генетическое разнообразие и потенциал порчи среди видов Pseudomonas, выделенных из жидких молочных продуктов и предприятий по переработке молочных продуктов» . Прикладная и экологическая микробиология . 69 (1): 130–138. Бибкод : 2003ApEnM..69..130D . дои : 10.1128/АЕМ.69.1.130-138.2003 . ISSN 0099-2240 . ПМЦ 152439 . ПМИД 12513987 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с Казалинуово, Ида А.; Ди Пьеро, Донато; Колетта, Массимилиано; Ди Франческо, Паоло (1 ноября 2006 г.). «Применение электронных носов для диагностики заболеваний и обнаружения порчи пищевых продуктов» . Датчики . 6 (11): 1428–1439. Бибкод : 2006Senso...6.1428C . дои : 10.3390/s6111428 . ПМК 3909407 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д Маган, Нареш; Павлу, Алекс; Хрисантакис, Иоаннис (5 января 2001 г.). «Чувство молока: летучая сенсорная система распознает в молоке бактерии, вызывающие порчу, и дрожжи». Датчики и исполнительные механизмы B: Химические вещества . 72 (1): 28–34. дои : 10.1016/S0925-4005(00)00621-3 .
^ Pseudomonas в LPSN ; Парте, Эйдан К.; Сарда Карбасс, Хоаким; Мейер-Колтхофф, Ян П.; Реймер, Лоренц К.; Гёкер, Маркус (1 ноября 2020 г.). «Список названий прокариот, имеющих номенклатурное положение (ЛПСН), перемещается в ДСМЗ» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 70 (11): 5607–5612. дои : 10.1099/ijsem.0.004332 .
^ Анзай, Ю; Ким, Х; Пак, JY; Вакабаяси, Х; Ояизу, Х (2000). «Филогенетическая принадлежность псевдомонад по последовательности 16S рРНК» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 50 (4): 1563–1589. дои : 10.1099/00207713-50-4-1563 . ISSN 1466-5034 . ПМИД 10939664 .
^ Джун, Се-Ран; Вассенаар, Труди М.; Нукаев, Интават; Хаузер, Лорен; Ванчай, Висану; Земля, Мириам; Тимм, Коллин М.; Лу, Цзе-Юань С.; Шадт, Кристофер В.; Доктыч, Митчел Дж.; Пеллетье, Дейл А.; Ассери, Дэвид В. (2016). «Разнообразие геномов Pseudomonas, включая изоляты, связанные с Populus, по данным сравнительного анализа генома» . Прикладная и экологическая микробиология . 82 (1): 375–383. Бибкод : 2016ApEnM..82..375J . дои : 10.1128/АЕМ.02612-15 . ISSN 0099-2240 . ПМЦ 4702629 . ПМИД 26519390 .
^ Мулет, Магдалена; Лалукат, Хорхе; Гарсиа-Вальдес, Елена (2010). «Анализ последовательностей ДНК видов Pseudomonas ». Экологическая микробиология . 12 (6): 1513–30. Бибкод : 2010EnvMi..12.1513M . дои : 10.1111/j.1462-2920.2010.02181.x . ПМИД 20192968 .
^ Мулет, Магдалена; Гомила, Маргарита; Скотта, Клаудия; Санчес, Дэвид; Лалукат, Хорхе; Гарсиа-Вальдес, Елена (2012). «Соответствие между времяпролетной масс-спектрометрией с лазерной десорбцией / ионизацией цельноклеточной матрицы и подходами к анализу многолокусных последовательностей в различении видов внутри рода Pseudomonas» . Систематическая и прикладная микробиология . 35 (7): 455–464. дои : 10.1016/j.syapm.2012.08.007 . ISSN 0723-2020 . ПМИД 23140936 .
^ Гомила, Маргарита; Пенья, Арантча; Мулет, Магдалена; Лалукат, Хорхе; Гарсиа-Вальдес, Елена (2015). «Филогеномика и систематика Pseudomonas» . Границы микробиологии . 6 : 214. дои : 10.3389/fmicb.2015.00214 . ISSN 1664-302X . ПМЦ 4447124 . ПМИД 26074881 .
