Стенотрофомонас
| Стенотрофомонас | |
|---|---|
| Научная классификация | |
| Домен: | |
| Тип: | |
| Сорт: | |
| Заказ: | |
| Семья: | |
| Род: | Стенотрофомонас Паллерони и Брэдбери, 1993 г.
|
| Разновидность | |
|
С. ацидаминифила | |
Стенотрофомонады — род бактерий грамотрицательных . [ 2 ] включает не менее десяти видов. Основными резервуарами Stenotropomonas являются почва и растения. [ 3 ] Виды Stenotropomonas варьируются от обычных почвенных организмов ( S. nitritireducens ) до условно-патогенных микроорганизмов человека ( S.maltophilia ); молекулярная систематика рода до сих пор неясна. [ 4 ]
Важность
[ редактировать ]Самый распространенный вид, S.maltophilia , очень универсален и может быть полезен для роста и здоровья растений, может использоваться в сельском хозяйстве, биоконтроле, стратегиях биоремедиации и фиторемедиации, а также для производства биомолекул, имеющих экономическую ценность. [ 3 ] С другой стороны, некоторые штаммы S.maltophilia патогенны для человека с профилем множественной лекарственной устойчивости . [ 3 ] S. indologenes также может вызывать или быть частью полимикробных инфекций у людей, особенно у маленьких детей. [ 5 ] Stenotropomonas также могут быть фитопатогенными в отличие от близкородственных родов Xylella и Xanthomonas . [ 3 ] Представители рода Stenotropomonas играют важную экологическую роль в круговоротах азота и серы. Stenotropomonas Виды , особенно S.maltophilia и S.rhizophila , часто встречаются в сочетании с такими растениями, как огурец, рапс, картофель, клубника, люцерна, подсолнечник, кукуруза, рис, пшеница, различные сорняки, ива и тополь. Стенотрофомонады могут быть выделены из ризосферы или внутренних тканей растений, особенно из сосудистых тканей корня и стебля. [ 3 ]
История
[ редактировать ]Первым видом, описанным Хью и Рыщенко, был S.maltophila в 1961 году. В то время он назывался Pseudomonasmaltophilia , но позже был переведен в род Xanthomonas, прежде чем ему был выделен собственный род. Название рода (от греческого «стенос», что означает узкий, «трофус», что означает «тот, кто питается», и «монас», что означает единица) было призвано подчеркнуть ограниченный диапазон питательных веществ бактерии. Однако впоследствии несколько исследований показали, что этот род обладает большой метаболической универсальностью и внутривидовой гетерогенностью. [ 3 ] [ 2 ]
Генетика
[ редактировать ]полные геномные последовательности изолята из окружающей среды S.maltophilia R551-3 и клинического изолята S.maltophilia K279a. Доступны [ 3 ] Оба штамма содержат гены, кодирующие пили типа I , которые участвуют в адгезии и ранних стадиях образования биопленок, и пили типа IV , которые участвуют в адгезии, аутоагрегации, подергивающейся подвижности и образовании биопленок . Консервативное распределение кластеров генов, кодирующих пили, в секвенированных геномах может указывать на сходство стратегий колонизации растений и животных. [ 3 ] Идентификация видов Stenotropomonas . является проблематичным, поскольку эти бактерии не проявляют активности в большинстве стандартных панелей фенотипирования, основанных на метаболизме. Кроме того, виды генотипически схожи: сходство последовательностей генов 16S рРНК составляет 95,7–99,6%. Один из генов домашнего хозяйства gyrB, кодирующий B-субъединицу ДНК-гиразы, успешно использован для типирования. [ 6 ] [ 7 ] Более того, сравнение последовательностей gyrB показывает, что штаммы, идентифицированные как S.maltophilia, могут представлять собой отдельные новые виды. [ 7 ]
Обнаружено, что в геноме Stenotropomonasmaltophilia широко распространены мелкие палиндромные элементы, несущие на одном конце тетрануклеотид GTAG . Повторы представляют собой видоспецифичные варианты суперсемейства повторяющихся экстрагенных палиндромов (REP). Эти повторы непосредственно фланкируют сотни генов, и они, вероятно, функционируют как контрольные последовательности РНК за счет сворачивания повторов в мРНК и либо стабилизируя вышестоящие транскрипты, либо способствуя их деградации. [ 8 ]
Метаболизм
[ редактировать ]Виды Stenotropomonas . могут эффективно колонизировать такие различные биотопы, как растения, люди и морская среда. Виды Stenotropomonas . метаболизируют широкий спектр органических соединений, присутствующих в ризосфере, включая фенольные соединения, обнаруженные в корневых экссудатах растений. S.maltophilia способна разлагать п -нитрофенол и 4-хлорфенол, полициклические ароматические углеводороды , соединения селена, бензол, толуол, этилбензол и ксенобиотики. Виды Stenotropomonas . производит гормон роста растений индол-3-уксусную кислоту (IAA), он также может стимулировать рост растений за счет фиксации азота и окисления элементарной серы, которая, в свою очередь, обеспечивает растения сульфатами. Многие штаммы S.maltophilia обладают внутренней устойчивостью к различным тяжелым металлам. [ 3 ] Большинство изолятов S.maltophilia продуцируют противогрибковые соединения, такие как мальтофилин и ксантобакцин, или летучие органические соединения с противогрибковой активностью. Штаммы S.maltophilia обладают чрезвычайно высоким гидролитическим потенциалом; они продуцируют разнообразные протеазы, хитиназы, глюканазы, ДНКазы, РНКазы, липазы и лакказы. [ 3 ] S.maltophilia приспособлены для поглощения железа, поскольку они продуцируют сидерофор энтеробактин и многие TonB-зависимые рецепторы (TBDR), используемые для активного транспорта комплексов железо-сидерофор. [ 3 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Перейти обратно: а б с д и ж г час я дж к Часть, АК «Стенотрофомонас» . ЛПСН .
- ^ Перейти обратно: а б Паллерони Н., Брэдбери Дж. (1993). «Stenotropomonas, новый род бактерий Xanthomonasmaltophilia (Хью, 1980), Swings et al., 1983» . Int J Syst Bacteriol . 43 (3): 606–9. дои : 10.1099/00207713-43-3-606 . ПМИД 8347518 .
- ^ Перейти обратно: а б с д и ж г час я дж к Райан, Роберт П.; Монши, Себастьен; Кардинале, Массимилиано; Тагави, Сафий; Кроссман, Лиза; Ависон, Мэтью Б.; Берг, Габриэле; ван дер Лели, Дэниел; Доу, Дж. Максвелл (2009). «Универсальность и адаптация бактерий рода Stenotropomonas» . Обзоры природы Микробиология . 7 (7): 514–525. дои : 10.1038/nrmicro2163 . ISSN 1740-1526 . ПМИД 19528958 .
- ^ Хаубен Л., Вотерен Л., Мур Э., Хост Б., Свингс Дж. (1999). «Геномное разнообразие рода Stenotropomonas» . Int J Syst Bacteriol . 49 (4): 1749–60. дои : 10.1099/00207713-49-4-1749 . ПМИД 10555357 .
- ^ Айкач, Кубра; Озсурекчи, Ясемин; Тунсер, Озлем; Санчак, Бану; Ченгиз, Али Бюлент; Кара, Атес; Джейхан, Мехмет (2016). «Шесть случаев в 2012–2015 гг. и обзор литературы по инфекциям Chryseobacterium indologenes у пациентов детского возраста». Канадский журнал микробиологии . 62 (10): 812–819. дои : 10.1139/cjm-2015-0800 . ISSN 0008-4166 . ПМИД 27397741 .
- ^ Коэнье, Том; Ванлаэр, Эльке; ЛиПума, Джон Дж; Вандам, Питер (2004). «Идентификация геномных групп рода Stenotropomonas с использованием gyrB RFLP-анализа» . FEMS Иммунология и медицинская микробиология . 40 (3): 181–185. дои : 10.1016/S0928-8244(03)00307-9 . hdl : 2027.42/72378 . ПМИД 15039092 .
- ^ Перейти обратно: а б Свенссон-Штадлер, Лизелотт А.; Михайлова Сашка А.; Мур, Эдвард Р.Б. (2012). «Межвидовая дифференциация и идентификация Stenotropomonas с помощью анализа последовательности gyrB». Письма FEMS по микробиологии . 327 (1): 15–24. дои : 10.1111/j.1574-6968.2011.02452.x . ПМИД 22092789 .
- ^ Рокко, Франческо; Де Грегорио, Элиана; Ди Ночера, Пьер Паоло (2010). «Гигантское семейство коротких палиндромных последовательностей у Stenotropomonasmaltophilia: REPs Stenotropomonasmaltophilia» . Письма FEMS по микробиологии : нет. дои : 10.1111/j.1574-6968.2010.02010.x .
