Взаимодействие микробов-хозяев у Caenorhabditis elegans

Caenorhabditis elegans – взаимодействие микробов определяется как любое взаимодействие, которое включает в себя ассоциацию с микробами, которые временно или постоянно живут внутри или на нематоде C. elegans. Микробы могут вступать в комменсальное , мутуалистическое или патогенное взаимодействие с хозяином. К ним относятся бактериальные, вирусные, одноклеточные эукариотические и грибковые взаимодействия. В природе C. elegans является носителем разнообразного набора микробов. [1] Напротив, штаммы C. elegans , которые культивируются в лабораториях в исследовательских целях, утратили связанные с ними естественные микробные сообщества и обычно поддерживаются одним бактериальным штаммом, Escherichia coli OP50. Однако E. coli OP50 не позволяет проводить обратный генетический скрининг, поскольку библиотеки RNAi были созданы только в штамме HT115. Это ограничивает возможность изучения бактериального воздействия на фенотипы хозяина. [2] Взаимодействие C. elegans с микробами-хозяевами тщательно изучается из-за их ортологов у человека. [2] Следовательно, чем лучше мы понимаем взаимодействие C. elegans с хозяином , тем лучше мы сможем понять взаимодействие хозяина с организмом человека.
Природная экология
[ редактировать ]
C. elegans является хорошо зарекомендовавшим себя модельным организмом в различных областях исследований, однако его экология изучена плохо. У них короткий цикл развития, продолжающийся всего три дня, а общая продолжительность жизни около двух недель. [2] C. elegans ранее считалась почвенной нематодой. [3] [4] [5] но за последние 10 лет было показано, что естественные места обитания C. elegans богаты микробами, например, компостные кучи, гнилой растительный материал и гнилые фрукты. [3] [6] [7] [8] [9] Большинство исследований C. elegans основано на штамме N2, адаптированном к лабораторным условиям. [10] [11] [12] Лишь в последние несколько лет природная экология C. elegans стала изучаться более подробно. [13] и одним из направлений текущих исследований является его взаимодействие с микробами. [14] Поскольку C. elegans питается бактериями ( микробиворы ), кишечник червей, выделенных из дикой природы, обычно заполнен большим количеством бактерий. [9] [15] [16] В отличие от очень большого разнообразия бактерий в естественной среде обитания C. elegans , лабораторные штаммы скармливают только одному бактериальному штамму, производному Escherichia coli OP50. . [17] OP50 не был выделен совместно с C. elegans из природы, а скорее использовался из-за его удобства для лабораторного обслуживания. [18] Отбеливание — распространенный в лабораторных условиях метод очистки C. elegans от загрязнений и синхронизации популяции червей. [19] Во время отбеливания червей обрабатывают 5 н. раствором NaOH и бытовым отбеливателем , что приводит к гибели всех червей и выживанию только яиц нематод. [19] Личинки, вылупляющиеся из этих яиц, лишены каких-либо микробов, поскольку ни один из известных в настоящее время C. elegans, микробов, ассоциированных с не может передаваться вертикально . Поскольку большинство лабораторных штаммов содержатся в этих гнотобиотических условиях, о составе микробиоты C. elegans ничего не известно . [20] Экологию C. elegans можно полностью понять только в свете многочисленных взаимодействий с микроорганизмами, с которыми он сталкивается в дикой природе. Влияние микробов на C. elegans может варьироваться от полезного до летального.
Полезные микробы
[ редактировать ]В естественной среде обитания C. elegans постоянно сталкивается с различными бактериями, которые могут оказывать как отрицательное, так и положительное влияние на ее приспособленность. На сегодняшний день большинство исследований взаимодействия C. elegans с микробами сосредоточено на взаимодействии с патогенами. Лишь недавно некоторые исследования обратились к роли комменсальных и мутуалистических бактерий в приспособленности C. elegans . В этих исследованиях C. elegans подвергался воздействию различных почвенных бактерий, либо изолированных в другом контексте, либо из C. elegans , перенесенных в почву. лабораторных штаммов [21] [22] Эти бактерии могут влиять на C. elegans либо непосредственно через специфические метаболиты, либо вызывать изменение условий окружающей среды и, таким образом, вызывать физиологический ответ у хозяина. [21] Полезные бактерии могут оказывать положительное влияние на продолжительность жизни, создавать определенную устойчивость к патогенам или влиять на развитие C. elegans .