^ Гессен, Кедр; Шульц, Фредерик; Булл, Кэроли Т.; Шаффер, Бренда Т.; Ян, Цин; Шапиро, Николь; Хасан, Карл А.; Варгезе, Неха; Эльбурн, Лиам Д.Х.; Полсен, Ян Т.; Кирпид, Никос; Войке, Таня; Лопер, Джойс Э. (2018). «Геномная эволюционная история видов Pseudomonas » . Экологическая микробиология . 20 (6): 2142–2159. Бибкод : 2018EnvMi..20.2142H . дои : 10.1111/1462-2920.14130 . ISSN 1462-2912 . ОСТИ 1529110 . ПМИД 29633519 . S2CID 4737911 .
^ Жирар, Леа; Лоод, Седрик; Хёфте, Моника; Вандам, Питер; Рокни-Заде, Хасан; ван Ноорт, Вера; Лавин, Роб; Де Мот, Рене (2021). «Постоянно расширяющийся род Pseudomonas : описание 43 новых видов и разделение группы Pseudomonas putida » . Микроорганизмы . 9 (8): 1766. doi : 10.3390/microorganisms9081766 . ISSN 2076-2607 . ПМК 8401041 . ПМИД 34442845 .
^ Ван Ландшут, А.; Россау, Р.; Де Лей, Дж. (1986). «Внутри- и межродовые сходства цистронов рибосомальных рибонуклеиновых кислот Acinetobacter » . Международный журнал систематической бактериологии . 36 (2): 150. дои : 10.1099/00207713-36-2-150 .
^ Жирар Л., Луд К., Хёфте М., Вандам П., Рокни-Заде Х., ван Ноорт В., Лавин Р., Де Мот Р. (2021). «Постоянно расширяющийся род Pseudomonas : описание 43 новых видов и разделение группы Pseudomonas putida » . Микроорганизмы . 9 (8): 1766. doi : 10.3390/microorganisms9081766 . ПМК 8401041 . ПМИД 34442845 .
^ Йи Б, Далпке АХ. (2022). «Возврат к внутриродовой структуре рода Pseudomonas с использованием полной информации о последовательностях всего генома: понимание разнообразия и генетических детерминант, связанных с патогенами» . Заразить Генет Эвол . 97 : 105183. doi : 10.1016/j.meegid.2021.105183 . ПМИД 34920102 . S2CID 245180021 . Обратите внимание, что дерево в этой ссылке имеет ту же топологию, но выглядит по-другому, поскольку у него нет корней.
^ Перейти обратно: ^а ^б Хертвельдт, К.; Лавин, Р.; Плетенева Е.; Сернова Н.; Курочкина Л. ; Корчевский Р.; Роббен, Дж.; Месянжинов В.; Крылов В.Н.; Волкарт, Г. (2005). «Сравнение геномов крупных фагов Pseudomonas aeruginosa » (PDF) . Журнал молекулярной биологии . 354 (3): 536–545. дои : 10.1016/j.jmb.2005.08.075 . ПМИД 16256135 . Архивировано из оригинала (PDF) 0 марта 2016 г. Проверено 2 августа 2015 г.
^ Лавин, Роб; Нобен, Жан-Поль; Хертвельдт, Кирстен; Джейсенс, Питер-Ян; Бриерс, Ив; Дюмон, Дебора; Рукур, Барт; Крылов Виктор Н.; Месянжинов Вадим Владимирович; Роббен, Йохан; Волкарт, Гвидо (2006). «Структурный протеом бактериофага Pseudomonas aeruginosa φKMV» . Микробиология . 152 (2): 529–534. дои : 10.1099/mic.0.28431-0 . ISSN 1465-2080 . ПМИД 16436440 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Цейсенс, Питер-Ян; Лавин, Роб; Маттеус, Уэсли; Чибеу, Эндрю; Хертвельдт, Кирстен; Маст, Ян; Роббен, Йохан; Волкарт, Гвидо (2006). «Геномный анализ фагов Pseudomonas aeruginosa LKD16 и LKA1: создание подгруппы φKMV в супергруппе T7» . Журнал бактериологии . 188 (19): 6924–6931. дои : 10.1128/JB.00831-06 . ISSN 0021-9193 . ПМК 1595506 . ПМИД 16980495 .
^ Ли, Люси Ф.; Боэзи, Дж. А. (1966). «Характеристика бактериофага gh-1 Pseudomonas putida » . Журнал бактериологии . 92 (6). Американское общество микробиологии: 1821–1827 гг. дои : 10.1128/JB.92.6.1821-1827.1966 . ПМК 316266 . ПМИД 5958111 .
^ Бьюкенен, Р.Э. (1955). «Таксономия». Ежегодный обзор микробиологии . 9 : 1–20. дои : 10.1146/annurev.mi.09.100155.000245 . ПМИД 13259458 .

