Геобацилла стеаротермофилус
| Геобацилла стеаротермофилус | |
|---|---|
 | |
Научная классификация  | |
| Домен: | Бактерии |
| Тип: | Бациллота |
| Сорт: | Бациллы |
| Заказ: | Бациллы |
| Семья: | Бацилловые |
| Род: | Геобациллы |
| Разновидность: | Г. стеатермофилус |
| Биномиальное имя | |
| Геобацилла стеаротермофилус (Донк 1920) Назина и др. 2001 г. | |
Geobacillus stearothermophilus (ранее Bacillus stearothermophilus ) [1] [2] Это палочковидная грамположительная бактерия , принадлежащая к типу Bacillota . Бактерия является термофилом и широко распространена в почве, горячих источниках, океанских отложениях и является причиной порчи пищевых продуктов. Он будет расти в диапазоне температур 30–75 ° C. Некоторые штаммы способны аэробно окислять угарный газ. Его обычно используют в качестве возбудителя для исследований по проверке стерилизации и периодической проверки циклов стерилизации. содержит Биологический индикатор споры организма на фильтровальной бумаге внутри флакона. После стерилизации крышку закрывают, ампулу с питательной средой внутри флакона измельчают и инкубируют весь флакон . Изменение цвета и/или мутности указывает на результаты процесса стерилизации; отсутствие изменений указывает на то, что условия стерилизации были достигнуты, в противном случае рост спор указывает на то, что процесс стерилизации не был соблюден. Штаммы с флуоресцентной меткой , известные как быстро считываемые BI, [3] становятся все более распространенными для проверки стерилизации, поскольку видимая флуоресценция появляется примерно за одну десятую времени, необходимого для изменения цвета индикатора pH, а недорогой датчик света может обнаружить растущие колонии.
Биологические индикаторы используются в сочетании с химическими индикаторами и индикаторами процесса для проверки процессов стерилизации.
Впервые он был описан в 1920 году как Bacillus stearothermophilus . [4] но вместе с Bacillus thermoflucosidasius он был реклассифицирован как член рода Geobacillus в 2001 году. [5]
Приложения в молекулярной биологии
[ редактировать ]ДНК-полимераза
[ редактировать ]| ДНК-полимераза I | |||
|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||
| Организм | |||
| Символ | Польша | ||
| ПДБ | 2XY5 | ||
| ЮниПрот | E1C9K5 | ||
| |||
| Термостабильная обратная транскриптаза интрона группы II GsI-IIC | |||
|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||
| Организм | |||
| Символ | ТРТ | ||
| ПДБ | 6АР1 | ||
| ЮниПрот | E2GM63 | ||
| |||
В последнее время ДНК-полимераза, полученная из этих бактерий, Bst- полимераза, стала важной в приложениях молекулярной биологии.
Bst- полимераза обладает геликазоподобной активностью, что позволяет ей раскручивать нити ДНК. Его оптимальная рабочая температура составляет от 60 до 65 °C, а денатурация происходит при температуре выше 70 °C. Эти особенности делают его полезным при петлевой изотермической амплификации (LAMP) . [6] LAMP похожа на полимеразную цепную реакцию (ПЦР), но не требует этапа высокой температуры (96 ° C), необходимого для денатурации ДНК.
Обратная транскриптаза
[ редактировать ]В 2013 году было обнаружено, что термостабильная интрона группы II обратная транскриптаза (TGIRT), GsI-IIC-MRF, из G. stearothermophilus сохраняет активность до 70 ° C, демонстрирует высокую процессивность и низкую частоту ошибок. [7] Эти свойства делают этот фермент полезным для обратной транскрипции длинных и/или высокоструктурированных молекул РНК . Метод определения вторичной структуры РНК поскольку он точно преобразует нормальную РНК в ДНК, но вносит мутации в неспаренные основания, которые были метилированы диметилсульфатом , DMS-MaPseq, использует этот фермент , , и мутации можно идентифицировать с помощью секвенирования . [8]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Куревиц А; Динсдейл, AE; Халкет, Г; Леббе, Л; Де Вос, П; Ван Ландшут, А; Логан, Северная Каролина (июль 2012 г.). «Таксономический пересмотр рода Geobacillus: исправление Geobacillus, G. stearothermophilus, G. jurassicus, G. toebii, G. thermodenitrificans и G. thermoflucosidans (номинальное название corrig., ранее «thermo Glucosidasius»); перенос Bacillus thermantarcticus в род как G. thermantarcticus comb. nov.; предложение Caldibacillus debilis gen. nov., comb. nov.; переход G. tepidamans на Anoxybacillus как A. tepidamans com. nov .; Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 62 (Часть 7): 1470–85. дои : 10.1099/ijs.0.030346-0 . ПМИД 21856988 .
- ^ «Уведомление о том, что в томе 50, часть 2, IJSEM появились новые имена и новые комбинации» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 51 (3): 795–6. 2001. doi : 10.1099/00207713-51-3-795 . ПМИД 11411700 .
- ^ «Быстросчитываемые биологические индикаторы» . База знаний Стерис . Стерис Здравоохранение . Проверено 17 июня 2024 г.
- ^ DONK PJ: Высокоустойчивый термофильный организм» Журнал бактериологии 1920; 5, 373–374.
- ^ Т. Н. Назина; Т.П. Турова; А.Б. Полтараус; Е.В. Новикова; А.А. Григорян; А.Е. Иванова; А.М. Лысенко; В.В. Петруняка; Г.А. Осипов; С. С. Беляев, М. В. Иванов (2001). «Таксономическое исследование аэробных термофильных бацилл: описания Geobacillus subterraneus gen. nov., sp. nov. и Geobacillus uzenensis sp. nov. из нефтяных резервуаров и перенос Bacillus stearothermophilus, Bacillus thermocatenulatus, Bacillus thermoleovorans, Bacillus kaustophilus, Bacillus thermodenitrificans в Geobacillus как и новые сочетания G. stearothermophilus, G.th» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 51 (2): 433–446. дои : 10.1099/00207713-51-2-433 . ПМИД 11321089 .
- ^ Мори Й., Хирано Т., Нотоми Т. (2006). «Последовательность-специфическое визуальное обнаружение реакций LAMP путем добавления катионных полимеров» . БМК Биотехнология . 6 :3. дои : 10.1186/1472-6750-6-3 . ПМЦ 1373654 . ПМИД 16401354 .
- ^ Мор, С.; Ганем, Э.; Смит, В.; Шитер, Д.; Цинь, Ю.; Кинг, О.; Полиудакис, Д.; Айер, ВР; Ханике-Смит, С.; Свами, С.; Куерстен, С. (1 июля 2013 г.). «Термостабильные белки, слитые с обратной транскриптазой интрона группы II, и их использование в синтезе кДНК и секвенировании РНК следующего поколения» . РНК . 19 (7): 958–970. дои : 10.1261/rna.039743.113 . ISSN 1355-8382 . ПМЦ 3683930 . ПМИД 23697550 .
- ^ Зубрадт, Меган; Гупта, Паромита; Персад, Ситара; Ламбовиц, Алан М; Вайсман, Джонатан С; Рускин, Сильви (07 ноября 2016 г.). «DMS-MaPseq для полногеномного или целевого исследования структуры РНК in vivo» . Природные методы . 14 (1): 75–82. дои : 10.1038/nmeth.4057 . ISSN 1548-7091 . ПМК 5508988 . ПМИД 27819661 .
Внешние ссылки
[ редактировать ] | Эта бациллах статья о незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |