✖


Jump to content

Pseudomonas stutzeri

Pseudomonas stutzeri
Научная классификация Изменить эту классификацию
Домен: Бактерии
Тип: Псевдомонадота
Сорт: Гаммапротеобактерии
Заказ: Псевдомонады
Семья: псевдомонадные
Род: Псевдомонада
Разновидность:
П. Штуцери
Биномиальное имя
Pseudomonas stutzeri
(Леманн и Нейман, 1896 г.)
Сиддериус 1946 г.
Тип штамма
АТСС 17588

ККУГ 11256
ЦБП 2443
СИП 103022
ДСМ 5190
ДЖКМ 5965
ЛМГ 11199
НБРЦ 14165
НККБ 76042
ВКМ Б-975

Синонимы
  • Bacillus denitrificans II Бурри и Штутцер 1895 г.
  • Бактерия stutzeri Лемана и Неймана, 1896 г.
  • Бацилла азотистая Мигула 1900
  • Bacillus stutzeri Честер 1901 г.
  • Achromobacter Sewerinii Bergey et al. 1923 год
  • Achromobacter stutzeri Bergey et al. 1930 год
  • Pseudomonas stanri Mandel 1966
  • Pseudomonas perfectomarina corrig. (бывший ZoBell и Upham 1944) Baumann et al. 1983 год
  • Pseudomonas loritidismutans Wolterink et al. 2002 г.

Pseudomonas stutzeri — это грамотрицательная почвенная бактерия , подвижная, имеющая один полярный жгутик и классифицируемая как бацилла, или палочковидная. [1] [2] Хотя эта бактерия была впервые выделена из спинномозговой жидкости человека, [3] С тех пор он был обнаружен во многих различных средах из-за его различных характеристик и метаболических возможностей. [4] P. stutzeri является условно-патогенным патогеном в клинических условиях, хотя инфекции встречаются редко. [3] На основании анализа 16S рРНК эту бактерию отнесли к группе P. stutzeri , которой она и дала свое название. [5]

Таксономия

[ редактировать ]

P. stutzeri легче всего отличить от других видов Pseudomonas. тем, что он не производит флуоресцентные пигменты . [6] P. mendocina, P. alcaligenes, P. pseudoalcaligenes и P. balearica отнесены к той же ветви псевдомонад, что и P. stutzeri, на основании последовательностей 16S рРНК и других филогенетических маркеров. [6] Из этой группы P. stutzeri наиболее близок к P. balearica , и их можно отличить не только по последовательностям 16S рРНК, но и по способности P. stutzeri расти при температуре выше 42 °C. [7] P. stutzeri был выделен во многих разных местах, и поскольку каждый штамм немного отличается в зависимости от того, где он был изолирован, группа P. stutzeri содержит множество геномоваров . [6] Это означает, что многие штаммы P. stutzeri можно считать геновидами, то есть организмами, которые можно дифференцировать только по составу их нуклеиновых кислот. [8]

Открытие

[ редактировать ]

Бурри и Штутцер впервые описали P. stutzeri в 1895 году и назвали бактерию Bacillus denitrificans II . [9] В 1902 году компания Itersonion разработала культуру накопительную P. stutzeri, которая позже была описана ван Нилом и Алленом в 1952 году. [10] Обогатительная среда представляет собой минеральную среду с 2% нитрата и тартрата (или малата , сукцината , малоната , цитрата , этанола или ацетата ), используемую в анаэробных условиях при 37 °С. [10] Организм был изолирован из самых разных мест, таких как спинномозговая жидкость человека, солома, навоз, почва и вода из каналов. [10]

Характеристика

[ редактировать ]

Pseudomonas stutzeri представляет собой грамотрицательную палочковидную неспорообразующую бактерию , длина которой обычно составляет 1–3 микрометра , а ширина – 0,5–0,8 микрометра. [10] Он дает положительный результат как на каталазу , так и на оксидазу . [11] [12] P. stutzeri оптимально растет при температуре около 35 °C, что делает его мезофильным организмом, хотя он может расти и при температуре всего 4 °C. [6] и достигает 44°С. [12] При выращивании на среде лизогенного бульона (LB) при температуре 32 °C время удвоения этой бактерии составляет около 53 минут. [13] Когда температура снижается примерно до 28 °C, время удвоения увеличивается и может достигать 72 минут. [13] Однако на с аспарагином минимальной среде (Asn) P. stutzeri имеет типичное время удвоения около 34 минут. [13] Несмотря на различия во времени удвоения между двумя средами , P. stutzeri достигает стационарной фазы примерно через 10–11 часов после инокуляции или введения в обе среды. [13] P. stutzeri лучше всего растет на средах, содержащих 2% NaCl , хотя он может переносить соленость (содержание NaCl) в пределах 1–5%. [14] Эта бактерия предпочитает нейтральный pH (pH7), но может расти и при pH до 9. [10] P. stutzeri обладает пилями IV типа и полярным жгутиком, которые помогают ему сохранять подвижность. [10] [15]

все бактерии Pseudomonas Первоначально считалось, что не способны фиксировать азот . [16] Однако с тех пор было обнаружено несколько Pseudomonas видов , включая P. stutzeri , которые продемонстрировали способность фиксировать азот. [16] Секвенирование генома фиксации азота, а также 42 гена , штамма P. stutzeri DSM4166 выявило некоторые гены которые кодируют основные части денитрификационного комплекса. [16] Ученые предполагают, что гены, необходимые для фиксации азота, были приобретены этими видами бактерий посредством латерального переноса генов . [16] Подобно другим бактериям рода Pseudomonas , P. stutzeri штаммы представляют собой гетеротрофные организмы, способные восстанавливать металлы и разлагать такие соединения, как углеводороды . [17] Однако, в отличие от других бактерий этого рода, штаммы P. stutzeri не флуоресцируют . [18]

Условия роста

[ редактировать ]

P. stutzeri Штаммы способны расти на средах нескольких различных типов, поскольку они могут использовать разные электронов доноры и акцепторы для поддержания своего метаболизма. [17] Бактерия часто использует органические соединения в качестве доноров электронов, некоторые из которых включают: глюкозу , лактат , ацетат , сукцинат , пируват , сахарозу и фумарат . [17] В качестве акцептора электронов P. stutzeri будет использовать либо кислород, если он находится в аэробных условиях, либо нитрат, если он находится в анаэробных условиях. [12] Хотя было показано, что бактерия растет на твердых средах (таких как желатин и агар ), жидких средах (таких как среда, не содержащая нитратов или нитритов ) и даже на картофеле, оптимальный рост она демонстрирует на пептонном или дрожжевом агаре. [10] В аэробной среде P. stutzeri может расти даже на более сложных средах, таких как лизогенные и бульоны Ризонера 2А (R2A). [17] причем последний из двух весьма полезен при отборе конкретных микробов из-за отсутствия в нем большого количества питательных веществ. [19] Каждая из различных сред приводит к собственным небольшим изменениям фенотипов колоний P. stutzeri , возникающим в результате роста. [10] Некоторые из этих изменений включают изменения в поверхностной пленке или выработке слизи, изменения текстуры (например, добавление гребней) или изменения формы (например, от круглой до многоугольной). [10]

Характеристики колонии

[ редактировать ]

Хотя микробные колонии могут P. stutzeri меняться в зависимости от среды, на которой выращивается бактерия, существуют консервативные, различимые характеристики, которые проявляются почти в каждой колонии этого вида. [10] При исследовании на твердой среде эта бактерия обнаруживает сухие, жесткие колонии, которые так плотно сцеплены друг с другом, что при необходимости часто легче удалить всю колонию, а не только ее часть. [10] Цвет колоний обычно коричневый, хотя при смене среды он может меняться. [12] Форма каждой колонии имитирует форму кратера, поскольку внешние края приподняты, образуя углубление в центре. [10] Края каждой колонии выступают наружу, что часто позволяет колониям вступать в контакт друг с другом. [10]

Метаболизм

[ редактировать ]

P. stutzeri является факультативным анаэробом , который использует дыхательный метаболизм с терминальными акцепторами электронов, такими как кислород и азот. [6] При анаэробном выращивании организмы рода Pseudomonas считаются модельными организмами для изучения денитрификации . [20] Штаммы, протестированные Стайнером и его коллегами, были способны расти и использовать следующие субстраты: глюконат , D-глюкоза , D-мальтоза, крахмал, глицерин , ацетат, бутират , изобутират , изовалерат , пропионат , фумарат , глутарат , гликолат , глиоксилат , DL- 3-гидроксибутират, итаконат , DL-лактат, DL-малат, малонат, оксалоацетат , 2-оксоглутарат , пируват , сукцинат, D-аланин , D-аспарагин, L-глутамат , L-глутамин , L-изолейцин и L-пролин. и гидролиз L-аланин-пара-нитроанилида. [6] D-мальтоза, крахмал и этиленгликоль являются источниками углерода, которые обычно не используются другими псевдомонадами , как показано Stainer et al.

Окисление тиосульфата

[ редактировать ]

Известно, что некоторые штаммы P. stutzeri используют тиосульфат в качестве неорганического источника энергии. [6] В 1999 г. Сорокин и др. выделил и описал семь штаммов P. stutzeri , которые были способны использовать нитрит, нитрат или закись азота в качестве акцепторов электронов при окислении тиосульфата в тетратионат в анаэробных условиях. [21] Окисление тиосульфата до тетратионата не может поддерживать автотрофный рост, поскольку оно дает только один электрон, поэтому штаммы, которые осуществляют это, являются облигатными гетеротрофами . [21] Окисление тиосульфата может происходить как в присутствии, так и в отсутствие кислорода, хотя в анаэробных условиях оно происходит гораздо медленнее. [6]

Окисление фосфитов и гипофосфитов

[ редактировать ]

В 1998 году Меткалф и Вульф выделили штамм P. stutzeri WM88, который мог окислять восстановленные соединения фосфора, такие как фосфит и гипофосфит , до фосфата. [22] Для обогащения организма, использующего гипофосфит, 0,4% глюкозо -MOPS- среду, содержащую 0,5 мМ гипофосфита. в качестве единственного источника фосфора с инокулятом из различных почвенных и водных сред использовали [22] В частности, штамм WM88 может использовать фосфит в качестве единственного источника фосфора при выращивании в среде сукцинат-MOPS. [22] Исследователи показали, что при выращивании в анаэробных условиях P. stutzeri не способен осуществлять окисление гипофосфита нитратом в качестве акцептора электронов. [22] Однако окисление фосфита в аналогичных условиях не изменяется. [22]

Деградация углеводородов

[ редактировать ]

Разложение алифатических углеводородов

[ редактировать ]

В 1913 году штамм P. stutzeri был одним из первых микроорганизмов, которые были идентифицированы как разлагающие алканы . [23] В литературе мало информации о других алифатические углеводороды штаммах P. stutzeri, разлагающих , однако штамм KC широко изучался из-за его потенциального биотехнологического применения. [6] Штамм КС выделен из водоносного горизонта и способен превращать четыреххлористый углерод в углекислый газ, формиат и другие менее опасные продукты. [6] Четыреххлористый углерод может быть загрязнителем почв и грунтовых вод. [6] и, по данным Центра по контролю и профилактике заболеваний (CDC), он способен вызвать повреждение почек и даже смерть у людей, подвергающихся его воздействию в течение длительного периода времени. [24] В биотехнологических целях штамм КС может минерализовать четыреххлористый углерод, что полезно для восстановления на месте водоносных горизонтов, загрязненных четыреххлористым углеродом. [6]

Разложение ароматических углеводородов

[ редактировать ]

Ароматические соединения, такие как бензол , считаются загрязнителями окружающей среды, несмотря на их естественное распространение в природе. [6] Штамм P16 P. stutzeri представляет собой бактерию, разлагающую полициклические ароматические углеводороды (ПАУ). [6] который был выделен из загрязненной креозотом почвы с помощью культуры, обогащенной фенантреном . [25] В качестве единственного источника углерода и энергии штамм P16 способен расти, используя фенантрен, флуорен , нафталин и метилнафталины . [26] В сочетании с анионным поверхностно-активным веществом Tergitol NP10 и фенантреном штамм P16 был предложен в качестве модели для изучения влияния поверхностно-активных веществ на биодоступность неводных углеводородов. [6]

Геномика

[ редактировать ]

Включение этой бактерии в род Pseudomonas было подтверждено гибридизацией ДНК-ДНК и сравнением сходства последовательностей рРНК . [27] четыре оперона rrn идентифицированы У P. stutzeri и сайт начала репликации . [27] Штаммы P. stutzeri разделены на отдельные геномные группы, называемые геномоварами. [27] Концепция геномовара была использована для P. stutzeri для различения генотипически сходных штаммов. [6] Два штамма P. stutzeri можно отнести к одному геномовару, если сходство ДНК-ДНК составляет не менее 70%. [6] Охарактеризовано семь геномоваров, размеры их геномов варьируются от 3,75 до 4,64 МБП. [27] Считается, что эти различия в геномах геномовара были вызваны хромосомными перестройками в ходе его эволюции. [27]

Содержание GC в геномах штаммов P. stutzeri колеблется в пределах 60–66 мол%. [16] [28] Штамм P. stutzeri DSM4166 — это штамм, который был изучен и специально продемонстрировал наличие ровно 61,74% содержания GC в своей кольцевой хромосоме . [16] Хотя этот штамм, по-видимому, не имеет плазмиды, координирующейся с его хромосомой, считается, что этот штамм имеет 59 генов тРНК и 4 оперона рРНК. [16] При глобальном сравнении геномов нескольких штаммов P. stutzeri было обнаружено, что многие геномные области генома этой бактерии консервативны между различными штаммами. [17] Одним из штаммов, изменчивость которого была обнаружена, является штамм RCH2. [17] Этот штамм имеет дополнительные 244 гена, которые, как полагают, помогают бактерии в хемотаксисе и в образовании пилуса и комплекса пируват/2-оксоглутарат. [17] Когда этот штамм был секвенирован, было обнаружено, что он имеет кольцевую хромосому размером 4,6 Мб и три плазмиды. [17]

В сравнительном геномном и филогеномном исследовании было проанализировано 494 полных генома всего рода Pseudomonas , 19 из которых были отнесены к более широкой эволюционной группе P. stutzeri . [28] Эти 19 геномов P. stutzeri кодируют от 3342 до 4524 (в среднем: 4086) белков каждый, причем 2080 из них являются общими для всех членов группы (основные белки). [28]

Экология

[ редактировать ]

Первоначально штаммы P. stutzeri были ошибочно идентифицированы с другими видами в аналогичных средах роста из-за ограничений фенотипически сходных бактерий Pseudomonas . [6] P. stutzeri широко распространен в окружающей среде и занимает разнообразные экологические ниши, в том числе является условно-патогенным микроорганизмом у человека. [6] Среды обитания и экология P. stutzeri разнообразны не только из-за его способности расти органотрофно или анаэробно с использованием окислительного метаболизма, но и из-за его хемолитотрофных свойств, устойчивости к металлам, широких источников азота, которые он может использовать, а также ареала обитания. температур, которые поддерживают его рост. [6]

Гены P. stutzeri были обнаружены в ризосферной области почвы, что указывает на значимость этой бактерии как фиксатора азота. [29] Эта бактерия была выделена из проб загрязненной нефтью почвы и морской воды/отложений. [6] Хотя большинство штаммов Pseudomonas , выделенных из морской среды, после классификации в конечном итоге переводятся в другой род, P. stutzeri является одним из немногих штаммов, который этого не сделал. [6] Этот штамм отвечает требованиям устойчивости к NaCl и встречается в толщах воды Тихого океана и отложениях Средиземного моря . [6] Эти морские штаммы играют множество экологических ролей, включая разложение нафталина, окисление серы и, что наиболее важно, денитрификацию и диазотрофию (фиксацию азота). [6] Имеются также свидетельства присутствия P. stutzeri на очистных сооружениях. [6] ZoBell, AN10, NF13, MT-1 и HTA208 являются наиболее значимыми штаммами, выделенными из морской среды и обнаруженными в таких местах, как водные толщи Тихого океана, загрязненные морские отложения Средиземного моря, рифты Галапагосских островов вблизи гидротермальных источников на глубинах 2500 метров и пробы Марианской впадины на глубине 11 000 метров. [6] Несколько других штаммов P. stutzeri были обнаружены даже в других местах, например, в образцах навоза, прудовой воды, соломы и перегноя. [11]

Актуальность

[ редактировать ]

Здоровье

[ редактировать ]

несколько штаммов Pseudomonas stutzeri Было обнаружено, что ведут себя как условно- патогенные микроорганизмы у человека. [3] Однако только в 1973 году способность P. stutzeri вызывать инфекцию стала темой обсуждения в научной литературе. [30] Первая известная инфекция наблюдалась в сочетании с постоянным переломом большеберцовой кости , потребовавшим хирургического вмешательства. [30] С момента первоначального заражения P. stutzeri может вызывать инфекции у людей с различными заболеваниями, в том числе: эндокардитом , инфекциями костей, глаз, кожи или мочевыводящих путей , менингитом , пневмонией , артритом и некоторыми другими. [3] У некоторых пациентов даже наблюдаются такие серьезные состояния здоровья, как опухоли, инфицированные полости суставов и коллапс легких . [11] У инфицированных штаммы P. stutzeri были выделены из крови, фекалий, спинномозговой жидкости , ушей, глаз и систем органов (например, дыхательной и мочевыделительной). [11] Когда штаммы этой бактерии обнаруживаются у инфицированных пациентов, они часто сопровождаются другими патогенными микробами. [11]

Хотя P. stutzeri с момента своего открытия стал причиной многочисленных инфекций, он стал причиной небольшого количества смертей, что придает ему гораздо более низкий рейтинг вирулентности по сравнению с другими видами Pseudomonas , такими как Pseudomonas aeruginosa . [6] Однако, несмотря на отсутствие значительной вирулентности, эта бактерия по-прежнему представляет угрозу для здоровья человека, поскольку содержит множество механизмов устойчивости к антибиотикам . [3] Фактически, у P. stutzeri устойчивые к антибиотикам, так много механизмов устойчивости, что штаммы P. stutzeri, были обнаружены и выделены почти для каждого семейства антибиотиков, за исключением фторхинолонов . [31] Некоторые из наиболее изученных механизмов резистентности включают: использование бета-лактамаз , которые способны расщеплять пенициллины , цефалоспорины и другие классы антибиотиков, а также способность изменять липополисахаридные и белковые компоненты внешней мембраны. [32] Чтобы приобрести устойчивость к фторхинолонам, мутации в gyrA ( ген гиразы ) и parC ( ген топоизомеразы IV ), мутации, которые встречаются не так часто. часто необходимы [31] только один штамм P. stutzeri , штамм 13, имеет мутации, которые делают его устойчивым к фторхинолонам. Было обнаружено, что [31] Причина, по которой штаммы P. stutzeri вызывают меньшую озабоченность по поводу значительной устойчивости к антибиотикам по сравнению с другими Pseudomonas штаммами , такими как P. aeruginosa, вероятно, связана с тем, что эти штаммы менее распространены в клинических условиях и, следовательно, реже подвергаются воздействию антибиотиков. [31]

Относящийся к окружающей среде

[ редактировать ]

Некоторые штаммы P. stutzeri способны связываться с загрязнителями и токсичными металлами, такими как биоциды и производные нефти, таким образом, что бактерия способствует разложению этих веществ. [6] Другие штаммы этой бактерии обладают метаболическими способностями, такими как круговорот металлов, которые позволяют сохранять важные металлы, такие как медь и железо , и разлагать токсичные металлы, такие как уран и свинец . [6] Один конкретный штамм P. stutzeri , штамм RCH2, в настоящее время изучается как потенциальный инструмент для биоремедиации почвы и водных ресурсов, поскольку он продемонстрировал способность снижать концентрацию шестивалентного хрома в районах с высоким содержанием этого загрязняющего вещества. [17] Несколько других штаммов P. stutzeri , таких как штамм A15, продемонстрировали способность снижать содержание атмосферного азота , поэтому их изучают в качестве агентов, способствующих ускорению роста растений. [33] Эти штаммы специально изучаются для использования на рисовых растениях, поскольку было доказано, что они естественным образом заражают и обитают в корнях этих растений. [33] Живя в корнях, P. stutzeri может напрямую снабжать растения восстановленными соединениями азота, которые они производят. [6]

Микробиологический

[ редактировать ]

несколько различных штаммов P. stutzeri Было обнаружено, что способны к естественной генетической трансформации . [34] Частота трансформации между особями одного и того же штамма P. stutzeri обычно высока. [34] Однако между особями разных штаммов или между штаммами P. stutzeri и другими видами Pseudomonas частота трансформации обычно значительно снижается. [34] Полная последовательность генома высокотрансформируемого штамма P. stutzeri , штамм 28a24, определена и доступна для наблюдения. [35]

Ссылки

[ редактировать ]
  1. ^ Леманн КБ, Нейман Р (1896). Атлас и очерк бактериологии и учебник специальной бактериологической диагностики . Мюнхен: Леманн. дои : 10.5962/bhl.title.117384 .
  2. ^ Сидериус Р. (1946). Гетеротрофные бактерии, окисляющие тиосульфат (кандидатская диссертация). Университет Амстердама. стр. 1–146.
  3. ^ Jump up to: а б с д и Пак С.В., Бэк Дж.Х., Ли С.В., Сон Дж.Х., Шин CH, Ким GE, Ким MJ (июнь 2013 г.). «Успешное лечение антибиотиками перитонита, вызванного Pseudomonas stutzeri, без удаления катетера для перитонеального диализа при непрерывном амбулаторном перитонеальном диализе» . Исследования почек и клиническая практика . 32 (2): 81–3. дои : 10.1016/j.krcp.2013.04.004 . ПМЦ   4713909 . ПМИД   26877919 .
  4. ^ Спирс А.Дж., Баклинг А., Рейни П.Б. (октябрь 2000 г.). «Причины разнообразия Pseudomonas» . Микробиология . 146 (Часть 10) (10): 2345–2350. дои : 10.1099/00221287-146-10-2345 . ПМИД   11021911 .
  5. ^ Анзай Ю, Ким Х, Пак ДжЙ, Вакабаяши Х, Ояизу Х (июль 2000 г.). «Филогенетическая принадлежность псевдомонад на основе последовательности 16S рРНК». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 50, часть 4 (4): 1563–1589. дои : 10.1099/00207713-50-4-1563 . ПМИД   10939664 .
  6. ^ Jump up to: а б с д и ж г час я дж к л м н тот п д р с т в v В х и С аа аб и объявление Лалукат Дж., Беннасар А., Бош Р., Гарсиа-Вальдес Э., Паллерони, Нью-Джерси (июнь 2006 г.). «Биология Pseudomonas stutzeri» . Обзоры микробиологии и молекулярной биологии . 70 (2): 510–47. дои : 10.1128/MMBR.00047-05 . ПМК   1489536 . ПМИД   16760312 .
  7. ^ Беннасар А., Росселло-Мора Р., Лалукат Дж., Мур Э.Р. (январь 1996 г.). «Анализ последовательности гена 16S рРНК относительно геномоваров Pseudomonas stutzeri и предложения Pseudomonas balearica sp. nov» . Международный журнал систематической бактериологии . 46 (1): 200–5. дои : 10.1099/00207713-46-1-200 . ПМИД   8573496 .
  8. ^ Уэйн Л.Г., Бреннер Д.Д., Колвелл Р.Р., Гримонт П.А., Кандлер О., Кричевский М.И. и др. (1987). «Отчет специальной комиссии по согласованию подходов к бактериальной систематике» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 37 (4): 463–464. дои : 10.1099/00207713-37-4-463 .
  9. ^ Бурри Р., Штутцер А (1895). «О нитратразрушающих бактериях и вызванных ими потерях азота». Центбл. бактериол. Диск "Паразиты". Отдел II . 1 : 257–265, 350–364, 392–398, 422–432.
  10. ^ Jump up to: а б с д и ж г час я дж к л м Ван Нил CB, Аллен МБ (1952). «Заметка о Pseudomonas Stutzeri» . Журнал бактериологии . 64 (3): 413–422. дои : 10.1128/jb.64.3.413-422.1952 . ISSN   0021-9193 . ПМК   169368 . ПМИД   12980914 .
  11. ^ Jump up to: а б с д и Лапаж С.П., Хилл Л.Р., Рив Дж.Д. (ноябрь 1968 г.). «Pseudomonas stutzeri в патологоанатомическом материале» . Журнал медицинской микробиологии . 1 (2): 195–202. дои : 10.1099/00222615-1-2-195 . ПМИД   5747915 .
  12. ^ Jump up to: а б с д Станье Р.Ю., Паллерони, Нью-Джерси, Дудорофф М. (май 1966 г.). «Аэробные псевдомонады: таксономическое исследование» . Журнал общей микробиологии . 43 (2): 159–271. дои : 10.1099/00221287-43-2-159 . ПМИД   5963505 .
  13. ^ Jump up to: а б с д Соммер М., Се Х., Мишель Х. (сентябрь 2017 г.). «Pseudomonas stutzeri как альтернативный хозяин мембранных белков» . Заводы по производству микробных клеток . 16 (1): 157. дои : 10.1186/s12934-017-0771-0 . ПМК   5607611 . ПМИД   28931397 .
  14. ^ Сейп Б., Галински Э.А., Курц М. (февраль 2011 г.). «Природное и искусственное производство гидроксиэктоина на основе кластера генов Pseudomonas stutzeri ectABCD-ask» . Прикладная и экологическая микробиология . 77 (4): 1368–74. дои : 10.1128/АЕМ.02124-10 . ПМК   3067233 . ПМИД   21169432 .
  15. ^ Граупнер С., Вакернагель В. (апрель 2001 г.). «Pseudomonas stutzeri имеет два тесно связанных гена pilA (структурный белок пилуса типа IV) с противоположным влиянием на естественную генетическую трансформацию» . Журнал бактериологии . 183 (7): 2359–66. дои : 10.1128/JB.183.7.2359-2366.2001 . ПМК   95145 . ПМИД   11244078 .
  16. ^ Jump up to: а б с д и ж г Ю Х, Юань М, Лу В, Ян Дж, Дай С, Ли Q и др. (июль 2011 г.). «Полная последовательность генома азотфиксирующей и ризосферной бактерии Pseudomonas stutzeri, штамм DSM4166» . Журнал бактериологии . 193 (13): 3422–3. дои : 10.1128/jb.05039-11 . ПМК   3133286 . ПМИД   21515765 .
  17. ^ Jump up to: а б с д и ж г час я Чакраборти Р., Ву Х., Дехал П., Уокер Р., Земла М., Ауэр М. и др. (2017). «Штамм Pseudomonas stutzeri RCH2, выделенный из участка, загрязненного шестивалентным хромом [Cr(VI)]» . Стандарты в геномных науках . 12 (1): 23. дои : 10.1186/s40793-017-0233-7 . ПМК   5299692 . ПМИД   28194258 .
  18. ^ Чакраборти Р., Браун В., Хантке К., Корнелис П. (2013). Поглощение железа бактериями с акцентом на E. coli и Pseudomonas . Дордрехт: Спрингер.
  19. ^ Reasoner DJ, Geldreich EE (январь 1985 г.). «Новая среда для подсчета и субкультивирования бактерий из питьевой воды» . Прикладная и экологическая микробиология . 49 (1): 1–7. дои : 10.1128/АЕМ.49.1.1-7.1985 . ПМК   238333 . ПМИД   3883894 .
  20. ^ Цумфт РГ (1997). «Клеточная биология и молекулярные основы денитрификации» . Обзоры микробиологии и молекулярной биологии . 61 (4): 533–616. дои : 10.1128/ммбр.61.4.533-616.1997 . ПМК   232623 . ПМИД   9409151 .
  21. ^ Jump up to: а б Сорокин Д.Ю., Теске А., Робертсон Л.А., Куэнен Дж.Г. (октябрь 1999 г.). «Анаэробное окисление тиосульфата до тетратионата облигатно гетеротрофными бактериями, принадлежащими к группе Pseudomonas stutzeri» . ФЭМС Микробиология Экология . 30 (2): 113–123. дои : 10.1111/j.1574-6941.1999.tb00640.x . hdl : 21.11116/0000-0004-C35F-6 . ПМИД   10508936 .
  22. ^ Jump up to: а б с д и Меткалф В.В., Вулф Р.С. (ноябрь 1998 г.). «Молекулярно-генетический анализ окисления фосфитов и гипофосфитов Pseudomonas stutzeri WM88» . Журнал бактериологии . 180 (21): 5547–58. дои : 10.1128/JB.180.21.5547-5558.1998 . ПМЦ   107611 . ПМИД   9791102 .
  23. ^ Зенген Н.Л. (1913). «Бензин, нефть, парафиновое масло и парафин как источники углерода и энергии для микробов». Центральный вид Бактериол. Паразитеск . 37 :595-609.
  24. ^ «Четверохлористый углерод» .
  25. ^ Стрингфеллоу В.Т., Эйткен, доктор медицины (июнь 1994 г.). «Сравнительная физиология разложения фенантрена двумя разными псевдомонадами, выделенными из почвы, загрязненной креозотом». Канадский журнал микробиологии . 40 (6): 432–8. дои : 10.1139/m94-071 . ПМИД   8050063 .
  26. ^ Стрингфеллоу В.Т., Эйткен, доктор медицины (январь 1995 г.). «Конкурентный метаболизм нафталина, метилнафталинов и флуорена псевдомонадами, разлагающими фенантрен» . Прикладная и экологическая микробиология . 61 (1): 357–62. дои : 10.1128/АЕМ.61.1.357-362.1995 . ПМК   167289 . ПМИД   7887615 .
  27. ^ Jump up to: а б с д и Жинард М., Лалукат Дж., Туммлер Б., Рёмлинг У. (январь 1997 г.). «Организация генома Pseudomonas stutzeri и вытекающие отсюда таксономические и эволюционные соображения» . Международный журнал систематической бактериологии . 47 (1): 132–43. дои : 10.1099/00207713-47-1-132 . ПМИД   8995815 .
  28. ^ Jump up to: а б с Николаидис, Мариос; Моссиалос, Димитрис; Оливер, Стивен Г.; Амуциас, Григориос Д. (24 июля 2020 г.). «Сравнительный анализ основных протеомов основных эволюционных групп Pseudomonas выявляет видоспецифическую адаптацию Pseudomonas aeruginosa и Pseudomonas chromraphis» . Разнообразие . 12 (8): 289. дои : 10.3390/d12080289 . ISSN   1424-2818 .
  29. ^ Демба Диалло М., Виллемс А., Вломанс Н., Кузен С., Вандекеркхове Т.Т., де Лажуди П. и др. (апрель 2004 г.). «Полимеразная цепная реакция, денатурирующий градиентный гель-электрофорез, анализ разнообразия N2-фиксирующих бактерий в почве под Acacia tortilis ssp. raddiana и Balanites aegyptiaca в засушливой части Сенегала». Экологическая микробиология . 6 (4): 400–15. дои : 10.1111/j.1462-2920.2004.00577.x . ПМИД   15008817 .
  30. ^ Jump up to: а б Джиларди Г.Л., Манкин Х.Дж. (декабрь 1973 г.). «Инфекция, вызванная Pseudomonas stutzeri». Медицинский журнал штата Нью-Йорк . 73 (23): 2789–91. ПМИД   4520361 .
  31. ^ Jump up to: а б с д Родригес-Мартинес Х.М., Пуарель Л., Аль Наиеми Н., Дебетс-Оссенкопп Ю.Дж., Нордманн П. (февраль 2010 г.). «Характеристика устойчивости к фторхинолонам клинического изолята Pseudomonas stutzeri» . Журнал антимикробной химиотерапии . 65 (2): 366–7. дои : 10.1093/jac/dkp441 . ПМИД   20008448 .
  32. ^ Таттавасарт Ю, Майлард Дж. Я., Ферр Дж. Р., Рассел А. Д. (июль 1999 г.). «Развитие устойчивости к диацетату хлоргексидина и хлориду цетилпиридиния у Pseudomonas stutzeri и изменение чувствительности к антибиотикам». Журнал госпитальной инфекции . 42 (3): 219–29. дои : 10.1053/jhin.1999.0591 . ПМИД   10439995 .
  33. ^ Jump up to: а б Деснуес Н., Линь М., Го X, Ма Л., Карреньо-Лопес Р., Элмерих С. ​​(август 2003 г.). «Генетика и регуляция фиксации азота у штамма Pseudomonas stutzeri, связанного с рисом» . Микробиология . 149 (Часть 8): 2251–2262. дои : 10.1099/mic.0.26270-0 . ПМИД   12904565 .
  34. ^ Jump up to: а б с Лоренц М.Г., Сикорски Дж. (декабрь 2000 г.). «Потенциал внутривидового горизонтального обмена генами путем естественной генетической трансформации: половая изоляция среди геномоваров Pseudomonas stutzeri» . Микробиология . 146 Пт 12: 3081–3090. дои : 10.1099/00221287-146-12-3081 . ПМИД   11101666 .
  35. ^ Смит Б.А., Догерти К.М., Балтрус Д.А. (июнь 2014 г.). «Полная последовательность генома высокотрансформируемого штамма Pseudomonas stutzeri 28a24» . Геномные объявления . 2 (3). дои : 10.1128/genomea.00543-14 . ПМК   4047452 . ПМИД   24903873 .
[ редактировать ]
Retrieved from "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Pseudomonas_stutzeri&oldid=1193274863"
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: ae56b4506903f00db03004aec39a230c__1704228840
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/ae/0c/ae56b4506903f00db03004aec39a230c.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Pseudomonas stutzeri - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)