Fusobacteriota
| Fusobacteriota | |
|---|---|
| |
| Fusobacterium в жидкой культуре | |
Научная классификация 
| |
| Домен: | Бактерии |
| Филум: | Fusobacteriota Garrity & Holt 2021 [ 2 ] |
| Сорт: | Fusobacteriia Staley & Whitman 2012 |
| Заказ: | Fusobacteriales Staley & Whitman 2012 |
| Семьи [ 1 ] | |
| Синонимы | |
| |
Fusobacteriota являются обязательно анаэробными, неспособными грамотрицательными бациллами . После первых сообщений в конце девятнадцатого века различные названия были применены к этим организмам, иногда с тем же названием применяется к разным видам. Совсем недавно произошли не только изменения в номенклатуре , но и попытки дифференцировать виды, которые, как полагают, являются либо патогенными, либо комменсальными или обоими. Из -за их асахаролитической природы и общего недостатка положительных результатов в обычных биохимических тестах, лабораторная идентификация Fusobacteriota была затруднена. Тем не менее, применение новых молекулярных биологических методов к таксономии установило ряд новых видов, а также подпрограмма Fusobacterium necrophorum и F. ucleatum и предоставило новые методы для идентификации. Вовлечение Fusobacteriota в широком спектре человеческих инфекций, вызывающих некроз тканей и сепсис, давно признано, и в последнее время сообщалось о их важности в интраамниотических инфекциях, преждевременных трудовых и тропических язвах.
После первых сообщений о Fusobacteriota в конце девятнадцатого века разнообразие названий видов привело к некоторой путанице в родах Fusobacterium и Leptotrichia . Тем не менее, новые методы исследования привели к лучшему пониманию таксономии с описанием нескольких новых видов Fusobacteriota. Среди новых описанных видов есть F. Язвенные из тропических язв и несколько видов из полости рта. Подпространена важных видов F. necrophorum и F. ucleatum также возможны. Вполне вероятно, что таксономия Фузобактериоты может быть дополнительно развита в будущем. [ 3 ]
Филогения
[ редактировать ]Принятая в настоящее время таксономия основана на списке прокариотических имен в номенклатуре (LSPN) [ 4 ] и Национальный центр информации о биотехнологии (NCBI). [ 5 ]
| 16S RRNA на основе LTP _08_2023 [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ] | 120 маркерных белков на основе GTDB 08-RS214 [ 9 ] [ 10 ] [ 11 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
Роль в болезни человека
[ редактировать ]Появляются новые доказательства того, что эта бактерия может вызвать или быть связанной с раком толстой кишки человека. В 2011 году исследователи сообщили о наличии Fusobacteriota в тканях рака толстой кишки (Genome Res 2012; 22: 292), а новое многоцентровое исследование свидетельствует о том, что некоторые случаи, особенно правые, могут быть вызваны инфекцией Fusobacteriota. [ 12 ]
Смотрите также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ "Fusobacteriales" . Таксономия NCBI . Bethesda, MD: Национальный центр биотехнологической информации . Получено 3 января 2019 года .
- ^ Орен А, Гаррити Г.М. (2021). «Действительная публикация названий сорока двух фил прокариот» . Int J Syst Evol Microbiol . 71 (10): 5056. doi : 10.1099/ijsem.0.005056 . PMID 34694987 .
- ^ Беннетт, KW; Эли А. (1 октября 1993 г.). «Fusobacteria: новая таксономия и связанные с ними заболевания» . Журнал медицинской микробиологии . 39 (4): 246–254. doi : 10.1099/00222615-39-4-246 . PMID 8411084 .
- ^ JP Euzéby. "Fusobacteria" . Список прокариотических имен с стоянием в номенклатуре (LPSN) . Получено 2016-03-20 .
- ^ Sayers; и др. "Fusobacteria" . Национальный центр биотехнологической информации (NCBI) База данных таксономии . Получено 2016-03-20 .
- ^ "LTP" . Получено 20 ноября 2023 года .
- ^ «Дерево LTP_ALL в формате Newick» . Получено 20 ноября 2023 года .
- ^ «LTP_08_2023 Notes» (PDF) . Получено 20 ноября 2023 года .
- ^ "GTDB Release 08-RS214" . База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 года .
- ^ "BAC120_R214.sp_label" . База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 года .
- ^ «История таксонов» . База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 года .
- ^ Bullman S, Pedadallu CS, Sicska E, Clancy TE, Zhang X, Cai D, Neuberg D, Huang K, Guevara F, Nelson T, Chinashvili O, Haganker M, Ramachandran, Goddado B, Serna G, Mulet N, Landolfi S, Ramon Y Cajal S, Fasani R, Aguirre AJ, Ng K, Elez E, Ogino S, Tabernero J, Fuchs, Hahn WC, Nuciforo P, Enerson M. (2017). «Любое упорство Fusabacterium и антибиотико -реакцию при колоректальном раке » Наука 358 (6369): 1443–1 Bibcode : 2017sci ... 358.1443b Doi : 10.1126/ science.aal5 PMC 5823247 PMID 29170280