Внешние ссылки

Общий

Pseudomonas – причина мирового дождя и снега
Псевдомонады выживают в ядерном реакторе
псевдомонад База данных геномов
Псевдомонада
о флуоресцентных псевдомонадах Видео

[name-10] Чтобы облегчить изложение прозы на английском языке, названия родов можно «упрощать», чтобы сформировать просторечное название для обозначения члена рода: для рода Pseudomonas это «псевдомонада» (множественное число: «псевдомонады»), вариант неименительного падежа в греческом склонении моны , monada . ^[67] По историческим причинам представители нескольких родов, которые ранее классифицировались как виды Pseudomonas , могут называться псевдомонадами, в то время как термин «флуоресцентная псевдомонада» относится исключительно к нынешним членам рода Pseudomonas , поскольку они производят пиовердин , флуоресцентный сидерофор . ^[4]^{[ нужна страница ]} Последний термин, флуоресцентная псевдомонада, отличается от термина группа P. fluorescens , который используется для различения подмножества членов Pseudomonas sensu stricto , а не в целом.

[1] Лалукат, Хорхе; Гомила, Маргарита; Мулет, Магдалена; Зарума, Андерсон; Гарсиа-Вальдес, Елена (2021). «Прошлое, настоящее и будущее границ рода Pseudomonas : предложение Stutzerimonas gen. nov». Syst Appl Микробиол . 45 (1): 126289. doi : 10.1016/j.syapm.2021.126289 . hdl : 10261/311157 . ПМИД 34920232 . S2CID 244943909 .

[2] Парте, Эйдан К.; Сарда Карбасс, Хоаким; Мейер-Колтхофф, Ян П.; Реймер, Лоренц К.; Гёкер, Маркус (2020). «Список названий прокариот, имеющих номенклатурное положение (ЛПСН), перемещается в ДСМЗ» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 70 (11): 5607–5612. дои : 10.1099/ijsem.0.004332 . ПМЦ 7723251 . ПМИД 32701423 .

[3] «Род Псевдомонас » . LPSN.dsmz.de. Проверено 4 апреля 2023 г. Частичное цитирование, см. в Parte et al., 2020. ссылку на проект

[Brock-4] Перейти обратно: ^а ^б Мэдиган М; Мартинко Дж., ред. (2006). Брок Биология микроорганизмов (11-е изд.). Прентис Холл. ISBN 0-13-144329-1 .

[5] Падда, Киран Прит; Пури, Акшит; Чанвей, Крис (01 ноября 2019 г.). «Эндофитная фиксация азота – возможный «скрытый» источник азота для сосен ложчатых, растущих на неутилизированных участках добычи гравия» . ФЭМС Микробиология Экология . 95 (11). дои : 10.1093/femsec/fiz172 . ISSN 0168-6496 . PMID 31647534 .

[6] Падда, Киран Прит; Пури, Акшит; Чанвей, Крис П. (20 сентября 2018 г.). «Выделение и идентификация эндофитных диазотрофов из лежачих сосен, растущих на неутилизированных гравийных карьерах в центральной части Британской Колумбии, Канада». Канадский журнал лесных исследований . 48 (12): 1601–1606. doi : 10.1139/cjfr-2018-0347 . hdl : 1807/92505 . ISSN 0045-5067 . S2CID 92275030 .

[:0-7] Мигула, В. (1894) О новой системе бактерий. Arb Bacteriol Inst Карлсруэ 1: 235–238.

[migula-8] Мигула, В. (1900) Система бактерий, Том 2. Йена, Германия: Густав Фишер.

[palleroni-9] Перейти обратно: ^а ^б ^с Паллерони, Нью-Джерси (2010). «История Псевдомонады» . Экологическая микробиология . 12 (6): 1377–1383. Бибкод : 2010EnvMi..12.1377P . дои : 10.1111/j.1462-2920.2009.02041.x . ПМИД 20553550 .

[Cornelis-11] Перейти обратно: ^а ^б ^с Корнелис, Пьер, изд. (2008). Pseudomonas: геномика и молекулярная биология (1-е изд.). Кайстер Академик Пресс. ISBN 978-1-904455-19-6 .

[Anzai2000-12] Перейти обратно: ^а ^б Анзай, Ю.; Ким, Х.; Пак, JY; Вакабаяси, Х. (2000). «Филогенетическая принадлежность псевдомонад на основе последовательности 16S рРНК». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 50 (4): 1563–89. дои : 10.1099/00207713-50-4-1563 . ПМИД 10939664 .

[13] Анзай, Ёдзиро; Кудо, Юко; Ояизу, Хироши (1997). «Филогения родов Chryseomonas , Flavimonas и Pseudomonas подтверждает синонимию этих трех родов» . Международный журнал систематической бактериологии . 47 (2): 249–251. дои : 10.1099/00207713-47-2-249 . ПМИД 9103607 .

[14] Ябуучи, Эйко; Косако, Ёсимаса; Ояизу, Хироши; Яно, Икуя; Хотта, Хисако; Хашимото, Ясухиро; Эзаки, Такаюки; Аракава, Мичио (1992). «Предложение Burkholderia gen. Nov. И перевод семи видов рода Pseudomonas группы гомологии II в новый род с типовым видом Burkholderia cepacia (Palleroni and Holmes 1981) comb. Nov» . Микробиология и иммунология . 36 (12): 1251–1275. дои : 10.1111/j.1348-0421.1992.tb02129.x . ПМИД 1283774 . S2CID 46648461 .

