Ризосфера
![]() | Эта статья требует внимания эксперта по растениям . смотрите на странице обсуждения Подробности ( сентябрь 2020 г. ) |

Ризосфера , — это узкая область почвы или субстрата , на которую непосредственно влияют выделения корней и связанные с ними почвенные микроорганизмы известные как корневой микробиом . [2] Почвенные поры в ризосфере могут содержать множество бактерий и других микроорганизмов, которые питаются отслоившимися растительными клетками, что называется ризоотложением . [3] а белки и сахара, выделяемые корнями, называются корневыми экссудатами . [4] Этот симбиоз приводит к более сложным взаимодействиям, влияющим на рост растений и конкуренцию за ресурсы. Большая часть круговорота питательных веществ и подавления болезней с помощью антибиотиков, необходимых растениям, происходит в непосредственной близости от корней за счет корневых выделений и продуктов метаболизма симбиотических и патогенных сообществ микроорганизмов. [5] Ризосфера также предоставляет пространство для производства аллелохимикатов для контроля над соседями и родственниками. [6]
Ризоплана . относится к поверхности корня, включая связанные с ней частицы почвы, которые тесно взаимодействуют друг с другом [7] Петля обратной связи растение-почва и другие физические факторы, возникающие на границе раздела растений и корней почвы, оказывают важное селективное давление на сообщества и рост в ризосфере и ризоплане. [8]
Фон
[ редактировать ]Термин «ризосфера» впервые был использован в 1904 году немецким физиологом растений Лоренцем Хилтнером для описания того, как корни растений взаимодействуют с окружающей почвой. [9] [10] Приставка риза- происходит от греческого языка и означает «корень». Хилтнер постулировал, что ризосфера — это область, окружающая корни растений и населенная микроорганизмами, находящимися под некоторым контролем химических веществ, выделяемых из корней растений. [9] [8]
Химические взаимодействия
[ редактировать ]Часть серии о |
Микробиомы |
---|
![]() |
Химическая доступность
[ редактировать ]Корни растений могут выделять 20–40% сахаров и органических кислот — фотосинтетически связанного углерода. [11] Корневые выделения растений, такие как органические кислоты , изменяют химическую структуру и биологические сообщества ризосферы по сравнению с основной массой или материнской почвой. Концентрации органических кислот и сахаридов влияют на способность биологических сообществ переносить фосфор, азот, [12] [13] калий и вода до корневого чехлика, [4] и полная доступность железа для завода и его соседей. [14] Способность корня растения и связанных с ним почвенных микроорганизмов обеспечивать специфические транспортные белки влияет на доступность железа и других минералов для него и его соседей. Это может повлиять на состав сообщества и его приспособленность.
Корневые экссудаты представлены в виде химических веществ, выделяемых в ризосферу клетками корней, и клеточных отходов, называемых «ризодепозицией». Это ризоотложение происходит в различных формах органического углерода и азота, которые обеспечивают существование сообществ вокруг корней растений и существенно влияют на химический состав, окружающий корни. [15] Экзополисахариды полигликолид , такие как ( PGA ), влияют на способность корней поглощать воду, поддерживая физическую стабильность почвенной углеродной губки и контролируя поток воды. [16] Например, полевые исследования томатов показали, что экзополисахариды, экстрагированные из ризосферы, были разными (общее количество сахара и средние значения инфракрасных измерений) в зависимости от выращиваемых сортов томатов. [17] и что в условиях водного дефицита (ограниченное орошение) увеличение продукции экзополисахаридов и микробной активности влияло на удержание воды в почве и полевые продуктивность томата. [18] В корневых экссудатах сортов картофеля фенолы и лигнины составляют наибольшее количество соединений, влияющих на ионы, независимо от места произрастания; однако было обнаружено, что на интенсивность различных соединений влияют почвы и условия окружающей среды, что приводит к различиям между соединениями азота, лигнинами, фенолами, углеводами и аминами . [19]
Аллелохимия
[ редактировать ]Хотя это выходит за пределы области ризосферы, примечательно, что некоторые растения выделяют из своих корней аллелохимические вещества , которые подавляют рост других организмов. Например, чесночная горчица производит химическое вещество, которое, как полагают, предотвращает образование мутуализма между окружающими деревьями и микоризой в мезических Северной Америки лесах умеренного пояса , где она является инвазивным видом . [20]
Экология ризосферы
[ редактировать ]

Ризодепонирование позволяет расти сообществам микроорганизмов непосредственно вокруг корней растений и внутри них. Это приводит к сложным взаимодействиям между видами, включая мутуализм, хищничество/паразитизм и конкуренцию.
Хищничество
[ редактировать ]Хищничество считается нисходящим, потому что эти взаимодействия уменьшают популяцию, но близость взаимодействия видов напрямую влияет на доступность ресурсов, в результате чего на популяцию также влияет контроль снизу вверх. [24] Без почвенной фауны, микробов, которые напрямую охотятся на конкурентов растений и растений-мутуалистов, взаимодействия внутри ризосферы были бы антагонистическими по отношению к растениям. Почвенная фауна обеспечивает нисходящий компонент ризосферы, а также обеспечивает восходящий рост питательных веществ за счет ризоотложения и неорганического азота. Сложность этих взаимодействий также была показана в экспериментах с распространенной почвенной фауной, такой как нематоды и протисты. Было показано, что хищничество нематод, питающихся бактериями, влияет на доступность азота и рост растений. [25] Также наблюдалось увеличение популяций бактерий, к которым были добавлены нематоды. Нападение амебы на Pseudomonas показывает, что хищники способны активировать токсины, вырабатываемые добычей, без прямого взаимодействия с использованием супернатанта. [26] Способность хищников контролировать экспрессию и производство агентов биоконтроля у добычи без прямого контакта связана с эволюцией видов-жертв к сигналам о высокой плотности хищников и доступности питательных веществ.
Пищевую сеть в ризосфере можно рассматривать как три разных канала с двумя разными источниками энергии: детритозависимые каналы представляют собой грибы и бактериальные виды, а корневой энергозависимый канал состоит из нематод, симбиотических видов и некоторых членистоногих. [24] Эта пищевая сеть постоянно меняется, поскольку количество доступного детрита и скорость отпадения корней меняются по мере их роста и старения. Этот бактериальный канал считается более быстрым из-за способности видов концентрироваться на более доступных ресурсах в ризосфере и иметь более быстрое время регенерации по сравнению с грибковым каналом. Все три канала также взаимосвязаны с корнями, составляющими основу экосистемы ризосферы, и хищниками, такими как нематоды и протисты, которые охотятся на многие из одних и тех же видов микрофлоры.
Соревнование
[ редактировать ]Конкуренция между растениями за выделяемые экссудаты зависит от геометрических свойств, определяющих способность перехвата экссудатов из любой точки по отношению к корням растений, физико-химических свойств, определяющих способность каждого корня поглощать экссудаты на данной территории. . [27] Геометрическими свойствами являются плотность корней, диаметр корней и расположение корней. Физико-химическими свойствами являются скорость экссудации, скорость распада экссудата и свойства среды, влияющие на диффузию. Эти свойства определяют ризосферу корней и вероятность того, что растения могут напрямую конкурировать с соседями.
Растения и почвенная микрофлора косвенно конкурируют друг с другом, связывая в свою биомассу ограниченные ресурсы, такие как углерод и азот. [28] Эта конкуренция может происходить с разной скоростью из-за соотношения углерода и азота в детрите и продолжающейся минерализации азота в почве. Микоризы и гетеротрофные почвенные микроорганизмы конкурируют за углерод и азот, в зависимости от того, что является лимитирующим в данный момент, что само по себе сильно зависит от вида, способности к очистке и условий окружающей среды, влияющих на поступление азота. Растения менее успешно усваивают органический азот, например аминокислоты, чем почвенная микрофлора, существующая в ризосфере. [29] Это влияет на другие мутуалистические отношения, формируемые растениями в отношении поглощения азота.
На конкуренцию за другие ресурсы, такие как кислород в ограниченных средах, напрямую влияет пространственное и временное расположение видов и ризосферы. У метанотрофов близость к корням с более высокой плотностью и к поверхности важна и помогает определить, где они доминируют над гетеротрофами на рисовых полях. [30]
Слабая связь между различными каналами энергии важна для регуляции популяций как хищников, так и жертв, а также доступности ресурсов биома. Прочные связи между ресурсом-потребителем и потребителем-потребителем создают связанные системы осцилляторов, которые затем определяются природой имеющихся ресурсов. [31] Тогда эти системы можно считать циклическими, квазипериодическими или хаотическими.
мутуализм
[ редактировать ]Растения выделяют через корни множество соединений, выполняющих симбиотические функции в ризосфере. Стриголактоны , секретируемые и обнаруживаемые микоризными грибами, стимулируют прорастание спор и инициируют изменения в микоризе, которые позволяют ей колонизировать корень. Паразитическое растение Стрига также обнаруживает присутствие стриголактонов и прорастает, когда обнаруживает их; затем они перемещаются в корень, питаясь присутствующими питательными веществами. [32] [33]
Симбиотические азотфиксирующие бактерии, такие как виды Rhizobium , обнаруживают такие соединения, как флавоноиды, выделяемые корнями бобовых растений, а затем производят nod-факторы , которые сигнализируют растению об их присутствии и приводят к образованию корневых клубеньков . Бактерии размещаются в симбиосомах в этих клубеньках, где они поддерживаются питательными веществами растения и преобразуют газообразный азот в форму, которая может быть использована растением. [34] Несимбиотические (или «свободноживущие») азотфиксирующие бактерии могут обитать в ризосфере сразу за пределами корней некоторых растений (включая многие травы) и аналогичным образом «фиксировать» газообразный азот в богатой питательными веществами ризосфере растений. Хотя считается, что эти организмы лишь слабо связаны с растениями, в которых они обитают, они могут очень сильно реагировать на состояние растений. Например, азотфиксирующие бактерии в ризосфере риса демонстрируют суточные циклы , которые имитируют поведение растения, и имеют тенденцию поставлять больше фиксированного азота на стадиях роста, когда растение проявляет высокую потребность в азоте. [35]
