Микробиомы искусственной среды
Микробиомы искусственной среды [1] [2] Это область исследования сообществ микроорганизмов , которые живут в созданных человеком средах, таких как дома, автомобили и водопроводные трубы. Ее также иногда называют микробиологией искусственной среды.
- В последние годы эта область несколько ускорилась благодаря значительному финансированию со стороны Фонда Альфреда П. Слоана. [3] и с увеличением внимания, уделяемого микробиомам и сообществам микробов в целом.
- Национальные академии наук, техники и медицины США проводят исследование в этой области под названием «Микробиомы искусственной среды: от исследования к применению». [4]
- Американская ассоциация содействия развитию науки провела симпозиум по этой теме в 2014 году. [5]
- Американская академия микробиологии провела коллоквиум по этой теме в сентябре 2015 года и опубликовала отчет «Микробиология искусственной среды». [6]
Статья Брента Стивенса 2016 года. [7] освещаются некоторые ключевые результаты исследований «микробиомов внутренней среды». Эти ключевые выводы включают в себя те, которые перечислены ниже:
- «Культурально-независимые методы обнаруживают гораздо большее микробное разнообразие по сравнению с методами, основанными на культуре»
- «Внутренние помещения часто содержат уникальные микробные сообщества»
- «Внутренние бактериальные сообщества часто происходят из внутренних источников».
- «Люди также являются основным источником бактерий в воздухе помещений»
- «Проектирование и эксплуатация зданий могут влиять на микробные сообщества внутри помещений».
Микробиомы искусственной среды изучаются по множеству причин, в том числе по тому, как они могут повлиять на здоровье людей и других организмов, населяющих искусственную среду, а также по некоторым причинам, не связанным со здоровьем, таким как диагностика свойств зданий, судебно-медицинская экспертиза, влияние на производство продуктов питания, влияние на функцию построенной среды и многое другое.
Изучаемые среды
[ редактировать ]Были проведены обширные исследования отдельных микробов, обнаруженных в искусственной среде. В последнее время значительно увеличилось количество исследований, изучающих сообщества микробов, обитающих в искусственной среде. Такие исследования охватили широкий спектр сред.
- Здания . Примеры включают дома, [8] [9] [10] общежития, [11] офисы, [12] [13] больницы, [14] [15] [16] операционные, [17] [18] [19] отделения интенсивной терапии [20] классы, [21] [22] транспортные средства, такие как железнодорожные станции и станции метро, [23] [24] пищевые производства [25] (например, молочные заводы, винодельни, [26] оборудование для производства сыра, [27] [28] пивоварни сакэ [29] и пивоварни, [30] аквариумы, [31] библиотеки, [32] чистые помещения, [33] [34] зоопарки, приюты для животных, фермы, курятники и жилье. [35]
- Транспортные средства . Примеры включают самолеты, [36] корабли, поезда, [24] автомобили [37] и космические аппараты, включая Международную космическую станцию , [38] [39] МНЕ, [40] Марсианская Одиссея , [41] » Космический корабль «Гершель . [42]
- Водные системы . Примеры включают душевые насадки, [43] детские бассейны, [44] муниципальные системы водоснабжения, [45] рециркуляционные системы аквакультуры, [46] питьевая вода и сантехнические системы помещений [47] [48] [49] [50] и сауны. [51]
- Другой . Примеры включают предметы искусства и культурного наследия, [52] одежда, [53] кухонные губки, [54] и бытовая техника, такая как посудомоечные машины [55] и стиральные машины. [56]
Выводы
[ редактировать ]Общая биогеография
[ редактировать ]В целом, многочисленные исследования микробиомов искусственной среды начали выявлять некоторые общие закономерности, касающиеся микробов, обнаруженных в различных местах. Различные районы и типы зданий связаны с разными видами микробиоты. [57] Пакпур и др. в 2016 году проанализировали закономерности присутствия архей в помещениях (на основе анализа данных последовательности генов рРНК). [58]
Здоровье человека
[ редактировать ]Многие исследования документально подтвердили возможные последствия микробиомов искусственной среды для здоровья человека. [59]
- Колонизация новорожденных . Микробы, колонизирующие новорожденных, частично происходят из искусственной среды (например, больничных палат). Это особенно актуально для детей, рожденных с помощью кесарева сечения (см., например, Shin et al. 2016). [60] ), а также младенцы, которые проводят время в отделении интенсивной терапии. [20]
- Риск аллергии и астмы . Риск аллергии и астмы коррелирует с различиями в микробиоме искусственной среды. Некоторые экспериментальные тесты (например, на мышах) показали, что эти корреляции на самом деле могут быть причинно-следственными (т. е. различия в микробиомах могут фактически приводить к различиям в риске аллергии или астмы). Обзорные статьи по этой теме включают Casas et al. 2016 год [61] и Фуджимура и Линч, 2015 г. [62] Микробиом домашней пыли коррелирует с детским риском аллергии, астмы и фенотипами, связанными с этими заболеваниями. [63] [64] [65] Влияние микробиома искусственной среды на риск аллергии, астмы и других воспалительных или иммунных состояний является возможным механизмом, лежащим в основе так называемой гипотезы гигиены .
- Психическое здоровье . В обзоре 2015 года Hoisington et al. обсудить возможные связи между микробиологией искусственной среды и здоровьем человека. [66] Концепция, представленная в этой статье, заключается в том, что накапливается все больше и больше доказательств того, что микробиом человека оказывает определенное влияние на мозг, и, следовательно, если антропогенная среда прямо или косвенно влияет на микробиом человека, это, в свою очередь, может оказать влияние на психическое здоровье человека. [ нужна ссылка ]
- Передача возбудителя . Многие патогены передаются в искусственной среде, а также могут находиться в ней в течение некоторого периода времени. [67] Хорошие примеры включают грипп, норовирус , легионеллу и MRSA . Изучение передачи и выживания этих патогенов является составной частью исследований микробиомов искусственной среды.
