Ацинетобактер
Acinetobacter — род грамотрицательных бактерий , принадлежащий к более широкому классу гаммапротеобактерий . Acinetobacter Виды оксидазоотрицательны , обладают подергивающейся подвижностью . [7] и встречаются парами под увеличением.
Они являются важными почвенными организмами , где способствуют минерализации , например, ароматических соединений . Виды Acinetobacter являются ключевым источником инфекции у ослабленных пациентов в больнице, в частности вид Acinetobacter baumannii .
Описание
[ редактировать ]Виды рода Acinetobacter являются строго аэробными , неферментативными , грамотрицательными бациллами . они демонстрируют преимущественно коккобациллярную На неселективном агаре морфологию. В жидких средах, особенно в ранний период роста, преобладают палочки. [ нужна ссылка ]
Морфология видов Acinetobacter может весьма варьировать в клинических образцах человека, окрашенных по Граму, и ее нельзя использовать для дифференциации Acinetobacter от других распространенных причин инфекции. [ нужна ссылка ]
Большинство штаммов Acinetobacter , за исключением некоторых штаммов A. lwoffii , хорошо растут на агаре МакКонки (без соли). Хотя официально они классифицируются как неферментирующие лактозу, при выращивании на агаре МакКонки они часто ферментируют лактозу частично. Они оксидазо -отрицательные, каталазо-положительные, индол-отрицательные, неподвижные и обычно нитрат -отрицательные. [ нужна ссылка ]
Известно, что бактерии рода Acinetobacter образуют внутриклеточные включения полигидроксиалканоатов при определенных условиях окружающей среды (например, при недостатке таких элементов, как фосфор, азот или кислород, в сочетании с избыточным поступлением источников углерода). [ нужна ссылка ]
Этимология
[ редактировать ]Ацинетобактер — сложное слово научного греческого [α + κίνητο + βακτηρ(ία)], означающее неподвижный стержень. Первый элемент акинето- появляется как несколько причудливый перевод греческой морфемы ακίνητο-, которая обычно транслитерируется в английском языке как акинето- , но на самом деле происходит из французского cinetique и была заимствована непосредственно в английском языке. [ нужна ссылка ] Тем не менее, французское слово также происходит от греческого приватива α + κίνησις (движение), подтверждающего то же происхождение, но иного пути.
Таксономия
[ редактировать ]Род Acinetobacter включает 38 достоверно названных видов. [8]
Идентификация
[ редактировать ]Идентификация видов Acinetobacter осложнена отсутствием стандартных методов идентификации. Первоначально идентификация основывалась на фенотипических характеристиках, таких как температура роста, морфология колоний , среда для выращивания, источники углерода, гидролиз желатина, ферментация глюкозы и другие. Этот метод позволил идентифицировать A.calcoaceticus–A. baumannii путем образования гладких, округлых, слизистой колоний при 37 °С. Близкородственные виды не могли быть дифференцированы, а отдельные виды, такие как A. baumannii и геномный вид 3 Acinetobacter, не могли быть идентифицированы фенотипически. [ нужна ссылка ]
Поскольку рутинная идентификация в клинической микробиологической лаборатории пока невозможна, изоляты Acinetobacter разделены и сгруппированы в три основных комплекса: [ нужна ссылка ]
- Комплекс Acinetobacter Calcoaceticus-baumannii : негемолитический препарат, окисляющий глюкозу ( A. baumannii можно идентифицировать типированием OXA-51)
- Acinetobacter lwoffii : глюкозо-отрицательный негемолитический препарат.
- Acinetobacter haemolyticus : гемолитический
Различные виды бактерий этого рода можно идентифицировать с помощью флуоресценции-денитрификации лактозы, чтобы определить количество кислоты, вырабатываемой в метаболизма глюкозы результате . Другим надежным идентификационным тестом на уровне рода является анализ трансформации хромосомной ДНК. В этом анализе естественно компетентный триптофан- ауксотрофный мутант Acinetobacter baylyi (BD4 trpE27) трансформируется тотальной ДНК предполагаемого изолята Acinetobacter , и трансформационную смесь высеивают на агар с инфузией мозга и сердца. Затем ростки собирают после инкубации в течение 24 часов при 30 °C, высевают на минимальный агар Acinetobacter (AMA) и инкубируют при 30 °C в течение 108 часов. Рост на АМА указывает на положительный анализ трансформации и подтверждает принадлежность изолята к роду Acinetobacter . E. coli HB101 и A.calcoaceticus MTCC1921T можно использовать в качестве отрицательного и положительного контроля соответственно. [9]
Некоторые из молекулярных методов, используемых для идентификации видов, включают повторяющуюся ПЦР на основе экстрагенных палиндромных последовательностей, риботипирование, гель-электрофорез в импульсном поле (PFGE), случайную амплифицированную полиморфную ДНК, полиморфизм длин амплифицированных фрагментов (AFLP), рестрикцию и анализ последовательностей тРНК и 16S- Спейсеры генов 23S рРНК и рестрикционный анализ амплифицированной рибосомальной ДНК 16S (ARDRA). PFGE, AFLP и ARDRA являются проверенными распространенными методами, используемыми сегодня из-за их различительной способности. Однако самые последние методы включают мультилокусное типирование последовательностей, мультилокусную ПЦР и масс-спектрометрию с ионизацией электрораспылением, которые основаны на амплификации высококонсервативных генов «домашнего хозяйства» и могут использоваться для изучения генетического родства между различными изолятами. [10]
среда обитания
[ редактировать ]Виды Acinetobacter широко распространены в природе и обычно встречаются в почве и воде. [11] Их способность выживать на влажных и сухих поверхностях, а также выдерживать воздействие различных распространенных дезинфицирующих средств позволяет некоторым видам Acinetobacter выживать в больничных условиях. [11] Кроме того, виды Acinetobacter могут расти в широком диапазоне температур, что позволяет им выживать в самых разных средах. [11]
Клиническое значение
[ редактировать ]Acinetobacter часто выделяется при внутрибольничных инфекциях и особенно распространен в отделениях интенсивной терапии , где как спорадические случаи, так и эпидемические и эндемические распространены случаи. A. baumannii является частой причиной внутрибольничной пневмонии с поздним началом , особенно вентилятор-ассоциированной пневмонии . Он может вызывать различные другие инфекции, включая инфекции кожи и ран, бактериемию и менингит , но A. lwoffi . за последний ответственен преимущественно [ нужна ссылка ]
Из Acinetobacter A. baumannii является основной причиной заболеваний человека, поскольку он участвует в ряде внутрибольничных инфекций, таких как бактериемия, инфекции мочевыводящих путей (ИМП), вторичный менингит, инфекционный эндокардит, а также раневые и ожоговые инфекции. [12] В частности, A. baumannii часто выделяют как причину внутрибольничной пневмонии среди пациентов, поступивших в отделения интенсивной терапии . Факторы риска включают длительную интубацию и аспирацию из трахеи или легких. В большинстве случаев вентилятор-ассоциированной пневмонии оборудование, используемое для искусственной вентиляции легких, такое как эндотрахеальные трубки или бронхоскопы, служит источником инфекции и приводит к колонизации нижних дыхательных путей A. baumannii . В некоторых случаях бактерии могут попасть в кровоток, что приводит к бактериемии с уровнем смертности от 32% до 52%. ИМП, вызванные A. baumannii, по-видимому, связаны с постоянной катетеризацией, а также с терапией антибиотиками. A. baumannii Сообщалось также, что инфицирует кожу и мягкие ткани при травматических повреждениях и послеоперационных ранах. A. baumannii обычно инфицирует ожоги и может приводить к осложнениям из-за трудностей в лечении и ликвидации. Хотя это и менее распространено, некоторые данные также связывают эту бактерию с менингитом, чаще всего после инвазивного хирургического вмешательства, и, в очень редких случаях, с внебольничным первичным менингитом, при котором большинство жертв были детьми. [13] Сообщения о случаях заболевания также связывают A. baumannii с эндокардитом, кератитом, перитонитом и, очень редко, с фатальным неонатальным сепсисом. [14]
