Бацилла мегатериум

Бацилла мегатериум
	Клетки Bacillus megaterium, окрашенные суданом черным B и сафранином .
Научная классификация
Домен:	Бактерии
Тип:	Бациллота
Сорт:	Бациллы
Заказ:	Бациллы
Семья:	Бацилловые
Род:	Бацилла
Разновидность:	Б. мегатериум
Биномиальное имя
	Бацилла мегатериум ; Бари 1884 г.

Bacillus megaterium — палочковидная грамположительная , преимущественно аэробная, спорообразующая бактерия, встречающаяся в самых разнообразных средах обитания. ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]} Он имеет длину клеток до 100 мкм и диаметр 0,1 мкм, что для бактерий довольно велико. ^{[ 3 ]} Клетки часто встречаются парами и цепочками. ^{[ 1 ]} где клетки соединены полисахаридами на клеточных стенках. ^{[ нужна ссылка ]}

В 1980-х годах, до использования Bacillus subtilis для этой цели, B. megaterium был основным модельным организмом среди грамположительных бактерий для интенсивных исследований по биохимии, споруляции и бактериофагам. В последнее время его популярность в области биотехнологии начала расти из-за его способности производить рекомбинантный белок. ^{[ 3 ]}

Этот вид был переведен в род Priestia . ^{[ 4 ]} Правильная номенклатура теперь Priestia megaterium. ^{[ 5 ]}.

Характеристики

B. megaterium растет при температуре от 3 до 45 °С, оптимум около 30 °С. Было обнаружено, что некоторые изоляты из геотермального озера Антарктики растут при температуре до 63 °C. ^{[ 1 ]} Он был признан эндофитом и потенциальным средством биоконтроля болезней растений. Азотфиксация была продемонстрирована у некоторых штаммов B. megaterium . ^{[ 1 ]}

B. megaterium на протяжении десятилетий был важным промышленным организмом. Он производит пенициллинамидазу, используемую для производства синтетического пенициллина, и несколько ферментов, таких как амилазы, используемые в хлебопекарной промышленности, и глюкозодегидрогеназа, используемая в анализах крови на глюкозу. Он также производит ферменты для модификации кортикостероидов и дегидрогеназ некоторых аминокислот. Кроме того, его используют для производства пирувата , витамина B ₁₂ и молекул с фунгицидными и противовирусными свойствами. ^{[ 2 ]} Некоторые из этих биологически активных соединений представляют собой циклические липопептиды , принадлежащие к семействам липопептидов сурфактина , итурина и фенгицина, которые также продуцируются некоторыми другими видами Bacillus . ^{[ 6 ]}

B. megaterium Известно, что производит поли-γ-глутаминовую кислоту . Накопление полимера значительно увеличивается в солевой (2–10% NaCl ) среде, в которой полимер состоит в основном из L-глутамата (содержание L-изомера до 95%). ^{[ 7 ]} По крайней мере, один штамм B. megaterium можно считать галофилом , поскольку наблюдался рост при концентрации NaCl до 15%. ^{[ 8 ]}

Филогенетически, основываясь на 16S рРНК , B. megaterium тесно связан с B. flexus , последний отличался от B. megaterium столетие назад, но лишь недавно был подтвержден как отдельный вид. ^{[ 1 ]} B. megaterium имеет сложное плазмидное содержимое. ^{[ 9 ]} а также некоторое фенотипическое и филогенетическое сходство с возбудителями B. anthracis. ^{[ 10 ]} и B. cereus , хотя сам по себе относительно безвреден. ^{[ 1 ]}

Изоляция

B. megaterium широко распространен в окружающей среде. Помимо того, что она является распространенной почвенной бактерией и эндофитом , ее можно найти в различных продуктах питания (включая мед и пчелиную пыльцу , ^{[ 11 ]} на которых большинство микроорганизмов не растет) и на различных поверхностях, включая клинические образцы, кожу, бумагу, камень и т. д. Он также был выделен из фекалий крупного рогатого скота, гусениц императорской моли и фрагментов восковой моли . ^{[ 1 ]}

История названия

Вид был описан де Бари в 1884 году, который назвал его Bacillus megaterium , но не дал этимологии. ^{[ 12 ]} Однако некоторые последующие авторы назвали его B. megatherium, предполагая, что название было написано неправильно. ^{[ 13 ]} Эта тенденция сохраняется, поскольку многие ученые до сих пор используют название B. megatherium . ^{[ 14 ]}^{[ 15 ]} сея путаницу.

Название B. megaterium является именительным существительным в приложении (см. Правило 12 IBCN). ^{[ 16 ]} и образовано от греческого прилагательного мега ) ^{[ 17 ]} и второе слово неясной этимологии. Возможны три гипотезы возникновения эпитета «мегатериум»: ^{[ 13 ]}

непреднамеренная орфографическая ошибка (маловероятная, учитывая тот факт, что де Бари и его ученики постоянно использовали эпитет «мегатерий»), тогда как это должно было быть мегатерий , от териона ( θηρίον , что означает «зверь» ^{[ 18 ]}), что означает «великий зверь».
сокращение «мегабактерий», как предположил Риппель в ^{[ 19 ]} учитывая тот факт, что де Бари назвал бактерию прозвищем Гросстье или Гроссвич
происходит от teras, teratos ( τερασ, τερατος , существительное среднего рода, означающее предзнаменование или чудо или, косвенно, чудовище, ^{[ 20 ]}), что можно интерпретировать как «великое чудовище» (при этом неолатинское имя сформировано неправильно, учитывая, что нет никаких свидетельств того, что греческое существительное третьего склонения при преобразовании в латынь становилось вторым латинским склонением с использованием именительной основы, которая является «тер- ", в то время как в другом случае используется основа "terat-". Если бы оно было преобразовано в существительное третьего склонения, это было бы "megateras, -atis").

Следовательно, в первом юридическом заключении Бактериологического кодекса было решено, что название должно оставаться «мегатериумом», учитывая неясное значение. ^{[ 13 ]}

Приведенная в ЛПСН этимология представляет собой, хотя и не совсем корректную, сплав первой и третьей интерпретации Гр. прил. мега, большой; гр. н. терас -атис, чудовище, зверь; НЛ н. мегатериум, большой зверь. ^{[ 21 ]}

Видовое название megaterium применялось и к другим родам.

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г Де Вос, П. и др. Руководство Берджи по систематической бактериологии: Том 3: Фирмикуты. Спрингер (2009)
^ Jump up to: ^а ^б Вари, С.П. и др. Bacillus megaterium — от простой почвенной бактерии до промышленного хозяина-продуцента белка. Appl Microbial Biotechnol 76 : 957–967 (2007).
^ Jump up to: ^а ^б Банк, Б. и др. Короткая история о большом волшебном жуке. Биоинженерные ошибки 1 : 85–91 (2010)
^ Гупта, Рэдхи С.; Патель, Судип; Шайни, Навнеет; Чен, Шу (01 ноября 2020 г.). «Надежное разграничение 17 различных клад видов Bacillus, предложенных как новые роды Bacillaceae, с помощью филогеномики и сравнительного геномного анализа: описание Robertmurraya kyonggiensis sp. nov. и предложение по исправленному роду Bacillus, ограничивающему его только членами клад Subtilis и Cereus. видов» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 70 (11): 5753–5798. дои : 10.1099/ijsem.0.004475 . ISSN 1466-5026 . ПМИД 33112222 .
^ Парт, Эйдан С.; Сарда Карбасс, Хоаким; Мейер-Колтхофф, Ян П.; Реймер, Лоренц К.; Гёкер, Маркус (01 ноября 2020 г.). «Вид Priestia megaterium» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 70 (11): 5607–5612. дои : 10.1099/ijsem.0.004332 . ISSN 1466-5026 . ПМЦ 7723251 . ПМИД 32701423 .
^ Пуэйо, Мануэль Трояно; Блох, Карлос; Кармона-Рибейро, Ана Мария; ди Масцио, Паоло (29 октября 2008 г.). «Липопептиды, продуцируемые штаммом почвенной бациллы Megaterium» . Микробная экология . 57 (2): 367–378. дои : 10.1007/s00248-008-9464-x . ISSN 1432-184X . ПМИД 18958512 . S2CID 266751 .
^ Симидзу, К., Накамура, Х. и Ашиучи, М. Индуцируемый солью бионилоновый полимер из Bacillus Megaterium . Прил. Окружающая среда. Микробиол. 73 : 2378–2379 (2007).
^ Хан, Дж. А. Биодеградация азокрасителя умеренно галотолерантной Bacillus megaterium и исследование фермента азоредуктазы, участвующего в разложении. Передовые биотехнологии 10 : 21–27 (2011).
^ Швед PS et al. Полные последовательности генома типа Priestia megaterium и клинических штаммов содержат сложные массивы плазмид. Микробиол. Объявления о ресурсах 10(27 ) :e00403-21(2021)
^ Диб, Э.Г. и др. Негемолитические, неподвижные грамположительные палочки, указывающие на Bacillus anthracis . Экстренное заражение Dis. 9 : 1013–1015 (2003).
^ Мохаммад, Сальма Малиха; Махмуд-Аб-Рашид, Нор-Хайзура; Завави, Норхаснида (25 августа 2020 г.). «Пробиотические свойства бактерий, выделенных из перги безжалостной пчелы Heterotrigona itama» (PDF) . Журнал пчеловодческих исследований . 60 : 172–187. дои : 10.1080/00218839.2020.1801152 . ISSN 0021-8839 . S2CID 225208290 .
^ ДЕ БАРИ (А.): Сравнительная морфология и биология грибов, мицетозоев и бактерий. Вильгельм Энгельманн, Лейпциг, 1884 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с Бьюкенен, RE; Порода, РС; Сент-Джон-Брукс, Р. (1951). «Мнение 1. Правильное написание видового эпитета в видовом названии Bacillus Megaterium De Bary 1884: одобрено Судебной комиссией Международного комитета по бактериологической номенклатуре» . Международный бюллетень бактериологической номенклатуры и таксономии . 1 : 35–36. дои : 10.1099/0096266X-1-1-35 .
^ Нахид, Э.-А. Фенотипическая и генетическая изменчивость трех изолятов Bacillus Megatherium. I. Эволюция in viro потенциала растворения трикальцийфосфата и закономерностей роста. J Am Sc 6 : 111–115 (2010)
^ Ду, X. и др. Связь бактериального разнообразия гнилей пекинской капусты со средой обитания. Вэй Шэн У Сюэ Бао 51 : 1639-45 (2011)
^ Лапаж, С.; Снит, П.; Лессель, Э.; Скерман, В.; Силигер, Х.; Кларк, В. (1992). Международный кодекс номенклатуры бактерий: Бактериологический кодекс, редакция 1990 г. Вашингтон, округ Колумбия: ASM Press. ПМИД 21089234 .
^ мега
^ зверь
^ Ripple, Arch Microbiol. 11, 470, 1940
^ монстр
^ B. megaterium в LPSN ; Парте, Эйдан К.; Сарда Карбасс, Хоаким; Мейер-Колтхофф, Ян П.; Реймер, Лоренц К.; Гёкер, Маркус (1 ноября 2020 г.). «Список названий прокариот, имеющих номенклатурное положение (ЛПСН), перемещается в ДСМЗ» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 70 (11): 5607–5612. дои : 10.1099/ijsem.0.004332 .

Внешние ссылки

Типовой штамм Bacillus megaterium в Bac Dive - база метаданных бактериального разнообразия

[bergey-1] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г Де Вос, П. и др. Руководство Берджи по систематической бактериологии: Том 3: Фирмикуты. Спрингер (2009)

[vary-2] Jump up to: ^а ^б Вари, С.П. и др. Bacillus megaterium — от простой почвенной бактерии до промышленного хозяина-продуцента белка. Appl Microbial Biotechnol 76 : 957–967 (2007).

[bunk-3] Jump up to: ^а ^б Банк, Б. и др. Короткая история о большом волшебном жуке. Биоинженерные ошибки 1 : 85–91 (2010)

[4] Гупта, Рэдхи С.; Патель, Судип; Шайни, Навнеет; Чен, Шу (01 ноября 2020 г.). «Надежное разграничение 17 различных клад видов Bacillus, предложенных как новые роды Bacillaceae, с помощью филогеномики и сравнительного геномного анализа: описание Robertmurraya kyonggiensis sp. nov. и предложение по исправленному роду Bacillus, ограничивающему его только членами клад Subtilis и Cereus. видов» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 70 (11): 5753–5798. дои : 10.1099/ijsem.0.004475 . ISSN 1466-5026 . ПМИД 33112222 .

[5] Парт, Эйдан С.; Сарда Карбасс, Хоаким; Мейер-Колтхофф, Ян П.; Реймер, Лоренц К.; Гёкер, Маркус (01 ноября 2020 г.). «Вид Priestia megaterium» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 70 (11): 5607–5612. дои : 10.1099/ijsem.0.004332 . ISSN 1466-5026 . ПМЦ 7723251 . ПМИД 32701423 .

[6] Пуэйо, Мануэль Трояно; Блох, Карлос; Кармона-Рибейро, Ана Мария; ди Масцио, Паоло (29 октября 2008 г.). «Липопептиды, продуцируемые штаммом почвенной бациллы Megaterium» . Микробная экология . 57 (2): 367–378. дои : 10.1007/s00248-008-9464-x . ISSN 1432-184X . ПМИД 18958512 . S2CID 266751 .

[7] Симидзу, К., Накамура, Х. и Ашиучи, М. Индуцируемый солью бионилоновый полимер из Bacillus Megaterium . Прил. Окружающая среда. Микробиол. 73 : 2378–2379 (2007).

[8] Хан, Дж. А. Биодеградация азокрасителя умеренно галотолерантной Bacillus megaterium и исследование фермента азоредуктазы, участвующего в разложении. Передовые биотехнологии 10 : 21–27 (2011).

[9] Швед PS et al. Полные последовательности генома типа Priestia megaterium и клинических штаммов содержат сложные массивы плазмид. Микробиол. Объявления о ресурсах 10(27 ) :e00403-21(2021)

[10] Диб, Э.Г. и др. Негемолитические, неподвижные грамположительные палочки, указывающие на Bacillus anthracis . Экстренное заражение Dis. 9 : 1013–1015 (2003).

[11] Мохаммад, Сальма Малиха; Махмуд-Аб-Рашид, Нор-Хайзура; Завави, Норхаснида (25 августа 2020 г.). «Пробиотические свойства бактерий, выделенных из перги безжалостной пчелы Heterotrigona itama» (PDF) . Журнал пчеловодческих исследований . 60 : 172–187. дои : 10.1080/00218839.2020.1801152 . ISSN 0021-8839 . S2CID 225208290 .

[12] ДЕ БАРИ (А.): Сравнительная морфология и биология грибов, мицетозоев и бактерий. Вильгельм Энгельманн, Лейпциг, 1884 г.

[JO1-13] Jump up to: ^а ^б ^с Бьюкенен, RE; Порода, РС; Сент-Джон-Брукс, Р. (1951). «Мнение 1. Правильное написание видового эпитета в видовом названии Bacillus Megaterium De Bary 1884: одобрено Судебной комиссией Международного комитета по бактериологической номенклатуре» . Международный бюллетень бактериологической номенклатуры и таксономии . 1 : 35–36. дои : 10.1099/0096266X-1-1-35 .

[14] Нахид, Э.-А. Фенотипическая и генетическая изменчивость трех изолятов Bacillus Megatherium. I. Эволюция in viro потенциала растворения трикальцийфосфата и закономерностей роста. J Am Sc 6 : 111–115 (2010)

[15] Ду, X. и др. Связь бактериального разнообразия гнилей пекинской капусты со средой обитания. Вэй Шэн У Сюэ Бао 51 : 1639-45 (2011)

[code-16] Лапаж, С.; Снит, П.; Лессель, Э.; Скерман, В.; Силигер, Х.; Кларк, В. (1992). Международный кодекс номенклатуры бактерий: Бактериологический кодекс, редакция 1990 г. Вашингтон, округ Колумбия: ASM Press. ПМИД 21089234 .

[17] мега

[18] зверь

[19] Ripple, Arch Microbiol. 11, 470, 1940

[20] монстр

[21] B. megaterium в LPSN ; Парте, Эйдан К.; Сарда Карбасс, Хоаким; Мейер-Колтхофф, Ян П.; Реймер, Лоренц К.; Гёкер, Маркус (1 ноября 2020 г.). «Список названий прокариот, имеющих номенклатурное положение (ЛПСН), перемещается в ДСМЗ» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 70 (11): 5607–5612. дои : 10.1099/ijsem.0.004332 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]

[ 19 ]

[ 20 ]

[ 21 ]