- Качество воздуха в помещении . Изучение качества воздуха в помещениях и влияния такого качества воздуха на здоровье, по крайней мере частично, связано с микробами в искусственной среде, поскольку они могут прямо или косвенно влиять на качество воздуха в помещениях. [ нужна ссылка ]
Компоненты искусственной среды, которые могут влиять на микробиомы
[ редактировать ]Основной компонент исследований микробиомов искусственной среды включает определение того, как компоненты искусственной среды влияют на эти микробы и микробные сообщества. Факторы, которые считаются важными, включают влажность, pH, химическое воздействие, температуру, фильтрацию, материалы поверхности и поток воздуха. [68] Предпринимались попытки разработать стандарты того, какие «метаданные» искусственной среды следует собирать в связи с исследованиями микробных сообществ в искусственной среде. [69] В документе 2014 года рассматриваются инструменты, доступные для улучшения данных об искусственной среде, собираемых в ходе таких исследований. [70] Данные, включенные в этот обзор, включают характеристики зданий и условия окружающей среды, характеристики системы HVAC и скорость вентиляции, измерения занятости и активности людей, характеристики поверхностей, а также отбор проб воздуха и динамику аэрозолей.
Влияние микробиомов на искусственную среду
[ редактировать ]Подобно тому, как искусственная среда оказывает влияние на обнаруженные в ней микробиомы, микробные сообщества искусственной среды могут влиять на саму искусственную среду. Примеры включают деградацию строительных материалов, изменение потока жидкости и воздуха, образование летучих веществ и многое другое. [ нужна ссылка ]
Возможное использование в криминалистике
[ редактировать ]Микробиом искусственной среды имеет некоторый потенциал для использования в качестве признака для судебно-медицинских исследований. Большинство этих приложений все еще находятся на ранней стадии исследований. Например, было показано, что люди оставляют после себя своего рода диагностическую микробную сигнатуру, когда печатают на клавиатуре компьютера. [71] пользоваться телефонами [72] или занять комнату. [11]
Запах
[ редактировать ]Было проведено значительное количество исследований роли, которую микробы играют в различных запахах в искусственной среде. Например, Дикманн и др. исследовали связь между летучими органическими выбросами в автомобильных кондиционерах. [73] Они сообщили, что типы обнаруженных микробов коррелируют с обнаруженными неприятными запахами. Парк и Ким исследовали, какие микробы, обнаруженные в автомобильном кондиционере, могут производить летучие соединения с неприятным запахом, и определили таксоны-кандидаты, производящие некоторые такие соединения. [74]
Методы
[ редактировать ]Для изучения микробов в искусственной среде используется множество методов. Обзор таких методов и некоторых проблем их использования был опубликован NIST. Хойсингтон и др. в 2014 году были рассмотрены методы, которые могут быть использованы специалистами в области строительства для изучения микробиологии искусственной среды. [75] Методы, используемые при изучении микробов в искусственной среде, включают культивирование (с последующими исследованиями культивируемых микробов), микроскопию , отбор проб воздуха, воды и поверхности, химический анализ и независимые от культуры исследования ДНК, такие как ПЦР гена рибосомальной РНК и метагеномика . [ нужна ссылка ]
См. также
[ редактировать ]Внешние ссылки
[ редактировать ]Примеры проектов
[ редактировать ]Растет число исследовательских проектов и групп, прямо или косвенно фокусирующихся на микробиомах искусственной среды.
- BIMERC — Консорциум Беркли по исследованию микробной экологии в помещении . Эта группа занимается «пониманием микробных компонентов воздуха в помещениях, включая выявление популяций источников и освещение процессов, которые суспендируют и распространяют микробы и микробные продукты в зданиях».
- Центр BioBE - Центр биологии и искусственной среды
- «Дикая природа ваших домов» — это гражданский научный проект, посвященный « разнообразию бактериальных сообществ, обнаруженных в девяти различных местах наших домов».
- Проект микробиома искусственной среды, связанной с ребенком
- Проект микробиома душевой лейки
- Проект больничного микробиома
- Домашний микробиом
- PROBE – Исследование патогенов в искусственной среде
- PreMiEr - Инженерно-исследовательский центр микробиомной изучающий , инженерии микробиомы и прецизионной улучшающий искусственной среды.
Связанные журналы
[ редактировать ]Общества и организации
[ редактировать ]- Международное общество качества воздуха и климата в помещениях (ISIAQ)
- Программа Фонда Альфреда П. Слоана по микробиологии искусственной среды
Новости и сопутствующее освещение
[ редактировать ]- Nova Next: картирование микробиома
- NPR: Ваши невидимые соседи: в каждом городе есть уникальные микробы
- Ученые: в вашем офисе особый микробиом
- Статья Эрики Хартманн «Разговор» Ученые за работой: изучение микробной экологии в помещении означает отбор проб в общественных туалетах
- Журнал TIME Ваш дом покрыт микробами
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Конья, Теодор; Скотт, Джеймс А. (2014). «Последние достижения в микробиологии искусственной среды» . Текущие отчеты об устойчивой/возобновляемой энергетике . 1 (2): 35–42. дои : 10.1007/s40518-014-0007-4 . ISSN 2196-3010 .
- ^ Корси, Ричард Л.; Кинни, Керри А.; Левин, Хэл (2012). «Микробиомы искусственной среды: основные моменты симпозиума 2011 года и рекомендации рабочих групп» . Внутренний воздух . 22 (3): 171–172. дои : 10.1111/j.1600-0668.2012.00782.x . ISSN 0905-6947 . ПМК 3412220 . ПМИД 22489819 .