Клиническое значение A. baumannii частично обусловлено его способностью развивать устойчивость ко многим доступным антибиотикам. Сообщения показывают, что он обладает устойчивостью к цефалоспоринам широкого спектра действия , β-лактамным антибиотикам , аминогликозидам и хинолонам . об устойчивости к карбапенемам . Все чаще сообщается [15] [16] A. baumannii может сохраняться на коже человека или сухих поверхностях в течение нескольких недель и устойчив к различным дезинфицирующим средствам, что делает его особенно легким для распространения в больничных условиях. [17] Гены устойчивости к антибиотикам часто передаются в плазмидах, а плазмиды, присутствующие в штаммах Acinetobacter, могут передаваться другим патогенным бактериям путем горизонтального переноса генов . [ нужна ссылка ]
У здоровых людей наличие колоний Acinetobacter на коже коррелирует с низкой частотой возникновения аллергии ; [18] Acinetobacter защищает от аллергии. Считается, что [19]
Уход
[ редактировать ]Виды Acinetobacter врожденно устойчивы ко многим классам антибиотиков, включая пенициллин , хлорамфеникол и часто аминогликозиды . устойчивости к фторхинолонам Сообщалось о развитии во время терапии, что также приводило к повышению устойчивости к другим классам лекарств, опосредованному активным оттоком лекарств . о резком увеличении устойчивости к антибиотикам у штаммов Acinetobacter (CDC) сообщили Центры по контролю и профилактике заболеваний , а карбапенемы признаны золотым стандартом и средством последней инстанции. [20] Виды Acinetobacter необычны тем, что они чувствительны к сульбактаму , который обычно используется для ингибирования бактериальной бета-лактамазы, но это пример антибактериальных свойств самого сульбактама. [21] Недавно сульбактам-дурлобактам, новая антибактериальная комбинация, проходящая фазу 3 испытаний, продемонстрировала хорошую активность in vitro также против устойчивых к карбапенемам A. baumannii (чувствительность 92%). изолятов [22]
В ноябре 2004 года Центры по контролю и профилактике заболеваний сообщили о росте числа инфекций кровотока, вызванных A. baumannii , у пациентов в военных медицинских учреждениях, где проходили лечение военнослужащие, получившие ранения в Ирака / Кувейта регионе во время операции «Свобода Ирака» и в Афганистане во время операции «Несокрушимая свобода» . [23] Большинство из них имели множественную лекарственную устойчивость. Среди одного набора изолятов из Армейского медицинского центра Уолтера Рида 13 (35%) были чувствительны только к имипенему , а два (4%) были устойчивы ко всем протестированным препаратам. Один противомикробный агент, колистин (полимиксин Е), использовался для лечения инфекций, вызванных A. baumannii с множественной лекарственной устойчивостью ; однако тестирование чувствительности к противомикробным препаратам колистина на изолятах, описанных в этом отчете, не проводилось. Поскольку A. baumannii могут выживать на сухих поверхностях до 20 дней, они представляют высокий риск распространения и заражения в больницах, потенциально подвергая пациентов с ослабленным иммунитетом и других пациентов риску заражения лекарственно-устойчивыми инфекциями, которые часто смертельны и, как правило, дорогостоящи. обращаться. Были задокументированы испытания по внедрению вакцин для предотвращения инфекций Acinetobacter. [24] [25]
Сообщения показывают, что эта бактерия восприимчива к фаготерапии . [26]
антисмысловые олигомеры, подавляющие гены, в форме, называемой пептид-конъюгированными фосфородиамидатными морфолиноолигомерами Сообщалось также, что , ингибируют рост в тестах, проведенных на животных, инфицированных устойчивым к антибиотикам A. baumannii . [27] [28]
Сульбактам/дурлобактам (Xacduro) был одобрен для медицинского применения в США в мае 2023 года. [29]
Асептическая техника
[ редактировать ]Частота внутрибольничных инфекций в британских больницах побудила Национальную службу здравоохранения провести исследование эффективности анионов для очистки воздуха, обнаружив, что повторные воздушно-капельные инфекции Acinetobacter в палате устраняются установкой отрицательного ионизатора воздуха — уровень заражения упал до нуля. [30]
Естественная трансформация
[ редактировать ]Бактериальная трансформация включает перенос ДНК от донора к бактерии-реципиенту через промежуточную жидкую среду. Бактерии-реципиенты должны сначала войти в особое физиологическое состояние, называемое способностью получать донорскую ДНК. Способность A.calcoaceticus к естественной трансформации индуцируют путем разведения стационарной культуры в свежей питательной среде. [31] Компетенция постепенно теряется при длительном экспоненциальном росте и на период после входа в стационарное состояние. Поглощенная ДНК может быть использована для восстановления повреждений ДНК или в качестве средства обмена генетической информацией путем горизонтального переноса генов. [31] Естественная трансформация A. Calcoaceticus может защитить от воздействия повреждающих ДНК условий в естественной среде этих бактерий, как, по-видимому, и в случае с другими видами бактерий, способными к трансформации. [32]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Перейти обратно: а б с д и ж г час я дж к л м н тот п д р с т в v В х и С аа аб Парте, АЦ «Ацинетобактер» . ЛПСН .
- ^ « Acinetobacter oryzae ANC 4261 – Проект» . Онлайн-база данных геномов (GOLD) . Объединенный институт генома (JGI) . Проверено 6 мая 2021 г.
- ^ «Информация – Acinetobacter oryzae ANC 4261» . Объединенного института генома Геномный портал . Проверено 6 мая 2021 г.
- ^ «Браузер таксономии ( Acinetobacter oryzae )» . Браузер таксономии NCBI . Проверено 6 мая 2021 г.
- ^ «Виды: Acinetobacter oryzae » . LPSN ( Список названий прокариот, стоящих в номенклатуре ) . ДСМЗ ( Немецкая коллекция микроорганизмов и клеточных культур ) . Проверено 6 мая 2021 г.
- ^ [2] [3] [4] [5]
- ^ Битриан, Мариана; Гонсалес, Родриго Х.; Пэрис, Гастон; Хеллингверф, Клаас Дж.; Нудель, Клара Б. (1 сентября 2013 г.). «Зависимое от синего света ингибирование подергивающейся моторики у Acinetobacter baylyi ADP1: аддитивное участие трех белков, содержащих BLUF-домен» . Микробиология . 159 (Часть 9): 1828–1841. дои : 10.1099/mic.0.069153-0 . HDL : 11336/6600 . ISSN 1465-2080 . ПМИД 23813679 . S2CID 42820743 .
- ^ Виска П., Зайферт Х., Таунер К.Дж. (декабрь 2011 г.). «Ацинетобактерная инфекция – новая угроза здоровью человека» . ИУБМБ Жизнь . 63 (12): 1048–54. дои : 10.1002/iub.534 . ПМИД 22006724 . S2CID 45593914 .
- ^ Рохбахш-Замин, Ф.; Сачдев, Д.П.; Каземи-Пур, Н.; Инженер А.; Зинжарде, СС; Дакепхалкар, ПК; Чопаде, бакалавр (2012). «Характеристика свойств, способствующих росту растений, у видов Acinetobacter, выделенных из ризосферы Pennisetum glaucum». J Микробиол Биотехнология . 21 (6): 556–566. дои : 10.4014/jmb.1012.12006 . ПМИД 21715961 .
- ^ Устойчивость к антибиотикам является основным фактором риска эпидемического поведения Acinetobacter baumannii. Инфекционный контроль Хосп Эпидемиол 2001; 22:284–288.
- ^ Перейти обратно: а б с Дугари Х.Дж.; Ндакидеми, Пенсильвания; Человеческая ИС; Бенаде С. (2011). «Экология, биология и патогенез видов Acinetobacter: обзор» . Микробы и окружающая среда . 26 (2): 101–112. дои : 10.1264/jsme2.me10179 . ПМИД 21502736 .
- ^ Дент Лемюэль, Л; Маршалл, ДР; Пратап, С; Юлетт, РБ (2010). «Множественная лекарственная устойчивость Acinetobacter baumannii: описательное исследование в городской больнице» . BMC заразить дис . 10 :196. дои : 10.1186/1471-2334-10-196 . ПМК 2909240 . ПМИД 20609238 .
- ^ Зигман-Игра, Ю; Бар-Йосеф, С; Горя, А; Аврам, Дж (1993). «Нозокомиальный ацинетобактерный менингит, вторичный по отношению к инвазивным процедурам: отчет о 25 случаях и обзор». Клин Инфекционный Дис . 17 (5): 843–849. дои : 10.1093/clinids/17.5.843 . ПМИД 8286623 .