[15] Ябуучи, Эйко; Косако, Ёсимаса; Яно, Икуя; Хотта, Хисако; Нисиучи, Юкико (1995). «Перенос двух видов Burkholderia и Alcaligenes в род Ralstonia. Ноябрь: Предложение о гребне Ralstonia Pickettii (Ralston, Palleroni and Doudoroff 1973). Ноябрь, гребешок Ralstonia solanacearum (Smith 1896). Ноябрь. И Ralstonia eutropa (Дэвис 1969). ." гребень . Микробиология и иммунология . 39 (11): 897–904. дои : 10.1111/j.1348-0421.1995.tb03275.x . ПМИД 8657018 . S2CID 28187828 .

[Nikolaidis2020-16] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж Николаидис, Мариос; Моссиалос, Димитрис; Оливер, Стивен Г.; Амуциас, Григориос Д. (24 июля 2020 г.). «Сравнительный анализ основных протеомов основных эволюционных групп Pseudomonas выявляет видоспецифические адаптации Pseudomonas aeruginosa и Pseudomonas chromraphis » . Разнообразие . 12 (8): 289. дои : 10.3390/d12080289 . ISSN 1424-2818 .

[17] Рихтер, Майкл; Росселло-Мора, Рамон (10 ноября 2009 г.). «Изменение золотого стандарта генома для определения видов прокариот» . Труды Национальной академии наук . 106 (45): 19126–19131. Бибкод : 2009PNAS..10619126R . дои : 10.1073/pnas.0906412106 . ISSN 0027-8424 . ПМЦ 2776425 . ПМИД 19855009 .

[18] Тран, Фуонг Н.; Савка, Михаил А.; Ган, Хан Мин (12 июля 2017 г.). «Таксономическая классификация 373 геномов in silico выявляет ошибочную идентификацию видов и новые геновиды внутри рода Pseudomonas » . Границы микробиологии . 8 : 1296. дои : 10.3389/fmicb.2017.01296 . ISSN 1664-302X . ПМК 5506229 . ПМИД 28747902 .

[Koehorst2016-19] Перейти обратно: ^а ^б Кохорст, Джаспер Дж.; Дам, Джесси Си Джей; ван Хек, Рубен Г.А.; ван Сакченти, Эдоардо; Мартинс душ Сантос, Витор А.П.; Суарес-Диес, Мария; Шаап, Питер Дж. (06 декабря 2016 г.). «Сравнение 432 штаммов Pseudomonas посредством интеграции геномных, функциональных, метаболических и экспрессионных данных» . Научные отчеты . 6 (1): 38699. Бибкод : 2016НатСР...638699К . дои : 10.1038/srep38699 . ISSN 2045-2322 . ПМК 5138606 . ПМИД 27922098 .

[Bergey_1984-20] Криг, Ноэль (1984). Руководство Берджи по систематической бактериологии, Том 1 . Балтимор: Уильямс и Уилкинс. ISBN 0-683-04108-8 .

[Meyer_2002-21] Мейер, Жан-Мари; Жоффруа, Валери А.; Байда, Надер; Гардан, Луи; Изард, Дэниел; Лемансо, Филипп; Ашуак, Вафа; Паллерони, Норберто Дж. (2002). «Типирование сидерофора — мощный инструмент для идентификации флуоресцентных и нефлуоресцентных псевдомонад» . Прикладная и экологическая микробиология . 68 (6): 2745–2753. Бибкод : 2002ApEnM..68.2745M . дои : 10.1128/АЕМ.68.6.2745-2753.2002 . ПМК 123936 . ПМИД 12039729 .

[Lau_2004-22] Лау, Джи В.; Хассетт, Дэниел Дж.; Ран, Хуйминь; Конг Ф, Фаньшэн (2004). «Роль пиоцианина в инфекции Pseudomonas aeruginosa». Тенденции молекулярной медицины . 10 (12): 599–606. doi : 10.1016/j.molmed.2004.10.002 . PMID 15567330 .

[Matthijs_2007-23] Маттейс, Сандра; Тегерани, Курош Аббаспур; Лаус, Джордж; Джексон, Роберт В.; Купер, Ричард М.; Корнелис, Пьер (2007). «Тиохинолобактин, сидерофор Pseudomonas с противогрибковой и антипитиевой активностью». Экологическая микробиология . 9 (2): 425–434. Бибкод : 2007EnvMi...9..425M . дои : 10.1111/j.1462-2920.2006.01154.x . ПМИД 17222140 .

[24] Бьелло, Дэвид (28 февраля 2008 г.). «Микробы делают снег?» . Научный американец .

[Hassett_2002-25] Хассетт, Дэниел Дж.; Купполетти, Джон; Трапнелл, Брюс; Лымарь Сергей В.; и др. (2002). «Анаэробный метаболизм и определение кворума биопленками Pseudomonas aeruginosa в дыхательных путях при хроническом муковисцидозе: переосмысление стратегий лечения антибиотиками и целей применения лекарств». Обзоры расширенной доставки лекарств . 54 (11): 1425–1443. дои : 10.1016/S0169-409X(02)00152-7 . ПМИД 12458153 .

[Sherris-26] Перейти обратно: ^а ^б Райан, Кеннет Дж.; Рэй, К. Джордж; Шеррис, Джон К., ред. (2004). Медицинская микробиология Шерриса (4-е изд.). МакГроу Хилл. ISBN 0-8385-8529-9 .

[27] Ван Элдере, Йохан (февраль 2003 г.). «Многоцентровый надзор за Pseudomonas aeruginosa чувствительностью к при внутрибольничных инфекциях» . Журнал антимикробной химиотерапии . 51 (2): 347–352. дои : 10.1093/jac/dkg102 . ПМИД 12562701 .

[28] Пул, К. (январь 2004 г.). «Мультирезистентность, опосредованная оттоком, у грамотрицательных бактерий» . Клиническая микробиология и инфекции . 10 (1): 12–26. дои : 10.1111/j.1469-0691.2004.00763.x . ПМИД 14706082 .

[29] «Ученые открыли глину для борьбы со смертельными бактериями» . www.infoniac.com . 16 марта 2007 г. Проверено 20 ноября 2008 г.

[30] Смит, Майкл (16 марта 2007 г.). «Галлий может иметь свойства, подобные антибиотикам» . МедПейдж сегодня . Архивировано из оригинала 18 сентября 2008 г.

[31] Боди, Джеральд П.; Боливар, Рикардо; Файнштейн, Виктор; Джадеджа, Лина (1 марта 1983 г.). «Инфекции, вызываемые Pseudomonas aeruginosa » . Клинические инфекционные болезни . 5 (2): 279–313. дои : 10.1093/clinids/5.2.279 . ISSN 1058-4838 . ПМИД 6405475 .

[Hardie-32] Харди, Ким Р.; Помье, Стефани; Вильгельм, Сюзанна (2009). «Секретируемые белки Pseudomonas aeruginosa : механизмы их экспорта и как они способствуют патогенезу». Бактериальные секретируемые белки: секреторные механизмы и роль в патогенезе . Кайстер Академик Пресс. ISBN 978-1-904455-42-4 .

[Brodey_1991-33] Броуди, Кэтрин Л.; Рейни, Пол Б.; Тестер, Марк; Джонстон, Кейт (1991). «Бактериальная пятнистость культивируемых грибов вызвана ионным каналом, образующим липодепсипептидный токсин». Молекулярные растительно-микробные взаимодействия . 1 (4): 407–411. дои : 10.1094/MPMI-4-407 .

[Young_1970-34] Янг, Дж. М. (1970). «Качающиеся жабры: бактериальное заболевание культурных грибов, вызываемое Pseudomonas agarici n. sp» . Новозеландский журнал сельскохозяйственных исследований . 13 (4): 977–90. Бибкод : 1970NZJAR..13..977Y . дои : 10.1080/00288233.1970.10430530 .

[35] Хаас, Дитер; Дефаго, Женевьева (2005). «Биологический контроль почвенных патогенов с помощью флуоресцентных псевдомонад». Обзоры природы Микробиология . 3 (4): 307–319. дои : 10.1038/nrmicro1129 . ПМИД 15759041 . S2CID 18469703 .

[36] Чин-А-Военг ТФ; Блумберг, Гвидо В.; Малдерс, Ине Х.М.; Деккерс, Линда С.; и др. (2000). «Колонизация корня бактерией Pseudomonas chromaphis PCL1391, продуцирующей феназин-1-карбоксамид, необходима для биоконтроля ножки томата и корневой гнили» . Мол Растительный Микроб Взаимодействие . 13 (12): 1340–1345. дои : 10.1094/MPMI.2000.13.12.1340 . hdl : 1887/62881 . ПМИД 11106026 .

[37] Esipov, SE; Adanin, VM; Baskunov, BP; Kiprianova, EA; et al. (1975). "Novyĭ antibioticheski aktivnyĭ florogliutsid iz Pseudomonas aurantiaca" [New antibiotically active fluoroglucide from Pseudomonas aurantiaca ]. Antibiotiki (in Russian). 20 (12): 1077–81. PMID 1225181 .

[O-38] О'Махони, Марк М.; Добсон, Алан Д.В.; Барнс, Джереми Д.; Синглтон, Ян (2006). «Использование озона для очистки почвы, загрязненной полициклическими ароматическими углеводородами». Хемосфера . 63 (2): 307–314. Бибкод : 2006Chmsp..63..307O . doi : 10.1016/j.chemSphere.2005.07.018 . ПМИД 16153687 .

