Лизинибацилла фузиформис
| Лизинибацилла фузиформис | |
|---|---|
Научная классификация 
| |
| Домен: | Бактерии |
| Тип: | Бациллота |
| Сорт: | Бациллы |
| Заказ: | Бациллы |
| Семья: | Бацилловые |
| Род: | Лизинибацилла |
| Разновидность: | Л. фузиформис
|
| Биномиальное имя | |
| Лизинибацилла фузиформис (Ахмед и др., 2007 г.)
| |
| Тип штамма | |
| ZC1 ЗБ2 НК1 Б-1 ДСМ 2898 ДЦМ 12229 ЛМГ 9816 АТСС 7055 ККУГ 28888 НБРЦ 15717 | |
| Синонимы | |
|
Бацилла фузиформис | |
Lysinibacillus fusiformis (обычно сокращенно L. ) грамположительная палочковидная — бактерия рода fusiformis Lysinibacillus . [ 1 ] Ученым еще предстоит полностью охарактеризовать патогенную природу этого микроба. [ 2 ] [ 3 ] мало что известно Хотя об этом организме , несколько проектов по секвенированию генома различных штаммов L. fusiformis . в настоящее время реализуется [ 4 ]
История
[ редактировать ]Lysinibacillus fusiformis была первоначально выделена с поверхности beta vulgaris доктором немецким биологом О. Готхайлем в 1901 году. [ 5 ] Готтейл использовал различные методы изоляции , включая культивирование организма Доктор на ломтиках моркови и свеклы . [ 5 ] L. fusiformis первоначально была известна как Bacillus fusiformis До 2007 года ; в этот момент он был реклассифицирован в род Lysinibacillus вместе со своим близким родственником Bacillus sphaericus . [ 6 ] Таксономическая классификация организма и была изменена в результате отличительных характеристик L. fusiformis , таких как , филогения физиология состав пептидогликана . [ нужна ссылка ]
Этимология
[ редактировать ]Значение слова «лизини», применительно к представителям рода Lysinibacillus , означает наличие лизина , аланина , глутаминовой кислоты и аспарагиновой кислоты в пептидогликановом слое клеточной стенки . [ 6 ] « Бацилла маленькая палочка», относится к палочковидной физиологии бактериальной », что означает « формы. [ 1 ] «Фусум» переводится как «веретено» , а «форма» обозначает конкретную фигуру, внешний вид или конфигурацию. бактерий веретенообразной структуры Таким образом, «fusiformis» происходит от . [ 1 ]
Морфология
[ редактировать ]Lysinibacillus — грамположительная палочковидная бактерия неподвижная . fusiformis [ 7 ] Активные клетки имеют приблизительную длину 2,5-3,0 микрометра и приблизительную ширину 0,5-0,9 микрометра . [ 8 ] В напряженных условиях этот микроб может генерировать неактивные сферические эндоспоры , устойчивые к высоким температурам , повреждающим химическим веществам и ультрафиолетовому свету . [ 7 ] Развивающиеся эндоспоры локализуются либо в центре, либо на концах увеличенных спорангиев и могут сохранять функциональность в течение длительного периода времени . [ 7 ]
Экология
[ редактировать ]Lysinibacillus fusiformis — это встречающаяся в природе бактерия , различные штаммы которой были выделены из различных сред, включая сельскохозяйственную почву и фабричные сточные воды . [ 5 ] [ 8 ] Этот организм считается полностью мезофильным ; Лучше всего растет при температуре 17-37 градусов Цельсия . [ 7 ] L. fusiformis также считается слабо алкалофильным и умеренно галофильным растением ; лучше всего растет в диапазоне pH 6–9,5 и концентрации NaCl 2–7%. [ 7 ]
Патогенность
[ редактировать ]В 20 веке считалось, что Lysinibacillus fusiformis форму патогенности, вызывает у человека связанную с тропическими язвенными образованиями и кожными и/или респираторными инфекциями . [ 2 ] Некоторые исследователи считали, что L. fusiformis инфекции могут возникать только в результате симбиотических отношений с определенными спирохет видами . [ 3 ] Многочисленные эксперименты по доказательству существования патогенности оказались безрезультатными. [ 2 ] [ 3 ] В 2010 году исследователи идентифицировали штамм L. fusiformis , B-1 , на основе 16S рРНК анализа гена . [ 9 ] штамм был обнаружен исключительно в токсине рыбы фугу Takifugu Этот obscurus . [ 9 ] Этот токсин представляет собой тетродотоксин , который является смертельно опасным нейротоксином , который разрушает центральную нервную систему человека , вызывая паралич . [ 9 ] L. fusiformis Показано, что чувствительна к обычному антибиотику широкого спектра действия, известному как тетрациклин . [ 1 ]
Метаболизм
[ редактировать ]Lysinibacillus fusiformis дает положительный результат на оксидазу и является облигатным аэробом . [ 7 ] Это означает, что он может использовать кислород для метаболизма различных сахаров и других простых углеводов . [ 7 ] Однако он не метаболизирует полисахариды, такие как крахмал . [ 7 ] Этот организм не производит кислоту или газ в результате метаболизма D -глюкозы или любых других углеводов и не восстанавливает нитраты до нитритов . [ 7 ] L. fusiformis может гидролизовать казеин и желатин . [ 7 ] Он также может использовать ацетат , цитрат , формиат , лактат и сукцинат в качестве углерода . источников [ 7 ] С метаболической точки зрения L. fusiformis и Lysinibacillus sphaericus практически идентичны. [ 1 ] На данный момент единственным известным фактором, который различает эти два вида, является то, что L. fusiformis положителен на уреазу . [ 1 ] Это означает, что L. fusiformis может гидролизовать мочевину с образованием аммиака и CO 2 . [ 10 ] В 2011 году было показано, что штамм L. fusiformis ZC1 сохраняет способность восстанавливать хромат до хрома . [ 8 ]
Геномика
[ редактировать ]По состоянию на 2014 год существует пара частичных 16S рРНК последовательностей гена (GenBank № AF169537 и EU430993), которые были проанализированы для L. fusiformis , а также несколько последовательностей полного генома различных штаммов. [ 4 ] [ 11 ] Существует множество текущих проектов по секвенированию генома с участием этого организма . [ 4 ] В настоящее время эти геномные последовательности существуют в виде каркасов и включают следующие штаммы: Lysinibacillus fusiformis H1K , Lysinibacillus fusiformis ZB2 и Lysinibacillus fusiformis ZC1 . [ 4 ] По данным Национального центра биотехнологической информации , L. fusiformis ZC1 (биопроект: PRJNA226204) является текущим геномным представителем L. fusiformis . [ 4 ] Геном fusiformis ZC1 L. секвенировали с использованием метода полногеномного секвенирования . [ 8 ] Геномный анализ штамма ZC1 показывает геном с приблизительной длиной 4,65 мегабаз , который содержит 4729 белок кодирующих генов, , и поддерживает относительно умеренное содержание GC (моль%), равное 37,3%. [ 8 ] Ген что chrA был обнаружен у L. fusiformis и кодирует хромата Cr(VI), переносчик к хромату Cr(VI) подтверждает устойчивость . [ 8 ]
Приложения в науке и медицине
[ редактировать ]Механизм L. fusiformis патогенности недостаточно изучен микробиологами . [ нужна ссылка ]
Пластиковая деградация:
В 2016 году группа исследователей под руководством профессора А.Б. Аде из факультета ботаники Университета Савитрибай Пхуле, Пуна, Массачусетс, Индия, сообщила о 22%-ном снижении потери веса пластика (политена) при использовании штамма Lysinibacillus fusiformis VASB14/WL после 2 месяцев регулярного встряхивания при комнатной температуре. [ 12 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Перейти обратно: а б с д и ж Прист, Ф.Г., М. Гудфеллоу и К. Тодд. «Численная классификация рода Bacillus». Национальный центр биотехнологической информации. Национальная медицинская библиотека США, июль 1988 г. Интернет. 29 апреля 2014 г.
- ^ Перейти обратно: а б с Смит, Э.К. «Эксперименты по инокуляции Bacillus Fusiformis, выделенной из тропической язвы, с наблюдением за бациллой». Национальный центр биотехнологической информации. Национальная медицинская библиотека США, 14 апреля 1933 г. Интернет. 29 апреля 2014 г.
- ^ Перейти обратно: а б с Питерс, Уильям Х. «Инфекция рук, очевидно, вызванная Bacillus Fusiformis». JSTOR. Журнал инфекционных заболеваний, 15 июня 1911 г. Интернет. 29 апреля 2014 г.
- ^ Перейти обратно: а б с д и «Лизинибацилла Фузиформис». Национальный центр биотехнологической информации. Национальная медицинская библиотека США, веб-сайт. 29 апреля 2014 г.
- ^ Перейти обратно: а б с «Ботаническое описание некоторых почвенных бактерий». Интернет-архивы. Иллинойс, 1901 год. Интернет. 30 апреля 2014 г.
- ^ Перейти обратно: а б Ахмед, Ифтихар и др. «Предложение о Lysinibacillus Boronitolerans Gen. Nov. Sp. Nov. и перенос Bacillus Fusiformis в Lysinibacillus Fusiformis Comb. Nov. и Bacillus Sphaericus в Lysinibacillus Sphaericus Comb. Nov.» ИДЖСЭМ. Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии, май 2007 г. Интернет. 29 апреля 2014 г.
- ^ Перейти обратно: а б с д и ж г час я дж к Дэвид Хендрикс, Пол Де Вос и Уильям Барни Уитмен. Фирмикуты. 2-е изд. Том. 3. Дордрехт: Springer, 2009. Печать.
- ^ Перейти обратно: а б с д и ж Он, М. и др. «Характеристика и геномный анализ высокохроматоустойчивого и редуцирующего бактериального штамма Lysinibacillus Fusiformis ZC1». Национальный центр биотехнологической информации. Национальная медицинская библиотека США, 30 января 2011 г. Интернет. 29 апреля 2014 г.
- ^ Перейти обратно: а б с Ван, Цзюнь, Яньхуэй Фань и Чжиган Яо. «Выделение штамма Lysinibacillus Fusiformis, обладающего способностью продуцировать тетродотоксин, из рыбы фугу Fugu Obscurus и характеристика этого штамма». НаукаДирект. Эльсервье, 15 сентября 2010 г. Интернет. 29 апреля 2014 г.
- ^ Бринк, Бенита. «Протокол уреазного теста». Микробная библиотека АСМ. Американское общество микробиологии, 11 ноября 2011 г. Интернет. 29 апреля 2014 г.
- ^ Накамура, Л.К. «Филогения организмов, подобных Bacillus Sphaericus». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии 50 (2000): 1715-722. Веб.
- ^ Шахнаваз, Модератор; Сангале, Маниша К.; Аде, Авинаш Б. (01 июля 2016 г.). «Ризосфера марины Авиценния (Форск.) Вирх. как ориентир для бактерий, разлагающих полиэтилен». Наука об окружающей среде и исследования загрязнения . 23 (14): 14621–14635. дои : 10.1007/s11356-016-6542-3 . ISSN 1614-7499 . ПМИД 27072028 . S2CID 38513560 .