Продление срока службы
[ редактировать ]
Продолжительность жизни C. elegans увеличивается при выращивании на чашках с Pseudomonas sp. или Bacillus megaterium по сравнению с людьми, живущими на E.coli . [21] Увеличение продолжительности жизни, опосредованное B. megaterium, больше, чем вызванное Pseudomonas sp. . Как установлено с помощью микроматричного анализа (метод, который позволяет идентифицировать гены C. elegans , которые по-разному экспрессируются в ответ на различные бактерии), 14 генов иммунной защиты активировались, когда C. elegans выращивали на B. megaterium , в то время как только у двоих наблюдался повышенный уровень регуляции при кормлении Pseudomonas sp. Помимо генов иммунной защиты, в синтезе коллагена и других компонентов кутикулы участвуют и другие гены с повышенной регуляцией , что указывает на то, что кутикула может играть важную роль во взаимодействии с микробами. Хотя известно, что некоторые гены важны для увеличения продолжительности жизни C. elegans , точные механизмы, лежащие в их основе, до сих пор остаются неясными. [21]
Защита от микробов
[ редактировать ]В настоящее время признано, что микробные сообщества, проживающие внутри тела хозяина, важны для эффективного иммунного ответа. [22] Однако молекулярные механизмы, лежащие в основе этой защиты, в значительной степени неизвестны. Бактерии могут помочь хозяину бороться с патогенами, либо напрямую стимулируя иммунный ответ, либо конкурируя с патогенными бактериями за доступные ресурсы. [23] [24] У C. elegans некоторые ассоциированные бактерии, по-видимому, обеспечивают защиту от патогенов. Например, при C. elegans выращивании на Bacillus megaterium или Pseudomonas mendocina черви становятся более устойчивыми к заражению патогенной бактерией Pseudomonas aeruginosa [21], которая является распространенной бактерией в естественной среде обитания C. elegans и, следовательно, потенциальным природным патогеном. . [25] Эта защита характеризуется длительным выживанием P. aeruginosa в сочетании с отсроченной колонизацией C. elegans патогеном. Из-за своего сравнительно большого размера B. megaterium не является оптимальным источником пищи для C. elegans . [26] что приводит к задержке развития и снижению репродуктивной способности. Способность B. megaterium повышать устойчивость к инфекции P. aeruginosa, по-видимому, связана со снижением репродуктивной способности. Однако защита от инфекции P. aeruginosa , обеспечиваемая P. mendocina , не зависит от репродукции и зависит от пути протеинкиназы, активируемой митогеном p38 . P. mendocina способна активировать путь p38 MAPK и, таким образом, стимулировать иммунный ответ C. elegans против патогена. [22] Обычным способом защиты организма от микробов является увеличение оплодотворения , чтобы увеличить количество выживших особей перед лицом нападения. Эта защита от паразитов генетически связана с путями реакции на стресс и зависит от врожденной иммунной системы. [27]
Влияние на развитие
[ редактировать ]может быть выгодно В естественных условиях C. elegans развиваться как можно быстрее, чтобы иметь возможность быстро размножаться. Бактерия Comamonas DA1877 ускоряет развитие C. elegans . [28] Ни TOR (мишень рапамицина), ни передача сигналов инсулина , по-видимому, не опосредуют этот эффект на ускоренное развитие. Таким образом, возможно, что секретируемые метаболиты Comamonas , которые могут ощущаться C. elegans , приводят к более быстрому развитию. Черви, которых кормили Comamonas DA1877, также показали меньшее количество потомства и меньшую продолжительность жизни. [28] [29] Еще одним микробом, ускоряющим рост C. elegans, являются L. сферический. Эти бактерии значительно увеличили скорость роста C. elegans по сравнению с их обычным рационом E. coli OP50. [30] C. elegans в основном выращивают и наблюдают в контролируемой лаборатории с контролируемой диетой, поэтому они могут демонстрировать разные скорости роста по сравнению с естественными микробами.
Патогенные микробы
[ редактировать ]В своей естественной среде C. elegans сталкивается с множеством различных потенциальных патогенов. C. elegans интенсивно использовался в качестве модельного организма для изучения взаимодействия хозяин-патоген и иммунной системы. [5] [31] Эти исследования показали, что C. elegans обладает хорошо функционирующей врожденной иммунной защитой . Первой линией защиты является чрезвычайно прочная кутикула, которая обеспечивает внешний барьер против проникновения патогенов. [32] Кроме того, несколько консервативных сигнальных путей способствуют защите, в том числе DAF-2 / DAF-16 путь инсулиноподобных рецепторов и несколько MAP-киназ. пути, которые активируют физиологические иммунные реакции. [33] Наконец, поведение избегания патогенов представляет собой еще одну линию иммунной защиты C. elegans . [34] Все эти защитные механизмы работают не независимо, а совместно, обеспечивая оптимальную защитную реакцию против патогенов. [31] В лабораторных условиях было установлено, что многие микроорганизмы являются патогенными для C. elegans . Для идентификации потенциальных патогенов C. elegans червей на личиночной стадии L4 переносят в среду, содержащую интересующий организм, которым в большинстве случаев является бактерия. О патогенности организма можно судить, измеряя продолжительность жизни червей. Существует несколько известных патогенов человека, которые отрицательно влияют на выживаемость C. elegans . Патогенные бактерии также могут образовывать биопленки, липкая экзополимерная матрица которых может препятствовать C. elegans. подвижности [35] и скрывает хемоаттрактанты, чувствительные к бактериальному кворуму, от обнаружения хищниками. [36] Биопленки могут секретировать сидерофоры железа, которые могут быть обнаружены C.elegans. [37] . Однако C. elegans . в настоящее время известно лишь очень небольшое количество природных патогенов [5]
Эукариотические микробы
[ редактировать ]Одним из наиболее изученных природных патогенов C. elegans является микроспоридий Nematocida parisii , который был выделен непосредственно из пойманного в дикой природе C. elegans . N. parisii — внутриклеточный паразит, передающийся исключительно горизонтально от одного животного к другому. Споры микроспоридий, вероятно, выходят из клеток, разрушая консервативную структуру цитоскелета в кишечнике, называемую терминальной паутиной. Похоже, что ни один из известных иммунных путей C. elegans не участвует в обеспечении устойчивости к N. parisii . Микроспоридии были обнаружены у нескольких нематод, изолированных из разных мест, что указывает на то, что микроспоридии являются обычными природными паразитами C. elegans . Система N. parisii - C. elegans представляет собой очень полезный инструмент для изучения механизмов заражения внутриклеточными паразитами. [5] был обнаружен новый вид микроспоридий Кроме того, недавно у пойманного в дикой природе C. elegans , секвенирование генома которого отнесло к тому же роду Nematocida, что и предыдущие микроспоридии, обнаруженные у этих нематод. Этот новый вид был назван Nematocida displodere в честь фенотипа, наблюдаемого у поздно инфицированных червей, которые взрываются в вульве, высвобождая инфекционные споры. Было показано, что N. displodere инфицирует широкий спектр тканей и типов клеток C. elegans , включая эпидермис, мышцы, нейроны, кишечник, клетки шва и целомоциты. Как ни странно, большинство кишечных инфекций не переходят на более поздние паразитарные стадии, в то время как мышечная и эпидермальная инфекция процветают. [38] Это резко контрастирует с N. parisii , который заражает и завершает весь свой жизненный цикл в кишечнике C. elegans . Эти родственные виды Nematocida используются для изучения механизмов хозяина и патогена, ответственных за разрешение или блокирование роста эукариотических паразитов в различных тканевых нишах. Другим эукариотическим патогеном является гриб Drechmeria coniospora , который не был напрямую выделен из природы вместе с C. elegans , но до сих пор считается естественным патогеном C. elegans . D. coniospora прикрепляется к кутикуле червя в области вульвы, рта и ануса, а ее гифы проникают в кутикулу. Таким образом, D. coniospora заражает червя снаружи, тогда как большинство бактериальных возбудителей заражают червя из просвета кишечника. [39] [40]