- ^ Фалагас, Мэн; Карвели, Е.А.; Келесидис, я; Келесидис, Т (2007). «Внебольничные инфекции Acinetobacter». Eur J Clin Microbiol Infect Dis . 26 (12): 857–868. дои : 10.1007/s10096-007-0365-6 . ПМИД 17701432 . S2CID 25898468 .
- ^ Ху, Кью; Ху, З; Ли, Дж; Тиан, Б; Сюй, Х; Ли, Дж (2011). «Обнаружение карбапенемаз и интегронов OXA-типа среди устойчивых к карбапенемам Acinetobactor baumannii в клинической больнице в Китае» . J Базовая микробиол . 51 (5): 467–472. дои : 10.1002/jobm.201000402 . ПМИД 21656808 . S2CID 10955468 .
- ^ Фурнье, Пьер Эдуард; Рише, Х (2006). «Эпидемиология и борьба с Acinetobacter baumannii в медицинских учреждениях» . Клин Инфекционный Дис . 42 (5): 692–699. дои : 10.1086/500202 . ПМИД 16447117 .
- ^ Пелег А.Ю.; Зейферт Х; Патерсон Д.Л. (июль 2008 г.). « Acinetobacter baumannii : появление успешного патогена» . Обзоры клинической микробиологии . 21 (3): 538–582. дои : 10.1128/CMR.00058-07 . ПМК 2493088 . ПМИД 18625687 .
- ^ Хански, И.; Фон Герцен, Л.; Фирквист, Н.; Коскинен, К.; Торппа, К.; Лаатикайнен, Т.; Карисола, П.; Аувинен, П.; Полин, Л.; Макела, MJ; Вартиайнен, Э.; Косунен, ТУ; Алениус, Х.; Хаахтела, Т. (2012). «Биоразнообразие окружающей среды, микробиота человека и аллергия взаимосвязаны» . Труды Национальной академии наук . 109 (21): 8334–8339. Бибкод : 2012PNAS..109.8334H . дои : 10.1073/pnas.1205624109 . ПМЦ 3361383 . ПМИД 22566627 .
- ^ Дебарри, Дж.; Ханушкевич А.; Штейн, К.; Холст, О.; Хейне, Х. (2009). «Аллергозащитные свойства Acinetobacter lwoffii F78 придают его липополисахарид». Аллергия . 65 (6): 690–697. дои : 10.1111/j.1398-9995.2009.02253.x . ПМИД 19909295 . S2CID 28194712 .
- ^ Рахал Дж (2006). «Новые комбинации антибиотиков против инфекций, вызываемых почти полностью устойчивыми видами Pseudomonas aeruginosa и Acinetobacter » . Клин Инфекционный Дис . 43 (Приложение 2): С95–9. дои : 10.1086/504486 . ПМИД 16894522 .
- ^ Вуд Г.К., Ханс С.Д., Кроче М.А., Фабиан Т.К., Баугер Б.А. (2002). «Сравнение ампициллина-сульбактама и имипенема-циластатина для лечения ацинетобактерной вентилятор-ассоциированной пневмонии» . Клин Инфекционный Дис . 34 (11): 1425–30. дои : 10.1086/340055 . ПМИД 12015687 .
- ^ Сегаторе, Бернадетт; Пиччирилли, Алессандра; Керубини, Сабрина; Принц, Луи; Останься, Джованни; Меццатеста, Мария Лина; Салмери, Марио; Ди Белла, Стефано; Мильявакка, Роберта; Площадь, Аврора; Мерони, Элиза; Фази, Паоло; Визаджо, Даниэла; Виска, Паоло; Кортаццо, Венера (22 августа 2022 г.). «Активность сульбактама-дурлобактама in vitro против устойчивых к карбапенемам клинических изолятов Acinetobacter baumannii: многоцентровый отчет из Италии» . Антибиотики . 11 (8): 1136. doi : 10.3390/antibiotics11081136 . ISSN 2079-6382 . ПМЦ 9404735 . ПМИД 36010006 .
- ^ Центры по контролю и профилактике заболеваний (2004 г.). « Инфекции Acinetobacter baumannii среди пациентов военных медицинских учреждений, лечащих раненых военнослужащих США, 2002-2004 гг.». MMWR Morb Mortal Wkly Rep . 53 (45): 1063–6. ПМИД 15549020 .
