Информационная система по биоразнообразию океана
 | в этой статье Использование внешних ссылок может не соответствовать политике и рекомендациям Википедии . ( декабрь 2023 г. ) |
Тип сайта | веб-система данных и информации |
|---|---|
| Доступно в | Английский |
| URL-адрес | www.obis.org |
| Коммерческий | нет |
| Регистрация | не требуется |
| Запущен | май 2000 г. |
| Текущий статус | активный |
Информационная система океанического биоразнообразия ( ОБИС ), ранее называвшаяся Океанская биогеографическая информационная система , представляет собой веб-точку доступа к информации о распространении и численности живых видов в океане . Он был разработан как компонент управления информацией десятилетней переписи морской жизни (CoML) (2001-2010 гг.), но не ограничивается данными, полученными в рамках CoML, и направлен на обеспечение интегрированного представления всех данных о морском биоразнообразии, которые могут быть собраны. предоставлены ему на основе открытого доступа соответствующими хранителями данных. Согласно его веб-сайту по состоянию на июль 2018 года, ОБИС «является глобальным центром обмена данными и информацией с открытым доступом о морском биоразнообразии для науки, сохранения и устойчивого развития». На сайте ОБИС перечислены 8 конкретных целей, главной из которых является «Предоставление крупнейшей в мире базы научных знаний о разнообразии, распространении и численности всех морских организмов в интегрированном и стандартизированном формате». [1]
История и текущий статус
[ редактировать ]Первоначальные идеи для OBIS были разработаны на совещании CoML по бентической (донной) жизни океана в октябре 1997 года. Рекомендации этого семинара привели к созданию веб-сайта ( http://marine.rutgers.edu/OBIS ) в Рутгерсе в 1998 году, продемонстрировать первоначальную концепцию OBIS. [2] Первый международный семинар OBIS был проведен 3–4 ноября 1999 г. в Вашингтоне, округ Колумбия, что привело к определению масштабов проекта и привлечению потенциальных партнеров, а отдельные материалы были опубликованы в специальном выпуске журнала Oceanography . [3] в рамках которого основатель OBIS д-р Дж. Ф. Грассле сформулировал видение OBIS как «всемирного онлайн-атласа для доступа, моделирования и картирования морских биологических данных в многомерном географическом контексте». [4] В мае 2000 года правительственные агентства США в рамках Национальной программы океанографического партнерства вместе с Фондом Альфреда П. Слоана профинансировали восемь исследовательских проектов по запуску OBIS. США В мае 2001 года Национальный научный фонд профинансировал Университету Рутгерса разработку глобального портала для OBIS. Также в 2001 году был сформирован Международный комитет ОБИС, первое заседание которого состоялось в августе 2001 года. [5]
Производственная версия портала OBIS была запущена в Университете Рутгерса в 2002 году как веб-сайт http://www.iobis.org , обслуживающий 430 000 записей данных с географической привязкой по видам из 8 партнерских баз данных, включая записи о рыбах из FishBase , о головоногих моллюсках из CephBase , кораллы из «Биогеоинформатики гексакораллов» , моллюски из базы данных по моллюскам Индо-Тихоокеанского региона и многое другое. [6] К маю 2006 года портал ОБИС смог получить доступ к 9,5 миллионам записей о 59 000 видов из 112 баз данных. [7] и к декабрю 2010 года (по завершении переписи морской жизни) предоставил доступ к 27,7 миллионам записей, представляющих 167 000 названий таксонов. [8] По состоянию на июль 2018 года на веб-сайте ОБИС указано, что система обеспечивает доступ к более чем 45 миллионам наблюдений почти 120 000 морских видов (сокращение количества цитируемых названий происходит в результате разрешения синонимов, то есть сокращения таксонов, зарегистрированных под несколькими названиями, до одного принятое название), на основе вкладов 500 учреждений из 56 стран. [9]
В 2009 году OBIS был принят в качестве проекта программы Международного обмена океанографическими данными и информацией (МООД) Межправительственной океанографической комиссии (МОК) ЮНЕСКО , а в 2011 году с прекращением финансирования секретариата и портала в Рутгерсе со стороны Фонда Слоана. , предложение Фландрского морского института (VLIZ) о размещении в Остенде , Бельгия, было принято в качестве долгосрочного хостинга системы, а также секретариат ОБИС переехал из Университета Рутгерса в Проектный офис МОК для МООД в Остенде, откуда находится ОБИС. в настоящее время поддерживается и ведется дополнительная разработка. Веб-адрес изменился на [1] . Таким образом, компания OBIS теперь находится в Остенде, в том же здании, где находится и VLIZ. VLIZ поддерживает две таксономические базы данных: Всемирный реестр морских видов и IRMNG , Временный реестр морских и неморских родов , обе из которых учитываются при принятии таксономических решений, используемых для управления отображением информации о видах в OBIS, а также обеспечивают таксономическую иерархию через по какому содержимому OBIS можно перемещаться. ОБИС в настоящее время находится под руководством МООД при поддержке руководящей группы — Руководящей группы МООД по ОБИС (SG-OBIS); Оперативная деятельность направляется Исполнительным комитетом ОБИС (OBIS-EC) при поддержке различных целевых групп ОБИС и специальных проектных групп ОБИС. Секретариат ОБИС, расположенный в офисе проекта ЮНЕСКО/МОК для МООД в Остенде (Бельгия), включает в себя менеджера проекта ОБИС и менеджера по данным, а также в дополнение к обслуживанию системы ОБИС также обеспечивает обучение и техническую помощь своим поставщикам данных, направляет новые данные. стандарты и технические разработки, а также поощряет международное сотрудничество для увеличения групповых преимуществ сети. [10]
Данные, доступные через OBIS, охватывают все группы организмов, которые каким-либо образом связаны с морской или устьевой средой обитания, включая береговую линию и атмосферу над океаном, например, морских позвоночных (рыбы, морские млекопитающие, черепахи, морские птицы и т. д.); морские беспозвоночные (включая зоопланктон ); морские бактерии ; и морские растения (например, фитопланктон, морские водоросли, мангровые заросли).
Портал ОБИС
[ редактировать ]По мере развития доступных веб-технологий портал ОБИС претерпел ряд изменений с момента своего создания в 2002 году. Первоначально система получала удаленные данные в режиме реального времени в ответ на запрос пользователя и использовала KGS Mapper для визуализации результатов. В 2004 году было введено централизованное индексирование и кэширование метаданных, что привело к более быстрым и надежным результатам, а картограф c-квадратов . к опциям визуализации данных был добавлен [11] полноценная веб-система на основе ГИС вместе с новой версией веб-сайта, что привело к значительно более подробному и гибкому представлению результатов поиска, а также к ряду новых опций поиска. В 2010 году впервые была представлена [12] В апреле 2018 года было объявлено о финансировании разработки новой версии ОБИС «2.0» с улучшенными возможностями. [13] и выпущен 29 января 2019 года. [14] URL-адрес веб-сайта изменен с iobis.org на obis.org.
Региональные узлы ОБИС
[ редактировать ]За период с 2004 года по настоящее время также была создана международная сеть региональных узлов OBIS , которые облегчают подключение источников данных в своем регионе к главной сети данных OBIS, а также все чаще предоставляют специализированные услуги или просмотр данных OBIS пользователям в свой конкретный регион.
- Организаторами выступили Бельгийская платформа по биоразнообразию, Брюссель, и Морской институт Фландрии , Остенде. Управляющий Бруно Данис
- Организатор: Centro Nacional Patagonico - (CENPAT) - CONICET. Под руководством Мирты Льюис
- Организатор: Организация Содружества по научным и промышленным исследованиям «Океаны и атмосфера». Под руководством Дэйва Уоттса
- Организаторы: Центр морского биоразнообразия и Бедфордский институт океанографии. Под руководством Боба Брэнтона
- Организатор: Институт океанологии. Управляется Сунь Сяося
- Организатор: Морской институт Фландрии . Под управлением Уорда Аппельтанса
- Организаторы: Национальная химическая лаборатория и Национальный институт океанографии. Управляет Баба Инголе.
- Организатор: Национальный институт экологических исследований. Управляет Джунко Шимура
- Организатор: Национальный институт водных и атмосферных исследований. Управляет Дон Робертсон
- Организатор: Южноафриканский центр океанографических данных. Управляющий Мартен Грундлинг
- Организатор: Центр биоразнообразия АСЕАН. Управляющий Кристиан Эллоран
- Организатор: Университет Консепсьона. Управляющий Рубен Эскрибандо
- Организовано Университетом Сан-Паулу (USP) и Справочным центром экологической информации (CRIA). Под руководством Фабио Ланга Да Сильвера.
- Организатор: Геологическая служба США (USGS). Управляет Эбби Бенсон.
См. также
[ редактировать ]
Избранные публикации об ОБИС
[ редактировать ]- Грассл, Дж. Ф. и Стокс, К. И., 1999. Глобальная биогеографическая информационная система океана (ОБИС) для переписи морской жизни. Океанография 12(3), стр. 12-14.
- Грассл, Дж. Ф. 2000. Океанская биогеографическая информационная система (ОБИС): онлайновый всемирный атлас для доступа, моделирования и картирования морских биологических данных в многомерном географическом контексте. Океанография 13(3), стр. 5-7.
- Чжан Ю. и Грассл Дж. Ф. 2003. Портал океанической биогеографической информационной системы. Oceanologica Acta 25(5), стр. 193-197.
- Марк Дж. Костелло, Дж. Фредерик Грассл, Юньцин Чжан, Карен Стокс и Эдвард Ванден Берге, 2005. Где что и что находится где? Онлайн-картирование морских видов. Информационный бюллетень MarBEF . Весна 2005 г., стр. 20–22.
- Вуд Дж.Б., Чжан П.Ю., Костелло М.Дж. и Грассл Дж.Ф. 2006. Введение в ОБИС, www.iobis.org. В: Милаславич П. и Кляйн Э. (ред.), Морское биоразнообразие Карибского моря: известное и неизвестное. DEStech Publications Inc., Ланкастер, Пенсильвания, США, стр. 253–254.
- Костелло М.Дж., Стокс К., Чжан Ю., Грассл Дж.Ф., Фаутин Д.Г. 2007. О биогеографической информационной системе океана. Получено с http://hdl.handle.net/2292/5236.
- Эдвард Ванден Берге, Карен И. Стокс и Дж. Фредерик Грассл. 2010. Интеграция данных: Океанская биогеографическая информационная система. Глава 17 (стр. 333–353) в книге Аласдера Д. Макинтайра (ред.): Жизнь в Мировом океане. Глава Blackwell Publishing Ltd. также доступна по адресу http://www.comlmaps.org/mcintyre/ch17/data-integration-the-ocean-biogeographic-information-system .
- Ванден Берге Э., Халпин П., Ланг да Силвейра Ф., Стокс К. и Грассл Ф. 2010. Интеграция биологических данных в системы наблюдения за океаном: будущая роль ОБИС. В зале J, Харрисон Д.Э. и Стаммер Д. (редакторы) Труды OceanObs'09: Устойчивые наблюдения за океаном и информация для общества (Том 2). Париж, Публикация Европейского космического агентства № WPP-306.
- Костелло М.Дж., Ванхоорн Б., Аппелтанс В. 2015. Прогресс в сохранении биоразнообразия посредством таксономии, публикации данных и совместной инфраструктуры. Биология сохранения 29 (4), 1094–1099.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Веб-сайт ОБИС (посещение 18 июля 2018 г.)
- ^ Грассл, Дж. Ф. и Стокс, К. И., 1999. «Глобальная биогеографическая информационная система океана (ОБИС) для переписи морской жизни». Океанография 12 (3): 12-14.
- ^ Океанография, том 13, вып. 3 ноября 2000 г. Специальный выпуск: Биогеографическая информационная система океана.
- ^ Грассл, Дж. Ф. 2000. «Океанская биогеографическая информационная система (OBIS): онлайновый всемирный атлас для доступа, моделирования и картирования морских биологических данных в многомерном географическом контексте». Океанография 13 (3): 5-7.
- ^ Чжан Ю. и Грассл Дж. Ф. 2003. «Портал для биогеографической информационной системы океана». Oceanologica Acta 25(5): 193-197.
- ^ «www.iobis.org: архивная версия, 20 марта 2002 г.» . Архивировано из оригинала 20 марта 2002 года . Проверено 20 марта 2002 г.
- ^ «www.iobis.org: архивная версия, 2 мая 2006 г.» . Архивировано из оригинала 2 мая 2006 года . Проверено 2 мая 2006 г.
- ^ www.obis.org: архивная версия, 13 декабря 2010 г.
- ↑ Об ОБИС: архивная версия, 5 июля 2018 г.
- ^ Об ОБИС: Управление
- ^ Тони Рис и Фиби Чжан, 2007. «Развитие концепций архитектуры и функциональности OBIS, океанской биогеографической информационной системы». в Vanden Berghe, E. et al. (ред.) Труды информатики океанического биоразнообразия: международная конференция по управлению данными о морском биоразнообразии Гамбург, Германия, 29 ноября – 1 декабря 2004 г. Отчет о семинаре МОК, 202, Специальная публикация VLIZ 37: стр. 167-176.
- ^ Эй Фудзиока и др. , 2012. «Продвижение глобальных исследований морской биогеографии с помощью программного обеспечения ГИС с открытым исходным кодом и облачных вычислений». Транзакции в ГИС 16(2): 143–160.
- ^ «МОК инвестирует в OBIS2.0, масштабную модернизацию платформы OBIS» ,
- ^ "Выпущен ОБИС 2.0" ,
Внешние ссылки
[ редактировать ]Международный портал ОБИС
[ редактировать ]Региональные узлы ОБИС
[ редактировать ]- АфрОБИС: узел ОБИС в Африке к югу от Сахары.
- ЕвроОБИС: Европейский узел ОБИС
- IndOBIS: узел ОБИС в Индийском океане.
- OBIS Australia: австралийский региональный узел OBIS.
- OBIS China: китайский региональный узел OBIS
- OBIS Southwestern Pacific: региональный узел OBIS в юго-западной части Тихого океана.
- СКАР-MarBIN: Информационная сеть по морскому биоразнообразию Антарктики
- SEAOBIS: узел ОБИС в Юго-Восточной Азии.
- US OBIS: региональный узел OBIS в США.
- OBIS Canada: канадский региональный узел OBIS.