Вирусные возбудители
[ редактировать ]первый естественно ассоциированный вирус был выделен В 2011 году из C. elegans, обнаруженного за пределами лаборатории, . Вирус Орсе представляет собой РНК-вирус, тесно родственный нодавирусам . Вирус нестабильно интегрирован в геном хозяина. В лабораторных условиях он передается горизонтально. Путь противовирусной РНКи необходим для устойчивости C. elegans к инфекции вируса Орсе. [41] На сегодняшний день не существует вируса, других внутриклеточных патогенов или многоклеточных паразитов, которые могли бы повлиять на нематод. По этой причине мы не можем использовать C. elegans в качестве экспериментальной системы для этих взаимодействий. В 2005 году два отчета показали, что вирус везикулярного стоматита (ВВС), арбовирус, хозяином которого является множество беспозвоночных и позвоночных, может реплицироваться в первичных клетках, полученных из эмбрионов C. elegans. [42]
Бактериальные возбудители
[ редактировать ]
Два бактериальных штамма рода Leucobacter были выделены из природы совместно с двумя Caenorhabditis видами C. briggsae и C. n. spp 11 и названы Verde 1 и Verde 2. Эти два штамма Leucobacter показали противоположные патогенные эффекты в отношении C. elegans . У червей, зараженных Verde 2, деформировалась анальная область (фенотип «Дар»), тогда как заражение Verde 1 приводило к замедлению роста из-за покрытия кутикулы бактериальным штаммом. В жидкой культуре зараженные Верде-1 черви слипались хвостами и образовывали так называемые «червячные звезды». Попавшие в ловушку черви не могут освободиться и в конечном итоге умирают. После смерти C. elegans используется в качестве источника пищи для бактерий. Только личинки на стадии L4, по-видимому, способны спастись путем аутотомии . Они разделяют свое тело пополам, чтобы передняя половина могла выбраться. «Получерви» сохраняют жизнеспособность в течение нескольких дней. [43] Грамположительная бактерия Bacillus thuringiensis , вероятно, в природе связана с C. elegans . B. thuringiensis — почвенная бактерия, которую часто используют в экспериментах по заражению C. elegans . [44] [45] Он производит спорообразующие токсины, называемые кристаллическими (Cry) токсинами, которые связаны со спорами. Они совместно поглощаются C. elegans перорально. Внутри хозяина токсины связываются с поверхностью клеток кишечника, где индуцируется образование пор в клетках кишечника, вызывая их разрушение. Результирующее изменение среды в кишечнике приводит к прорастанию спор, которые впоследствии размножаются в теле червя. [46] [47] [48] Особенностью системы C. elegans – B. thuringiensis является высокая вариабельность патогенности между различными штаммами. [45] [48] Существуют высокопатогенные штаммы, а также штаммы менее или даже непатогенные. [45] [48]
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Сэмюэл, Бак С.; Роуэддер, Холли; Брэндл, Кристиан; Феликс, Мари-Анн; Рувкун, Гэри (5 июля 2016 г.). «Реакция Caenorhabditis elegans на бактерии из естественной среды обитания» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 113 (27): E3941–3949. Бибкод : 2016PNAS..113E3941S . дои : 10.1073/pnas.1607183113 . ISSN 1091-6490 . ПМЦ 4941482 . ПМИД 27317746 .
- ^ Перейти обратно: а б с Чжан, Цзинъянь; Холдорф, Эми Д; Уолхаут, Альберта Дж. М. (август 2017 г.). «C. elegans и его бактериальная диета как модель для понимания взаимодействия хозяина и микробиоты на системном уровне» . Современное мнение в области биотехнологии . 46 : 74–80. дои : 10.1016/j.copbio.2017.01.008 . ПМЦ 5544573 . ПМИД 28189107 .
- ^ Перейти обратно: а б Хабер, М; Шюнгель, М; Путц, А; Мюллер, С; Хасерт, Б; Шуленбург, Х (2004). «Эволюционная история Caenorhabditis elegans, выведенная на основе микросателлитов: доказательства пространственной и временной генетической дифференциации и возникновения аутбридинга» . Мол Биол Эвол . 22 (1): 160–173. дои : 10.1093/molbev/msh264 . ПМИД 15371529 .
- ^ Норхаве, Нью-Джерси; Сперджен, Д; Свендсен, К; Седергрин, Н. (2012). «Как температура роста влияет на токсичность кадмия, измеренную на различных характеристиках жизненного цикла почвенной нематоды Caenorhabditis elegans?». Environ Toxicol Chem . 31 (4): 787–793. дои : 10.1002/etc.1746 . ПМИД 22253140 . S2CID 21375636 .
- ^ Перейти обратно: а б с д Тромель, ER; Феликс, Массачусетс; Уайтмен, Северная Каролина; Барьер, А; Осубель, FM (2008). «Микроспоридии являются естественными внутриклеточными паразитами нематоды Caenorhabditis elegans» . ПЛОС Биол . 6 (12): 2736–2752. дои : 10.1371/journal.pbio.0060309 . ПМК 2596862 . ПМИД 19071962 .
- ^ Барьер А., Феликс М.А. (2007). «Временная динамика и неравновесие по сцеплению в природных популяциях Caenorhabditis elegans» . Генетика . 176 (2): 999–1011. doi : 10.1534/genetics.106.067223 . ПМЦ 1894625 . ПМИД 17409084 .
- ^ Кионтке К.С., Феликс М.А., Эйлион М., Рокман М.В., Брэндл С., Пениго Ж.Б., Фитч Д.Х. (2011). «Филогения и молекулярные штрих-коды Caenorhabditis с многочисленными новыми видами из гниющих фруктов» . БМК Эвол Биол . 11 : 339. дои : 10.1186/1471-2148-11-339 . ПМЦ 3277298 . ПМИД 22103856 .
- ^ Блакстер М., Денвер, Др. (2012). «Червь в мире и мир в червяке» . БМК Биол . 10:57 . дои : 10.1186/1741-7007-10-57 . ПМЦ 3382423 . ПМИД 22731915 .
- ^ Перейти обратно: а б Феликс М.А., Дюво Ф (2012). «Популяционная динамика и совместное использование среды обитания природных популяций Caenorhabditis elegans и C. briggsae» . БМК Биол . 10:59 . дои : 10.1186/1741-7007-10-59 . ПМЦ 3414772 . ПМИД 22731941 .
- ^ МакГрат П.Т., Сюй Ю., Эйлион М., Гаррисон Дж.Л., Батчер Р.А., Баргманн С.И. (2011). «Параллельная эволюция одомашненных видов Caenorhabditis нацелена на гены рецепторов феромонов» . Природа . 477 (7364): 321–325. Бибкод : 2011Natur.477..321M . дои : 10.1038/nature10378 . ПМК 3257054 . ПМИД 21849976 .
- ^ Вебер К.П., Де С., Козарева И., Тернер Д.Д., Бабу М.М., де Боно М. (2010). «Полногеномное секвенирование подчеркивает генетические изменения, связанные с лабораторным одомашниванием C. elegans» . ПЛОС ОДИН . 5 (11): e13922. Бибкод : 2010PLoSO...513922W . дои : 10.1371/journal.pone.0013922 . ПМЦ 2978686 . ПМИД 21085631 .
- ^ Барьер, А.; Феликс, М.-А. (2005). «Естественная изменчивость и популяционная генетика Caenorhabditis elegans (26 декабря 2005 г.), WormBook, изд. Исследовательского сообщества C. elegans» . Червячная книга : 1–19. дои : 10.1895/wormbook.1.43.1 . ПМЦ 4781346 . ПМИД 18050391 .
- ^ Феликс, Массачусетс; Барьер, А. (2010). «Естественная история Caenorhabditis elegans» . Современная биология . 20 (22): R965–9. дои : 10.1016/j.cub.2010.09.050 . ПМИД 21093785 . S2CID 12869939 .
- ^ Фурманн, Джеффри Дж.; Зуберер, Дэвид А. (1998). Принципы и применение почвенной микробиологии . Прентис Холл. ISBN 978-0-13-459991-5 . [ нужна страница ]
- ^ Гариган Д., Сюй А.Л., Фрейзер А.Г., Камат Р.С., Арингер Дж., Кеньон С. (2002). «Генетический анализ старения тканей Caenorhabditis elegans: роль фактора теплового шока и пролиферации бактерий» . Генетика . 161 (3): 1101–1112. дои : 10.1093/генетика/161.3.1101 . ПМЦ 1462187 . ПМИД 12136014 .
- ^ МакГи, доктор медицинских наук, Вебер Д., Дэй Н, Вителли С., Криппен Д., Херндон Л.А., Холл Д.Х., Мелов С. (2011). «Потеря кишечных ядер и целостности кишечника у стареющего C. elegans» . Стареющая клетка . 10 (4): 699–710. дои : 10.1111/j.1474-9726.2011.00713.x . ПМК 3135675 . ПМИД 21501374 .
- ^ Бреннер, С. (1974). «Генетика Caenorhabditis elegans» . Генетика . 77 (1): 71–94. дои : 10.1093/генетика/77.1.71 . ПМЦ 1213120 . ПМИД 4366476 .
- ^ Фрезаль, Лиза; Феликс, Мари-Анн (30 марта 2015 г.). «C. elegans вне чашки Петри» . электронная жизнь . 4 : e05849. doi : 10.7554/eLife.05849 . ПМЦ 4373675 . ПМИД 25822066 .
- ^ Перейти обратно: а б Стирнагл, Т. (11 февраля 2006 г.). Исследовательское сообщество C. elegans (ред.). «Уход за C. elegans» . Червячная книга : 1–11. дои : 10.1895/wormbook.1.101.1 . ПМЦ 4781397 . ПМИД 18050451 .
- ^ Кларк, Л.К., Ходжкин, Дж. (2014). «Комменсалы, пробиотики и патогены в модели C aenorhabditis elegans» . Клеточная микробиол . 16 (1): 27–38. дои : 10.1111/cmi.12234 . ПМИД 24168639 . S2CID 3520862 .
{{cite journal}}
: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Перейти обратно: а б с д Кулон, Дж.Д., Джонс, К.Л., Тодд, Т.К., Карр, Британская Колумбия, и Герман, Массачусетс (2009). «Геномная реакция Caenorhabditis elegans на почвенные бактерии прогнозирует специфичное для окружающей среды генетическое воздействие на особенности жизненного цикла» . ПЛОС Генетика . 5 (6): e1000503. дои : 10.1371/journal.pgen.1000503 . ПМЦ 2684633 . ПМИД 19503598 .
{{cite journal}}
: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Перейти обратно: а б с Монтальво-Кац, Сирена; Хуан, Хао; Аппель, Майкл Дэвид; Берг, Морин; Шапира, Майкл (2012). «Ассоциация с почвенными бактериями повышает устойчивость Caenorhabditis elegans к p38-зависимой инфекции» . Инфекция и иммунитет . 81 (2): 514–520. дои : 10.1128/IAI.00653-12 . ПМЦ 3553824 . ПМИД 23230286 .
- ^ Секирова Инна; Рассел, Шеннон Л.; Антунес, Л. Каэтано М.; Финли, Б. Бретт (июль 2010 г.). «Кишечная микробиота в здоровье и болезнях». Физиологические обзоры . 90 (3): 859–904. doi : 10.1152/physrev.00045.2009 . ПМИД 20664075 . S2CID 9281721 .
- ^ Стечер Б., Хардт В.Д. (2011). «Механизмы, контролирующие колонизацию кишечника патогенами». Курс. Мнение. Микробиол . 14 (1): 82–91. дои : 10.1016/j.mib.2010.10.003 . ПМИД 21036098 .
- ^ Тан М.В., Махаджан-Миклош С., Аусубель FM (1999). «Уничтожение Caenorhabditis elegans Pseudomonas aeruginosa, используемое для моделирования бактериального патогенеза млекопитающих» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 96 (2): 715–720. Бибкод : 1999ПНАС...96..715Т . дои : 10.1073/pnas.96.2.715 . ПМЦ 15202 . ПМИД 9892699 .
- ^ Эйвери Л., Штонда Б.Б. (2003). «Перенос пищи в глотке C. elegans» . Дж. Эксп. Биол . 206 (14): 2441–2457. дои : 10.1242/jeb.00433 . ПМЦ 3951750 . ПМИД 12796460 .
- ^ Пайк, Виктория Л.; Форд, Сюзанна А.; Кинг, Кайла С.; Рафалюк-Мор, Шарлотта (октябрь 2019 г.). «Компенсация плодовитости зависит от генерализованной реакции на стресс у нематоды-хозяина» . Экология и эволюция . 9 (20): 11957–11961. дои : 10.1002/ece3.5704 . ПМК 6822023 . ПМИД 31695900 .
- ^ Перейти обратно: а б МакНил, Л.Т., Уотсон, Э., Арда, Х.Э., Чжу, Л.Дж., и Уолхаут, AJM (2013). «Ускорение развития, вызванное диетой, независимое от TOR и инсулина у C. elegans» . Клетка . 153 (1): 240–252. дои : 10.1016/j.cell.2013.02.049 . ПМК 3821073 . ПМИД 23540701 .
{{cite journal}}
: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Алтун, З.Ф.; Холл, Д.Х. «Введение. В WormAtlas».
{{cite journal}}
: Для цитирования журнала требуется|journal=
( помощь ) - ^ Вперёд, Джунхёк (2014). «Увеличенная продолжительность жизни и устойчивое развитие Caenorhabditis elegans на ранней стадии под действием почвенного микроба Lysinibacillus sphaericus». Отчеты по экологической микробиологии . 6 (6): 730–737. дои : 10.1111/1758-2229.12196 . ПМИД 25756126 .
- ^ Перейти обратно: а б Шуленбург, Х., Курц, К.Л., Юбэнк, Дж.Дж. (2004). «Эволюция врожденной иммунной системы: взгляд на червя». Иммунологические обзоры . 198 : 36–58. дои : 10.1111/j.0105-2896.2004.0125.x . ПМИД 15199953 . S2CID 21541043 .
{{cite journal}}
: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Ходжкин Дж., Партридж Ф.А. (2008). «Caenorhabditis elegans встречает Microsporidia: убийцы нематод из Парижа. PLoS Biol» . ПЛОС Биология . 6 (12): 2634–7. дои : 10.1371/journal.pbio.1000005 . ПМК 2605933 . ПМИД 19108611 .
- ^ Юбэнк, Джонатан (2006). «Сигнализация в иммунном ответе» . Червячная книга : 1–12. дои : 10.1895/wormbook.1.83.1 . ПМЦ 4781569 . ПМИД 18050470 .
- ^ Шуленбург, Х., Юбэнк, Дж. Дж. (2007). «Генетика предотвращения патогенов у Caenorhabditis elegans» . Молекулярная микробиология . 66 (3): 563–570. дои : 10.1111/j.1365-2958.2007.05946.x . ПМИД 17877707 . S2CID 20783253 .
{{cite journal}}
: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Чан, пастырь Юэнь; Лю, Сильвия Ян; Сенг, Цзыцзин; Чуа, Сун Линь (январь 2021 г.). «Матрица биопленки нарушает подвижность и хищническое поведение нематод» . Журнал ISME . 15 (1): 260–269. дои : 10.1038/s41396-020-00779-9 . ISSN 1751-7370 . ПМЦ 7852553 . ПМИД 32958848 .
- ^ Ли, Шаоян; Лю, Сильвия Ян; Чан, пастырь Юэнь; Чуа, Сун Линь (май 2022 г.). «Матрица биопленки скрывает бактериальный кворум, чувствительный к хемоаттрактантам, от обнаружения хищниками» . Журнал ISME . 16 (5): 1388–1396. дои : 10.1038/s41396-022-01190-2 . ISSN 1751-7370 . ПМЦ 9038794 . ПМИД 35034106 .
- ^ Ху, Минци; Ма, Йепин; Чуа, Сун Линь (16 января 2024 г.). «Бактериоядные нематоды расшифровывают микробные железные сидерофоры как сигнал добычи во взаимодействиях хищник-жертва» . Труды Национальной академии наук . 121 (3). дои : 10.1073/pnas.2314077121 . ISSN 0027-8424 . ПМК 10801909 .
- ^ Луаллен, Роберт; Рейнке, Аарон; Тонг, Линда; Боттс, Майкл; Феликс, Мари-Анн; Тромель, Эмили (2016). «Обнаружение природного микроспоридийного патогена с широким тканевым тропизмом у Caenorhabditis elegans» . ПЛОС Патогены . 12 (6): e1005724. биоRxiv 10.1101/047720 . дои : 10.1371/journal.ppat.1005724 . ПМЦ 4928854 . ПМИД 27362540 .
- ^ Бэррон, Джордж Л. (1977). Грибы, уничтожающие нематод . Канадские биологические публикации. OCLC 742327534 .
- ^ Янссон, Ханс-Бёрье (декабрь 1994 г.). «Адгезия конидий Drechmeria coniospora к Caenorhabditis elegans WildType и Mutants» . Журнал нематологии . 26 (4): 430–435. ПМК 2619527 . ПМИД 19279912 .
- ^ Феликс М.А., Эш А., Пиффаретти Дж., Ву Дж., Нуэс И. (2011). «Природное и экспериментальное заражение нематод Caenorhabditis новыми вирусами, родственными нодавирусам» . ПЛОС Биол . 9 (1): e1000586. дои : 10.1371/journal.pbio.1000586 . ПМК 3026760 . ПМИД 21283608 .
- ^ Гаммон, Дон Б. (01 декабря 2017 г.). «Caenorhabditis elegans как новая модель взаимодействия вируса с хозяином» . Журнал вирусологии . 91 (23). дои : 10.1128/JVI.00509-17 . ISSN 0022-538X . ПМЦ 5686719 . ПМИД 28931683 .
- ^ Ходжкин Дж., Феликс М.А., Кларк Л.К., Страуд Д., Гравато-Нобре М.Дж. (2013). «Два штамма лейкобактерий обладают дополнительной вирулентностью в отношении канорхабдита, включая смерть от образования звездчатых червей» . Курс. Биол . 23 (21): 2157–2161. дои : 10.1016/j.cub.2013.08.060 . ПМЦ 3898767 . ПМИД 24206844 .
{{cite journal}}
: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Хёфте, Х., Уайтли, HR (1989). «Инсектицидные кристаллические белки Bacillus thuringiensis» . Микробиол. Преподобный . 53 (2): 242–255. дои : 10.1128/MMBR.53.2.242-255.1989 . ПМК 372730 . ПМИД 2666844 .
{{cite journal}}
: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Перейти обратно: а б с Шуленбург Х., Мюллер С. (2004). «Естественные вариации реакции Caenorhabditis elegans на Bacillus thuringiensis». Паразитология . 128 (4): 433–443. дои : 10.1017/s003118200300461x . ПМИД 15151149 . S2CID 41628475 .
{{cite journal}}
: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Вэй Цзи Цзи; Хейл К.; Карта Л.; Платцер Э.; Вонг К.; Фанг СЦ.; Ароян Р.В. (2003). «Кристаллические белки Bacillus thuringiensis, нацеленные на нематод» . ПНАС . 100 (5): 2760–2765. Бибкод : 2003PNAS..100.2760W . дои : 10.1073/pnas.0538072100 . ПМК 151414 . ПМИД 12598644 .
- ^ Боргони Г.; Ван Дриссе Р.; Лейнс Ф.; Гораций Г.; Де Ваэле Д.; Куманс А (1995). «Прорастание спор Bacillus thuringiensis в бактериофагах-нематодах (Nematoda: Rhabditida)». Журнал патологии беспозвоночных . 65 (1): 61–67. дои : 10.1006/jipa.1995.1008 . ПМИД 7876593 .
- ^ Перейти обратно: а б с Саламиту С.; Рамисс Ф.; Бреелин М.; Бурже Д.; Жилуа Н.; Гоминет М.; Эрнандес Э.; Лереклус Д. (2000). «Регулон plcR участвует в оппортунистических свойствах Bacillus thuringiensis и Bacillus cereus у мышей и насекомых» . Микробиология . 146 (11): 2825–2832. дои : 10.1099/00221287-146-11-2825 . ПМИД 11065361 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Кабрейро, Филипе; Джемс, Дэвид (сентябрь 2013 г.). «Червям тоже нужны микробы: микробиота, здоровье и старение Caenorhabditis elegans» . ЭМБО Молекулярная медицина . 5 (9): 13.00–13.10. дои : 10.1002/emmm.201100972 . ПМЦ 3799487 . ПМИД 23913848 .
- Петерсен, Карола; Дирксен, Филипп; Шуленбург, Хинрих (1 марта 2015 г.). «Почему нам нужно больше экологии для генетических моделей, таких как C. elegans». Тенденции в генетике . 31 (3): 120–127. дои : 10.1016/j.tig.2014.12.001 . ПМИД 25577479 .