Священники
| Священники | |
|---|---|
| |
| Пристия мегатериум | |
| Научная классификация | |
| Домен: | |
| Тип: | |
| Сорт: | |
| Заказ: | |
| Семья: | |
| Род: | Пристия Гупта и др. 2020 год
|
| Разновидность | |
Информация на основе ЛПСН 2021 | |
Priestia — род преимущественно грамположительных ( P. flexa окрашивает грамвариабельные и P. koreensis окрашивает грамотрицательные ) палочковидных бактерий семейства Bacillaceae из порядка Bacillales . [ 1 ] [ 2 ] Типовым видом этого рода является Priestia megaterium. [ 3 ]
Члены Priestia ранее были видами, принадлежащими к Bacillus , роду, который, как было признано, демонстрирует обширную полифилию среди своих членов из-за расплывчатых критериев. [ 4 ] используется для отнесения видов к этой кладе. Было проведено множество исследований с использованием сравнительного филогенетического анализа в качестве средства для выяснения эволюционных взаимоотношений между видами Bacillus , что привело к переводу видов в многочисленные новые роды, такие как Alkalihalobacillus , Brevibacillus , Solibacillus , Alicyclobacillus , Virgibacillus и Evansella . [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ] [ 9 ] [ 1 ] Кроме того, род Bacillus ограничен и включает только виды, тесно связанные с Bacillus subtilis и Bacillus cereus . [ 5 ] [ 1 ]
Приестия названа в честь британского микробиолога Фергуса Г. Приста (профессора Университета Хериот-Ватт, Эдинбург; 1948–2019) за его большой вклад в систематику и использование представителей рода Bacillus . [ 1 ]
Биохимические характеристики и молекулярные подписи [ 1 ]
[ редактировать ]Представители этого рода аэробны и встречаются в самых разных местах, таких как почва, фекалии, верхние слои атмосферы, внутренние ткани хлопчатника, морские отложения и ризосфера корней ивы. Все члены могут производить эндоспоры, и большинство из них подвижны. Виды Priestia могут расти при температуре от 5 до 48 ° C, с оптимальным ростом в диапазоне 28–37 ° C, поэтому их можно квалифицировать как мезофильный и психротрофный организм. P. aryabhattai имеет промышленное значение, поскольку он устойчив к мышьяку и ультрафиолетовому излучению, что делает его доступной альтернативой традиционным, дорогим технологиям восстановления металлов.
Две консервативные сигнатурные индели (CSI) были идентифицированы посредством геномного анализа как эксклюзивные для этого рода в белках олигорибонуклеазы NrnB или фосфодиэстеразы цАМФ/цГМФ и белке суперсемейства DHH, и могут быть использованы для надежной дифференциации этого рода от других родов Bacillaceae и бактерий в молекулярных исследованиях. условия. [ 1 ]
Таксономия
[ редактировать ]Priestia по состоянию на май 2021 года содержит 10 видов с достоверно опубликованными названиями. [ 3 ] Этот род был идентифицирован как монофилетическая клада и филогенетически не связанный с другими видами Bacillus в исследованиях, изучающих таксономические отношения внутри Bacillus . [ 1 ] Эта модель ветвления также наблюдается в базе данных таксономии генома . [ 10 ]
Два неверно опубликованных вида, «Bacillus pseudoflexus» и «Bacillus zanthoxyli», также группируются с другими представителями Priestia на филогенетических деревьях, а также имеют одни и те же молекулярные маркеры в форме CSI. [ 1 ] Однако официально их передача не предлагалась из-за отсутствия информации о культурном штамме. Требуется дальнейший пересмотр этого рода, поскольку обнаруживаются и назначаются дополнительные геномы и новые виды.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с д и ж г час Гупта, Рэдхи С.; Патель, Судип; Шайни, Навнеет; Чен, Шу (1 ноября 2020 г.). «Надежное разграничение 17 различных клад видов Bacillus, предложенных как новые роды Bacillaceae, с помощью филогеномики и сравнительного геномного анализа: описание Robertmurraya kyonggiensis sp. nov. и предложение по исправленному роду Bacillus, ограничивающему его только членами subtilis и cereus клад . видов» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 70 (11): 5753–5798. дои : 10.1099/ijsem.0.004475 . ISSN 1466-5026 . ПМИД 33112222 .
- ^ Бреннер, Дон Дж.; Криг, Ноэль Р.; Стейли, Джеймс Т.; Гаррити, Джордж М.; Бун, Дэвид Р.; Де Вос, Пол; Гудфеллоу, Майкл; Рейни, Фред А.; Шляйфер, Карл-Хайнц, ред. (2005). Руководство Берджи® по систематической бактериологии . дои : 10.1007/0-387-28022-7 . ISBN 978-0-387-24144-9 .
- ^ Jump up to: а б «Род: Priestia» . lpsn.dsmz.de. Проверено 30 мая 2021 г.
- ^ Эш, Кэрол; Фэрроу, Джей; Уоллбэнкс, Салли; Коллинз, доктор медицины (28 июня 2008 г.). «Филогенетическая гетерогенность рода Bacillus, выявленная путем сравнительного анализа последовательностей малых субъединиц-рибосомальных РНК» . Письма по прикладной микробиологии . 13 (4): 202–206. дои : 10.1111/j.1472-765x.1991.tb00608.x . ISSN 0266-8254 . S2CID 82988953 .
- ^ Jump up to: а б Патель, Судип; Гупта, Рэдхи С. (1 января 2020 г.). «Филогеномная и сравнительная геномная основа для решения полифилии рода Bacillus: предложение для шести новых родов видов Bacillus, Peribacillus gen. nov., Cytobacillus gen. nov., Mesobacillus gen. nov., Neobacillus gen. nov., Metabacillus gen. ноябрь и Alkalihalobacillus gen . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 70 (1): 406–438. дои : 10.1099/ijsem.0.003775 . ISSN 1466-5026 . ПМИД 31617837 .
- ^ ШИДА, О.; ТАКАГИ, Х.; КАДОВАКИ, К.; КОМАГАТА, К. (1 октября 1996 г.). «Предложение по двум новым родам: Brevibacillus gen. nov. и Aneurinibacillus gen. nov . Международный журнал систематической бактериологии . 46 (4): 939–946. дои : 10.1099/00207713-46-4-939 . ISSN 0020-7713 . ПМИД 8863420 .
- ^ Визоцки, доктор медицинских наук; Юрщук П.; Фокс, GE; Дейнхард, Г.; Поралла, К. (1 апреля 1992 г.). «Сравнительный анализ последовательностей 16S рРНК (рДНК) Bacillus acidocaldarius, Bacillus acidoterrestris и Bacillus cycloheptanicus и предложение по созданию нового рода Alicyclobacillus gen. nov» . Международный журнал систематической бактериологии . 42 (2): 263–269. дои : 10.1099/00207713-42-2-263 . ISSN 0020-7713 . ПМИД 1374624 .
- ^ Муал, Пунам; Сингх, Нитин Кумар; Верма, Ашиш; Шуман, Питер; Кришнамурти, Шринивасан; Дастагер, Сайед; Майилрадж, Шанмугам (1 мая 2016 г.). «Реклассификация Bacillus isronensis Shivaji et al. 2009 как Solibacillus isronensis com. Nov. и исправленное описание рода Solibacillus Кришнамурти et al. 2009» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 66 (5): 2113–2120. дои : 10.1099/ijsem.0.000982 . ISSN 1466-5026 . ПМИД 26907585 .
- ^ Хейндрикс, М.; Леббе, Л.; Керстерс, К.; Хосте, Б.; Де Вахтер, Р.; Де Вос, П.; Форсайт, Г.; Логан, Северная Каролина (1 июля 1999 г.). «Предложение Virgibacillus proomii sp. nov. и исправленное описание Virgibacillus pantothenticus (Proom and Knight 1950) Heyndrickx et al. 1998» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 49 (3): 1083–1090. дои : 10.1099/00207713-49-3-1083 . ISSN 1466-5026 . ПМИД 10425765 .
- ^ «ГТДБ – Дерево» . gtdb.ecogenomic.org . Проверено 28 мая 2021 г.