В обмен на ресурсы и убежище, которые дают растения и корни, грибы и бактерии контролируют патогенные микробы. [36] Грибы, осуществляющие такую деятельность, также служат тесным связям с видами растений в виде микоризных грибов, разнообразных по отношению к растениям. Арбускулярные микоризные грибы и бактерии, которые делают ризосферу своим домом, также образуют тесные взаимоотношения, чтобы быть более конкурентоспособными. [37] что влияет на более крупные циклы питательных веществ, влияющих на экосистему, такие как биогеохимические пути. [14]
Структура сообщества
[ редактировать ]Ризосферу называют информационной супермагистралью из-за близости точек данных, включая корни и организмы в почве, а также методов передачи данных с использованием экссудатов и сообществ. [38] Это описание использовалось для объяснения сложных взаимодействий, в которые вступили растения, их грибы-мутуалисты и виды бактерий, живущие в ризосфере, в ходе своей эволюции. Некоторые виды, такие как Trichoderma, интересны своей способностью выбирать виды в этой сложной сети. Триходерма является агентом биологической борьбы , поскольку есть доказательства того, что она может уменьшать количество патогенов растений в ризосфере. [39] Сами растения также влияют на то, против каких видов бактерий в ризосфере происходит отбор из-за введения экссудатов и взаимоотношений, которые они поддерживают. Контроль над тем, какие виды находятся в этих небольших горячих точках разнообразия, может радикально повлиять на емкость этих пространств и будущие условия для будущей экологии. [36] [6]
Микробный консорциум
[ редактировать ]
Хотя различные исследования показали, что отдельные микроорганизмы могут оказывать благотворное воздействие на растения, становится все более очевидным, что при участии микробного консорциума — двух или более взаимодействующих микроорганизмов — можно ожидать аддитивных или синергических результатов. Частично это происходит из-за того, что несколько видов могут выполнять различные задачи в такой экосистеме, как ризосфера. Полезные механизмы стимуляции роста растений включают повышенную доступность питательных веществ, модуляцию фитогормонов , биоконтроль , а также устойчивость к биотическим и абиотическим стрессам, оказываемые различными микробными игроками в ризосфере, такими как бактерии, способствующие росту растений (PGPB), и грибы, такие как триходерма и микоризы. . [40]
На диаграмме справа показано, что ризосферные микроорганизмы, такие как бактерии, способствующие росту растений (PGPB), арбускулярные микоризные грибы (AMF) и грибы из рода Trichoderma spp. может установить благотворное взаимодействие с растениями, способствуя росту и развитию растений, усиливая систему защиты растений от патогенов, способствуя усвоению питательных веществ и повышая толерантность к различным стрессам окружающей среды. Ризосферные микроорганизмы могут влиять друг на друга, и образующиеся в результате консорциумы PGPB + PGPB (например, азотфиксирующие бактерии, такие как Rhizobium spp. и Pseudomonas fluorescens ), AMF + PGPB и Trichoderma + PGPB могут оказывать синергетическое воздействие на рост и приспособленность растений. , предоставляя растению дополнительные преимущества для преодоления биотического и абиотического стресса. Пунктирные стрелки указывают на благоприятное взаимодействие между АМФ и триходермой . [40]


Коммуникация
[ редактировать ]
Общение часто является основой биотических взаимодействий . Часто в общении могут принимать участие более двух организмов, что приводит к возникновению сложной сети перекрестных помех . Недавние достижения в исследованиях взаимодействия растений и микробов показали, что общение, как между царствами, так и внутри царств, формируется под воздействием широкого спектра факторов. В этом контексте ризосфера (т. е. почва вблизи поверхности корня) обеспечивает специфическую микросреду обитания, где происходят сложные взаимодействия. Сложная среда, составляющая ризосферу, может отбирать определенные микробные популяции, адаптированные к этой уникальной нише. Среди них ризобии стали важным компонентом ризосферного микробиома. Ризосферные перекрестные помехи обнаруживаются при взаимодействии ризобий- бобовые . Этот симбиоз представляет собой сложный процесс, включающий передачу сигналов , которая может формироваться ризосферными экссудатами растений и составом микробиома. Взаимоотношения, устанавливаемые ризобиями с другими ризосферными организмами, вместе с влиянием факторов окружающей среды обуславливают их благотворное влияние на здоровье растений-хозяев. [41]
Прокариоты и эукариоты взаимодействовали на протяжении миллионов лет, развивая и совершенствуя с течением времени свои системы связи. Как предложил Хаузер в 1996 г., [10] биологические сигналы и обмен информацией являются частью определения коммуникации, а сами сигналы рассматриваются как «любая структура, способная формировать поведение организмов». [42] [43] Следовательно, сигналы могут развиваться и сохраняться благодаря взаимодействию между производителями и приемниками сигналов. Тогда сотрудничество и улучшение приспособленности являются основой биологической коммуникации. [44] [41]
