Бацилла
Бацилла | |
---|---|
![]() | |
Bacillus subtilis , окрашенный | |
Научная классификация ![]() | |
Домен: | Бактерии |
Тип: | Бациллота |
Сорт: | Бациллы |
Заказ: | Бациллы |
Семья: | Бацилловые |
Род: | Бацилла Кон |
Разновидность | |
Bacillus «палочка») — род грамположительных бактерий палочковидных (лат . , входящий в тип Bacillota , насчитывающий 266 названных видов . Этот термин также используется для описания формы (стержня) других бактерий такой формы; а множественное число Bacilli — это название класса бактерий , к которому принадлежит этот род. Bacillus Виды могут быть либо облигатными аэробами , зависящими от кислорода , либо факультативными анаэробами , способными выживать в отсутствие кислорода. Культивируемые виды Bacillus дают положительный результат на фермент каталазу, если использовался или присутствует кислород. [1]
Бациллы могут превращаться в овальные эндоспоры и оставаться в этом состоянии покоя в течение многих лет. Сообщается, что эндоспора одного вида из Марокко выжила при нагревании до 420 ° C. [2] Образование эндоспор обычно вызвано недостатком питательных веществ: бактерия делится внутри клеточной стенки, и одна сторона затем поглощает другую. Они не являются настоящими спорами (т. е. не потомками). [3] Образование эндоспор первоначально определяло род, но не все такие виды тесно связаны, и многие виды были перенесены в другие роды Bacillota . [4] В каждой клетке образуется только одна эндоспора. Споры устойчивы к жаре, холоду, радиации, высушиванию и дезинфицирующим средствам. Bacillus anthracis для образования спор необходим кислород; это ограничение имеет важные последствия для эпидемиологии и контроля. [5] In vivo B. anthracis производит капсулу из полипептида (полиглутаминовой кислоты), которая убивает ее в результате фагоцитоза. [5] Роды Bacillus и Clostridium составляют семейство Bacillaceae . Виды идентифицируются по морфологическим и биохимическим критериям. [1] Поскольку споры многих видов Bacillus устойчивы к теплу, радиации, дезинфицирующим средствам и высыханию, их трудно удалить из медицинских и фармацевтических материалов, и они являются частой причиной загрязнения. Они не только устойчивы к теплу, радиации и т. д., но также устойчивы к химическим веществам, таким как антибиотики. [6] Это сопротивление позволяет им выживать в течение многих лет, особенно в контролируемой среде. [6] Виды Bacillus хорошо известны в пищевой промышленности как вредные организмы, вызывающие порчу. [1]
Повсеместно встречающиеся в природе Bacillus включают симбиотические (иногда называемые эндофитами ), а также независимые виды. Два вида имеют медицинское значение: B. anthracis вызывает сибирскую язву ; [7] и B. cereus вызывает пищевое отравление . [8]
Многие виды Bacillus могут производить большое количество ферментов, которые используются в различных отраслях промышленности, например, при производстве альфа-амилазы, используемой при гидролизе крахмала, и протеазы субтилизина, используемой в моющих средствах . B. subtilis является ценной моделью для бактериальных исследований. Некоторые Bacillus виды способны синтезировать и секретировать липопептиды , в частности сурфактины и микосубтилины . [9] [10] [11] Виды Bacillus также встречаются в морских губках . [11] Связанная с морской губкой Bacillus subtilis (штаммы WS1A и YBS29) может синтезировать несколько противомикробных пептидов. [11] [12] Эти штаммы Bacillus subtilis могут развивать у Labeo rohita устойчивость к болезням . [11]
Структура
[ редактировать ]Клеточная стенка
[ редактировать ]
Клеточная стенка Bacillus клетки представляет собой структуру на внешней стороне клетки, которая образует второй барьер между бактерией и окружающей средой и в то же время сохраняет форму стержня и выдерживает давление, создаваемое тургором . Клеточная стенка состоит из тейхоевой и тейхуроновой кислот. B. subtilis — первая бактерия, для которой установлена роль актиноподобного . цитоскелета в определении формы клеток и синтезе пептидогликана и локализован весь набор ферментов, синтезирующих пептидогликаны Роль цитоскелета в формировании и поддержании формы важна. [13]
Виды Bacillus представляют собой палочковидные, образующие эндоспоры аэробные или факультативно анаэробные грамположительные бактерии; в культурах некоторых видов с возрастом могут стать грамотрицательными. Многие виды этого рода обладают широким спектром физиологических способностей, которые позволяют им жить в любой природной среде. В каждой клетке образуется только одна эндоспора. Споры устойчивы к жаре, холоду, радиации, высушиванию и дезинфицирующим средствам. [1]
Происхождение имени
[ редактировать ]Род Bacillus был назван в 1835 году Кристианом Готфридом Эренбергом и включает палочковидные (бациллы) бактерии. Семью годами ранее он назвал род Bacterium . Bacillus внес поправки в Позже Фердинанд Кон , чтобы дополнительно описать их как спорообразующие, грамположительные, аэробные или факультативно анаэробные бактерии. [14] Как и другие роды, связанные с ранней историей микробиологии, такие как Pseudomonas и Vibrio , 266 видов Bacillus распространены повсеместно. [15] Этот род имеет очень большое разнообразие рибосом 16S . [16]
Изоляция и идентификация
[ редактировать ]Установленные методы выделения видов Bacillus для культуры в основном включают в себя суспендирование образцов почвы в дистиллированной воде, тепловой шок для уничтожения вегетативных клеток, оставляя в образце преимущественно жизнеспособные споры, и культивирование на чашках с агаром с дальнейшими тестами для подтверждения идентичности культивируемых колоний. [17] Кроме того, колонии, которые проявляют характеристики, типичные для бактерий Bacillus , могут быть выбраны из культуры образца окружающей среды, который был значительно разбавлен после теплового шока или сушки горячим воздухом, чтобы выбрать потенциальные Bacillus для тестирования. бактерии [18]
Культивируемые колонии обычно крупные, раскидистые и неправильной формы. Под микроскопом клетки Bacillus выглядят как палочки, и значительная часть клеток обычно содержит овальные эндоспоры на одном конце, что приводит к их выпуклости. [19]
Характеристики Bacillus spp.
[ редактировать ]Если Пол и др. (2021) [11] выделили и идентифицировали несколько штаммов Bacillus subtilis (штаммы WS1A, [20] ЯБС29, [21] КСП163А, [22] ОА122, [23] ИСП161А, [24] ОИ6, [25] WS11, [26] КСП151Э, [27] и S8, [28] ) из морских губок района острова Святого Мартина в Бенгальском заливе , Бангладеш . На основании их изучения колонии, морфологические, физиологические и биохимические характеристики Bacillus spp. показаны в таблице ниже. [11]
Тип теста | Тест | Характеристики |
Персонажи колонии | Размер | Середина |
Тип | Круглый | |
Цвет | Беловатый | |
Форма | Выпуклый | |
Морфологические символы | Форма | Стержень |
Физиологические признаки | Подвижность | + |
Рост при 6,5% NaCl | + | |
Биохимические признаки | Окраска по Граму | + |
Оксидаза | - | |
Каталаза | + | |
Окислительно-ферментативный | ИЗ | |
Подвижность | + | |
Метиловый красный | + | |
Фогес-Проскауэр | - | |
Индол | - | |
H 2 Производство S | +/– | |
Уреаза | - | |
Нитратредуктаза | + | |
β-галактозидаза | + | |
Гидролиз | Желатин | + |
Эскулин | + | |
Казеин | + | |
Твин 40 | + | |
Твин 60 | + | |
Твин 80 | + | |
Производство кислоты из | Глицерин | + |
Галактоза | + | |
D-глюкоза | + | |
D-фруктоза | + | |
D-манноза | + | |
Маннитол | + | |
N-ацетилглюкозамин | + | |
Амигдалин | + | |
Мальтоза | + | |
D-Мелибиоза | + | |
D-трегалоза | + | |
Гликоген | + | |
D-Тураноза | + |
Примечание: + = положительный, – = отрицательный, O = окислительный, F = ферментативный.
Филогения
[ редактировать ]Были представлены три предположения, представляющие филогению рода Bacillus . Первое предложение, представленное в 2003 году, представляет собой исследование, специфичное для Bacillus , при этом наибольшее разнообразие охвачено с использованием 16S и регионов ITS. Он делит род на 10 групп. Сюда входят вложенные роды Paenibacillus , Brevibacillus , Geobacillus , Marinibacillus и Virgibacillus . [29]
Второе предложение, представленное в 2008 году, [30] построили дерево 16S (и 23S, если таковое имеется) всех проверенных видов. [31] [32] Род Bacillus содержит очень большое количество вложенных таксонов, в основном как 16S, так и 23S. Парафилетичен к лактобактериям ( и Lactobacillus, Streptococcus, Staphylococcus, Listeria др.), обусловленным Bacillus coahuilensis и другими. [33]
Третье предложение, представленное в 2010 году, представляло собой исследование конкатенации генов и дало результаты, аналогичные предложению 2008 года, но с гораздо более ограниченным количеством видов с точки зрения групп. [34] использовалась (В этой схеме Listeria в качестве внешней группы, поэтому в свете дерева ARB она может быть «наизнанку»).
Одна клада, образованная Bacillus anthracis , Bacillus cereus , Bacillus mycoides , Bacillus pseudomycoides , Bacillus thuringiensis и Bacillus weihenstephanensis , согласно стандартам классификации 2011 года, должна представлять собой один вид (в пределах 97% 16S-идентичности), но по медицинским показаниям они считаются отдельные виды [35] (проблема также актуальна для четырех видов Shigella и Escherichia coli ). [36]
Филогеномное исследование 1104 протеомов Bacillus было основано на 114 основных белках и выявило взаимоотношения между различными видами, определяемыми как Bacillus из таксономии NCBI. [37] Различные штаммы были сгруппированы в виды на основе значений средней идентичности нуклеотидов (ANI) с пороговым значением вида 95%. [37]
бацилл Филогенетика | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Филогения рода Bacillus по данным [34] |
Разновидность
[ редактировать ]- Б. Сымун
- Б. ацидикола
- Б. ацидипродуценс
- Б. ацидокальдариус
- Б. ацидотеррестрис
- Б. эолиус
- Б. воздух
- Б. аэрофил
- Б. агарадхаэренс
- Б. агро
- Б. эйдингенсис
- Б. экономия
- Б. Альбус
- Б. алкалофлюс
- Б. альгикола
- Б. альгинолитический
- Б. алкалидиазотрофикус
- Б. алкалинтриликус
- Б. алкалеседиминис
- Б. алкателлурис
- Б. высота
- Б. альвеайенсис
- Б. альвей
- Б. амилоликфациенс
- Б. а. подвид амилоликифациенс
- Б. а. подвид растения
- Б. аминоворанс [38]
- Б. амилолитический
- Б. Андриссены
- Б. аневринилитикус
- Б. сибирская язва
- Б. акимарис
- Б. ареноси
- Б. арсениселенатис
- Б. арсеникус
- Б. аурантиакус
- Б. арви
- Б.арьябхаттаи
- Б.асахии
- Б. атрофеус
- Б. аксарквиенсис
- Б. азотофиксаны
- Б. азотоформанс
- Б. Бадиус
- Б. барбарикус
- Б. батавиенсис
- Б. пекинский
- Б. бензоворанс
- Б. берингенсис
- Б. Беркли
- Б. бевериджи
- Б. богориенсис
- Б. боронифилус
- Б. брашенсис
- Б. Бревис
- Б. бутаноливоранс
- Б. канавералиус
- Б. карбонифил
- Б. сецембенсис
- Б. целлюлозолитикус
- Б. центроспор
- Б. цереус
- Б. чаганноренсис
- Б. хитинолитический
- Б. хондроитинус
- Б. чошиненсис
- Б. chungangensis
- Б. чиби
- Б. циркулянс
- Б. Кларкии
- Б. Клаузии
- Б. коагуляны
- Б. коауиленсис
- Б. cohnii
- Б. соединения
- Б. курдланолитический
- Б. циклогептаникус
- Б. цитотоксикус
- Б. далиенсис
- Б. децисифрондис
- Б. обесцвечивание
- Б. дезертирство
- Б. дипсозаури
- Б. дрентенсис
- Б. edaphicus
- Б. эхименсис
- Б. Эйсениэ
- Б. энкленсис
- Б. эндофитный
- Б. эндорадицис
- Б. фаррагинис
- Б. привередливый
- Б. фэнцюенсис
- Б. филобактерия родентуим
- Б. фирма
- Б. изгиб
- Б. фораминис
- Б. Форди
- Б. красивая
- Б. фортис
- Б. дымоходы
- Б. фуникулус
- Б. фузиформис
- Б. гемокензис
- Б. галактофилус
- Б. галактозидилитус
- Б. галлиценсис
- Б. желатини
- Б. гибсонии
- Б. женьшень
- Б. женьшенгихуми
- Б. ginsengisoli
- Б. глюканолитикус
- Б. гордонае
- Б. gottheilii
- Б. трава
- Б. халмапалус
- Б. галоалкалифилус
- Б. галохарес
- Б. галоденитрификаны
- Б. халодуранс
- Б. галофилус
- Б. галосахароворанс
- Б. хейнесии
- Б. гемицеллюлосиликус
- Б. гемицентроти
- Б. герберштейненсис
- Б. хорикоши
- Б. Horneckiae
- Б. Хорти
- Б. huizhouensis
- Б. на земле
- Б. хваджинпоенсис
- Б. идриенсис
- Б. Индикус
- Б. инфантильный
- Б. ад
- Б. необычный
- Б. непобедимый
- Б. иранский
- Б. Изабелла
- Б. исроненсис
- Б. джотгали
- Б. каустофилус
- Б. кобенсис
- Б. котии
- Б. кокешииформис
- Б. кореенсис
- Б. корленсис
- Б. криббенсис
- Б. krulwichiae
- Б. леволактикус
- Б. личинки
- Б. латероспорус
- Б. мыть
- Б. лехенсис
- Б. лентиморбус
- Б. жесткий
- Б. licheniformis
- Б. лигнинифилус
- Б. литоралис
- Б. лоцисалис
- Б. люциференсис
- Б. лютеолус
- Б. желтый
- Б. macauensis
- Б. мацеранс
- Б. macquariensis
- Б. мацие
- Б. малацитенсис
- Б. маннанилитикус
- Б. марисфлави
- Б. марисмортуи
- Б. мармаренсис
- Б. массилиенсис
- Б. мегатериум
- « Б. мезентерикус »
- Б. мезонае
- Б. метаноликус
- Б. метилотрофикус
- Б. мигуланус
- Б. мохавенсис
- Б. mucilaginosus
- Б. муралис
- Б. в Мартини
- Б. микоидес
- Б. наганоенсис
- Б. нанхайенсис
- Б. нанайиседиминис
- Б. неальсонии
- Б. во второй половине дня
- Б. neizhouensis
- Б. ниабенсис
- Б. ниацини
- B. novalis
- Б. Oceanizediminis
- Б. Одиссея
- Б. охенсис
- Б. окухиденсис
- Б. олерониус
- Б. oryzaecorticus
- Б. ошименсис
- Б. кормовой
- Б. пакистанский
- Б. паллидус
- Б. паллидус
- Б. панацисолы
- Б. панацитеррае
- Б. пантотентикус
- Б. парабревис
- Б. парафлексус
- Б. пастерии
- Б. патагонский
- Б. пеории
- Б. персеполенсис
- Б. персик
- Б. первагус
- Б. плакортидис
- Б. почеоненсис
- Б. полигони
- Б. полимикса
- Б. соски
- Б. псевдокалофилус
- Б. псевдофирмус
- Б. псевдомикоидес
- Б. психродюранс
- Б. психрофилус
- Б. психросахаролитический
- Б. психротолеранс
- Б. пульвифациенс
- Б. пумилюс
- Б. резистентность к очищению
- Б. пикнус
- Б. циндаонский
- Б. Циншенгий
- Б. реусзери
- Б. ризосфера
- Б. смеяться
- Б. сельский
- Б. безопасный
- Б. Салариус
- Б. салексигенс
- Б. салифилус
- Б. шлегелии
- Б. седиминис
- Б. селенатарсенатис
- Б. селенитредуценс
- Б. seohaeanensis
- Б. шаченсис
- Б. шаклтонии
- Б. сиамский
- Б. сильвестрис
- Б. симплекс
- Б. сиралис
- Б. Смитии
- Б. один
- Б. солимангрови
- Б. солисалси
- Б. сонгкленсис
- Б. соноренсис
- Б. сферический
- Б. споротермодуранс
- Б. стеатермофилус
- Б. стратосферикус
- Б. подземный
- Б. субтилис
- Б. с. подвид безводный
- Б. с. подвид спизицении
- Б. с. подвид субтилис
- Б. taeanensis
- Б. текиленсис
- Б. термантарктикус
- Б. термоаэрофилус
- Б. термоамиловоранс
- Б. термокатенулат
- Б. термоклоаки
- Б. термокоприи
- Б. термоденитрификанты
- Б. термоглюкозидазиус
- Б. термолактис
- Б. термолеоворанс
- Б. термофилус
- Б. термопротеолитикус
- Б. терморезина
- Б. термосферикус
- Б. тиаминолитический
- Б. тиопаранс
- Б. тюрингский
- B. tianshenii
- Б. трипоксикола
- Б. Тоскана
- Б. сильный
- Б. валлисмортис
- Б. Веддери
- Б. велезенсис
- Б. вьетнамский
- Б. вирети
- Б. вулканы
- Б. вакоенсис
- Б. сямененсис
- Б. сяоксиенсис
- Б. зантоксили
- Б. жаньцзянгенсис
Экологическое и клиническое значение
[ редактировать ]Виды Bacillus повсеместно распространены в природе, например, в почве. Они могут возникать в экстремальных условиях, таких как высокий уровень pH ( B. alcalophilus ), высокая температура ( B. thermophilus ) и высокие концентрации солей ( B. halodurans ). Они также очень часто встречаются в виде эндофитов у растений, где они могут играть решающую роль в их иммунной системе , поглощении питательных веществ и способности связывать азот . [39] [40] [41] [42] [43] B. thuringiensis производит токсин, убивающий насекомых, поэтому его используют в качестве инсектицида. [44] B. siamensis содержит противомикробные соединения, которые подавляют патогены растений, такие как грибы Rhizoctonia solani и Botrytis cinerea , и способствуют росту растений за счет летучих выбросов. [45] Некоторые виды Bacillus естественным образом способны усваивать ДНК путем трансформации . [46]
- Два вида Bacillus имеют медицинское значение: B. anthracis , вызывающий сибирскую язву ; и B. cereus , вызывающий пищевое отравление с симптомами, сходными с симптомами, вызываемыми стафилококком . [47]
- B. cereus вырабатывает токсины, которые вызывают два разных набора симптомов:
- рвотный токсин, который может вызвать рвоту и тошноту.
- диарея
- B. cereus вырабатывает токсины, которые вызывают два разных набора симптомов:
- B. thuringiensis является важным патогеном насекомых и иногда используется для борьбы с насекомыми-вредителями.
- B. subtilis является важным модельным организмом . Это также заметный вредитель пищевых продуктов, вызывающий вязкость хлеба и связанных с ним продуктов.
- B. subtilis также может продуцировать и секретировать антибиотики.
- Некоторые экологические и коммерческие штаммы B. coagulans могут играть роль в порче высококислотных продуктов на основе томатов.
Промышленное значение
[ редактировать ]Многие виды Bacillus способны секретировать большое количество ферментов. Bacillus amyloliquefaciens является источником природного антибиотика протеина барназы ( рибонуклеазы ), альфа-амилазы, используемой при гидролизе крахмала, протеазы субтилизина, используемой с детергентами, и BamH1 фермента рестрикции , используемого в исследованиях ДНК. [ нужна ссылка ]
Часть генома Bacillus thuringiensis была включена в кукурузу [48] и хлопок [49] посевы. Полученные растения устойчивы к некоторым насекомым-вредителям. [50]
Bacillus subtilis ( натто ) является ключевым микробным участником продолжающегося производства традиционной ферментации натто на основе сои, а некоторые виды Bacillus включены в список GRAS (обычно считающихся безопасными) Управления по контролю за продуктами и лекарствами. [ нужна ссылка ]
Способность отдельных штаммов Bacillus продуцировать и секретировать большие количества (20–25 г/л) внеклеточных ферментов сделала их одними из наиболее важных промышленных производителей ферментов. [ нужна ссылка ] Способность различных видов ферментировать в кислых, нейтральных и щелочных диапазонах pH в сочетании с присутствием термофилов в этом роде привела к разработке множества новых коммерческих ферментных продуктов с желаемой температурой, активностью pH и Свойства стабильности для решения различных конкретных задач. Для разработки этих продуктов использовались классические методы мутации и (или) селекции, а также передовые стратегии клонирования и белковой инженерии. [ нужна ссылка ]
Усилия по производству и секреции высоких выходов чужеродных рекомбинантных белков в хозяевах Bacillus первоначально, по-видимому, были затруднены из-за деградации продуктов протеазами хозяина. [ нужна ссылка ] Недавние исследования показали, что медленное сворачивание гетерологичных белков на границе раздела мембрана-клеточная стенка грамположительных бактерий делает их уязвимыми для атак со стороны ассоциированных со стенками протеаз. [ нужна ссылка ] Кроме того, присутствие тиол-дисульфид-оксидоредуктазы в B. subtilis может способствовать секреции белков, содержащих дисульфидные связи. Такие разработки, основанные на нашем понимании сложного механизма транслокации белков грамположительных бактерий, должны позволить решить текущие проблемы секреции и сделать виды Bacillus превосходными хозяевами для производства гетерологичных белков. [ нужна ссылка ]
Штаммы Bacillus также были разработаны и сконструированы в качестве промышленных производителей нуклеотидов, витамина рибофлавина, ароматизатора рибозы и добавки полигамма-глутаминовой кислоты. Благодаря недавней характеристике генома B. subtilis 168 и некоторых родственных штаммов виды Bacillus готовы стать предпочтительными хозяевами для производства многих новых и улучшенных продуктов по мере нашего продвижения в геномную и протеомную эру. [51]
Использовать в качестве модельного организма
[ редактировать ]
Bacillus subtilis — один из наиболее изученных прокариотов с точки зрения молекулярной и клеточной биологии. Ее превосходная генетическая гибкость и относительно большой размер предоставили мощные инструменты, необходимые для исследования бактерии со всех возможных аспектов. Недавние усовершенствования в методах флуоресцентной микроскопии позволили по-новому взглянуть на динамическую структуру одноклеточного организма. Исследования B. subtilis находятся в авангарде бактериальной молекулярной биологии и цитологии, а этот организм является моделью дифференцировки, регуляции генов/белков и событий клеточного цикла у бактерий. [52]
См. также
[ редактировать ]- Paenibacillus и Virgibacillus — роды бактерий, ранее входившие в состав Bacillus . [53] [54]
Ссылки
[ редактировать ]- ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б с д Тернбулл ПК (1996). «Бацилла» . В бароне С. и др. (ред.). Медицинская микробиология Бэррона (4-е изд.). Университет Техасского медицинского отделения. ISBN 978-0-9631172-1-2 . ПМИД 21413260 .
- ^ Беладжал Л., Гейсенс Т., Клегг Дж.С., Амар М., Мертенс Дж. (сентябрь 2018 г.). «Жизнь из пепла: выживание сухих бактериальных спор после воздействия очень высоких температур». Экстремофилы: жизнь в экстремальных условиях . 22 (5): 751–759. дои : 10.1007/s00792-018-1035-6 . ПМИД 29869718 . S2CID 46935396 .
- ^ «Бактериальные эндоспоры» . Колледж сельского хозяйства и наук о жизни Корнеллского университета, факультет микробиологии . Проверено 21 октября 2018 г.
- ^ Мэдиган М., Мартинко Дж., ред. (2005). Брок Биология микроорганизмов (11-е изд.). Прентис Холл. ISBN 978-0-13-144329-7 .
- ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б Тернбулл ПК (1996). «Бацилла» . У барона С. (ред.). Медицинская микробиология (4-е изд.). Галвестон (Техас): Медицинский филиал Техасского университета в Галвестоне. ISBN 978-0-9631172-1-2 . ПМИД 21413260 . Проверено 18 марта 2024 г.
- ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б Кристи Дж., Сетлоу П. (октябрь 2020 г.). «Прорастание спор бацилл: известное, неизвестное и что нам нужно изучить» . Сотовая сигнализация . 74 : 109729. doi : 10.1016/j.cellsig.2020.109729 . ПМИД 32721540 .
- ^ Спенсер RC (март 2003 г.). «Бацилла сибирской язвы» . Журнал клинической патологии . 56 (3): 182–187. дои : 10.1136/jcp.56.3.182 . ПМК 1769905 . ПМИД 12610093 .
- ^ Шени Дж.Л., Вонг AC (март 2005 г.). «Пищевое отравление Bacillus cereus и ее токсины» . Журнал защиты пищевых продуктов . 68 (3): 636–648. дои : 10.4315/0362-028X-68.3.636 . ПМИД 15771198 .
- ^ Нигрис С., Балдан Е., Тонделло А., Занелла Ф., Витуло Н., Фаваро Г. и др. (октябрь 2018 г.). «Признаки биоконтроля Bacillus licheniformis GL174, культивируемого эндофита Vitis vinifera сорта Glera» . БМК Микробиология . 18 (1):133.doi 10.1186 : /s12866-018-1306-5 . ПМК 6192205 . ПМИД 30326838 .
- ^ Фаваро Г., Богиалли С., Ди Ганги И.М., Нигрис С., Балдан Е., Скуартини А. и др. (октябрь 2016 г.). «Характеристика липопептидов, продуцируемых Bacillus licheniformis, с использованием жидкостной хроматографии с точной тандемной масс-спектрометрией». Быстрая связь в масс-спектрометрии . 30 (20): 2237–2252. Бибкод : 2016RCMS...30.2237F . дои : 10.1002/rcm.7705 . ПМИД 27487987 .
- ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б с д и ж Пол С.И., Рахман М.М., Салам М.А., Хан М.А., Ислам М.Т. (15 декабря 2021 г.). «Идентификация бактерий, связанных с морскими губками, на острове Сен-Мартен в Бенгальском заливе с акцентом на профилактику подвижной сепсиса Aeromonas в Лабеорохите». Аквакультура . 545 : 737156. Бибкод : 2021Aquac.54537156P . doi : 10.1016/j.aquacultural.2021.737156 .
- ^ Рахман М.М., Пол С.И., Актер Т., Тай AC, Фойсал MJ, Ислам М.Т. (сентябрь 2020 г.). «Полногеномная последовательность Bacillus subtilis WS1A, многообещающего рыбного пробиотического штамма, выделенного из морской губки Бенгальского залива» . Объявления о ресурсах по микробиологии . 9 (39): e00641–20. дои : 10.1128/MRA.00641-20 . ПМЦ 7516141 . ПМИД 32972930 .
- ^ Ши Ю.Л., Ротфилд Л. (сентябрь 2006 г.). «Бактериальный цитоскелет» . Обзоры микробиологии и молекулярной биологии . 70 (3): 729–754. дои : 10.1128/MMBR.00017-06 . ПМЦ 1594594 . ПМИД 16959967 .
- ^ Кон Ф. (1872 г.). «Исследования о бактериях». растений Вклад в биологию (на немецком языке). 2 (1): 127–224.
- ^ Бацилла в ЛПСН ; Парте АС, Сарда Карбасс Х, Мейер-Колтхофф Дж.П., Раймер Л.К., Гёкер М. (1 ноября 2020 г.). «Список названий прокариот, имеющих номенклатурное положение (ЛПСН), перемещается в ДСМЗ» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 70 (11): 5607–5612. дои : 10.1099/ijsem.0.004332 .
- ^ Пей А.Ю., Обердорф В.Е., Носса К.В., Агарвал А., Чокши П., Герц Э.А. и др. (июнь 2010 г.). «Разнообразие генов 16S рРНК в отдельных геномах прокариот» . Прикладная и экологическая микробиология . 76 (12): 3886–3897. Бибкод : 2010ApEnM..76.3886P . дои : 10.1128/АЕМ.02953-09 . ПМЦ 2893482 . ПМИД 20418441 .
- ^ Трэверс Р.С., Мартин П.А., Райхельдерфер К.Ф. (июнь 1987 г.). «Селективный процесс эффективного выделения почвенных бактерий Bacillus spp» . Прикладная и экологическая микробиология . 53 (6): 1263–1266. Бибкод : 1987ApEnM..53.1263T . дои : 10.1128/aem.53.6.1263-1266.1987 . ПМК 203852 . ПМИД 16347359 .
- ^ Фойсал М.Дж., Лиза А.К. (декабрь 2018 г.). «Выделение и характеристика штамма Bacillus sp. BC01 из почвы, проявляющего сильную антагонистическую активность в отношении патогенных грибов и бактерий растений и рыб» . Журнал генной инженерии и биотехнологии . 16 (2): 387–392. дои : 10.1016/j.jgeb.2018.01.005 . ПМК 6353715 . ПМИД 30733751 .
- ^ Колдуэлл FE (06 апреля 2011 г.). Справочник студентов по бактериям . Лулу.com. ISBN 978-1-257-42416-0 .
- ^ «Штамм Bacillus subtilis WS1A» . ГенБанк . Национальная медицинская библиотека США. 19 мая 2019 г.
- ^ «Штамм Bacillus subtilis YBS29» . ГенБанк . Национальная медицинская библиотека США. 19 июня 2020 г.
- ^ «Штамм Bacillus subtilis KSP163A» . ГенБанк . Национальная медицинская библиотека США. 19 мая 2019 г.
- ^ «Штамм Bacillus subtilis ОА122» . ГенБанк . Национальная медицинская библиотека США. 20 июня 2020 г.
- ^ «Штамм Bacillus subtilis ISP161A» . ГенБанк . Национальная медицинская библиотека США. 20 июня 2020 г.
- ^ «Штамм Bacillus subtilis OI6» . ГенБанк . Национальная медицинская библиотека США. 19 июня 2020 г.
- ^ «Штамм Bacillus subtilis WS11» . ГенБанк . Национальная медицинская библиотека США. 19 мая 2019 г.
- ^ «Штамм Bacillus subtilis KSP151E» . ГенБанк . Национальная медицинская библиотека США. 19 июня 2020 г.
- ^ «Штамм S8 Bacillus subtilis» . ГенБанк . Национальная медицинская библиотека США. 20 июня 2020 г.
- ^ Сюй Д., Коте Ж.К. (май 2003 г.). «Филогенетические взаимоотношения между видами Bacillus и родственными родами, выведенные на основе сравнения 3'-концевых 16S рДНК и 5'-концевых нуклеотидных последовательностей 16S-23S ITS» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 53 (Часть 3): 695–704. дои : 10.1099/Ijs.0.02346-0 . ПМИД 12807189 .
- ^ Муньос Р., Ярза П., Людвиг В., Эзеби Дж., Аманн Р., Шлейфер К.Х. и др. (май 2011 г.). «Выпуск LTP104 общевидового живого дерева» (PDF) . Систематическая и прикладная микробиология . 34 (3): 169–70. дои : 10.1016/j.syapm.2011.03.001 . ПМИД 21497273 . Архивировано из оригинала (PDF) 23 сентября 2015 года.
- ^ Ярза П., Рихтер М., Пеплиес Дж., Юзеби Дж., Аманн Р., Шлейфер К.Х. и др. (сентябрь 2008 г.). «Проект «Всевидовое живое дерево»: филогенетическое дерево всех секвенированных типовых штаммов на основе 16S рРНК» . Систематическая и прикладная микробиология . 31 (4): 241–250. дои : 10.1016/j.syapm.2008.07.001 . hdl : 10261/103580 . ПМИД 18692976 .
- ^ Ярза П., Людвиг В., Эзеби Дж., Аманн Р., Шлейфер К.Х., Глёкнер Ф.О. и др. (октябрь 2010 г.). «Обновление проекта «Живое дерево для всех видов» на основе анализа последовательностей 16S и 23S рРНК». Систематическая и прикладная микробиология . 33 (6): 291–299. дои : 10.1016/j.syapm.2010.08.001 . hdl : 10261/54801 . ПМИД 20817437 .
- ^ Салветти Э., Харрис Х.М., Фелис Дж.Е., О'Тул П.В. (сентябрь 2018 г.). Бьоркрот Дж (ред.). «Сравнительная геномика рода Lactobacillus выявила надежные филогруппы, которые обеспечивают основу для реклассификации» . Прикладная и экологическая микробиология . 84 (17). Бибкод : 2018ApEnM..84E.993S . дои : 10.1128/AEM.00993-18 . ПМК 6102987 . ПМИД 29915113 .
- ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б Алькарас Л.Д., Морено-Хагельсиб Г., Эгиарте Л.Е., Соуза В., Эррера-Эстрелла Л., Ольмедо Г. (май 2010 г.). «Понимание эволюционных связей и основных особенностей Bacillus посредством сравнительной геномики» . БМК Геномика . 11 : 332. дои : 10.1186/1471-2164-11-332 . ПМЦ 2890564 . ПМИД 20504335 . 1471216411332.
- ^ Окстад ОА, Колсто АБ (декабрь 2010 г.). «Глава 2: Геномика видов Bacillus». В Видманн М., Чжан В. (ред.). Геномика бактериальных патогенов пищевого происхождения . Пищевая микробиология и безопасность пищевых продуктов. Том. 29. Нью-Йорк, штат Нью-Йорк: Спрингер. стр. 29–53 (34–35). дои : 10.1007/978-1-4419-7686-4_2 . ISBN 978-1-4419-7686-4 .
- ^ Бреннер DJ (1984). «Семейство I. Enterobacteriaceae Rahn 1937, Nom. fam. Cons. Opin. 15, Jud. Com. 1958, 73; Юинг, Фармер и Бреннер 1980, 674; Судебная комиссия 1981, 104». В Krieg NR, Холт Дж.Г. (ред.). Руководство Берджи по систематической бактериологии . Том. 1 (первое изд.). Балтимор: The Williams & Wilkins Co., стр. 408–420.
- ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б Николаидис М., Хескет А., Моссиалос Д., Илиопулос И., Оливер С.Г., Амуциас Г.Д. (август 2022 г.). «Сравнительный анализ основных протеомов внутри и между эволюционными группами Bacillus subtilis и Bacillus cereus выявляет закономерности линейной и видовой адаптации» . Микроорганизмы . 10 (9): 1720. doi : 10.3390/microorganisms10091720 . ПМК 9505155 . ПМИД 36144322 .
- ^ Лошон К.А., Беари К.Е., Гувейя К., Грей Э.З., Сантьяго-Лара Л.М., Сетлоу П. (март 1998 г.). «Нуклеотидная последовательность генов sspE, кодирующих небольшие кислоторастворимые споровые белки гамма-типа из бактерий, образующих круглые споры, Bacillusaminevorans, Sporosarcina halophila и S. ureae». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) – Структура и экспрессия генов . 1396 (2): 148–152. дои : 10.1016/S0167-4781(97)00204-2 . ПМИД 9540829 .
- ^ Дин Ю, Ван Дж, Лю Ю, Чен С (2005). «Выделение и идентификация азотфиксирующих палочек из ризосфер растений в районе Пекина». Журнал прикладной микробиологии . 99 (5): 1271–1281. дои : 10.1111/j.1365-2672.2005.02738.x . ПМИД 16238759 . S2CID 19917931 .
- ^ Се Г, Су Б, Цуй З (декабрь 1998 г.). «Выделение и идентификация N2-фиксирующих штаммов Bacillus в ризосфере риса долины реки Янцзы» . Вэй Шэн У Сюэ Бао = Acta Microbiologica Sinica (на китайском языке). 38 (6). Китайская академия наук: 480–483. ПМИД 12548929 .
- ^ Вар Нонгкхла Ф, Джоши С (2014). «Эпифитные и эндофитные бактерии, способствующие росту этномедицинских растений в субтропических лесах Мегхалаи, Индия» . Обзор тропической биологии . 62 (4): 1295–1308. дои : 10.15517/rbt.v62i4.12138 . ПМИД 25720168 .
- ^ Йосте М., Роетс Ф., Мидгли Г.Ф. и др. (2019). «Азотфиксирующие бактерии и Oxalis – свидетельство вертикально наследуемого бактериального симбиоза» . Биология растений BMC . 19 (1): 441. doi : 10.1186/s12870-019-2049-7 . ПМК 6806586 . ПМИД 31646970 .
- ^ Рамеш А., Шарма С.К., Член парламента от Шармы, Ядав Н., Джоши ОП (2014). «Инокуляция штаммов Bacillus aryabhattai, солюбилизирующих цинк, для улучшения роста, мобилизации и биофортификации цинка в соевых бобах и пшенице, выращиваемых в Vertisols в центральной Индии». Прикладная экология почв . 73 : 87–96. Бибкод : 2014AppSE..73...87R . дои : 10.1016/j.apsoil.2013.08.009 . ISSN 0929-1393 .
- ^ Слончевски Дж.Л., Фостер Дж.В. (2011). Микробиология: развивающаяся наука (2-е изд.). Нортон.
- ^ Чон Х., Чжон Д.Э., Ким Ш., Сон Г.К., Пак С.И., Рю К.М. и др. (август 2012 г.). «Проект последовательности генома бактерии Bacillus siamensis KCTC 13613T, стимулирующей рост растений» . Журнал бактериологии . 194 (15): 4148–4149. дои : 10.1128/JB.00805-12 . ПМК 3416560 . ПМИД 22815459 .
- ^ Кин Э.К., Блисковский В.В., Адхья С.Л., Дантас Г. (ноябрь 2017 г.). «Проект геномной последовательности естественно компетентного штамма Bacillus simplex WY10» . Геномные объявления . 5 (46): e01295–17. doi : 10.1128/genomeA.01295-17 . ПМК 5690344 . ПМИД 29146837 .
- ^ Райан К.Дж., Рэй К.Г., ред. (2004). Медицинская микробиология Шерриса (4-е изд.). МакГроу Хилл. ISBN 978-0-8385-8529-0 .
- ^ «История БТ» . Калифорнийский университет в Сан-Диего . Проверено 28 июня 2024 г.
- ^ Джеймс С. (1996). «Глобальный обзор полевых испытаний и коммерциализации трансгенных растений: 1986–1995 годы» (PDF) . Международная служба по приобретению агробиотехнологических приложений . Проверено 17 июля 2010 г.
- ^ Пирс ФБ (2013). «Bt Кукуруза: Здоровье и окружающая среда – 0,707» (PDF) . Дополнительный офис Университета штата Колорадо. Архивировано (PDF) из оригинала 9 октября 2022 г.
- ^ Шаллми М., Сингх А., Уорд ОП (январь 2004 г.). «Разработки в использовании видов Bacillus для промышленного производства». Канадский журнал микробиологии . 50 (1): 1–17. дои : 10.1139/w03-076 . ПМИД 15052317 .
- ^ Грауманн П., изд. (2012). Бацилла: клеточная и молекулярная биология (2-е изд.). Кайстер Академик Пресс. ISBN 978-1-904455-97-4 . [1] .
- ^ Эш С., Прист Ф.Г., Коллинз, доктор медицинских наук (1994). «Молекулярная идентификация бацилл группы 3 рРНК (Эша, Фэрроу, Уоллбэнкса и Коллинза) с использованием ПЦР-зонда. Предложение о создании нового рода Paenibacillus». Антони ван Левенгук . 64 (3–4): 253–260. дои : 10.1007/BF00873085 . ПМИД 8085788 . S2CID 7391845 .
- ^ Хейндрикс М., Леббе Л., Керстерс К., Де Вос П., Форсайт Г., Логан Н.А. (январь 1998 г.). «Virgibacillus: новый род для размещения Bacillus pantothenticus (Пром и Найт, 1950). Исправленное описание Virgibacillus pantothenticus» . Международный журнал систематической бактериологии . 48 (1): 99–106. дои : 10.1099/00207713-48-1-99 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]
- Геномы бацилл и связанная с ними информация в PATRIC , ресурсном центре по биоинформатике, финансируемом NIAID.