- ^ «Микробиология искусственной среды» . Слоан Фдн . Архивировано из оригинала 19 июля 2016 г. Проверено 25 июля 2016 г.
- ^ Комитет по микробиомам искусственной среды: от исследований к применению; Совет по наукам о жизни; Совет по экологическим исследованиям и токсикологии; Отдел исследований Земли и жизни; Отдел здравоохранения и медицины; Совет по инфраструктуре и искусственной среде; Отдел инженерных и физических наук; Национальная инженерная академия; Национальные академии наук, техники и медицины (2017 г.). Микробиомы искусственной среды: программа исследований в области микробиологии помещений, здоровья человека и зданий . Вашингтон, округ Колумбия: Издательство национальных академий. дои : 10.17226/23647 . ISBN 978-0-309-44980-9 .
{{cite book}}
: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ «Микробиомы искусственной среды» .
- ^ Ричмод, Дилан. «Часто задаваемые вопросы: микробиология искусственной среды» . academy.asm.org . Проверено 27 июля 2016 г.
- ^ Стивенс, Брент; Гиббонс, Шон Майкл (2016). «Что мы узнали о микробиомах внутренней среды?: ТАБЛИЦА 1» . mSystems . 1 (4): e00083–16. дои : 10.1128/mSystems.00083-16 . ISSN 2379-5077 . ПМК 5069963 . ПМИД 27822547 .
- ^ Лакс, Саймон; и др. (2014). «Продольный анализ микробного взаимодействия человека и окружающей среды» . Наука . 345 (6200): 1048–1052. Бибкод : 2014Sci...345.1048L . дои : 10.1126/science.1254529 . ПМЦ 4337996 . ПМИД 25170151 .
- ^ Барберан, Альберт; Данн, Роберт Р.; Райх, Брайан Дж.; Пасифичи, Кришна; Лабер, Эрик Б.; Меннингер, Холли Л.; Мортон, Джеймс М.; Хенли, Джессика Б.; Лефф, Джонатан В.; Миллер, Шелли Л.; Фирер, Ной (2015). «Экология микроскопической жизни в бытовой пыли» . Труды Королевского общества B: Биологические науки . 282 (1814): 20151139. doi : 10.1098/rspb.2015.1139 . ISSN 0962-8452 . ПМЦ 4571696 . ПМИД 26311665 .
- ^ Данн, Роберт Р.; Фирер, Ной; Хенли, Джессика Б.; Лефф, Джонатан В.; Меннингер, Холли Л. (2013). «Домашняя жизнь: факторы, структурирующие бактериальное разнообразие внутри домов и между ними» . ПЛОС ОДИН . 8 (5): e64133. Бибкод : 2013PLoSO...864133D . дои : 10.1371/journal.pone.0064133 . ISSN 1932-6203 . ПМЦ 3661444 . ПМИД 23717552 .
- ^ Jump up to: а б Луонго, Джулия С; Барберан, Альберт; Хакер-Кэри, Робин; Морган, Эмили Э.; Миллер, Шелли Л; Фирер, Ной (2016). «Микробный анализ переносимой по воздуху пыли, собранной из комнат общежития, позволяет предсказать пол жильцов» . Внутренний воздух . 27 (2): 338–344. дои : 10.1111/ina.12302 . ISSN 0905-6947 . ПМИД 27018492 . S2CID 3513352 .
- ^ Кембель, Стивен В.; Медоу, Джеймс Ф.; О'Коннор, Тимоти К.; Мхуирич, Гвинн; Норткатт, Дейл; Клайн, Джефф; Морияма, Максвелл; Браун, Джорджия; Боханнан, Брендан Дж. М.; Грин, Джессика Л. (2014). «Архитектурный дизайн определяет биогеографию внутренних бактериальных сообществ» . ПЛОС ОДИН . 9 (1): e87093. Бибкод : 2014PLoSO...987093K . дои : 10.1371/journal.pone.0087093 . ISSN 1932-6203 . ПМК 3906134 . ПМИД 24489843 .
- ^ Чейз, Джон; Фукье, Дженнифер; Заре, Махназ; Сондереггер, Дерек Л.; Найт, Роб; Келли, Скотт Т.; Сигел, Джеффри; Капорасо, Дж. Грегори; Гилберт, Джек А. (2016). «География и местоположение являются основными факторами состава офисного микробиома» . mSystems . 1 (2): e00022–16. дои : 10.1128/mSystems.00022-16 . ISSN 2379-5077 . ПМК 5069741 . ПМИД 27822521 .
- ^ Смит, Дэниел; Алверди, Джон; Ан, Гэри; Коулман, Морин; Гарсиа-Учинс, Сильвия; Грин, Джессика; Киган, Кевин; Келли, Скотт Т.; Киркуп, Бенджамин К.; Кочиолек, Ларри; Левин, Хэл; Лэндон, Эмили; Ольсевски, Паула; Найт, Роб; Сигел, Джеффри; Вебер, Стивен; Гилберт, Джек (2013). «Проект «Больничный микробиом»: отчет о совещании для 1-го семинара по проекту «Больничный микробиом» по планированию отбора проб и измерениям в области строительных наук, Чикаго, США, 7-8 июня 2012 г.» . Стандарты в геномных науках . 8 (1): 112–117. дои : 10.4056/sigs.3717348 . ISSN 1944-3277 . ПМЦ 3739179 . ПМИД 23961316 .
