Алкалигалобацилла алкалофилус
Алкалигалобацилла алкалофилус | |
---|---|
Научная классификация ![]() | |
Домен: | Бактерии |
Тип: | Бациллота |
Сорт: | Бациллы |
Заказ: | Бациллы |
Семья: | Бацилловые |
Род: | алкалигалобациллы |
Разновидность: | А. алкалофилус
|
Биномиальное имя | |
Алкалигалобацилла алкалофилус (Веддер, 1934) Патель и Гупта 2020
|
alcalophilus (ранее Bacillus alcalophilus ) — грамположительный палочковидный Alkalihalobacillus вид бактерий . Вероятные штаммы этого вида были выделены из сильнощелочных сточных вод. A. alcalophilus — умеренно галотолерантный облигатный алкалофил, растущий при 40 °C и pH 9–10,5 (и, возможно, выше), выделенный из почвы и навоза животных. [ 1 ] [ 2 ]
Этот вид был переведен в род Alkalihalobacillus в 2020 году после филогеномного исследования для разрешения полифилии рода Bacillus . [ 3 ]
Геном
[ редактировать ]Черновой вариант генома штамма A. alcalophilus AV1934 имеет длину 4 348 660 пар оснований и 3745 предсказанных белков. Содержание G+C в геноме составляет 37,2%. Другой вариант генома содержит 4095 предсказанных генов и 4063 предсказанных белка. [ 4 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Нтугиас, С; Зервакис, Г.И.; Эхалиотис, С; Каврулакис, Н; Пападопулу, К.К. (май 2006 г.). «Экофизиология и молекулярная филогения бактерий, выделенных из щелочных двухфазных отходов производства оливок» . Исследования в области микробиологии . 157 (4): 376–85. дои : 10.1016/j.resmic.2005.09.010 . ПМИД 16307869 .
- ^ Льюис, Р.Дж.; Кабак, Э.; Крулвич, Т.А. (1982). «Плейотропные свойства мутаций неалкалофилии у Bacillus alcalophilus» . Микробиология . 128 (2): 427–430. дои : 10.1099/00221287-128-2-427 .
- ^ Патель, Судип; Гупта, Рэдхи С. (01 января 2020 г.). «Филогеномная и сравнительная геномная основа для решения полифилии рода Bacillus: предложение для шести новых родов видов Bacillus, Peribacillus gen. nov., Cytobacillus gen. nov., Mesobacillus gen. nov., Neobacillus gen. nov., Metabacillus gen. ноябрь и Alkalihalobacillus gen . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 70 (1): 406–438. дои : 10.1099/ijsem.0.003775 . ISSN 1466-5026 .
- ^ Атти О, Джаяпракаш А, Шах Х, Полсен И.Т., Морино М, Такахаши Ю, Наруми И, Сачиданандам Р, Сато К, Ито М, Крулвич Т.А. (2014). «Проект геномной последовательности Bacillus alkalophilus AV1934, классического алкалофила, выделенного из человеческих фекалий в 1934 году» . Анонс генома . 2 (6). doi : 10.1128/genomeA.01175-14 . ПМЦ 4241669 . ПМИД 25395643 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]Лю, Ихань; Чжан, Тао; Чжан, Чжимэн; Сунь, Тонги; Ван, Цзяньлин; Лу, Фупин (2014). «Улучшение холодовой адаптации щелочной протеазы Bacillus alcalophilus путем направленной эволюции» . Журнал молекулярного катализа B: Enzymatic . 106 : 117–123. дои : 10.1016/j.molcatb.2014.05.005 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]