[Yen_1991-39] Йена, КМ; Карл, MR; Блатт, LM; Саймон, MJ; Зима, РБ; Фауссет, PR; Лу, ХС; Харкорт, А.А.; Чен, К.К. (1991). «Клонирование и характеристика кластера генов Pseudomonas mendocina KR1, кодирующего толуол-4-монооксигеназу» . Журнал бактериологии . 173 (17): 5315–27. дои : 10.1128/jb.173.17.5315-5327.1991 . ПМК 208241 . ПМИД 1885512 .

[Huertas_2006-40] Уэртас, М.-Ж.; Люке-Альмагро, ВМ; Мартинес-Люке, М.; Бласко, Р.; Морено-Вивиан, К.; Кастильо, Ф.; Ролдан, доктор медицинских наук (2006). «Цианидный метаболизм Pseudomonas pseudoalcaligenes CECT5344: роль сидерофоров». Труды Биохимического общества . 34 (1): 152–5. дои : 10.1042/BST0340152 . ПМИД 16417508 .

[Nojiri_2002-41] Нодзири, Хидеаки; Маэда, Кана; Секигути, Хиройо; Урата, Масааки; Синтани, Масаки; Ёсида, Такако; Хабе, Хироши; Омори, Тосио (2002). «Организация и транскрипционная характеристика генов деградации катехолов, участвующих в деградации карбазола штаммом Pseudomonas resinovorans CA10» . Бионауки, биотехнологии и биохимия . 66 (4): 897–901. дои : 10.1271/bbb.66.897 . ПМИД 12036072 .

[42] Гилани, Разия Алам; Рафик, Мажар; Рехман, Абдул; Мунис, Мухаммад Фарук Хусейн; Рехман, Шафик ур; Чаудхари, Хасан Джавед (2016). «Биодеградация хлорпирифоса бактериями рода Pseudomonas ». Журнал фундаментальной микробиологии . 56 (2): 105–119. дои : 10.1002/jobm.201500336 . ISSN 1521-4028 . ПМИД 26837064 . S2CID 1373984 .

[43] Нам, И.Х.; Чанг, Ю.С.; Хонг, HB; Ли, Ю.Е. (2003). «Новая катаболическая активность Pseudomonas veronii в биотрансформации пентахлорфенола». Прикладная микробиология и биотехнология . 62 (2–3): 284–290. дои : 10.1007/s00253-003-1255-1 . ПМИД 12883877 . S2CID 31700132 .

[44] Онака, Кристина; Кинингер, Мартин; Энгессер, Карл Х.; Альтенбухнер, Йозеф (май 2007 г.). «Разложение алкилметилкетонов Pseudomonas veronii » . Журнал бактериологии . 189 (10): 3759–3767. дои : 10.1128/JB.01279-06 . ЧВК 1913341 . ПМИД 17351032 .

[Marqués_1993-45] Маркес, Сильвия; Рамос, Хуан Л. (1993). «Транскрипционный контроль катаболических путей плазмиды Pseudomonas putida TOL». Молекулярная микробиология . 9 (5): 923–929. дои : 10.1111/j.1365-2958.1993.tb01222.x . ПМИД 7934920 . S2CID 20663917 .

[46] Сепульведа-Торрес, Лицели Дель К.; Раджендран, Нараянан; Дайбас, Майкл Дж.; Криддл, Крейг С. (1999). «Поколение и первоначальная характеристика мутантов Pseudomonas stutzeri KC с нарушенной способностью разлагать четыреххлористый углерод». Архив микробиологии . 171 (6): 424–429. Бибкод : 1999ArMic.171..424D . дои : 10.1007/s002030050729 . ПМИД 10369898 . S2CID 19916486 .

[47] «Что такое синегнойная палочка ?» . ВебМД . 27 октября 2022 г. . Проверено 7 августа 2023 г.

[Wood2021-48] Перейти обратно: ^а ^б ^с Вуд, Питер (16 марта 2021 г.). «Псевдомонада: как лечить и предотвращать в коммерческих системах водоснабжения» . Системы водоснабжения Уичвуда . Проверено 7 августа 2023 г.

[Dasen1-49] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д Дасен, SE; ЛиПума, Джей-Джей; Костман-младший; Сталл, TL (1 октября 1994 г.). «Характеристика ПЦР-риботипирования Burkholderia (Pseudomonas) cepacia» . Журнал клинической микробиологии . 32 (10): 2422–2424. doi : 10.1128/JCM.32.10.2422-2424.1994 . ISSN 0095-1137 . ПМК 264078 . ПМИД 7529239 .

[Dogan1-50] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и Доган, Белгин; Бур, Кэтрин Дж. (1 января 2003 г.). «Генетическое разнообразие и потенциал порчи среди видов Pseudomonas, выделенных из жидких молочных продуктов и предприятий по переработке молочных продуктов» . Прикладная и экологическая микробиология . 69 (1): 130–138. Бибкод : 2003ApEnM..69..130D . дои : 10.1128/АЕМ.69.1.130-138.2003 . ISSN 0099-2240 . ПМЦ 152439 . ПМИД 12513987 .

[Casalinuovo1-51] Перейти обратно: ^а ^б ^с Казалинуово, Ида А.; Ди Пьеро, Донато; Колетта, Массимилиано; Ди Франческо, Паоло (1 ноября 2006 г.). «Применение электронных носов для диагностики заболеваний и обнаружения порчи пищевых продуктов» . Датчики . 6 (11): 1428–1439. Бибкод : 2006Senso...6.1428C . дои : 10.3390/s6111428 . ПМК 3909407 .

[Magan1-52] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д Маган, Нареш; Павлу, Алекс; Хрисантакис, Иоаннис (5 января 2001 г.). «Чувство молока: летучая сенсорная система распознает в молоке бактерии, вызывающие порчу, и дрожжи». Датчики и исполнительные механизмы B: Химические вещества . 72 (1): 28–34. дои : 10.1016/S0925-4005(00)00621-3 .

[LPSN-53] Pseudomonas в LPSN ; Парте, Эйдан К.; Сарда Карбасс, Хоаким; Мейер-Колтхофф, Ян П.; Реймер, Лоренц К.; Гёкер, Маркус (1 ноября 2020 г.). «Список названий прокариот, имеющих номенклатурное положение (ЛПСН), перемещается в ДСМЗ» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 70 (11): 5607–5612. дои : 10.1099/ijsem.0.004332 .

[54] Анзай, Ю; Ким, Х; Пак, JY; Вакабаяси, Х; Ояизу, Х (2000). «Филогенетическая принадлежность псевдомонад по последовательности 16S рРНК» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 50 (4): 1563–1589. дои : 10.1099/00207713-50-4-1563 . ISSN 1466-5034 . ПМИД 10939664 .

[55] Джун, Се-Ран; Вассенаар, Труди М.; Нукаев, Интават; Хаузер, Лорен; Ванчай, Висану; Земля, Мириам; Тимм, Коллин М.; Лу, Цзе-Юань С.; Шадт, Кристофер В.; Доктыч, Митчел Дж.; Пеллетье, Дейл А.; Ассери, Дэвид В. (2016). «Разнообразие геномов Pseudomonas, включая изоляты, связанные с Populus, по данным сравнительного анализа генома» . Прикладная и экологическая микробиология . 82 (1): 375–383. Бибкод : 2016ApEnM..82..375J . дои : 10.1128/АЕМ.02612-15 . ISSN 0099-2240 . ПМЦ 4702629 . ПМИД 26519390 .

[56] Мулет, Магдалена; Лалукат, Хорхе; Гарсиа-Вальдес, Елена (2010). «Анализ последовательностей ДНК видов Pseudomonas ». Экологическая микробиология . 12 (6): 1513–30. Бибкод : 2010EnvMi..12.1513M . дои : 10.1111/j.1462-2920.2010.02181.x . ПМИД 20192968 .

[57] Мулет, Магдалена; Гомила, Маргарита; Скотта, Клаудия; Санчес, Дэвид; Лалукат, Хорхе; Гарсиа-Вальдес, Елена (2012). «Соответствие между времяпролетной масс-спектрометрией с лазерной десорбцией / ионизацией цельноклеточной матрицы и подходами к анализу многолокусных последовательностей в различении видов внутри рода Pseudomonas» . Систематическая и прикладная микробиология . 35 (7): 455–464. дои : 10.1016/j.syapm.2012.08.007 . ISSN 0723-2020 . ПМИД 23140936 .

[58] Гомила, Маргарита; Пенья, Арантча; Мулет, Магдалена; Лалукат, Хорхе; Гарсиа-Вальдес, Елена (2015). «Филогеномика и систематика Pseudomonas» . Границы микробиологии . 6 : 214. дои : 10.3389/fmicb.2015.00214 . ISSN 1664-302X . ПМЦ 4447124 . ПМИД 26074881 .

[59] Гессен, Кедр; Шульц, Фредерик; Булл, Кэроли Т.; Шаффер, Бренда Т.; Ян, Цин; Шапиро, Николь; Хасан, Карл А.; Варгезе, Неха; Эльбурн, Лиам Д.Х.; Полсен, Ян Т.; Кирпид, Никос; Войке, Таня; Лопер, Джойс Э. (2018). «Геномная эволюционная история видов Pseudomonas » . Экологическая микробиология . 20 (6): 2142–2159. Бибкод : 2018EnvMi..20.2142H . дои : 10.1111/1462-2920.14130 . ISSN 1462-2912 . ОСТИ 1529110 . ПМИД 29633519 . S2CID 4737911 .