- ^ Шоган, Бенджамин Д.; Смит, Дэниел П.; Пакман, Аарон И.; Келли, Скотт Т.; Лэндон, Эмили М; Бхангар, Сима; Вора, Гэри Дж.; Джонс, Рэйчел М.; Киган, Кевин (30 июля 2013 г.). «Проект «Больничный микробиом»: отчет о встрече 2-го проекта «Больничный микробиом», Чикаго, США, 15 января 2013 г.» . Стандарты в геномных науках . 8 (3): 571–579. дои : 10.4056/sigs.4187859 . ISSN 1944-3277 . ПМЦ 3910697 . ПМИД 24501640 .
- ^ Вествуд, Джек; Бернетт, Мэтью; Спратт, Дэвид; Болл, Майкл; Уилсон, Дэниел Дж.; Уэллстид, Салли; Клири, Дэвид; Грин, Энди; Хатли, Эмма (1 января 2014 г.). «Проект больничного микробиома: отчет о встрече Британской научно-инновационной сети, семинара Великобритании и США «Борьба с супербактериями: исследования больничного микробиома для борьбы с устойчивостью к противомикробным препаратам», 14 октября 2013 г.» . Стандарты в геномных науках . 9:12 . дои : 10.1186/1944-3277-9-12 . ISSN 1944-3277 . ПМЦ 4334475 .
- ^ Сайто, Юхэй; Ясухара, Хироши; Муракоши, Сатоши; Комацу, Таками; Фукацу, Казухико; Уэтера, Юши (2015). «Влияние в зависимости от времени на оценку загрязненных поверхностей окружающей среды в операционных». Американский журнал инфекционного контроля . 43 (9): 951–955. дои : 10.1016/j.ajic.2015.04.196 . ISSN 0196-6553 . ПМИД 26050097 .
- ^ Александр, Дж. Уэсли; Ван Сверинген, Хизер; ВанОсс, Кэтрин; Хукер, Эдмонд А.; Эдвардс, Майкл Дж. (2013). «Наблюдение за бактериальной колонизацией в операционных». Хирургические инфекции . 14 (4): 345–351. дои : 10.1089/sur.2012.134 . ISSN 1096-2964 . ПМИД 23859684 .
- ^ Сузуки, Асакацу; Намба, Ёшимичи; Мацуура, Масаджи; Хорисава, Акико (2009). «Бактериальная обсемененность полов и других поверхностей операционных: пятилетнее исследование» . Журнал гигиены . 93 (3): 559–566. дои : 10.1017/S002217240006513X . ISSN 0022-1724 . ПМК 2129451 . ПМИД 6512255 .
- ^ Jump up to: а б Харц, Лейси Э.; Брэдшоу, Ванда; Брэндон, Дебра Х. (2015). «Потенциальное влияние окружающей среды отделения интенсивной терапии на микробиом новорожденного» . Достижения в области ухода за новорожденными . 15 (5): 324–335. doi : 10.1097/anc.0000000000000220 . ПМЦ 4583357 . ПМИД 26340035 .
- ^ Медоу, Джеймс Ф; Альтрихтер, Адам Э; Кембель, Стивен В.; Морияма, Максвелл; О'Коннор, Тимоти К.; Вомак, Энн М; Браун, Джорджия; Грин, Джессика Л; Боханнан, Брендан Дж. М. (2014). «Бактериальные сообщества на поверхностях классной комнаты меняются в зависимости от контакта с человеком» . Микробиом . 2 (1): 7. дои : 10.1186/2049-2618-2-7 . ISSN 2049-2618 . ПМЦ 3945812 . ПМИД 24602274 .
- ^ Цянь, Дж.; Господский, Д.; Ямамото, Н.; Назаров, WW; Печча, Дж. (2012). «Уровни выбросов переносимых по воздуху бактерий и грибов в зависимости от размера в занятом классе» . Внутренний воздух . 22 (4): 339–351. дои : 10.1111/j.1600-0668.2012.00769.x . ISSN 0905-6947 . ПМЦ 3437488 . ПМИД 22257156 .
- ^ Люнг, MHY; Уилкинс, Д.; Ли, ЕКТ; Конг, ФКФ; Ли, ПКХ (2014). «Микробиом внутреннего воздуха в сети городского метрополитена: разнообразие и динамика» . Прикладная и экологическая микробиология . 80 (21): 6760–6770. Бибкод : 2014ApEnM..80.6760L . дои : 10.1128/АЕМ.02244-14 . ISSN 0099-2240 . ПМК 4249038 . ПМИД 25172855 .
- ^ Jump up to: а б Сюй, Тиффани; Джойс, Регина; Валларино, Хосе; Абу-Али, Галеб; Хартманн, Эрика М.; Шафкат, Афра; ДюЛонг, Кейси; Барановский, Екатерина; Геверс, Дирк; Грин, Джессика Л.; Морган, Сочитль К.; Спенглер, Джон Д.; Хаттенхауэр, Кертис; Найт, Роб (2016). «Микробные сообщества городской транспортной системы различаются по типу поверхности и взаимодействию с людьми и окружающей средой» . mSystems . 1 (3): e00018–16. дои : 10.1128/mSystems.00018-16 . ISSN 2379-5077 . ПМК 5069760 . ПМИД 27822528 .
- ^ Бокулич, Николай А; Льюис, Закери Т; Бауди-Миллс, Кирия; Миллс, Дэвид А. (2016). «Новый взгляд на микробные ландшафты в производстве продуктов питания» . Современное мнение в области биотехнологии . 37 : 182–189. дои : 10.1016/j.copbio.2015.12.008 . ISSN 0958-1669 . ПМЦ 4913695 . ПМИД 26773388 .
- ^ Бокулич, Николай Александрович; Охта, Мо; Ричардсон, Пол М.; Миллс, Дэвид А. (2013). «Мониторинг сезонных изменений микробиоты виноделен» . ПЛОС ОДИН . 8 (6): e66437. Бибкод : 2013PLoSO...866437B . дои : 10.1371/journal.pone.0066437 . ISSN 1932-6203 . ПМЦ 3686677 . ПМИД 23840468 .
- ^ Бокулич, Н.А.; Миллс, Д.А. (2013). «Специальный «домашний» микробиом объекта определяет микробный ландшафт ремесленных сыродельных заводов» . Прикладная и экологическая микробиология . 79 (17): 5214–5223. Бибкод : 2013ApEnM..79.5214B . дои : 10.1128/AEM.00934-13 . ISSN 0099-2240 . ПМЦ 3753952 . ПМИД 23793641 .
- ^ Калассо, Мария; Эрколини, Данило; Манчини, Леонардо; Стеллато, Джузеппина; Минервини, Фабио; Ди Каньо, Рафаэлла; Де Анджелис, Мария; Гоббетти, Марко (2016). «Взаимоотношения между микробиотой дома, кожуры и сердцевины при производстве традиционных итальянских сыров на одном молочном заводе». Пищевая микробиология . 54 : 115–126. дои : 10.1016/j.fm.2015.10.008 . ISSN 0740-0020 .
- ^ Бокулич, Н.А.; Охта, М.; Ли, М.; Миллс, Д.А. (2014). «Местные бактерии и грибы стимулируют брожение традиционного сакэ кимото» . Прикладная и экологическая микробиология . 80 (17): 5522–5529. Бибкод : 2014ApEnM..80.5522B . дои : 10.1128/АЕМ.00663-14 . ISSN 0099-2240 . ПМК 4136118 . ПМИД 24973064 .
- ^ Бокулич, Николай А; Бергсвейнсон, Джордин; Зиола, Барри; Миллс, Дэвид А. (2015). «Картирование микробных экосистем и потока генов порчи на пивоварнях выявляет закономерности загрязнения и устойчивости» . электронная жизнь . 4 . doi : 10.7554/eLife.04634 . ISSN 2050-084X . ПМЦ 4352708 . ПМИД 25756611 .
- ^ Ван Бонн, Уильям; ЛаПойнт, Аллен; Гиббонс, Шон М.; Фрейзер, Ангел; Хэмптон-Марселл, Джаррад; Гилберт, Джек (2015). «Реакция аквариумного микробиома на девяносто процентов замены воды в системе: ключ к управлению микробиомом» . Зоопарковая биология . 34 (4): 360–367. дои : 10.1002/zoo.21220 . hdl : 1912/7532 . ISSN 0733-3188 . ПМЦ 4852745 . ПМИД 26031788 .
- ^ Хейлисус, Сэмюэл Фекаду; Манайе, Абайне Мелаку (2014). «Микробиологическое качество воздуха помещений университетских библиотек» . Азиатско-Тихоокеанский журнал тропической биомедицины . 4 (Приложение 1): S312–S317. дои : 10.12980/APJTB.4.2014C807 . ISSN 2221-1691 . ПМК 4025286 . ПМИД 25183103 .
- ^ Манерт, Александр; Вайшампаян, Параг; Пробст, Александр Дж.; Ауэрбах, Анна; Мойссль-Айхингер, Кристина; Венкатешваран, Кастури; Берг, Габриэле (2015). «Поддержание чистых помещений значительно снижает количество, но не разнообразие внутренних микробиомов» . ПЛОС ОДИН . 10 (8): e0134848. Бибкод : 2015PLoSO..1034848M . дои : 10.1371/journal.pone.0134848 . ISSN 1932-6203 . ПМЦ 4537314 . ПМИД 26273838 .
- ^ Вайнмайер, Томас; Пробст, Александр Дж.; Ла Дюк, Майрон Т.; Чобану, Дойна; Ченг, Ян-Фан; Иванова, Наталья; Раттей, Томас; Вайшампаян, Параг (2015). «Метагеномный анализ, связанный с жизнеспособностью чистых помещений: эукариот, прокариотов и вирусов» . Микробиом . 3 (1): 62. дои : 10.1186/s40168-015-0129-y . ISSN 2049-2618 . ПМК 4672508 . ПМИД 26642878 .
- ^ Перссон, Эрика К.; Цукаяма, Пабло; Патель, Санкет; Мехия-Баутиста, Мелисса; Соса-Сото, Джордано; Наваррете, Карла М.; Кальдерон, Марица; Кабрера, Лилия; Ойос-Аранго, Уильям (2016). «Взаимосвязанные микробиомы и резистомы в местах обитания людей с низким доходом» . Природа . 533 (7602): 212–216. Бибкод : 2016Natur.533..212P . дои : 10.1038/nature17672 . ПМК 4869995 . ПМИД 27172044 .
- ^ Корвес, ТМ; Пичено, Ю.М.; Том, LM; ДеСантис, Теннесси; Джонс, BW; Андерсен, Г.Л.; Хван, генеральный менеджер (2013). «Бактериальные сообщества в высокоэффективных воздушных фильтрах твердых частиц (HEPA) коммерческих самолетов, оцененные с помощью анализа PhyloChip» . Внутренний воздух . 23 (1): 50–61. дои : 10.1111/j.1600-0668.2012.00787.x . ISSN 0905-6947 . ПМК 7201892 . ПМИД 22563927 .
- ^ Стивенсон, Рэйчел Э.; Гутьеррес, Даниэль; Питерс, Синди; Николс, Марк; Боулс, Блез Р. (2014). «Выявление бактерий, обнаруженных в салоне автомобиля, и стратегии уменьшения присутствия потенциальных патогенов» . Биологическое обрастание . 30 (3): 337–346. дои : 10.1080/08927014.2013.873418 . ISSN 0892-7014 . ПМЦ 3962071 . ПМИД 24564823 .