В определенной среде люди могут общаться и взаимодействовать с несколькими партнерами, а характер взаимодействия может определять переменные затраты и выгоды для партнера как биологического рынка. [45] Можно обмениваться большим количеством сигналов с участием самого растения, насекомых, грибов и микробов. Все это происходит в экологической нише с высокой плотностью населения. Обычно коммуникация является результатом химических реакций клеток на подписавшие молекулы, поступающие из других клеток. Эти сигналы влияют как на метаболизм, так и на транскрипцию генов, активируя несколько регуляторных механизмов. [41]

Часто в ризосфере в общении могут принимать участие более двух организмов (и видов), что приводит к возникновению сложной сети взаимодействий и перекрестных переговоров, которые влияют на приспособленность всех участвующих партнеров. Таким образом, эту среду можно считать горячей точкой для многочисленного межцарственного обмена сигналами, в котором участвуют растительно-ассоциированные микробные сообщества (ризобиом). Состав микробного сообщества в основном формируется и пополняется сотнями метаболитов, выделяемых в почву корнями растений, которые обычно облегчают взаимодействие с биотической и абиотической средой. Часто растение может модулировать свое разнообразие в зависимости от преимуществ с точки зрения роста и здоровья, например, с помощью ризобактерий, способствующих росту растений . [46] Тем не менее, большое количество питательных веществ, выделяемых растением, может представлять интерес для патогенных организмов, которые могут использовать растительные продукты для своего выживания в ризосфере. [47] [41]
Разумеется, растения играют фундаментальную роль в ризосфере. [48] Действительно, из-за химических сигналов, передаваемых богатыми питательными веществами экссудатами, выделяемыми корнями растений, большое разнообразие микробов может сначала колонизировать ризосферу, а затем постепенно проникать в корень и всю ткань растения ( эндофиты ). [49] В противном случае они могут колонизировать растение-хозяин, установив прочные и полезные симбиотические отношения. [50] К настоящему времени проведены многочисленные исследования состава корневых экссудатов. [46] [51] [52] [41]
Самый известный диалог растений и микробов на ризосферной арене, определяющий прямые и косвенные преимущества для партнеров, получил должное внимание еще в 1904 г., когда Хилтнер описал симбиотическое взаимодействие между бобовыми и ризобиями. [10] Этот симбиоз представляет собой высокоспецифичный процесс, в котором генетические и химические сигналы связи строго специфичны для растений и бактерий. В этом мутуалистическом взаимодействии ризобии положительно влияют на рост хозяина благодаря процессу фиксации азота и в то же время могут получать пользу от питательных веществ, обеспечиваемых растением. [41]
Этот симбиоз широко изучался в последние десятилетия, и было проведено множество исследований коммуникации и передачи сигналов между двумя партнерами на разных стадиях симбиоза (от заражения корня до развития клубеньков). [53] [54] Однако знания о более ранних этапах колонизации ризосферы, а именно о линии открытия на поверхности корня, остаются плохо изученными. Тем не менее, все больше данных показывают важность внутривидовых и многовидовых связей между ризосферными биотическими компонентами для улучшения взаимодействия ризобий и бобовых. Кроме того, было показано, что ризобии являются частью ризосферы широкого спектра небобовых растений, где они могут играть роль компонентов, способствующих росту растений, возвращая себе центральную роль в микробиоме ядра растения. [55] [41]
Методы
[ редактировать ]Ниже приведены некоторые методы, обычно используемые или представляющие интерес для исследований ризосферы. Многие из этих методов включают как полевые испытания корневых систем, так и лабораторные испытания с использованием моделируемых сред для проведения экспериментов, таких как определение pH. [56]
- Высокопроизводительный скрининг
- Высокопроизводительное секвенирование: ампликон 16S рРНК, метагеномика, метатранскриптомика
- Подходы, зависящие от культуры
- Корневая визуализация
- Изотопная маркировка
- Ферментные анализы
- Мини ризотронная камера
- Различные методы, используемые для определения движения воды в ризосфере, например, микроэлектроды и методы агара для определения pH и микроотбор проб материалов ризосферы. [56]
- с пиролизом и полевой ионизацией Масс-спектрометрия позволяет проводить спектрометрию сельскохозяйственных полей для обнаружения фульвовых и гуминовых кислот, а также остатков экстракции (гуминов) в некоторых исследованиях и расширять их до общих органических соединений в других недавних работах. [57] [19]


См. также
[ редактировать ]- Связь между растениями через микоризные сети
- Почвенная биомантия
- Дыхание почвы
- Ризобактерии
- Корневая слизь
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б Да, Мон Оо; Ким, Питер; Ли, Ифань; Сингх, Ануп К.; Нортен, Трент Р.; Чакраборти, Роми (26 марта 2021 г.). «Специализированные конструкции камер для выращивания растений для изучения сложных взаимодействий в ризосфере» . Границы микробиологии . 12 . Frontiers Media SA: 625752. doi : 10.3389/fmicb.2021.625752 . ISSN 1664-302X . ПМЦ 8032546 . ПМИД 33841353 .
Материал был скопирован из этого источника, который доступен по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .
- ^ «Микробное здоровье ризосферы» . Архивировано из оригинала 12 марта 2007 года . Проверено 5 мая 2006 г.
- ^ Хютч, Биргит В.; Августин, Юрген; Мербах, Вольфганг (2002). «Ризодепонирование растений – важный источник круговорота углерода в почвах» . Журнал питания растений и почвоведения . 165 (4): 397–407. doi : 10.1002/1522-2624(200208)165:4<397::AID-JPLN397>3.0.CO;2-C – через Research Gate.
