Эванселла
Эванселла | |
---|---|
Научная классификация ![]() | |
Домен: | Бактерии |
Филум: | Bacillota |
Сорт: | Бацилла |
Заказ: | Бациллаль |
Семья: | Bacillaceae |
Род: | Эванселла Gupta et al. 2020 |
Разновидность | |
Evansella -это род грамположительных бактерий в форме стержня в семействе Bacillaceae в рамках бациллалов . [ 1 ] [ 2 ] Типовым видом для этого рода является Evansella cellulosilytica. [ 3 ]
Члены Evansella были перенесены из рода Bacillus , род, который давно подвергался тщательному тщательному тщательному тщательному сообщению из -за его включения многих филогенетически не связанных видов. [ 4 ] [ 5 ] Первоначальные критерии, используемые для назначения видов в Bacillus, были расплывчаты и применялись ко многим различным видам бактерий, что приводит к большому роду, полному не связанным организмам с разнообразным диапазоном биохимических характеристик. [ 6 ] Чтобы прояснить таксономические отношения в рамках рода, были проведены множественные филогенетические исследования, что привело к переносу многих видов в новые роды, такие как Virgibacillus , Solibacillus , Brevibacillus и Ectobacillus . [ 7 ] [ 8 ] [ 9 ] [ 1 ] Кроме того, Bacillus был ограничен только включает виды, тесно связанные с Bacillus subtilis и Bacillus cereus . [ 10 ] [ 1 ]
Название Эванселла выбрано для празднования американского микробиолога доктора Алисы Кэтрин Эванс (1885-1975, Министерство сельского хозяйства США) в знак признания ее вклада в область бактериологии. [ 1 ]
Биохимические характеристики и молекулярные подписи
[ редактировать ]Члены рода Evansella могут быть аэробными или факультативно анаэробными . Клетки являются подвижными с помощью перитрихозной жгутики . Все они формируют эндопор и каталазу позитивны. Виды можно найти в промышленных районах и содовых озерах. Evansella может выжить при температурах в диапазоне от 15 ° C до 60 ° C, но оптимальный рост происходит в диапазоне 35-40 ° C. [ 1 ]
Три консервативных индела подписи (CSI) были идентифицированы с помощью геномного анализа как исключительного для этого рода в белке белков GTP -пирофосфокиназы, липопротеиновой пептидазы II и CLP -протеазы CLPP. [ 1 ] Эти CSI дают новые средства для отличия Evansella от других родов Bacillaceae в молекулярных терминах. [ 1 ]
Таксономия
[ редактировать ]насчитывается 5 видов с обоснованно опубликованными названиями По состоянию на май 2021 года в роде Evansella . [ 3 ] Различные филогенетические деревья, созданные на основе конкатенированных последовательностей из различных наборов данных консервативных белков и последовательностей генома 16S рРНК, показали, что члены эванелла образуют монофилетическую ветвь. Эта клада также отражена в схеме ветвления в базе данных таксономии генома (GTDB). [ 11 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а беременный в дюймовый и фон глин Гупта, Радхей С.; Патель, Судип; Саини, Навнет; Чен, Шу (2020-11-01). "Надежная демаркация 17 различных видов Bacillus, предложенных как новые роды Bacillaceae, Phylogenomics и сравнительный геномный анализ: описание Robertmurraya kyonggiensis sp. Nov. И предложение для полученного рода Bacillus, ограничивающий его только членам Subtilis и Cereus clades. видов " . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 70 (11): 5753–5798. doi : 10.1099/ijsem.0.004475 . ISSN 1466-5026 . PMID 33112222 .
- ^ Бреннер, Дон Дж.; Криг, Ноэль Р.; Стейли, Джеймс Т.; Гаррити, Джордж М.; Бун, Дэвид Р.; Де Вос, Пол; Гудфелло, Майкл; Рейни, Фред А.; Schleifer, Karl-Heinz, Eds. (2005). Bergey's Manual® систематической бактериологии . doi : 10.1007/0-387-28022-7 . ISBN 978-0-387-24144-9 .
- ^ Jump up to: а беременный «Род: Эванселла» . lpsn.dsmz.de. Получено 2021-05-25 .
- ^ Logan, NA (2011-12-20). «Bacillus и родственники при борьбе с пищевым дородом» . Журнал прикладной микробиологии . 112 (3): 417–429. doi : 10.1111/j.1365-2672.2011.05204.x . ISSN 1364-5072 . PMID 22121830 .
- ^ LA URC, Myron T; Сатоми, Масатака; Агата, Норо; Венкатсвар, Касттури (март 2004 г.). «Гирб как филогенетический дискриминатор для членов группы Bacillus anthracis - Cereus - Thuringensis » Журнал методов микробиологии 56 (3): 383–394. Doi : 10.1016/ j.mimet.2003.11.0 ISSN 0167-7 14967230PMID
- ^ Эш, Кэрол; Фарроу, Jae; Wallbanks, Салли; Коллинз, MD (2008-06-28). «Филогенетическая гетерогенность рода Bacillus выявлена в результате сравнительного анализа последовательностей с малой субъединичной рибосом» . Письма в прикладной микробиологии . 13 (4): 202–206. doi : 10.1111/j.1472-765x.1991.tb00608.x . ISSN 0266-8254 . S2CID 82988953 .
- ^ Heyndrickx, M.; Lebbe, L.; Kersters, K.; Хост, Б.; Де Вахтер, Р.; De Vos, P.; Forsyth, G.; Logan, NA (1999-07-01). «Предложение Virgibacillus proomii sp. Nov. И построено описание Virgibacillus pantothenticus (Proom and Knight 1950) Heyndrickx et al. 1998» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 49 (3): 1083–1090. doi : 10.1099/00207713-49-3-1083 . ISSN 1466-5026 . PMID 10425765 .
- ^ Шида, О.; Takagi, H.; Кадоваки, К.; Kogagata, K. (1996-10-01). «Предложение для двух новых родов, Brevibacillus Gen. Nov. Nov. и Aneurinibacillalus Gen. Nov » Международный журнал систематической бактериологии 46 (4): 939–9 Doi : 10.1099/ 00207713-46-4-9 ISSN 0020-7 PMID 8863420
- ^ Муаль, Пунам; Сингх, Нитин Кумар; Верма, Ашиш; Шуман, Петр; Кришнамурти, Шринивасан; Dastager, Сайед; Mayilraj, Shanmugam (2016-05-01). «Реклассификация Bacillus isronensis Shivaji et al. 2009 как Solibacillus isronensis Comb. Nov. И построено описание рода Solibacillus Krishnamurthi et al. 2009» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 66 (5): 2113–2120. doi : 10.1099/ijsem.0.000982 . ISSN 1466-5026 . PMID 26907585 .
- ^ Патель, Судип; Гупта, Радхей С. (2020-01-01). "Филогеномическая и сравнительная геномная структура для разрешения полифили рода Bacillus: предложение для шести новых родов видов Bacillus, Peribacillus Gen. Nov., Cytobacillus Gen. Nov., Mesobacillus Gen. Nov., Neobacillus Gen. Nov., Metabacillus. Генерал . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 70 (1): 406–438. doi : 10.1099/ijsem.0.003775 . ISSN 1466-5026 . PMID 31617837 .
- ^ "Gtdb - дерево" . gtdb.ecogenomic.org . Получено 2021-05-25 .