- ^ Кастро, Вирджиния; Трэшер, АН; Хили, М.; Отт, СМ; Пирсон, Д.Л. (2004). «Микробная характеристика во время раннего проживания на Международной космической станции». Микробная экология . 47 (2): 119–126. дои : 10.1007/s00248-003-1030-y . ISSN 0095-3628 . ПМИД 14749908 . S2CID 7746684 .
- ^ Мора, Максимилиан; Подмигни, Лиза; Кёглер, Инес; Манерт, Александр; Реттберг, Петра; Швенднер, Петра; Деметс, Рене; Кокелл, Чарльз; Алехова Татьяна; Клингль, Андреас; Краузе, Роберт (05 сентября 2019 г.). «Условия космической станции являются избирательными, но не изменяют микробные характеристики, имеющие отношение к здоровью человека» . Природные коммуникации . 10 (1): 3990. Бибкод : 2019NatCo..10.3990M . дои : 10.1038/s41467-019-11682-z . ISSN 2041-1723 . ПМК 6728350 . ПМИД 31488812 .
- ^ Новикова, Н.Д. (2004). «Обзор знаний о микробном загрязнении российских пилотируемых космических кораблей». Микробная экология . 47 (2): 127–132. дои : 10.1007/s00248-003-1055-2 . ISSN 0095-3628 . ПМИД 14994178 . S2CID 20497761 .
- ^ Ла Дюк, Майрон Т.; Николсон, Уэйн; Керн, Роджер; Венкатешваран, Кастури (2003). «Микробная характеристика космического корабля Mars Odyssey и его инкапсуляционной установки». Экологическая микробиология . 5 (10): 977–985. дои : 10.1046/j.1462-2920.2003.00496.x . ISSN 1462-2912 . ПМИД 14510851 .
- ^ Мойссль-Айхингер, Кристина; Пукалл, Рюдигер; Пробст, Александр Дж.; Штигльмайер, Микаэла; Швенднер, Петра; Мора, Максимилиан; Барчик, Саймон; Бомайер, Мария; Реттберг, Петра (2013). «Уроки, извлеченные из микробного анализа космического корабля Гершель во время сборки, интеграции и испытаний». Астробиология . 13 (12): 1125–1139. Бибкод : 2013AsBio..13.1125M . дои : 10.1089/ast.2013.1024 . ISSN 1531-1074 . ПМИД 24313230 .
- ^ Физель, Л.М.; Баумгартнер, ЛК; Петерсон, КЛ; Франк, Д.Н.; Харрис, Дж. К.; Пейс, NR (2009). «Условно-патогенные микроорганизмы, обогащенные биопленками душа» . Труды Национальной академии наук . 106 (38): 16393–16399. Бибкод : 2009PNAS..10616393F . дои : 10.1073/pnas.0908446106 . ISSN 0027-8424 . ПМЦ 2752528 . ПМИД 19805310 .
- ^ Савабе, Токо; Суда, Ватару; Осима, Кенширо; Хаттори, Масахира; Савабе, Томоо (2016). «Первые оценки микробиоты воды детского детского бассейна с использованием метагеномного анализа на основе гена 16S рРНК» . Журнал инфекций и общественного здравоохранения . 9 (3): 362–365. дои : 10.1016/j.jiph.2015.11.008 . ISSN 1876-0341 . ПМИД 26671497 .
- ^ Барон, Джулианна Л.; Харрис, Дж. Кирк; Холингер, Эрик П.; Дуда, Скотт; Стивенс, Марк Дж.; Робертсон, Чарльз Э.; Росс, Кимберли А.; Пейс, Норман Р.; Стаут, Джанет Э. (2015). «Влияние обработки монохлорамином на микробную экологию легионеллы и связанных с ней бактериальных популяций в системе горячего водоснабжения больницы». Систематическая и прикладная микробиология . 38 (3): 198–205. дои : 10.1016/j.syapm.2015.02.006 . ISSN 0723-2020 . ПМИД 25840824 .
- ^ Ericsson AC, Busi SB, Davis DJ, Nabli H, Eckhoff DC, Dorfmeyer RA, Turner G, Oswalt PS, Cim MJ, Bryda EC (август 2021 г.). «Молекулярная и культуральная оценка микробиома в системе содержания рыбок данио (Danio rerio) во время установки и уравновешивания» . Микробиом животных . 3 (55): 55. дои : 10.1186/s42523-021-00116-1 . ПМК 8340428 . ПМИД 34353374 .
- ^ Пинто, Амит Дж.; Си, Чуаньу; Раскин, Лутгард (2012). «Структура бактериального сообщества в микробиоме питьевой воды регулируется процессами фильтрации» . Экологические науки и технологии . 46 (16): 8851–8859. Бибкод : 2012EnST...46.8851P . дои : 10.1021/es302042t . ISSN 0013-936X . ПМИД 22793041 .
- ^ Руди, К.; Таннаес, Т.; Ватн, М. (2009). «Временное и пространственное разнообразие микробиоты водопроводной воды в норвежской больнице» . Прикладная и экологическая микробиология . 75 (24): 7855–7857. Бибкод : 2009ApEnM..75.7855R . дои : 10.1128/АЕМ.01174-09 . ISSN 0099-2240 . ПМК 2794120 . ПМИД 19837845 .
- ^ Ван, Хун; Мастерс, Шелдон; Эдвардс, Марк А.; Фолкинхэм, Джозеф О.; Прюден, Эми (2014). «Влияние дезинфицирующего средства, возраста воды и материалов труб на структуру бактериального и эукариотического сообщества в биопленке питьевой воды». Экологические науки и технологии . 48 (3): 1426–1435. Бибкод : 2014EnST...48.1426W . дои : 10.1021/es402636u . ISSN 0013-936X . ПМИД 24401122 .
- ^ Лю, Г.; Верберк, JQJC; Ван Дейк, JC (2013). «Бактериология систем распределения питьевой воды: целостный и многомерный обзор». Прикладная микробиология и биотехнология . 97 (21): 9265–9276. дои : 10.1007/s00253-013-5217-y . ISSN 0175-7598 . ПМИД 24068335 . S2CID 2580915 .
- ^ Ким, Бонг Су; Со, Джэ Ран; Пак, Ду Хён (2013). «Изменение и характеристика бактериальных сообществ, контаминирующих две сауны, работающие при температуре 64 ° C и 76 ° C» . Журнал бактериологии и вирусологии . 43 (3): 195. дои : 10.4167/jbv.2013.43.3.195 . ISSN 1598-2467 .
- ^ Стерфлингер, Катя; Пиньяр, Гваделупа (08 октября 2013 г.). «Микробная порча культурного наследия и произведений искусства — борьба с ветряными мельницами?» . Прикладная микробиология и биотехнология . 97 (22): 9637–9646. дои : 10.1007/s00253-013-5283-1 . ISSN 0175-7598 . ПМЦ 3825568 . ПМИД 24100684 .
- ^ Каллеварт, Крис; Мезенейр, Эвелин Де; Керкхоф, Фредерик-Мартен; Верлифде, Арне; Виле, Том Ван де; Бун, Нико (01 ноября 2014 г.). «Профиль микробного запаха одежды из полиэстера и хлопка после занятия фитнесом» . Прикладная и экологическая микробиология . 80 (21): 6611–6619. Бибкод : 2014ApEnM..80.6611C . дои : 10.1128/АЕМ.01422-14 . ISSN 0099-2240 . ПМК 4249026 . ПМИД 25128346 .
- ^ Кардинале, Массимилиано; Кайзер, Доминик; Людерс, Тильманн; Шнелл, Сильвия; Эгерт, Маркус (19 июля 2017 г.). «Анализ микробиома и конфокальная микроскопия использованных кухонных губок выявили массовую колонизацию видами Acinetobacter, Moraxella и Chryseobacterium» . Научные отчеты . 7 (1): 5791. Бибкод : 2017НатСР...7.5791С . дои : 10.1038/s41598-017-06055-9 . ISSN 2045-2322 . ПМК 5517580 . ПМИД 28725026 .
- ^ Брэндс, Бритта; Хониш, Марлитт; Мереттиг, Надин; Бихлер, Сандра; Стаммингер, Райнер; Кинниус, Йорг; Зейферт, Моника; Хардакер, Инго; Кесслер, Арнд (14 марта 2016 г.). «Качественный и количественный анализ микробных сообществ в бытовых посудомоечных машинах в Германии». Моющие средства на основе тензидных поверхностно-активных веществ . 53 (2): 112–118. дои : 10.3139/113.110415 . ISSN 0932-3414 . S2CID 101776055 .
- ^ Каллеварт, Крис; Ван Невель, Сэм; Керкхоф, Фредерик-Мартен; Границиотис, Майкл С.; Бун, Нико (01 января 2015 г.). «Бактериальный обмен в бытовых стиральных машинах» . Границы микробиологии . 6 :1381.дои 10.3389 : /fmicb.2015.01381 . ПМК 4672060 . ПМИД 26696989 .
- ^ Адамс, Рэйчел И.; Бейтман, Эшли С.; Бик, Холли М.; Медоу, Джеймс Ф. (2015). «Микробиота внутренней среды: метаанализ» . Микробиом . 3 (1): 49. дои : 10.1186/s40168-015-0108-3 . ISSN 2049-2618 . ПМК 4604073 . ПМИД 26459172 .
- ^ Пакпур, Сепиде; Скотт, Джеймс А.; Терви, Стюарт Э.; Брук, Джеффри Р.; Такаро, Тимоти К.; Сирс, Малкольм Р.; Клирономос, Джон (2016). «Присутствие архей во внутренней среде и их связь с характеристиками жилья» (PDF) . Микробная экология . 72 (2): 305–312. дои : 10.1007/s00248-016-0767-z . hdl : 1721.1/103800 . ISSN 0095-3628 . ПМИД 27098176 . S2CID 13255963 .
- ^ Печча, Иордания; Кван, Сара Э. (2016). «Здания, полезные микробы и здоровье». Тенденции в микробиологии . 24 (8): 595–597. дои : 10.1016/j.tim.2016.04.007 . ISSN 0966-842X . ПМИД 27397930 .
- ^ Шин, Хакдонг; Пей, Чжихэн; Мартинес, Кейт А.; Ривера-Винас, Хуана И.; Мендес, Кеймари; Каваллин, Умберто; Домингес-Белло, Мария Г. (2015). «Первая микробная среда младенцев, рожденных путем кесарева сечения: микробы операционной» . Микробиом . 3 (1): 59. дои : 10.1186/s40168-015-0126-1 . ISSN 2049-2618 . ПМЦ 4665759 . ПМИД 26620712 .
- ^ Касас, Лидия; Тишер, Кристина; Тойбель, Мартин (2016). «Детская астма и микробная среда в помещении». Текущие отчеты о состоянии окружающей среды . 3 (3): 238–249. дои : 10.1007/s40572-016-0095-y . ISSN 2196-5412 . ПМИД 27230430 . S2CID 18672419 .
- ^ Фудзимура, Кей Э.; Линч, Сьюзен В. (2015). «Микробиота при аллергии и астме и новые связи с микробиомом кишечника» . Клетка-хозяин и микроб . 17 (5): 592–602. дои : 10.1016/j.chom.2015.04.007 . ISSN 1931-3128 . ПМЦ 4443817 . ПМИД 25974301 .
- ^ Штейн, Мишель М.; Хруш, Кара Л.; Гоздз, Юстина; Игартуа, Кэтрин; Пивнюк, Вадим; Мюррей, Шон Э.; Ледфорд, Джули Г.; Сантос, Маурисиус Маркес душ; Андерсон, Ребекка Л. (3 августа 2016 г.). «Врожденный иммунитет и риск астмы у фермерских детей амишей и гуттеритов» . Медицинский журнал Новой Англии . 375 (5): 411–421. дои : 10.1056/nejmoa1508749 . ПМЦ 5137793 . ПМИД 27518660 .
- ^ Бирзеле, Лена Т.; Депнер, Мартин; Эге, Маркус Дж.; Энгель, Мэрион; Кублик, Сюзанна; Бернау, Кристоф; Потеря, Георг Дж.; Дженунейт, Джон; Хорак, Элизабет (01 августа 2016 г.). «Микробиота окружающей среды и слизистых оболочек и их роль в детской астме» . Аллергия . 72 (1): 109–119. дои : 10.1111/all.13002 . hdl : 1874/359909 . ISSN 1398-9995 . ПМИД 27503830 . S2CID 2577786 .
- ^ Фудзимура, Кей Э.; Демур, Тайн; Раух, Маркус; Фаруки, Али А.; Чан, Сихьюг; Джонсон, Кристина С.; Буши, Гомер А.; Зоратти, Эдвард; Оунби, Деннис (14 января 2014 г.). «Воздействие домашней пыли способствует обогащению кишечного микробиома лактобактериями и иммунной защите дыхательных путей от аллергенов и вирусных инфекций» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 111 (2): 805–810. Бибкод : 2014PNAS..111..805F . дои : 10.1073/pnas.1310750111 . ISSN 1091-6490 . ПМК 3896155 . ПМИД 24344318 .
- ^ Хойсингтон, Эндрю Дж.; Бреннер, Лиза А.; Кинни, Керри А.; Постолаче, Теодор Т.; Лоури, Кристофер А. (2015). «Микробиом искусственной среды и психическое здоровье» . Микробиом . 3 (1): 60. дои : 10.1186/s40168-015-0127-0 . ISSN 2049-2618 . ПМЦ 4682225 . ПМИД 26674771 .
- ^ «Документ о позиции ASHRAE по воздушно-капельным инфекционным заболеваниям» (PDF) . АШРАЭ . Проверено 20 августа 2016 г.
- ^ «Об исследовании – Микробиомы искусственной среды» .
- ^ Гласс, Элизабет М.; Дрибинский, Екатерина; Йылмаз, Пелин; Левин, Хэл; Ван Пелт, Роберт; Вендел, Дуг; Вилке, Андреас; Эйзен, Джонатан А.; Хьюз, Сью (1 января 2014 г.). «MIxS-BE: расширение MIxS, определяющее минимальный информационный стандарт для данных последовательности из искусственной среды» . Журнал ISME . 8 (1): 1–3. дои : 10.1038/ismej.2013.176 . ISSN 1751-7362 . ПМК 3869023 . ПМИД 24152717 .
- ^ Рамос, Тиффани; Стивенс, Брент (1 ноября 2014 г.). «Инструменты для улучшения сбора данных об искусственной среде для исследований микробной экологии в помещении» . Строительство и окружающая среда . 81 : 243–257. дои : 10.1016/j.buildenv.2014.07.004 .
- ^ Фирер, Н.; Лаубер, CL; Чжоу, Н.; Макдональд, Д.; Костелло, ЕК; Найт, Р. (2010). «Судебно-медицинская идентификация с использованием кожных бактериальных сообществ» . Труды Национальной академии наук . 107 (14): 6477–6481. дои : 10.1073/pnas.1000162107 . ISSN 0027-8424 . ПМК 2852011 . ПМИД 20231444 .
- ^ Медоу, Джеймс Ф.; Альтрихтер, Адам Э.; Грин, Джессика Л. (2014). «Мобильные телефоны несут персональный микробиом своих владельцев» . ПерДж . 2 : е447. дои : 10.7717/peerj.447 . ISSN 2167-8359 . ПМК 4081285 . ПМИД 25024916 .
- ^ Дикманн, Нина; Бургарц, Мелани; Ремус, Ларс; Кауфхольц, Анна-Лена; Наврат, Торбен; Роде, Манфред; Шульц, Стефан; Розелиус, Луиза; Шапер, Йорг (23 ноября 2012 г.). «Микробные сообщества, связанные с выбросами летучих органических соединений в автомобильных кондиционерах». Прикладная микробиология и биотехнология . 97 (19): 8777–8793. дои : 10.1007/s00253-012-4564-4 . ISSN 0175-7598 . ПМИД 23179618 . S2CID 17782555 .
- ^ Пак, Санджун; Ким, Ыйён (2014). «Определение химических веществ, вызывающих неприятный запах, производимых микроорганизмами внутри автомобиля» . Журнал КСББ . 29 (2): 118–123. дои : 10.7841/ksbbj.2014.29.2.118 .
- ^ Хойсингтон, Эндрю; Маэстре, Хуан П.; Сигел, Джеффри А.; Кинни, Керри А. (2014). «Изучение микробиома искусственной среды: введение в четыре биологических метода, доступных профессионалам в области строительства». Исследование HVAC&R . 20 (1): 167–175. дои : 10.1080/10789669.2013.840524 . ISSN 1078-9669 . S2CID 108747778 .