Lysinibacillus fusiformis
| Lysinibacillus fusiformis | |
|---|---|
Научная классификация 
| |
| Домен: | Бактерии |
| Филум: | Bacillota |
| Сорт: | Бацилла |
| Заказ: | Бациллаль |
| Семья: | Bacillaceae |
| Род: | Лизинибацилл |
| Разновидность: | L. fusiformis
|
| Биномиальное название | |
| Lysinibacillus fusiformis (Ahmed et al., 2007)
| |
| Тип напряжения | |
| Zc1 ZB2 HK1 B-1 DSM 2898 JCM 12229 LMG 9816 ATCC 7055 CCUG 28888 NBRC 15717 | |
| Синонимы | |
|
Bacillus fusiformis | |
Lysinibacillus fusiformis (обычно сокращается L. fusiformis ) представляет грамположительную , стержнюю бактерию рода собой Lysinibacillus . [ 1 ] Ученые природу этого микроба еще не полностью охарактеризовали патогенную . [ 2 ] [ 3 ] Хотя мало что известно об этом организме , несколько проектов секвенирования генома для различных штаммов L. fusiformis . в настоящее время в настоящее время проходят [ 4 ]
История
[ редактировать ]Lysinibacillus fusiformis был первоначально изолирован с поверхности бета -вульгариса доктором немецким биологом О. Геттел в 1901 году. [ 5 ] Геттхейл использовал различные методы изоляции , которые включали в себя культивирование организма Доктор на ломтиках морковки и свеклы . [ 5 ] L. fusiformis был первоначально известен как Bacillus fusiformis до 2007 года; в этот момент он был реклассифицирован на род Lysinibacillus , наряду с его близким относительным Bacillus sphaericus . [ 6 ] Таксономическая классификация организма и была переназначена в результате отличительных характеристик L. fusiformis , таких как , филогения физиология состав пептидогликана . [ Цитация необходима ]
Этимология
[ редактировать ]Значение «лизини», как это относится к членам рода Lysinibacillus , означает присутствие лизина , аланина , глутаминовой кислоты и аспарагиновой кислоты в пептидогликановом слое клеточной стенки . [ 6 ] « Bacillus », что означает Small-Rod, относится к форме стержня физиологии в бактериальной формы. [ 1 ] «Fusum» переводится как шпиндель , а «форма» обозначает конкретную фигуру, внешний вид или конфигурацию. бактерий шпинделю , подобной Таким образом, «fusiformis» получен из структуры . [ 1 ]
Морфология
[ редактировать ]Lysinibacillus fusiformis -это грамположительная , в форме стержней немотильная бактерия . [ 7 ] Активные клетки имеют приблизительную длину 2,5-3,0 микрометра и приблизительную ширину 0,5-0,9 микрометра . [ 8 ] В напряженных условиях этот микроб может генерировать неактивные сферические эндоспоры , которые устойчивы к высоким температурам , повреждению химических веществ и ультрафиолетовым светом . [ 7 ] Развивающиеся эндоспоры локализуют либо централизованно, так и в конечном итоге в увеличенной спорангии и могут оставаться функциональными в течение длительных периодов времени . [ 7 ]
Экология
[ редактировать ]Lysinibacillus fusiformis является естественной бактерией , и различные штаммы были выделены из нескольких сред, включая фермерские почвы и заводские сточные воды . [ 5 ] [ 8 ] Этот организм считается совершенно мезофильным ; Лучше всего в температурном диапазоне 17-37 градусов по Цельсию . [ 7 ] L. fusiformis также считается слегка щелочной и умеренно галофильной ; Лучше всего в диапазоне рН 6–9,5 и концентрации NaCl 2-7%. [ 7 ]
Патогенность
[ редактировать ]В 20 -м веке считалось, что Lysinibacillus fusiformis вызывает форму патогенности у людей, связанных с тропическими язвенными формациями и кожными и/или респираторными инфекциями . [ 2 ] Некоторые исследователи полагали, что L. fusiformis инфекции может возникнуть только как симбиотическая связь с определенными спирочет видами . [ 3 ] Многочисленные эксперименты чтобы доказать существование патогенности , [ 2 ] [ 3 ] В 2010 году исследователи идентифицировали штамм L. fusiformis , B-1 , из 16S рРНК анализа генов . [ 9 ] Этот штамм был найден исключительно в токсине рыбы Puffer , Takifugu Obscurus . [ 9 ] Этот токсин является тетродотоксином , который представляет собой очень смертельный нейротоксин , который разрушает центральную нервную систему людей , вызывая паралич . [ 9 ] L. fusiformis Показано, что чувствителен к общему широкому спектру антибиотику, известному как тетрациклин . [ 1 ]
Метаболизм
[ редактировать ]Lysinibacillus fusiformis тестирует положительно на оксидазу и является облигационным аэроботом . [ 7 ] Это означает, что он может использовать кислород для метаболизации различных сахаров и других простых углеводов . [ 7 ] Тем не менее, он не метаболизирует полисахариды, такие как крахмал . [ 7 ] Этот организм не производит кислоту или газ из метаболизма D -глюкозы или любых других углеводов и не уменьшает нитрат до нитрита . [ 7 ] L. fusiformis может гидролизовать казеин и желатин . [ 7 ] Он также может использовать ацетат , цитрат , формиат , лактат и сукцинат в качестве углерода . источников [ 7 ] С метаболической точки зрения, L. fusiformis и Lysinibacillus sphaericus почти идентичны. [ 1 ] На данный момент единственный известный фактор, который различает эти два вида, заключается в том, что L. fusiformis является положительным для уреазы . [ 1 ] Это означает, что L. fusiformis может гидролизовать мочевину с образованием аммиака и CO 2 . [ 10 ] В 2011 году было показано, что штамм L. fusiformis ZC1 сохраняет способность уменьшать хромат до хрома . [ 8 ]
Геномика
[ редактировать ]По состоянию на 2014 год существует пара частичных 16S рРНК последовательностей гена (Genbank № AF169537 и EU430993), которые были проанализированы на L. fusiformis и несколько последовательностей цельных геномов различных штаммов. [ 4 ] [ 11 ] Существует множество продолжающихся проектов секвенирования генома, включающих этот организм . [ 4 ] В настоящее время эти геномные последовательности существуют в виде каркасов и включают следующие штаммы: Lysinibacillus fusiformis H1K , Lysinibacillus fusiformis ZB2 и Lysinibacillus fusiformis ZC1 . [ 4 ] Согласно Национальному центру биотехнологической информации , L. fusiformis ZC1 (Bioproject: PRJNA226204) является нынешним геномным представителем L. fusiformis . [ 4 ] Геном fusiformis ZC1 L. всего генома был секвенирован с использованием метода секвенирования дробовика . [ 8 ] Геномный анализ штамма ZC1 показывает геном с приблизительной длиной 4,65 мегабаз , который содержит 4729 белок кодирующих генов, и сохраняет относительно умеренное содержание GC (MOL%) 37,3%. [ 8 ] Ген который chra был обнаружен в L. fusiformis и кодирует хромата CR (VI), транспортер к хромату CR (VI) подтверждает устойчивость . [ 8 ]
Приложения к науке и медицине
[ редактировать ]Механизм L. fusiformis патогенности не совсем понятен микробиологами . [ Цитация необходима ]
Пластическая деградация:
В 2016 году группа исследователей во главе с А.Б. профессором Месяцы регулярного встряхивания при комнатной температуре. [ 12 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а беременный в дюймовый и фон Священник, Ф.Г., М. Гудфелло и С. Тодд. «Численная классификация рода Bacillus». Национальный центр информации о биотехнологии. Национальная медицина США, июль 1988 года. Веб. 29 апреля 2014 года.
- ^ Jump up to: а беременный в Смит, ЭК "эксперименты с прививками с Bacillus fusiformis, выделенным из тропической язвы, с наблюдениями на Bacillus". Национальный центр информации о биотехнологии. Национальная медицина США, 14 апреля 1933 года. Веб. 29 апреля 2014 года.
- ^ Jump up to: а беременный в Петерс, Уильям Х. «Ручная инфекция, по -видимому, из -за Bacillus fusiformis.» Jstor. Журнал инфекционных заболеваний, 15 июня 1911 года. Веб. 29 апреля 2014 года.
- ^ Jump up to: а беременный в дюймовый и «Лизинибацилл Фузиформ». Национальный центр информации о биотехнологии. Национальная библиотека медицины США, ND Web. 29 апреля 2014 года.
- ^ Jump up to: а беременный в «Ботаническое описание некоторых почвенных бактерий». Интернет -архив. Иллинойс, 1901. Веб. 30 апреля 2014 года.
- ^ Jump up to: а беременный Ахмед, Ифтихар и соавт. «Предложение лизинибациллус -боронитолеранов генерала ноября. Ijsem. Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии, май 2007 г. Веб. 29 апреля 2014 года.
- ^ Jump up to: а беременный в дюймовый и фон глин час я Дж k Дэвид Хендрикс, Пол де Вос и Уильям Барни Уитмен. Фирмуты. 2 -е изд. Тол. 3. Dordrecht: Springer, 2009. Печать.
- ^ Jump up to: а беременный в дюймовый и фон Он, M et al. «Характеристика и геномный анализ устойчивого к хромату и восстанавливающего бактериального штамма Lysinibacillus fusiformis ZC1». Национальный центр информации о биотехнологии. Национальная библиотека медицины США, 30 января 2011 года. Веб. 29 апреля 2014 года.
- ^ Jump up to: а беременный в Ван, Джун, Янхуи Фан и Чиганг Яо. «Выделение штамма Fusiformis Lysinibacillus с способностью производить тетродотоксин от Puffer Fish Fugu Obscurus и характеристика этого штамма». ScienceDirect. Эльсерье, 15 сентября 2010 года. Веб. 29 апреля 2014 года.
- ^ Бринк, Бенита. «Протокол испытания уреазы». ASM Микробелипись. Американское общество микробиологии, 11 ноября 2011 г.. Веб. 29 апреля 2014 года.
- ^ Накамура, LK «Филогения бациллусных организмов, подобных организмам». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии 50 (2000): 1715-722. Веб -
- ^ Shahnawaz, Mohd.; Сангале, Маниша К.; Аде, Авинаш Б. (2016-07-01). «Ризосфера Avicennia Marina (Forsk.) Vierh. В качестве ориентира для полиэтиленовых ухудшающихся бактерий». Наука по окружающей среде и исследование загрязнения . 23 (14): 14621–14635. doi : 10.1007/s11356-016-6542-3 . ISSN 1614-7499 . PMID 27072028 . S2CID 38513560 .