- ^ Jump up to: а б Уокер, Трэвис С.; Байс, Суровый приятель; Гротеволд, Эрих; Виванко, Хорхе М. (2003). «Корневая экссудация и биология ризосферы» . Физиология растений . 132 (1): 44–51. дои : 10.1104/стр.102.019661 . ПМК 1540314 . ПМИД 12746510 .
- ^ Ингэм, Элейн Р. «Почвенная пищевая сеть» . Министерство сельского хозяйства США – НРКС . Проверено 3 июля 2006 г.
- ^ Jump up to: а б Грейстон, Сьюзен Дж.; Ван, Шэньцюань; Кэмпбелл, Колин Д.; Эдвардс, Энтони К. (март 1998 г.). «Селективное влияние видов растений на микробное разнообразие ризосферы». Биология и биохимия почвы . 30 (3): 369–378. дои : 10.1016/S0038-0717(97)00124-7 .
- ^ Эстерманн, Ева Ф.; Макларен, AD (1961). «Вклад ризопланных организмов в общую способность растений использовать органические питательные вещества». Растение и почва . 15 (3): 243–260. дои : 10.1007/BF01400458 . S2CID 35099987 .
- ^ Jump up to: а б Макнир-младший, Дэвид Х. (2013). «Ризосфера – корни, почва и все, что между ними» . Природное образование . 4 (3): 1.
- ^ Jump up to: а б Хилтнер, Л. (1904) «О недавнем опыте и проблемах в области почвенной бактериологии, с особым вниманием к фундаменту и залежу. Arb Deut Landw Gesell , 98 : 57-78.
- ^ Jump up to: а б с Хартманн, Антон; Ротбаллер, Майкл; Шмид, Майкл (2008). «Лоренц Хилтнер, пионер в области микробной экологии ризосферы и исследований почвенной бактериологии». Растение и почва . 312 (1–2): 7–14. дои : 10.1007/s11104-007-9514-z . S2CID 4419735 .
- ^ Канарини А., Кайзер С., Мерчант А., Рихтер А. и Ванек В. (2019) Корневая экссудация первичных метаболитов: механизмы и их роль в реакции растений на стимулы окружающей среды. Границы в науке о растениях 10:157. дои: 10.3389/fpls.2019.00157
- ^ Джонс, Дэвид Л. (август 1998 г.). «Органические кислоты в ризосфере – критический обзор». Растение и почва . 205 (1): 25–44. дои : 10.1023/А:1004356007312 . S2CID 26813067 .
- ^ Хинсингер, Филипп (декабрь 2001 г.). «Биодоступность неорганического фосфора почвы в ризосфере под влиянием химических изменений, вызванных корнями: обзор». Растение и почва . 237 (2): 173–195. дои : 10.1023/А:1013351617532 . S2CID 8562338 .
- ^ Jump up to: а б Ламберс, Ганс; Мугель, Кристоф; Жайяр, Бенуа; Хинсингер, Филипп (август 2009 г.). «Взаимодействие растений, микробов и почвы в ризосфере: эволюционная перспектива». Растительная почва . 321 (1–2): 83–115. дои : 10.1007/s11104-009-0042-x . S2CID 6840457 .
- ^ Хинсингер, Филипп; Гобран, Джордж Р.; Грегори, Питер Дж.; Венцель, Уолтер В. (ноябрь 2005 г.). «Геометрия ризосферы и неоднородность, возникающая в результате корнеопосредованных физических и химических процессов». Новый фитолог . 168 (2): 293–303. дои : 10.1111/j.1469-8137.2005.01512.x . ISSN 1469-8137 . ПМИД 16219069 .
- ^ Чарнес, С.; Халлетт, PD; Бенгоф, AG; Янг, И.М. (2000). «Слизи корневого и микробного происхождения влияют на структуру почвы и транспорт воды». Европейский журнал почвоведения . 51 (3): 435. doi : 10.1046/j.1365-2389.2000.00327.x . S2CID 96925936 .
- ^ Берар, Аннет; Клавель, Тьерри; Ле Бурвельек, Карин; Давуан, Орельен; Ле Галль, Самуэль; Дуссан, Клод; Бюро, Сильви (2020). «Экзополисахариды в ризосфере: сравнительное исследование методов экстракции. Применение к их количественному определению в почвах Средиземноморья» . Биология и биохимия почвы . 149 : 107961. doi : 10.1016/j.soilbio.2020.107961 .
- ^ Ле Галль, Самуэль; Берар, Аннет; Пейдж, Дэвид; Ланоэ, Лукас; Бертен, Надя; Дуссан, Клод (2021). «Повышенное производство экзополисахаридов и микробная активность влияют на удержание влаги в почве и полевые продуктивность томатов в условиях дефицита воды» . Ризосфера . 19 : 100408. doi : 10.1016/j.rhisph.2021.100408 . ISSN 2452-2198 .
- ^ Jump up to: а б Шлихтинг, Андре; Лейнвебер, Питер (2009). «Новые доказательства молекулярно-химического разнообразия корневищ растений картофеля, полученные методом пиролизно-ионизационной масс-спектрометрии». Фитохимический анализ . 20 (1): 1–13. дои : 10.1002/pca.1080 . ISSN 1099-1565 . ПМИД 18618895 .