- ^ Ахмад Т.А., Тауфик Д.М., Шевейта С.А., Харун М., Эль-Сайед Л.Х. (2016). «Разработка исследований иммунизации против Acinetobacter baumannii» . Исследования в вакцинологии . 5 : 53–60. дои : 10.1016/j.trivac.2016.03.001 .
- ^ Тауфик Д.М., Ахмад Т.А., Шевейта С.А., Харун М., Эль-Сайед Л.Х. (2017). «Выявление антигенных детерминант Acinetobacter baumannii» . Письма по иммунологии . 186 : 59–67. дои : 10.1016/j.imlet.2017.04.004 . ПМИД 28427887 .
- ^ Мацузаки С., Рашель М., Утияма Дж. и др. (октябрь 2005 г.). «Бактериофаготерапия: обновленная терапия против бактериальных инфекционных заболеваний». Дж. Заразить. Чематер . 11 (5): 211–9. дои : 10.1007/s10156-005-0408-9 . ПМИД 16258815 . S2CID 8107934 .
- ^ Геллер Б.Л., Маршалл-Бэтти К., Шнелл Ф.Дж. и др. (октябрь 2013 г.). «Антисмысловые олигомеры, подавляющие гены, ингибируют рост Acinetobacter in vitro и in vivo. J. Infect. Болезни».
{{cite journal}}: Для цитирования журнала требуется|journal=( помощь ) - ^ «Помимо антибиотиков: PPMO предлагают новый подход к бактериальной инфекции» . 15 октября 2013 г. Проверено 15 октября 2013 г.
- ^ «FDA одобрило новое лечение пневмонии, вызванной некоторыми трудноизлечимыми бактериями» . Управление по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США (пресс-релиз). 24 мая 2023 г. Проверено 24 мая 2023 г.
В данную статью включен текст из этого источника, находящегося в свободном доступе .
- ^ «Ионизаторы воздуха уничтожают больничные инфекции» . Новый учёный . Проверено 30 августа 2006 г.
- ^ Перейти обратно: а б Палмен Р., Восман Б., Буйсман П., Брик К.К., Хеллингверф К.Дж. (февраль 1993 г.). «Физиологическая характеристика естественной трансформации Acinetobacter Calcoaceticus» . Дж. Генерал Микробиол . 139 (2): 295–305. дои : 10.1099/00221287-139-2-295 . ПМИД 8436948 .
- ^ Мишод Р.Э., Бернштейн Х., Недельку А.М. (май 2008 г.). «Адаптационное значение пола у микробных патогенов». Заразить. Жене. Эвол . 8 (3): 267–85. дои : 10.1016/j.meegid.2008.01.002 . ПМИД 18295550 . http://www.hummingbirds.arizona.edu/Faculty/Michod/Downloads/IGE%20review%20sex.pdf
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- К.Дж. Таунер; Э. Бергонь-Березен; Калифорния Фьюсон (30 июня 1991 г.). Биология Acinetobacter: таксономия, клиническое значение, молекулярная биология, физиология, промышленная значимость (серия симпозиумов FEMS) . Спрингер. ISBN 0306439026 .
- Дунъю Лю (13 апреля 2011 г.). Молекулярное обнаружение бактериальных патогенов человека (1-е изд.). Crc Pr Inc. ISBN 978-1439812389 .
- Дунъю Лю (1 марта 2013 г.). Микробиология болезней, передающихся через воду: микробиологические аспекты и риски (2-е изд.). Академическая пресса. ISBN 978-0124158467 .
- Нарцисо-Да-Роча, К.; Ваз-Морейра, И.; Свенссон-Стадлер, Л.; Мур, Еврорадио; Манайя, CLM (2012). «Разнообразие и устойчивость к антибиотикам видов Acinetobacter в воде от источника до крана» . Прикладная микробиология и биотехнология . 97 (1): 329–340. дои : 10.1007/s00253-012-4190-1 . hdl : 10400.14/10027 . ПМИД 22669636 . S2CID 323861 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]
- Альянс за разумное использование антибиотиков
- Ацинетобактер sp. Страница генома ADP1
- CycSim: метаболическая модель Acinetobacter baylyi adp1 (на английском языке)
| Базы данных органов управления : Национальные |
|---|