[60] Жирар, Леа; Лоод, Седрик; Хёфте, Моника; Вандам, Питер; Рокни-Заде, Хасан; ван Ноорт, Вера; Лавин, Роб; Де Мот, Рене (2021). «Постоянно расширяющийся род Pseudomonas : описание 43 новых видов и разделение группы Pseudomonas putida » . Микроорганизмы . 9 (8): 1766. doi : 10.3390/microorganisms9081766 . ISSN 2076-2607 . ПМК 8401041 . ПМИД 34442845 .

[61] Ван Ландшут, А.; Россау, Р.; Де Лей, Дж. (1986). «Внутри- и межродовые сходства цистронов рибосомальных рибонуклеиновых кислот Acinetobacter » . Международный журнал систематической бактериологии . 36 (2): 150. дои : 10.1099/00207713-36-2-150 .

[Girard-62] Жирар Л., Луд К., Хёфте М., Вандам П., Рокни-Заде Х., ван Ноорт В., Лавин Р., Де Мот Р. (2021). «Постоянно расширяющийся род Pseudomonas : описание 43 новых видов и разделение группы Pseudomonas putida » . Микроорганизмы . 9 (8): 1766. doi : 10.3390/microorganisms9081766 . ПМК 8401041 . ПМИД 34442845 .

[63] Йи Б, Далпке АХ. (2022). «Возврат к внутриродовой структуре рода Pseudomonas с использованием полной информации о последовательностях всего генома: понимание разнообразия и генетических детерминант, связанных с патогенами» . Заразить Генет Эвол . 97 : 105183. doi : 10.1016/j.meegid.2021.105183 . ПМИД 34920102 . S2CID 245180021 . Обратите внимание, что дерево в этой ссылке имеет ту же топологию, но выглядит по-другому, поскольку у него нет корней.

[Hertveldt-64] Перейти обратно: ^а ^б Хертвельдт, К.; Лавин, Р.; Плетенева Е.; Сернова Н.; Курочкина Л. ; Корчевский Р.; Роббен, Дж.; Месянжинов В.; Крылов В.Н.; Волкарт, Г. (2005). «Сравнение геномов крупных фагов Pseudomonas aeruginosa » (PDF) . Журнал молекулярной биологии . 354 (3): 536–545. дои : 10.1016/j.jmb.2005.08.075 . ПМИД 16256135 . Архивировано из оригинала (PDF) 0 марта 2016 г. Проверено 2 августа 2015 г.

[65] Лавин, Роб; Нобен, Жан-Поль; Хертвельдт, Кирстен; Джейсенс, Питер-Ян; Бриерс, Ив; Дюмон, Дебора; Рукур, Барт; Крылов Виктор Н.; Месянжинов Вадим Владимирович; Роббен, Йохан; Волкарт, Гвидо (2006). «Структурный протеом бактериофага Pseudomonas aeruginosa φKMV» . Микробиология . 152 (2): 529–534. дои : 10.1099/mic.0.28431-0 . ISSN 1465-2080 . ПМИД 16436440 .

[:1-66] Перейти обратно: ^а ^б Цейсенс, Питер-Ян; Лавин, Роб; Маттеус, Уэсли; Чибеу, Эндрю; Хертвельдт, Кирстен; Маст, Ян; Роббен, Йохан; Волкарт, Гвидо (2006). «Геномный анализ фагов Pseudomonas aeruginosa LKD16 и LKA1: создание подгруппы φKMV в супергруппе T7» . Журнал бактериологии . 188 (19): 6924–6931. дои : 10.1128/JB.00831-06 . ISSN 0021-9193 . ПМК 1595506 . ПМИД 16980495 .

[Lee-67] Ли, Люси Ф.; Боэзи, Дж. А. (1966). «Характеристика бактериофага gh-1 Pseudomonas putida » . Журнал бактериологии . 92 (6). Американское общество микробиологии: 1821–1827 гг. дои : 10.1128/JB.92.6.1821-1827.1966 . ПМК 316266 . ПМИД 5958111 .

[68] Бьюкенен, Р.Э. (1955). «Таксономия». Ежегодный обзор микробиологии . 9 : 1–20. дои : 10.1146/annurev.mi.09.100155.000245 . ПМИД 13259458 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[примечание 1]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]

[18]

[19]

[20]

[21]

[22]

[23]

[24]

[25]

[26]

[27]

[28]

[29]

[30]

[31]

[32]

[33]

[34]

[35]

[36]

[37]

[38]

[39]

[40]

[41]

[42]

[43]

[44]

[45]

[46]

[47]

[48]

[49]

[50]

[51]

[52]

[53]

[54]

[55]

[56]

[57]

[58]

[59]

[60]

[61]

[62]

[63]

[64]

[65]

[66]

[67]