- ^ Стинсон, Кристина А; Кэмпбелл, Стюарт А; Пауэлл, Джефф Р.; Вулф, Бенджамин Э; Каллауэй, Рэган М; Телен, Джайлз С; Халлетт, Стивен Дж; Прати, Дэниел; Клирономос, Джон Н. (25 апреля 2006 г.). Лоро, Мишель (ред.). «Инвазивное растение подавляет рост местных саженцев деревьев, нарушая подземный мутуализм» . ПЛОС Биология . 4 (5). Публичная научная библиотека (PLoS): e140. doi : 10.1371/journal.pbio.0040140 . ISSN 1545-7885 . ПМЦ 1440938 . ПМИД 16623597 .
- ^ Нейлор, Дэн; Сэдлер, Натали; Бхаттачарджи, Арунима; Грэм, Эмили Б.; Андертон, Кристофер Р.; МакКлюр, Райан; Липтон, Мэри; Хофмокель, Кирстен С.; Янссон, Джанет К. (17 октября 2020 г.). «Почвенные микробиомы в условиях изменения климата и последствия для круговорота углерода» . Ежегодный обзор окружающей среды и ресурсов . 45 (1). Годовые обзоры: 29–59. doi : 10.1146/annurev-environ-012320-082720 . ISSN 1543-5938 . S2CID 219905513 .
Измененный материал был скопирован из этого источника, который доступен по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .
- ^ Янссон, Джанет К.; Таш, Неслихан (12 мая 2014 г.). «Микробная экология вечной мерзлоты». Обзоры природы Микробиология . 12 (6). ООО «Спрингер Сайенс энд Бизнес Медиа»: 414–425. дои : 10.1038/nrmicro3262 . ISSN 1740-1526 . ПМИД 24814065 . S2CID 42795586 .
- ^ Макельпранг, Рэйчел; Салеска, Скотт Р.; Якобсен, Карстен Зур; Янссон, Джанет К.; Таш, Неслихан (29 июня 2016 г.). «Метаомика вечной мерзлоты и изменение климата» . Ежегодный обзор наук о Земле и планетах . 44 (1). Годовые обзоры: 439–462. doi : 10.1146/annurev-earth-060614-105126 . ISSN 0084-6597 . S2CID 131260721 .
- ^ Jump up to: а б Мур, Джон К.; Макканн, Кевин; Сетля, Хейкки; Де Рюитер, Питер К. (2003). «Сверху вниз — это снизу вверх: регулирует ли хищничество в ризосфере надземную динамику?». Экология . 84 (4): 846. doi : 10.1890/0012-9658(2003)084[0846:TIBDPI]2.0.CO;2 .
- ^ Ингхэм, Рассел Э.; Трофимов, Ю.А.; Ингэм, Элейн Р.; Коулман, Дэвид К. (1985). «Взаимодействие бактерий, грибов и их нематод, питающихся животными: влияние на круговорот питательных веществ и рост растений». Экологические монографии . 55 (1): 119–140. дои : 10.2307/1942528 . JSTOR 1942528 .
- ^ Жуссе, Александр; Роша, Лорен; Шой, Стефан; Бонковски, Майкл; Кил, Кристоф (август 2010 г.). «Химическая война хищник-жертва определяет экспрессию генов биоконтроля ассоциированной с ризосферой Pseudomonas fluorescens » . Прикладная и экологическая микробиология . 76 (15): 5263–5268. Бибкод : 2010ApEnM..76.5263J . дои : 10.1128/АЕМ.02941-09 . ПМЦ 2916451 . ПМИД 20525866 .
- ^ Рейно, Ксавье; Жайар, Бенуа; Ледли, Пол В. (2008). «Растения могут изменить конкуренцию, изменяя биодоступность питательных веществ в ризосфере: подход к моделированию» (PDF) . Американский натуралист . 171 (1): 44–58. дои : 10.1086/523951 . ISSN 0003-0147 . ПМИД 18171150 . S2CID 23413577 .
- ^ Кэй, Джейсон П.; Харт, Стивен К. (1997). «Конкуренция за азот между растениями и почвенными микроорганизмами». Тенденции в экологии и эволюции . 12 (4): 139–43. дои : 10.1016/S0169-5347(97)01001-X . ПМИД 21238010 .
- ^ Оуэн, AG; Джонс, Д.Л. (2001). «Конкуренция за аминокислоты между корнями пшеницы и ризосферными микроорганизмами и роль аминокислот в приобретении азота растениями». Биология и биохимия почвы . 33 (4–5): 651–657. дои : 10.1016/s0038-0717(00)00209-1 .
- ^ Бодегом, Питер ван; Стамс, Фонс; Моллема, Лисбет; Буке, Сара; Леффелаар, Питер (август 2001 г.). «Окисление метана и конкуренция за кислород в ризосфере риса» . Прикладная и экологическая микробиология . 67 (8): 3586–3597. Бибкод : 2001ApEnM..67.3586V . дои : 10.1128/АЕМ.67.8.3586-3597.2001 . ПМК 93059 . ПМИД 11472935 .
- ^ Макканн, Кевин; Гастингс, Алан; Хаксель, Гэри Р. (22 октября 1998 г.). «Слабые трофические взаимодействия и баланс природы». Природа . 395 (6704): 794–798. Бибкод : 1998Natur.395..794M . дои : 10.1038/27427 . S2CID 4420271 .
