✖


Jump to content

Голобионт

Часть серии о
Микробиомы
Растительные микробиомы
Морские микробиомы
Микробиомы человека
Другие микробиомы
Микробиота
Голобионты
Виромы
Связанный
Проекты
Отношения микробиома отражают эволюцию хозяина. Чем более отдаленно родственные виды, тем более различен состав их родственных микробиомов, что отражается в наложенной филогении ос и их микробиоте. [1]

Голобионт — это совокупность хозяина и многих других видов, живущих в нем или вокруг него, которые вместе образуют дискретную экологическую единицу посредством симбиоза . [2] хотя существуют разногласия по поводу этой дискретности. Компонентами холобионта являются отдельные виды или бионты , а совокупный геном всех бионтов — хологеном . Концепция холобионта была первоначально предложена немецким биологом-теоретиком Адольфом Мейером-Абихом в 1943 году. [3] а затем, очевидно, независимо доктором Линн Маргулис в ее книге 1991 года «Симбиоз как источник эволюционных инноваций» . [2] Концепция претерпела изменения по сравнению с первоначальными формулировками. [4] Голобионты включают в себя хозяина , вирома , микробиома и любые другие организмы, которые каким-то образом способствуют функционированию целого. [5] [6] К хорошо изученным голобионтам относятся кораллы, строящие рифы , и люди. [7] [8]

Обзор

[ редактировать ]

Голобионт — это совокупность тесно связанных видов, которые имеют сложные взаимодействия, например, вид растения и члены его микробиома . [2] [9] Каждый вид, присутствующий в холобионте, представляет собой бионт, а геномы всех бионтов, взятые вместе, составляют хологеном, или «комплексную генную систему» ​​холобионта. [10] Голобионт обычно включает в себя эукариот- хозяина и все симбиотические вирусы , бактерии , грибы и т. д., живущие на нем или внутри него. [9]

Голобионты отличаются от суперорганизмов ; суперорганизмы состоят из множества особей, иногда принадлежащих к одному и тому же виду, и этот термин обычно применяется к эусоциальным насекомым. [11] [12] Колонию муравьев можно охарактеризовать как суперорганизм, тогда как отдельный муравей и связанные с ним бактерии, грибы и т. д. представляют собой холобионт. [10] Нет сомнений в том, что симбиотические микроорганизмы имеют решающее значение для биологии и экологии хозяина, обеспечивая его витаминами, энергией и неорганическими или органическими питательными веществами, участвуя в защитных механизмах или управляя эволюцией хозяина. [13] [14] Вокруг этих терминов до сих пор ведутся споры, и в некоторых публикациях они используются как синонимы. [8]

История концепции холобионта

[ редактировать ]

Холизм — философское понятие, впервые предложенное Аристотелем в IV веке до нашей эры. В нем говорится, что системы следует изучать в целом, уделяя особое внимание взаимосвязям между их различными компонентами, а не отдельными частями. [15] [16] Такие системы обладают эмерджентными свойствами, возникающими в результате поведения системы, которая «больше, чем сумма ее частей». Однако серьезный отход от холизма произошел в эпоху Просвещения, когда доминирующая мысль, обобщенная как «наука о вскрытии», заключалась в том, чтобы сосредоточиться на мельчайших компонентах системы как средстве ее понимания. [17]

Идея холизма начала вновь обретать популярность в биологии, когда теория эндосимбиоза была впервые предложена Константином Мерешковским в 1905 году и получила дальнейшее развитие Иваном Валлином в 1925 году. Эта теория, принятая и сегодня, постулирует единое происхождение эукариотических клеток посредством симбиотической ассимиляции прокариот. образовывать сначала митохондрии , а затем пластиды (последние в результате нескольких независимых симбиотических событий) посредством фагоцитоза (обзор: Archibald, 2015). [18] Эти древние и основополагающие симбиотические события, которые привели к метаболической и клеточной сложности эукариотической жизни, скорее всего, произошли в океане. [19] [17]

Несмотря на общее признание теории эндосимбиоза, термин холобиоз или холобионт не сразу вошел в научный оборот. Он был придуман независимо немцем Адольфом Мейером-Абихом в 1943 году. [20] [21] и Линн Маргулис в 1990 году, которая предположила, что эволюция происходила главным образом посредством прыжков, вызванных симбиозом, которые объединяли организмы в новые формы, называемые «холобионтами», и только во вторую очередь посредством постепенных мутационных изменений. [22] [23] Однако эта концепция не получила широкого распространения, пока более десяти лет спустя ее не переняли коралловые биологи. Кораллы и динофлагеллятовые водоросли, называемые зооксантеллами, являются одними из самых знаковых примеров симбиоза, встречающихся в природе; большинство кораллов неспособны к долгосрочному выживанию без продуктов фотосинтеза, обеспечиваемых их эндосимбиотическими водорослями. Ровер и др. (2002) [24] были первыми, кто использовал слово холобионт для описания единицы отбора в смысле Маргулиса. [25] для кораллов, где холобионт включал книдарийный полип (хозяин), водоросли Zooxanthellae, различные эктосимбионты ( эндолитические водоросли, прокариоты, грибы, другие одноклеточные эукариоты) и вирусы. [17]

Хотя изначально они были основаны на изучении морских организмов, большая часть исследований новых свойств и значения холобионтов с тех пор была проведена в других областях исследований: микробиота ризосферы растений или кишечника животных стала преобладающими моделями и привела к продолжающаяся смена парадигмы в агрономии и медицинских науках. [26] [27] [28] Голобионты встречаются как в наземной, так и в водной среде обитания, и можно провести несколько аналогий между этими экосистемами. Например, во всех этих средах обитания взаимодействия внутри и между голобионтами, такие как индукция химической защиты, приобретение питательных веществ или образование биопленок, опосредуются химическими сигналами и сигналами в окружающей среде, получившими название инфохимические вещества . [29] [30] [31] [32] Тем не менее, мы можем выделить два основных различия между наземными и водными системами. Во-первых, физико-химические свойства воды приводят к более высокой химической связи и передаче сигналов между макро- и микроорганизмами в водной или влажной среде. В морских экосистемах потоки углерода также кажутся более быстрыми, а трофические режимы более гибкими, что приводит к более высокой пластичности функциональных взаимодействий между холобионтами. [33] Более того, барьеры распространения обычно ниже, что позволяет быстрее перемещать микробное сообщество морских холобионтов. [34] [35] Во-вторых, филогенетическое разнообразие в широких таксономических масштабах (т. е. на уровне надцарства, королевства и типа) выше в водных сферах по сравнению с наземными, при этом большая часть водного разнообразия еще не раскрыта. [36] [37] особенно морские вирусы. [38] [39] [40] [17]

Компоненты холобионта

[ редактировать ]

Хозяин: Хозяином холобионта обычно является многоклеточный эукариот , например растение или человек. [10] Известные хозяева, которые хорошо изучены, включают людей, [41] кораллы, [7] и тополя. [42]

Микробиом: Микробиом включает бактерии, [5] археи , [43] микроскопические грибы, [9] и микроскопические протисты . [5]  

Виром: все вирусы, входящие в состав холобионта, вместе называются виромами . [44]

Грибы. В состав холобионтов могут быть включены многоклеточные грибы, такие как арбускулярные микоризные грибы (АМФ) в корнях растений. [9] [6]

Фенотип холобионта

[ редактировать ]
Фенотип холобионта [4]

Голобионты — это существа, состоящие из хозяина и всех его симбиотических микробов. [4]

холобионта На схеме симбиотические микробы, влияющие на фенотип и эволюционировавшие совместно с хозяином, окрашены в синий цвет, а микробы, влияющие на фенотип холобионта, но не эволюционировавшие совместно с хозяином, окрашены в красный цвет. Те, которые вообще не влияют на фенотип холобионта, окрашены в серый цвет. Микробы могут передаваться вертикально или горизонтально, могут приобретаться из окружающей среды и могут находиться в организме хозяина постоянно или непостоянно. [4]

Отсюда следует, что фенотипы холобионтов могут меняться во времени и пространстве по мере того, как микробы входят в холобионт и выходят из него. Микробы окружающей среды не входят в состав холобионта (белого цвета). Гологеномы затем охватывают геномы хозяина и всех его микробов в любой момент времени, при этом отдельные геномы и гены попадают в одни и те же три функциональные категории: синий, красный и серый. Голобионты и гологеномы — это сущности, тогда как коэволюция или эволюция взаимодействий хозяин-симбионт — это процессы. [4]

Растения

[ редактировать ]
Основная статья: Растительный холобионт

Хотя большая часть работ по взаимодействиям хозяина и микроба была сосредоточена на животных системах, таких как кораллы, губки или человек, существует значительный объем литературы по голобионтам растений. [45] Связанные с растениями микробные сообщества влияют на оба ключевых компонента приспособленности растений: рост и выживание. [6] и формируются наличием питательных веществ и защитными механизмами растений. [9] Было описано, что в нескольких средах обитания обитают микробы, связанные с растениями, включая ризоплану (поверхность корневой ткани), ризосферу (периферию корней), эндосферу (внутри ткани растения) и филлосферу (общая площадь надземной поверхности). . [14] Концепция холобионта первоначально предполагала, что значительная часть генома микробиома вместе с геномом хозяина передается от одного поколения к другому и, таким образом, может передавать уникальные свойства холобионта». [46] В связи с этим исследования показали, что такую ​​роль могут играть семена. Недавно были доказаны доказательства этого процесса, показывающие, что большая часть, до 95%, микробиома семян неправильно транслируется из поколения в поколение. [47]

Растительный холобионт относительно хорошо изучен, при этом особое внимание уделяется сельскохозяйственным видам, таким как бобовые и зерновые . Бактерии, грибы, археи, протисты и вирусы входят в состав холобионта растений. [5]

Типы бактерий, которые, как известно, являются частью голобионта растений, включают Actinomycetota , Bacteroidota , Bacillota и Pseudomonadota . [5] Например, азотфиксаторы, такие как Azotobacter (Pseudomonadota) и Bacillus (Bacillota), значительно улучшают продуктивность растений. [5]

Грибы типов Ascomycota , Basidiomycota , Glomeromycota и Mucoromycotina колонизируют ткани растения и обеспечивают множество функций растения-хозяина. [5] Например, арбускулярные микоризные грибы (Glomeromycota) распространены во всех группах растений и обеспечивают лучшее усвоение питательных веществ, устойчивость к температуре и засухе, а также снижение патогенной нагрузки. [48] Виды Epichloë (Ascomycota) являются частью холобионта овсяницы луговой и обеспечивают устойчивость травоядных животных, вырабатывая алкалоиды спорыньи , которые вызывают эрготизм у млекопитающих. [49]

Протисты растительного холобионта менее изучены, при этом большая часть знаний ориентирована на патогены. Однако имеются примеры комменсалистических растительно-протистских ассоциаций, например Phytomonas ( Trypanosomatidae ). [50]

Морской

[ редактировать ]
Основная статья: Морской холобионт

Кораллы, строящие рифы, представляют собой холобионты, которые включают сам коралл (эукариотические беспозвоночные класса Anthozoa ), фотосинтезирующие динофлагелляты, называемые зооксантеллами ( Symbiodinium ), и связанные с ними бактерии и вирусы. [7] Существуют модели коэволюции коралловых микробных сообществ и филогении кораллов. [51]

Эффекты стрессоров

[ редактировать ]
Влияние стрессоров на холобионта
Реакция холобионта на стрессоры

Стрессоры могут напрямую изменять физиологию и иммунитет хозяина, а также состав и плотность симбиотического сообщества. Стрессоры могут также косвенно влиять на симбиотическое сообщество, изменяя физиологию хозяина (которая представляет собой симбиотическую нишу) и иммунное состояние хозяина. И наоборот, симбионты могут смягчать стрессоры посредством снабжения питательными веществами, физиологической толерантности и защиты от естественных врагов хозяина. [55]

Реакцию холобионта на стрессоры трудно предсказать, поскольку многие факторы могут подвергаться селекции. Сюда входят гены устойчивости хозяина и пластические механизмы, а также приобретение симбионтов, которые могут составить пул генов с новыми функциями. Некоторыми ключевыми факторами, которые могут предпочтительно выбирать хозяина или симбионтов для адаптации к стрессорам, являются: (1) особенности стрессора, такие как его частота или амплитуда, а также его комбинация с другим стрессором, которая может привести к аддитивному синергетическому эффекту. или взаимодействие антагонистов; (2) способ передачи симбионтов; (3) специфичность и эффективность данного механизма буферизации, а также чистый баланс между его затратами и выгодами. [55]

Холобиомика

[ редактировать ]

Холобиомика — это научный анализ сообщества холобионтов, который фокусируется на взаимосвязях между его компонентами в контексте преобладающих условий окружающей среды, а не на отдельных частях. Научный подход к этой развивающейся области исследований основан на концепции холизма . Целью холобиомики является изучение холобионтов системы, их свойств и взаимодействий в целом.

Термин «холобиомика» составлен из греческих элементов όλος ( холос ), «весь, целый, тотальный», и βίος ( биос ), «жизнь», оканчивающихся на -оме ( биом ); и суффикс - омикс (-ομική, женский род), обозначающий подобласти современной биологии , целью которых является характеристика и количественная оценка совокупности подобных отдельных элементов с целью сделать выводы о структуре, функции и динамике системы.

Чтобы сделать вывод о свойствах и взаимодействиях симбиотических партнеров, используются методы молекулярной биологии, [56] экология, [57] и моделирование [58] совмещены.

Споры

[ редактировать ]
Визуальное изображение холобионта: человек и его микробиом

В последние годы были разработаны мощные, но относительно недорогие инструменты для характеристики микробных сообществ, в том числе технологии высокопроизводительного секвенирования, такие как полногеномное секвенирование . Эти технологические достижения привели к взрывному росту интереса к микробной экологии и эволюции взаимоотношений микроб-хозяин. Некоторые исследователи задаются вопросом, необходима ли концепция холобионта и отражает ли она тонкости взаимоотношений хозяина и симбионта. [59] В 2016 году Дуглас и Веррен подвергли сомнению концепцию, согласно которой «голобионт (хозяин плюс его микробиом) и составляющий его гологеном (совокупность геномов в холобионте) являются единицей отбора, и поэтому эта единица обладает свойствами, сходными с индивидуальными. организм". [60] Они утверждают, что «концепция хологенома бесполезна для изучения взаимодействий хозяина с резидентными микроорганизмами, поскольку она фокусируется на одном уровне отбора (холобионте) и, как следствие, касается кооперативных и интегративных особенностей систем хозяин-микроб. исключение других видов взаимодействий, включая антагонизм между микроорганизмами и конфликты между хозяином и микробными партнерами». [60]

Голобионт и, как следствие, концепция гологенома остаются спорными, особенно в отношении хозяина и его микробиома как единой эволюционной единицы. [61] Чтобы подтвердить концепцию холобионта с эволюционной точки зрения, необходимы новые теоретические подходы, которые признают различные уровни, на которых естественный отбор может действовать в контексте взаимодействий микробиома и хозяина. Например, отбор может происходить на уровне холобионта, когда может поддерживаться трансгенерационная ассоциация между конкретными генотипами хозяина и симбионта. [61]

Тем не менее, концепция холобионта привела к смещению акцента с симбиозов с участием одного микробного партнера и одного хозяина (кальмары и люминесцентные Aliivibrio , бобовые и Rhizobium , тли и Buchnera ) к большему интересу к симбиозам в сложных многопартнерских консорциумах ( кишечные системы животных, морские беспозвоночные, эпифиты растений и морских водорослей, микробно-микробные взаимодействия в почве, водные биомы). [61] Более того, существует понимание того, что даже относительно хорошо изученные бинарные симбиозы, такие как тля и Buchnera, являются более сложными и включают ряд разнообразных факультативных симбионтов, способствующих устойчивости к паразитам. [62] расширение использования растения-хозяина [63] и температурная адаптация. [64] [61]

См. также

[ редактировать ]

Ссылки

[ редактировать ]
  1. ^ Брукс А.В., Коль К.Д., Брукер Р.М., ван Опстал Э.Дж., Борденштайн С.Р. (ноябрь 2016 г.). «Филосимбиоз: взаимоотношения и функциональные эффекты микробных сообществ в истории эволюции хозяина» . ПЛОС Биология . 14 (11): e2000225. дои : 10.1371/journal.pbio.2000225 . ПМЦ   5115861 . ПМИД   27861590 . Материал был скопирован из этого источника, который доступен по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .
  2. ^ Jump up to: а б с Маргулис Л., Фестер Р. (1991). Симбиоз как источник эволюционных инноваций . МТИ Пресс. ISBN  9780262132695 .
  3. ^ Баедке Дж., Фабрегас-Техеда А., Ньевес Дельгадо А. (2020). «Концепция холобионта до Маргулиса» . J Exp Zool (Мол Дев Эвол) . 334 (3): 149–55. дои : 10.1002/jez.b.22931 . ПМК   212183 . ПМИД   3294806 .
  4. ^ Jump up to: а б с д и Тайс К.Р., Дейли Н.М., Классен Дж.Л., Брукер Р.М., Бейнс Дж.Ф., Бош Т.К., Крайан Дж.Ф., Гилберт С.Ф., Гуднайт С.Дж., Ллойд Э.А., Сапп Дж., Ванденкорнхейс П., Зильбер-Розенберг И., Розенберг Э., Борденштайн С.Р. (2016). «Правильное понимание концепции гологенома: эко-эволюционная основа хозяев и их микробиомов» . mSystems . 1 (2). дои : 10.1128/mSystems.00028-16 . ПМК   5069740 . ПМИД   27822520 . Материал был скопирован из этого источника, который доступен по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .
  5. ^ Jump up to: а б с д и ж г Де Вегер Л.А., ван дер Влюгт К.И., Вейфьес А.Х., Баккер П.А., Шипперс Б., Лугтенберг Б. (июнь 1987 г.). «Для колонизации корней картофеля необходимы жгутики штамма Pseudomonas fluorescens, стимулирующего рост растений» . Журнал бактериологии . 169 (6): 2769–73. дои : 10.1128/jb.169.6.2769-2773.1987 . ПМК   212183 . ПМИД   3294806 .
  6. ^ Jump up to: а б с Ванденкокорнхейз П., Кайзер А., Дюамель М., Ле Ван А., Дюфрен А. (июнь 2015 г.). «Значение микробиома холобионта растений» . Новый фитолог . 206 (4): 1196–206. дои : 10.1111/nph.13312 . ПМИД   25655016 .
  7. ^ Jump up to: а б с Ноултон Н., Ровер Ф. (октябрь 2003 г.). «Многовидовые микробные мутуализмы на коралловых рифах: хозяин как среда обитания». Американский натуралист . 162 (4 Приложения): S51–62. дои : 10.1086/378684 . ПМИД   14583857 . S2CID   24127308 .
  8. ^ Jump up to: а б Крамер П., Брессан П. (июль 2015 г.). «Люди как суперорганизмы: как микробы, вирусы, импринтированные гены и другие эгоистичные сущности формируют наше поведение» . Перспективы психологической науки . 10 (4): 464–81. дои : 10.1177/1745691615583131 . hdl : 11577/3162912 . ПМИД   26177948 . S2CID   12954636 .
  9. ^ Jump up to: а б с д и Санчес-Канисарес К, Хоррин Б, Пул П.С., Ткач А (август 2017 г.). «Понимание холобионта: взаимозависимость растений и их микробиома» . Современное мнение в микробиологии . 38 : 188–196. дои : 10.1016/j.mib.2017.07.001 . ПМИД   28732267 . S2CID   11555411 .
  10. ^ Jump up to: а б с Борденштейн С.Р., Тайс КР (август 2015 г.). «Биология хозяина в свете микробиома: десять принципов холобионтов и гологеномов» . ПЛОС Биология . 13 (8): e1002226. дои : 10.1371/journal.pbio.1002226 . ПМЦ   4540581 . ПМИД   26284777 .
  11. ^ Гордон Дж., Ноултон Н., Релман Д.А., Ровер Ф., Юл М. (2013). «Сверхорганизмы и холобионты» . Микроб . 8 (4): 152–153. дои : 10.1128/микроб.8.152.1 .
  12. ^ Уилер В.М. (1928). Общественные насекомые, их происхождение и эволюция . Харкорт Брейс.
  13. ^ Розенберг Э., Зильбер-Розенберг I (март 2016 г.). «Микробы стимулируют эволюцию животных и растений: концепция гологенома» . мБио . 7 (2): e01395. дои : 10.1128/mBio.01395-15 . ПМЦ   4817260 . ПМИД   27034283 .
  14. ^ Jump up to: а б с Угарелли К., Чакрабарти С., Лаас П., Стингл У. (декабрь 2017 г.). «Голобионт морской травы и его микробиом» . Микроорганизмы . 5 (4): 81. doi : 10.3390/microorganisms5040081 . ПМЦ   5748590 . ПМИД   29244764 . Материал был скопирован из этого источника, который доступен по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .
  15. ^ Аристотель Метафизика Z.17, 1041b11–33
  16. ^ Роткале, Лива (2018). «Форма не является надлежащей частью метафизики Аристотеля Z.17, 1041b11–33» . Метафизика . 1 : 75–87. дои : 10.5334/мет.13 . S2CID   171840883 .
  17. ^ Jump up to: а б с д Диттами, Саймон М.; и др. (2021). «Взгляд сообщества на концепцию морских холобионтов: текущее состояние, проблемы и будущие направления» . ПерДж . 9 : е10911. дои : 10.7717/peerj.10911 . ПМЦ   7916533 . ПМИД   33665032 . Материал был скопирован из этого источника, который доступен по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .
  18. ^ Арчибальд, Джон М. (2015). «Эндосимбиоз и эволюция эукариотических клеток» . Современная биология . 25 (19): Р911–Р921. дои : 10.1016/j.cub.2015.07.055 . ПМИД   26439354 . S2CID   16089231 .
  19. ^ Мартин, Уильям; Баросс, Джон; Келли, Дебора; Рассел, Майкл Дж. (2008). «Гидротермальные источники и происхождение жизни». Обзоры природы Микробиология . 6 (11): 805–814. дои : 10.1038/nrmicro1991 . ПМИД   18820700 . S2CID   1709272 .
  20. ^ Мейер-Абих А. (1943). «Вклад в эволюционную теорию организмов: I. Основной типологический закон и его последствия» Acta Biotheoretica , 7 : 1–80.
  21. ^ Бедке, Ян; Фабрегас-Техеда, Алехандро; Ньевес Дельгадо, Эбигейл (2020). «Концепция холобионта до Маргулиса» . Журнал экспериментальной зоологии, часть B: Молекулярная эволюция и эволюция развития . 334 (3): 149–155. дои : 10.1002/jez.b.22931 . ПМИД   32039567 . Материал был скопирован из этого источника, который доступен по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .
  22. ^ Маргулис, Линн; Фестер, Рене (1991). Симбиоз как источник эволюционных инноваций: видообразование и морфогенез . МТИ Пресс. ISBN  9780262132695 .
  23. ^ о'Мэлли, Морин А. (2017). «От эндосимбиоза к холобионтам: оценка концептуального наследия». Журнал теоретической биологии . 434 : 34–41. Бибкод : 2017JThBi.434...34O . дои : 10.1016/j.jtbi.2017.03.008 . ПМИД   28302492 .
  24. ^ Ровер, Ф.; Сегуритан, В.; Азам, Ф.; Ноултон, Н. (2002). «Разнообразие и распространение коралловых бактерий» . Серия «Прогресс в области морской экологии» . 243 : 1–10. Бибкод : 2002MEPS..243....1R . дои : 10.3354/meps243001 .
  25. ^ Розенберг, Юджин; Корен, Омри; Решеф, Лия; Эфроний, Ротем; Зильбер-Розенберг, Илана (2007). «Теория гологенома игнорирует коралловый холобионт: ответ Розенберга и др.» . Обзоры природы Микробиология . 5 (10): 826. doi : 10.1038/nrmicro1635-c2 . S2CID   8258214 .
  26. ^ Булгарелли, Давиде; Шлеппи, Клаус; Спепен, Стейн; Ван Темаат, Эмиэль Вер Лорен; Шульце-Леферт, Пол (2013). «Структура и функции бактериальной микробиоты растений». Ежегодный обзор биологии растений . 64 : 807–838. doi : 10.1146/annurev-arplant-050312-120106 . ПМИД   23373698 .
  27. ^ Шрайнер, Эндрю Б.; Као, Джон Ю.; Янг, Винсент Б. (2015). «Микробиом кишечника в норме и при болезни» . Современное мнение в гастроэнтерологии . 31 (1): 69–75. дои : 10.1097/MOG.0000000000000139 . ПМК   4290017 . ПМИД   25394236 .
  28. ^ Фор, Денис; Симон, Жан-Кристоф; Элен, Тьерри (2018). «Голобионт: концептуальная основа для изучения экоэволюционных и функциональных последствий взаимодействия хозяина и микробиоты во всех экосистемах» . Новый фитолог . 218 (4): 1321–1324. дои : 10.1111/nph.15199 . ПМИД   29738088 .
  29. ^ Лох, Джон; Пирсон, Элизабет А.; Пирсон, Леланд С.; Стейси, Гэри; Чаттерджи, Арун (2002). «Ощущение кворума у ​​бактерий, связанных с растениями». Современное мнение в области биологии растений . 5 (4): 285–290. дои : 10.1016/S1369-5266(02)00274-1 . ПМИД   12179960 .
  30. ^ Хардер, Тилманн; Кэмпбелл, Александра Х.; Иган, Сухелен; Стейнберг, Питер Д. (2012). «Химическое опосредование тройных взаимодействий между морскими холобионтами и окружающей их средой на примере красной водоросли Delisea pulchra». Журнал химической экологии . 38 (5): 442–450. дои : 10.1007/s10886-012-0119-5 . ПМИД   22527059 . S2CID   14117311 .
  31. ^ Роллан, Жан Люк; Стин, Дидье; Санчес-Ферандин, Софи; Лами, Рафаэль (2016). «Ощущение кворума и тушение кворума в фикосфере фитопланктона: случай химических взаимодействий в экологии» (PDF) . Журнал химической экологии . 42 (12): 1201–1211. дои : 10.1007/s10886-016-0791-y . ПМИД   27822708 . S2CID   16684025 .
  32. ^ Саха, Махасвета; Бердалет, Элиза; Каротенуто, Иления; Финк, Патрик; Хардер, Тилманн; Джон, Уве; Нет, Фабрис; Понерт, Георг; Потен, Филипп; Селандер, Эрик; Виверман, Вим; Уичард, Томас; Зупо, Валерио; Стейнке, Майкл (2019). «Использование химического языка для формирования будущего здоровья морской среды». Границы в экологии и окружающей среде . 17 (9): 530–537. дои : 10.1002/fee.2113 . hdl : 1854/LU-8640919 . S2CID   191151384 .
  33. ^ Митра, А.; Флинн, К.Дж.; Беркхолдер, Дж. М.; Берге, Т.; Кальбет, А.; Рэйвен, Дж.А.; Гранели, Э.; Глиберт, премьер-министр; Хансен, П.Дж.; Стокер, ДК; Тингстад, Ф.; Тильманн, У.; Воге, С.; Уилкен, С.; Зубков, М.В. (2014). «Роль миксотрофных простейших в биологическом углеродном насосе» . Биогеонауки . 11 (4): 995–1005. Бибкод : 2014BGeo...11..995M . дои : 10.5194/bg-11-995-2014 . hdl : 10453/117781 . S2CID   215764908 . Материал был скопирован из этого источника, который доступен по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .
  34. ^ Кинлан, Брайан П.; Гейнс, Стивен Д. (2003). «Распространение размножения в морской и наземной среде: точка зрения сообщества». Экология . 84 (8): 2007–2020. дои : 10.1890/01-0622 .
  35. ^ Берджесс, Скотт С.; Баскетт, Марисса Л.; Гросберг, Ричард К.; Морган, Стивен Г.; Стратманн, Ричард Р. (2016). «Когда происходит рассредоточение? Объединение морских и наземных перспектив» . Биологические обзоры . 91 (3): 867–882. дои : 10.1111/brv.12198 . ПМИД   26118564 . S2CID   9877585 .
  36. ^ Де Варгас, К.; и др. (2015). «Разнообразие эукариотического планктона в освещенном солнцем океане» . Наука . 348 (6237). дои : 10.1126/science.1261605 . hdl : 10261/117736 . ПМИД   25999516 . S2CID   12853481 .
  37. ^ Томпсон, Люк Р.; и др. (2017). «Общий каталог раскрывает многомасштабное микробное разнообразие Земли» . Природа . 551 (7681): 457–463. Бибкод : 2017Natur.551..457T . дои : 10.1038/nature24621 . ПМК   6192678 . ПМИД   29088705 . Материал был скопирован из этого источника, который доступен по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .
  38. ^ Мидделбо, Матиас; Брюссаард, Корина (2017). «Морские вирусы: ключевые игроки в морских экосистемах» . Вирусы . 9 (10): 302. дои : 10.3390/v9100302 . ПМК   5691653 . ПМИД   29057790 . Материал был скопирован из этого источника, который доступен по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .
  39. ^ Грегори, Энн К.; и др. (2019). «Морское ДНК-вирусное макро- и микроразнообразие от полюса до полюса» . Клетка . 177 (5): 1109–1123.e14. дои : 10.1016/j.cell.2019.03.040 . ПМК   6525058 . ПМИД   31031001 .
  40. ^ Домингес-Уэрта, Гильермо; Заид, Ахмед А.; Вайнайна, Джеймс М.; Го, Цзярун; Тиан, Фунин; Пратама, Акбар Аджи; Болдук, Бенджамин; Мохссен, Мохамед; Заблоки, Оливье; Пеллетье, Эрик; Делаж, Эрван (10 июня 2022 г.). «Разнообразие и экологический след РНК-вирусов Мирового океана» . Наука . 376 (6598): 1202–1208. Бибкод : 2022Sci...376.1202T . дои : 10.1126/science.abn6358 . ISSN   0036-8075 . ПМИД   35679415 . S2CID   249544984 .
  41. ^ ван де Гухте М., Блоттьер Х.М., Доре Ж. (май 2018 г.). «Люди как голобионты: значение для профилактики и терапии» . Микробиом . 6 (1): 81. дои : 10.1186/s40168-018-0466-8 . ПМЦ   5928587 . ПМИД   29716650 .
  42. ^ Хаккард С., Шадт CW (март 2015 г.). «На пути к целостному пониманию полезных взаимодействий микробиома Populus». Новый фитолог . 205 (4): 1424–30. дои : 10.1111/nph.13133 . hdl : 11858/00-001M-0000-0025-72E9-F . ОСТИ   1286722 . ПМИД   25422041 .
  43. ^ Хассани М.А., Дуран П., Хаккард С. (март 2018 г.). «Микробные взаимодействия внутри холобионта растений» . Микробиом . 6 (1): 58. дои : 10.1186/s40168-018-0445-0 . ПМК   5870681 . ПМИД   29587885 .
  44. ^ Грасис Дж.А. (2017). «Внутризависимость вирусов и холобионта» . Границы в иммунологии . 8 : 1501. дои : 10.3389/fimmu.2017.01501 . ПМЦ   5684104 . ПМИД   29170664 .
  45. ^ Кусио С., Энгелен А.Х., Коста Р., Мюзер Г. (2016). «Ризосферные микробиомы европейских + морских трав выбираются растением, но не являются видовыми» . Границы микробиологии . 7 : 440. дои : 10.3389/fmicb.2016.00440 . ПМЦ   4815253 . ПМИД   27065991 .
  46. ^ Розенберг Э., Зильбер-Розенберг I (апрель 2018 г.). «Гологеномная концепция эволюции через 10 лет» . Микробиом . 6 (1): 78. дои : 10.1186/s40168-018-0457-9 . ПМЦ   5922317 . ПМИД   29695294 .
  47. ^ Абдельфаттах А., Вишневски М., Шена Л., Тэк А.Дж. (январь 2021 г.). «Экспериментальные доказательства наследования микробов у растений и путей передачи от семян к филлосфере и корням» . Экологическая микробиология . 23 (4): 2199–2214. дои : 10.1111/1462-2920.15392 . ПМИД   33427409 .
  48. ^ Бегум Н., Цинь С., Ахангер М.А., Раза С., Хан М.И., Ашраф М., Ахмед Н., Чжан Л. (2019). «Роль арбускулярных микоризных грибов в регуляции роста растений: влияние на устойчивость к абиотическому стрессу» . Границы в науке о растениях . 10 : 1068. дои : 10.3389/fpls.2019.01068 . ПМК   6761482 . ПМИД   31608075 .
  49. ^ Герр П. (март 2015 г.). «Алкалоиды спорыньи, продуцируемые эндофитными грибами рода Epichloë» . Токсины . 7 (3): 773–90. дои : 10.3390/toxins7030773 . ПМЦ   4379524 . ПМИД   25756954 .
  50. ^ Швельм А., Бадстобер Дж., Булман С., Десуаньи Н., Этемади М., Фаллун Р.Э. и др. (апрель 2018 г.). «Нет в привычном топ-10: протисты, поражающие растения и водоросли» . Молекулярная патология растений . 19 (4): 1029–1044. дои : 10.1111/mpp.12580 . ПМЦ   5772912 . ПМИД   29024322 .
  51. ^ Поллок Ф.Дж., МакМиндс Р., Смит С., Борн Д.Г., Уиллис Б.Л., Медина М. и др. (ноябрь 2018 г.). «Бактерии, ассоциированные с кораллами, демонстрируют филосимбиоз и кофилогению» . Природные коммуникации . 9 (1): 4921. Бибкод : 2018NatCo...9.4921P . дои : 10.1038/s41467-018-07275-x . ПМК   6250698 . ПМИД   30467310 .
  52. ^ Томпсон-младший, Ривера Х.Э., Клосек С.Дж., Медина М. (2014). «Микробы в коралловом холобионте: партнеры в эволюции, развитии и экологических взаимодействиях» . Границы клеточной и инфекционной микробиологии . 4 : 176. дои : 10.3389/fcimb.2014.00176 . ПМК   4286716 . ПМИД   25621279 .
  53. ^ Пита Л., Рикс Л., Слаби Б.М., Франке А., Хентшель Ю. (март 2018 г.). «Губка-голобионт в меняющемся океане: от микробов к экосистемам» . Микробиом . 6 (1): 46. дои : 10.1186/s40168-018-0428-1 . ПМЦ   5845141 . ПМИД   29523192 . Материал был скопирован из этого источника, который доступен по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .
  54. ^ Кавальканти Г.С., Шукла П., Моррис М., Рибейро Б., Фоли М., Доан М.П., ​​Томпсон К.С., Эдвардс М.С., Динсдейл Э.А., Томпсон Флорида (сентябрь 2018 г.). «Голобионты родолитов в меняющемся океане: взаимодействие хозяина и микробов обеспечивает устойчивость коралловых водорослей в условиях закисления океана» . БМК Геномика . 19 (1): 701. doi : 10.1186/s12864-018-5064-4 . ПМК   6154897 . ПМИД   30249182 . Материал был скопирован из этого источника, который доступен по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .
  55. ^ Jump up to: а б Бенар А., Вавр Ф., Кремер Н. (2020). «Стресс и симбиоз: орел или решка?» . Границы экологии и эволюции . 8 : 167. дои : 10.3389/fevo.2020.00167 . . Материал был скопирован из этого источника, который доступен по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .
  56. ^ Поульсен, Майкл; Ху, Хаофу; Ли, Цай; Чен, Чжэньшэн; Сюй, Луохао; Отани, Сария; Найгаард, Санне; Нобре, Таня; Клаубауф, Сильвия; Шиндлер, Филипп М.; Хаузер, Франк (07 октября 2014 г.). «Дополнительный вклад симбионтов в разложение растений у термитов, выращивающих грибы» . Труды Национальной академии наук . 111 (40): 14500–14505. Бибкод : 2014PNAS..11114500P . дои : 10.1073/pnas.1319718111 . ISSN   0027-8424 . ПМК   4209977 . ПМИД   25246537 .
  57. ^ Пакетт, Ален; Мессье, Кристиан (2011). «Влияние биоразнообразия на продуктивность деревьев: от умеренных до бореальных лесов» . Глобальная экология и биогеография . 20 (1): 170–180. дои : 10.1111/j.1466-8238.2010.00592.x . ISSN   1466-8238 .
  58. ^ Зиглер, Марен; Эгилуз, Виктор М; Дуарте, Карлос М; Вулстра, Кристиан Р. (январь 2018 г.). «Редкие симбионты могут способствовать устойчивости кораллово-водорослевых комплексов» . Журнал ISME . 12 (1): 161–172. дои : 10.1038/ismej.2017.151 . ISSN   1751-7362 . ПМК   5739009 . ПМИД   29192903 .
  59. ^ Моран Н.А., Слоан Д.Б. (декабрь 2015 г.). «Концепция гологенома: полезная или пустая?» . ПЛОС Биология . 13 (12): e1002311. дои : 10.1371/journal.pbio.1002311 . ПМК   4670207 . ПМИД   26636661 .
  60. ^ Jump up to: а б Дуглас А.Э., Веррен Дж.Х. (март 2016 г.). «Дыры в гологеноме: почему симбиозы хозяина и микроба не являются холобионтами» . мБио . 7 (2): e02099. дои : 10.1128/mBio.02099-15 . ПМЦ   4817262 . ПМИД   27034285 .
  61. ^ Jump up to: а б с д Иган С., Фукацу Т., Франсино, член парламента (2020). «Возможности и проблемы исследования микробного симбиоза в эпоху микробиома» . Границы микробиологии . 11 : 1150. дои : 10.3389/fmicb.2020.01150 . ПМЦ   7308722 . ПМИД   32612581 . Материал был скопирован из этого источника, который доступен по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .
  62. ^ Оливер К.М., Рассел Дж.А., Моран Н.А., Хантер М.С. (февраль 2003 г.). «Факультативные бактериальные симбионты тлей придают устойчивость к осам-паразитам» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 100 (4): 1803–7. Бибкод : 2003PNAS..100.1803O . дои : 10.1073/pnas.0335320100 . ПМК   149914 . ПМИД   12563031 .
  63. ^ Цучида Т., Кога Р., Фукацу Т. (март 2004 г.). «Специализация растения-хозяина, управляемая факультативным симбионтом». Наука . 303 (5666). Нью-Йорк, штат Нью-Йорк: 1989. doi : 10.1126/science.1094611 . ПМИД   15044797 . S2CID   46139967 .
  64. ^ Монтллор CB, Максмен А., Перселл А.Х. (2002). «Факультативные бактериальные эндосимбионты приносят пользу гороховой тле Acyrthosiphon pisum при тепловом стрессе» . Экологическая энтомология . 27 (2): 189–195. doi : 10.1046/j.1365-2311.2002.00393.x .
Retrieved from "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Holobiont&oldid=1225532848"
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: c66d7107fe60b51440e931dd4828cb85__1716589500
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/c6/85/c66d7107fe60b51440e931dd4828cb85.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Holobiont - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)