Омпаподобный трансмембранной домен
| Омпаподобный трансмембранной домен | |||
|---|---|---|---|
 | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | Ompa_membrane | ||
| Pfam | PF01389 | ||
| PFAM клан | CL0193 | ||
| InterPro | IPR000498 | ||
| PROSITE | PDOC00819 | ||
| Краткое содержание | 1bxw / scope / supfam | ||
| TCDB | 1.B.6 | ||
| OPM Суперсемейство | 26 | ||
| OPM белок | 1qjp | ||
| |||
Амбоподобный трансмембранное домен представляет собой эволюционно консервативный домен бактериальных белков наружной мембраны . Этот домен состоит из восьмицепочечной бета-бочки . [ 1 ] OMPA является преобладающим антигеном клеточной поверхности у энтеробактерий, обнаруженных в примерно 100 000 экземпляров на клетку. [ 2 ] Экспрессия OMPA строго регулируется различными механизмами. Одним из механизмов, с помощью которого экспрессия ompa регулируется у видов вибрации , является антисмысловая некодирующая РНК, называемая VRRA . [ 3 ]
Структура
[ редактировать ]Структура состоит из восьмицепочечного бета-бокса . Пяния соединены четырьмя внеклеточными петлями и тремя внутриклеточными поворотами. [ 4 ]
Функция
[ редактировать ]Многочисленные OMPA-подобные мембранные домены способствуют бактериальной вирулентности различными механизмами, такими как связывание с клетками-хозяевами или иммунные регуляторы, такие как фактор H. Примечательные примеры включают E. coli Ompa и Yersinia pestis ail. Некоторые из этих белков являются кандидатами на вакцину.
Было показано, что E. coli Opma проводит специфические взаимодействия с гликопротеиновым ЭКГП человека на эндотелиальных клетках микрососудистых клеток головного мозга. [ 5 ] Cronobacter sakazakii - это патоген, вызывающий менингит, у новорожденных, и было показано, что он связывал фибронектин через OMPA, и это сыграло значительную роль в инвазии в кровопролитие. [ 6 ] Белок Y. pestis AIL связывается с ламинином и гепарином, что позволяет бактериальному прикреплению к клеткам -хозяевам. [ 7 ] Белок Borrelia afzelii Bapko_0422 представляет собой омпаподобный трансмембранный домен и связывается с человеческим фактором h . [ 8 ]
Смотрите также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Pautsch A, Schulz GE (ноябрь 1998 г.). «Структура белка наружного мембраны трансмембранного домена». Природа структурная биология . 5 (11): 1013–7. doi : 10.1038/2983 . PMID 9808047 . S2CID 20529728 .
- ^ Смит С.Г., Махон В., Ламберт М.А., Фаган Р.П. (август 2007 г.). «Молекулярный швейцарский армейский нож: структура, функция и выражение OMPA» . Письма микробиологии FEMS . 273 (1): 1–11. doi : 10.1111/j.1574-6968.2007.00778.x . PMID 17559395 .
- ^ Песня T, Wai Sn (июль 2009 г.). «Новая сРНК, которая модулирует вирулентность и экологическую пригодность вибрионо -холеры» . РНК -биология . 6 (3): 254–8. doi : 10.4161/rna.6.3.8371 . PMID 19411843 .
- ^ Fernández C, Hilty C, Wider G, Güntert P, Wüthrich K (март 2004 г.). «ЯМР -структура интегрального мембранного белка ompx». Журнал молекулярной биологии . 336 (5): 1211–21. doi : 10.1016/j.jmb.2003.09.014 . PMID 15037080 .
- ^ Прасадарао Н.В., Шривастава П.К., Рудрабхатла Р.С., Ким К.С., Хуан С.Х., Сукумаран С.К. (апрель 2003 г.). «Клонирование и экспрессия рецептора Escherichia coli K1 белка A, гомолога GP96» . Инфекция и иммунитет . 71 (4): 1680–8. doi : 10.1128/iai.71.4.1680-1688.2003 . PMC 152083 . PMID 12654781 .
- ^ Nair MK, Venkitanarayanan K, Silbart LK, Kim KS (май 2009 г.). «Внешний мембранный белок A (OMPA) кронобактер Sakazakii связывает фибронектин и способствует инвазии микрососудистых эндотелиальных клеток головного мозга человека». Пищевые патогены и болезнь . 6 (4): 495–501. doi : 10.1089/fpd.2008.0228 . PMID 19415974 .
- ^ Yamashita S, Lukacik P, Barnard TJ, Noinaj N, Felek S, Tsang TM, Krukonis ES, Hinnebusch BJ, Buchanan SK (ноябрь 2011 г.). «Структурное понимание AIL-опосредованной адгезии в Yersinia pestis» . Структура 19 (11): 1672–82. doi : 10.1016/j.str.2011.08.010 . PMC 3217190 . PMID 22078566 .
- ^ Dyer A, Brown G, Stejskal L, Laity PR, Bingham RJ (2015). «Внешняя мембрана Borrelia Afzelii белок Bapko_0422 связывает человеческий фактор-H и прогнозируется, что он образует мембранный β-болот» . Отчеты о биологии . 35 (4): E00240. doi : 10.1042/bsr20150095 . PMC 4613713 . PMID 26181365 .
 | Эта статья, связанная с мембранным белком, является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |