Молликуты
| Молликуты | |
|---|---|
Научная классификация  | |
| Домен: | Бактерии |
| Тип: | Микоплазматота |
| Сорт: | Молликуты Эдвард и Фрейндт, 1967 год. [1] |
| Заказы | |
Ахолеплазмалес | |
| Синонимы | |
| |
Молликуты — класс бактерий. [2] отличается отсутствием клеточной стенки . Слово «Молликутес» происходит от латинского слова «mollis» (что означает «мягкий» или «податливый») и «cutis» (что означает «кожа»). Особи очень малы, обычно всего 0,2–0,3 мкм (200–300 нм имеют размер ) и имеют очень маленький размер генома . Они различаются по форме, хотя большинство из них содержат стерины , которые делают клеточную мембрану более жесткой. Многие из них способны передвигаться посредством скольжения , но представители рода Spiroplasma имеют спиральную форму и передвигаются за счет скручивания. Самый известный род Mollicutes — Mycoplasma . Колонии имеют типичный вид «жареных яиц».
Молликуты — паразиты различных животных и растений, живущие на клетках хозяина или в них. вызывают заболевания у человека, прикрепляясь к клеткам дыхательных или мочеполовых путей Многие из них, особенно виды Mycoplasma и Ureaplasma , . Фитоплазма и спироплазма являются патогенами растений, ассоциированными с насекомыми-переносчиками.
Если раньше тривиальное название «микоплазма» (множественное число: «микоплазмы») обычно обозначало любого члена класса Mollicutes, то теперь в научной классификации оно относится исключительно к члену рода Mycoplasma .
Происхождение и развитие паразитической жизни
[ редактировать ]Анализ геномов Mollicutes («микоплазм») дает убедительную поддержку гипотезе о том, что Mollicutes развились из грамположительных бактерий в результате процесса редуктивной эволюции. Приняв паразитический образ жизни с использованием питательных веществ своих хозяев, многие молликуты смогли значительно сократить свой генетический материал. С другой стороны, они утратили гены многих ассимилятивных процессов. Таким образом, микоплазма , возможно, стала самым маленьким самовоспроизводящимся организмом в природе. Микоплазма гениталиум с 580 000 пар оснований имеет особенно маленький размер генома. Некоторые фитоплазмы также имеют очень маленький размер генома. Роды с наименьшим геномом считаются филогенетически самыми «поздними» молликутами.
Чтобы поддерживать свой паразитический образ жизни, молликуты разработали довольно сложные механизмы колонизации своих хозяев и сопротивления иммунной системе хозяина. [3]
Распространение
[ редактировать ]Молликуты (ранее также называемые плевропневмоноподобными организмами, PPLO), а также бактерии L-формы (ранее также называемые бактериями L-фазы), у которых отсутствуют клеточные стенки, размножаются не путем бинарного деления, а по механизму почкования. В 1954 году этот способ пролиферации был продемонстрирован путем постоянных наблюдений за живыми клетками с использованием фазово-контрастной микроскопии. [4]
Раньше молликуты иногда считали стабильными бактериями L-формы, однако филогенетический анализ определил их как бактерии, утратившие клеточные стенки в ходе эволюции. [5]
История классификации
[ редактировать ]Классификация молликутов всегда была сложной задачей. Особи крошечные, и, поскольку являются паразитами, их приходится культивировать на специальных средах. До сих пор многие виды вообще не удалось выделить. Вначале было неясно, были ли это грибы, вирусы или бактерии. Также сбивало с толку сходство с L-формами . Поначалу всех представителей класса Mollicutes обычно называли «микоплазмами» или плевропневмоноподобными организмами (ППЛО). Молликулы, кроме некоторых представителей рода Mycoplasma, все еще не идентифицированы. Первым видом Mycoplasma /Mollicutes, который удалось выделить, была Mycoplasma mycoides . Эту бактерию культивировали Нокар и Ру в 1898 году. [6]
В 1956 году Эдвард Г. и Фройндт сделали первое предложение по классификации и присвоению названий PPLO. Однако они остались нерешенными, принадлежат ли они к бактериям ( прокариотам , в 1956 году названным «шизомицетами») или к эукариотам . В качестве типового вида (вида, дающего название) PPLO/микоплазм Эдвард и Фройндт предложили Mycoplasma mycoides , являющуюся возбудителем плевропневмонии крупного рогатого скота и относящуюся к плевропневмоноподобным организмам. До этого Mycoplasma mycoides была известна как Asterococcus mycoides , но позже это название не было признано действительным. В своей публикации 1956 года они описали 15 видов микоплазм . [7] класс Mollicutes, включающий порядок Mycoplasmatales . В 1967 году Подкомитетом по таксономии микоплазмат был предложен [1] Теперь название Mycoplasma следует использовать исключительно для представителей рода Mycoplasma , а не использовать в качестве тривиального названия для любого Mollicute. Поскольку тривиальное название уже давно используется в литературе, это пока не всегда так.
Три отдела бактерий
[ редактировать ]Традиционно систематика бактерий основывалась на сходстве и различии морфологии (таксономия Линнея).
В 1962 году Р.Дж.Э. Мюррей предложил разделить «королевство» (ныне домен [8] ) Бактерии делятся на три отдела (= типа) в зависимости от типа клеточной стенки:
- Грамотрицательные Gracilicutes с тонкой клеточной стенкой и небольшим количеством пептидогликана ;
- Грамположительные «Firmacutes» с более толстой клеточной стенкой и большим количеством пептидогликана (позже название было изменено на «Firm icutes ») и
- «Молликуты» без клеточной стенки. [9]
Филогения
[ редактировать ]
Для классификации и номенклатуры молликут существуют специальные правила, которые поддерживаются Подкомитетом по таксономии молликут Международного комитета по систематике прокариот (ICSP) (бывший Подкомитет Международного комитета по систематической бактериологии (ICSB) по таксономии Mycoplasmatales ). [11]
Традиционно таксономия Mollicutes основывалась на серологических и фенотипических характеристиках . Однако большинство современных классификаций основаны на последовательностях ДНК или РНК, особенно 16S рРНК. на последовательностях [5] (см. рисунок).
Тип молликутов
[ редактировать ]Результаты филогенетического анализа Mollicutes оказались противоречивыми. Некоторые систематики относят их к Bacillota, другие — к Mycoplasmatota. Вёзе и др. предположили, что молликуты могли произойти от разных ветвей бактерий. Они пришли к выводу, что Mollicutes не являются филогенетически целостной группой и, следовательно, не образуют отдельного таксона более высокого уровня. Вместо этого они группируются внутри грамположительных бактерий типа Bacillota. [5] Результаты молекулярно-филогенетического анализа частично зависели от выбранного молекулярного маркера, такого как рРНК , фактор элонгации или другой белок. [12] Филогенетические деревья, основанные на аминокислотных последовательностях фосфоглицераткиназы (Pgk), указывают на монофилетическое происхождение Mollicutes внутри Bacillota. [13]
В раннем издании « Руководства по систематической бактериологии» Берджи класс Mollicutes помещался в тип Bacillota . [14] [15] тогда как в объявленном 2-м издании они перенесены в отдельный тип Tenericutes (позже переименованный в Mycoplasmatota ). [16] [17] [18] Это изменение мотивировано «их уникальными фенотипическими свойствами, в частности отсутствием жестких клеточных стенок и общей низкой поддержкой альтернативных маркеров». [12] В «Таксономическом обзоре бактерий и архей» (выпуск TOBA 7.7), март 2007 г., Mollicutes представляют собой класс типа Bacillota. [19]
Принятая в настоящее время таксономия основана на Списке названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN). [20] и Национальный центр биотехнологической информации (NCBI) [21]
| на основе 16S рРНК ДП _08_2023 [22] [23] [24] | 120 маркерных белков на основе GTDB 08-RS214 [25] [26] [27] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
♦ Парафилетические молликуты.
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б Эдвард, генеральный директор; Ф. А. Фройндт (июль 1967 г.). «Предложение о Mollicutes как названии класса, установленного для отряда Mycoplasmatales» . Int J Syst Bacteriol . 17 (3): 267–268. дои : 10.1099/00207713-17-3-267 .
- ^ [1] «Молликуты» из Британской энциклопедии Online. Проверено 15 октября 2011 г.
- ^ Шмуэль Разин, Дэвид Йогев и Иегудит Наот Молекулярная биология и патогенность микоплазм . Микрон. и Молек. Biology Reviews, декабрь 1998 г. , стр. 1094–1156, Vol. 62, № 4
- ^ Кандлер, Гертрауд; Кандлер, Отто (1954). «Исследования морфологии и размножения плевропневмоноподобных организмов и L-фазы бактерий. I. Световая микроскопия (теперь микоплазмы и бактерии L-формы)] (PDF) . Архив микробиологии (на немецком языке). 21 (2). (Статья доступна на английском языке): 178–201. дои : 10.1007/BF01816378 . ПМИД 14350641 . S2CID 21257985 .
- ^ Jump up to: а б с CR Woese, J. Maniloff и LB Zablen Филогенетический анализ микоплазм Proc. Натл. акад. наук. США Том. 77, № 1, стр. 494–498, январь 1980 г.
- ^ Хейфлик Л. и Чанок, Р.М. (1965). «Виды микоплазм человека» (PDF) . Бактериологические обзоры . 29 (2): 185–221. дои : 10.1128/MMBR.29.2.185-221.1965 . ПМК 441270 . ПМИД 14304038 .
- ^ Эдвард Д.Г., Фройндт Э.А. (февраль 1956 г.). «Классификация и номенклатура организмов группы плевропневмоний» . Дж. Генерал Микробиол . 14 (1): 197–207. дои : 10.1099/00221287-14-1-197 . ПМИД 13306904 . PDF [2]
- ^ Вёзе, Карл Р .; Кандлер, Отто ; Уилис, Марк Л. (1990). «На пути к естественной системе организмов: предложение по доменам архей, бактерий и эукариев» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 87 (12): 4576–9. Бибкод : 1990PNAS...87.4576W . дои : 10.1073/pnas.87.12.4576 . ПМК 54159 . ПМИД 2112744 .
- ^ Предложения Н. Э. Гиббонса и Р. Дж. Мюррея относительно высших таксонов бактерий [ постоянная мертвая ссылка ] Int J Syst Bacteriol Vol. 28 (1) января 1978 г., стр. 1–6.
- ^ Осима, К; Маэдзима, К; Намба, С (2013). «Геномные и эволюционные аспекты фитоплазм» . Границы микробиологии . 4 : 230. дои : 10.3389/fmicb.2013.00230 . ПМЦ 3743221 . ПМИД 23966988 .
- ^ Пересмотренные минимальные стандарты для описания новых видов класса Mollicutes (отдел Tenericutes). Архивировано 10 июля 2010 г. в Wayback Machine PDF [3]. [ постоянная мертвая ссылка ] ; Дэниел Р. Браун, Роберт Ф. Уиткомб и Джанет М. Брэдбери (2007) Int J Syst Evol Microbiol 57 2703–2719; дои : 10.1099/ijs.0.64722-0
- ^ Jump up to: а б Людвиг В. и Шляйфер К.Х. Молекулярная филогения бактерий на основе сравнительного анализа последовательностей консервативных генов. Микробная филогения и эволюция, 2005, стр. 2005, с. 70–98.
- ^ Вольф, Матиас; Мюллер, Т; Дандекар, Т; Поллак, доктор медицинских наук; и др. (2004). «Филогения Firmicutes с особым упором на Mycoplasma (Mollicutes), как следует из данных по аминокислотной последовательности фосфоглицераткиназы» . Int J Syst Evol Microbiol . 54 (Часть 3): 871–875. дои : 10.1099/ijs.0.02868-0 . ПМИД 15143038 . DOI 10.1099/ijs.0.02868-0
- ^ Таксономический очерк прокариотов. Руководство Берджи по систематической бактериологии. Архивировано 29 декабря 2009 г. в Wayback Machine Garrity, Bell & Lilburn; Второе издание, выпуск 5.0 (2004 г.); стр. 140–204. doi : 10.1007/bergeysoutline200405 .
- ^ К. Йоханссон и Б. Петтерссон, Таксономия молликутов book.google.com (2002)
- ^ «Тенерикуты» . Браузер таксономии . НКБИ . Проверено 11 сентября 2008 г.
- ^ Вольфганг Людвиг, Карл-Хайнц Шляйфер и Уильям Б. Уитмен (в печати, выпуск 2009 г. ). «Пересмотренный план развития типа Firmicutes». В P. De Vos et al. (ред.) Руководство Берджи по систематической бактериологии , 2-е изд., том. 3 (Фирмикуты). Спрингер-Верлаг, Нью-Йорк. ISBN 0-387-95041-9 ; PDF , заархивировано 21 сентября 2010 г. в Wayback Machine.
- ^ Проверка публикации новых имен и новых комбинаций ... Int. Дж. Сист. Бактериол.; Июль 1984 г., стр. 355–357.
- ^ Гаррити и др. Таксономическое описание бактерий и архей, заархивировано 2 мая 2013 г. в Wayback Machine (выпуск TOBA 7.7); Март 2007 года. «Таксономический очерк бактерий и архей» (PDF) . Таксономический очерк бактерий и архей . Архивировано из оригинала (PDF) 7 октября 2011 г. Проверено 13 августа 2009 г.
- ^ Ж. П. Эзеби. «Эриспелотрихия» . Список названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN) . Проверено 21 октября 2016 г.
- ^ Сэйерс; и др. «Эриспелотрихия» . База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Проверено 20 марта 2013 г.
- ^ «ЛТП» . Проверено 20 ноября 2023 г.
- ^ «Дерево LTP_all в формате Ньюика» . Проверено 20 ноября 2023 г.
- ^ «Примечания к выпуску LTP_08_2023» (PDF) . Проверено 20 ноября 2023 г.
- ^ «Выпуск GTDB 08-RS214» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
- ^ "bac120_r214.sp_label" . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
- ^ «История таксонов» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
Внешние ссылки
[ редактировать ]Молликуты Национальной медицинской библиотеки США в медицинских предметных рубриках (MeSH)