- ^ Бессерер, Арно; Пуэх-Пажес, Вирджиния; Кифер, Патрик; Гомес-Ролдан, Виктория; Жоно, Ален; Рой, Себастьен; Портэ, Жан-Шарль; Ру, Кристоф; Бекар, Гийом; Сежалон-Дельмас, Натали (27 июня 2006 г.). Чори, Джоан (ред.). «Стриголактоны стимулируют арбускулярные микоризные грибы путем активации митохондрий» . ПЛОС Биология . 4 (7). Публичная научная библиотека (PLoS): e226. дои : 10.1371/journal.pbio.0040226 . ISSN 1545-7885 . ПМЦ 1481526 . ПМИД 16787107 .
- ^ Андреас Брахманн, Мартин Парниске (2006). «Самый распространенный симбиоз на Земле» . ПЛОС Биология . 4 (7): е239. дои : 10.1371/journal.pbio.0040239 . ПМК 1489982 . ПМИД 16822096 .
- ^ Тянь, CF; Гарнероне, А.-М.; Матье-Демазьер, К.; Массон-Бойвен, К.; Батут, Дж. (2012). «Аденилатциклазы бактериальных рецепторов, активируемые растениями, модулируют эпидермальную инфекцию в симбиозе Sinorhizobium meliloti-Medicago» . Труды Национальной академии наук . 109 (17): 6751–6756. Бибкод : 2012PNAS..109.6751T . дои : 10.1073/pnas.1120260109 . ПМК 3340038 . ПМИД 22493242 .
- ^ Симс, ГК; Дуниган, EP (1984). «Суточные и сезонные изменения активности нитрогеназы (снижение C2H2) корней риса». Биология и биохимия почвы . 16 (1): 15–18. дои : 10.1016/0038-0717(84)90118-4 .
- ^ Jump up to: а б Веллер, DM (1988). «Биологический контроль почвенных патогенов растений в ризосфере с помощью бактерий» . Ежегодный обзор фитопатологии . 26 (1): 379–407. дои : 10.1146/annurev.py.26.090188.002115 .
- ^ Бьянчотто, В.; Минерди, Д.; Перотто, С.; Бонфанте, П. (1996). «Клеточные взаимодействия между арбускулярными микоризными грибами и ризосферными бактериями». Протоплазма . 193 (1–4): 123–131. дои : 10.1007/BF01276640 . S2CID 39961232 .
- ^ Байс, Суровый приятель; Пак, Сан-Вук; Вейр, Тиффани Л; Каллауэй, Рэган М; Виванко, Хорхе М (2004). «Как растения общаются, используя подземную информационную супермагистраль». Тенденции в науке о растениях . 9 (1): 26–32. doi : 10.1016/j.tplants.2003.11.008 . ПМИД 14729216 .
- ^ Хауэлл, CR (2003). «Механизмы, используемые видами Trichoderma для биологической борьбы с болезнями растений: история и эволюция современных концепций» . Болезни растений . 87 (1): 4–10. дои : 10.1094/PDIS.2003.87.1.4 . ПМИД 30812698 .
- ^ Jump up to: а б с д и Сантойо, Густаво; Гусман-Гузман, Паулина; Парра-Кота, Фанни Исела; Сантос-Вильялобос, Серхио де лос; Ороско-Москеда, Массачусетс дель Кармен; Глик, Бернард Р. (2021). «Стимуляция роста растений микробными консорциумами» . Агрономия . 11 (2): 219. doi : 10.3390/agronomy11020219 .
Материал был скопирован из этого источника, который доступен по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .
- ^ Jump up to: а б с д и ж г час Чекуччи, Алиса; Маркетти, Марта (2020). «Ток-шоу «Ризосфера»: Ризобии на сцене» . Границы в агрономии . 2 . дои : 10.3389/fagro.2020.591494 . hdl : 11585/787803 .
Материал был скопирован из этого источника, который доступен под номером [1] .
- ^ Мейнард-Смит, Джон; Харпер, Дэвид (6 ноября 2003 г.). Сигналы животных . Нью-Йорк: Издательство Оксфордского университета. ISBN 978-0-19-852685-8 . OCLC 54460090 .
- ^ Скотт-Филлипс, TC (2008). «Определение биологической связи» . Журнал эволюционной биологии . 21 (2): 387–395. дои : 10.1111/j.1420-9101.2007.01497.x . ПМИД 18205776 . S2CID 5014169 .
- ^ Захави, Амоц (2008). «Принцип гандикапа и сигнализация в совместных системах». В Хьюзе, Дэвид П.; д'Этторре, Патриция (ред.). Социобиология общения . Издательство Оксфордского университета. стр. 1–10.
- ^ Вернер, Гейсберт Д.А.; Корнуэлл, Уильям К.; Корнелиссен, Йоханнес ХК; Кирс, Э. Тоби (2015). «Эволюционные сигналы симбиотической устойчивости в мутуализме бобовых и ризобий» . Труды Национальной академии наук . 112 (33): 10262–10269. Бибкод : 2015PNAS..11210262W . дои : 10.1073/pnas.1424030112 . ПМЦ 4547229 . ПМИД 26041807 .
- ^ Jump up to: а б Хартманн, Антон; Шмид, Майкл; Туйнен, Дидерик ван; Берг, Габриэле (2009). «Растительный отбор микробов». Растение и почва . 321 (1–2): 235–257. дои : 10.1007/s11104-008-9814-y . S2CID 17890501 .
- ^ Расманн, Серджио; Терлингс, Тед СиДжей (2016). «Корневые сигналы, которые опосредуют мутуалистические взаимодействия в ризосфере» . Современное мнение в области биологии растений . 32 : 62–68. дои : 10.1016/j.pbi.2016.06.017 . ПМИД 27393937 .
- ^ Гибка, ГД (2017). «Ризопшара и ее микроорганизмы». Энциклопедия прикладных наук о растениях . стр. 347–351. дои : 10.1016/B978-0-12-394807-6.00165-9 . ISBN 9780123948083 .
- ^ Хардойм, Пабло Р.; Ван Овербек, Лео С.; Эльзас, Ян Дирк ван (2008). «Свойства бактериальных эндофитов и их предполагаемая роль в росте растений». Тенденции в микробиологии . 16 (10): 463–471. дои : 10.1016/j.tim.2008.07.008 . ПМИД 18789693 .
- ^ Чи, Фэн; Шен, Ши-Хуа; Ченг, Хай-Пин; Цзин, Юй-Сян; Янни, Юсеф Г.; Даццо, Фрэнк Б. (2005). «Восходящая миграция эндофитных ризобий от корней к листьям внутри растений риса и оценка преимуществ для физиологии роста риса» . Прикладная и экологическая микробиология . 71 (11): 7271–7278. Бибкод : 2005ApEnM..71.7271C . дои : 10.1128/АЕМ.71.11.7271-7278.2005 . ПМК 1287620 . ПМИД 16269768 .
- ^ Булгарелли, Давиде; Шлеппи, Клаус; Спепен, Стейн; Ван Темаат, Эмиэль Вер Лорен; Шульце-Леферт, Пол (2013). «Структура и функции бактериальной микробиоты растений». Ежегодный обзор биологии растений . 64 : 807–838. doi : 10.1146/annurev-arplant-050312-120106 . ПМИД 23373698 .
- ^ Вентури, Витторио; Кил, Кристоф (2016). «Сигнализация в ризосфере» . Тенденции в науке о растениях . 21 (3): 187–198. doi : 10.1016/j.tplants.2016.01.005 . ПМИД 26832945 .
- ^ Олдройд, Джайлз ЭД; Мюррей, Джереми Д.; Пул, Филип С.; Дауни, Дж. Аллан (2011). «Правила участия в бобово-ризобиальном симбиозе». Ежегодный обзор генетики . 45 : 119–144. doi : 10.1146/annurev-genet-110410-132549 . ПМИД 21838550 .
- ^ Олдройд, Джайлз ЭД (2013). «Говори, друг, и войди: сигнальные системы, способствующие полезным симбиотическим ассоциациям в растениях». Обзоры природы Микробиология . 11 (4): 252–263. дои : 10.1038/nrmicro2990 . ПМИД 23493145 . S2CID 7849557 .
- ^ Да, Юн Кит; Паунгфу-Лонхиен, Чаньярат; Деннис, Пол Г.; Робинсон, Николь; Рэган, Марк А.; Шмидт, Сюзанна; Гугенгольц, Филип (2016). «Основной корневой микробиом сахарного тростника, выращиваемого при различном внесении азотных удобрений». Экологическая микробиология . 18 (5): 1338–1351. дои : 10.1111/1462-2920.12925 . ПМИД 26032777 .
- ^ Jump up to: а б с Грегори, Пи Джей; Хинсингер, П. (1999). «Новые подходы к изучению химических и физических изменений в ризосфере: обзор». Растение и почва . 211 : 1–9. дои : 10.1023/А:1004547401951 . S2CID 24345065 .
- ^ Шльтен, Ханс-Рольф; Лейнвебер, Питер (апрель 1993 г.). «Пиролизно-ионизационная масс-спектрометрия сельскохозяйственных почв и гумусовых веществ: Влияние систем земледелия и влияние минеральной матрицы». Растение и почва . 151 (1): 77–90. дои : 10.1007/BF00010788 . ISSN 0032-079X . S2CID 23547420 .
- ^ Гири, Б.; Джианг, PH; Кумари, Р.; Прасад, Р.; Варма, А. (2005). «Микробное разнообразие в почвах». Микроорганизмы в почвах: роль в генезисе и функции . Почвенная биология. Том. 3. С. 19–55. дои : 10.1007/3-540-26609-7_2 . ISBN 978-3-540-22220-0 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- «Почвенная среда обитания» . Университет Западной Австралии. Архивировано из оригинала 20 августа 2006 года . Проверено 3 июля 2006 г.
- Эндрю Уайли (2006). «Рыбаться в грязи: созрело ли исследование ризосферы для подхода системной биологии?» . Science Creative Ежеквартальный журнал . Проверено 24 апреля 2017 г.
- Макнир-младший, DH (2013). «Ризосфера – корни, почва и все, что между ними» . Знания о природном образовании . 4 (3): 1 . Проверено 24 апреля 2017 г.