Иерсиния пестис
Иерсиния пестис | |
---|---|
Сканирующая электронная микрофотография, изображающая массу бактерий Yersinia pestis в передней кишке инфицированной блохи. | |
Научная классификация | |
Домен: | Бактерии |
Тип: | Псевдомонадота |
Сорт: | Гаммапротеобактерии |
Заказ: | Энтеробактерии |
Семья: | Иерсиниевые |
Род: | Иерсиния |
Разновидность: | Ю. пестис |
Биномиальное имя | |
Иерсиния пестис (Леманн и Нейман, 1896 г.) Ван Логем, 1944 год. | |
Синонимы | |
|
Yersinia pestis ( Y. pestis ; ранее Pasteurella pestis ) — грамотрицательная , неподвижная , коккобактерия произошел без спор, родственная как Yersinia enterocolitica , так и Yersinia pseudotuberculosis , возбудителю, из которого pestis. Y. [1] [2] и ответственен за дальневосточную скарлатоподобную лихорадку . Это факультативный анаэробный организм , который может заразить человека через восточную крысиную блоху ( Xenopsylla cheopis ). [3] Он вызывает болезнь чума , которая вызвала чуму Юстиниана и Черную смерть , самую смертоносную пандемию в зарегистрированной истории. Чума принимает три основные формы: легочную , септицемическую и бубонную . Yersinia pestis является паразитом своего хозяина, крысиной блохи , которая также является паразитом крыс, следовательно, Y. pestis является гиперпаразитом .
Y. pestis был обнаружен в 1894 году Александром Йерсеном , швейцарско-французским врачом и бактериологом из Института Пастера , во время эпидемии чумы в Гонконге . [4] [5] Йерсен был представителем школы Пастера . Китасато Сибасабуро , японский бактериолог, практиковавший методологию Коха . Поиском возбудителя чумы в то время занимался также [6] Однако Йерсен на самом деле связал чуму с бациллой, первоначально названной Pasteurella pestis ; он был переименован в Yersinia pestis в 1944 году .
по-прежнему поступает от одной до двух тысяч случаев чумы Ежегодно во Всемирную организацию здравоохранения . [7] При правильном антибиотиками лечении прогноз для пострадавших намного лучше, чем до того, как были разработаны антибиотики. Пяти-шестикратное увеличение числа случаев произошло в Азии во время войны во Вьетнаме , возможно, из-за нарушения экосистем и более тесной близости между людьми и животными. В настоящее время чума широко распространена в странах Африки к югу от Сахары и на Мадагаскаре, где сейчас приходится более 95% зарегистрированных случаев. Чума также оказывает пагубное воздействие на млекопитающих, кроме человека; [8] в Соединенных Штатах к ним относятся чернохвостая луговая собачка и находящийся под угрозой исчезновения черноногий хорек .
Общие характеристики
[ редактировать ]Y. pestis — неподвижная коккобацилла , факультативная анаэробная бактерия с биполярным окрашиванием (придающим ей вид английской булавки ), которая образует антифагоцитарный слой слизи. [9] Как и другие виды иерсиний , он дает отрицательный результат на уреазу , ферментацию лактозы и индол . [10] насчитывает 11 видов Род Yersinia , три из них вызывают заболевания человека. Двумя другими являются Yersinia pseudotuberculosis и Yersinia enterocolitica . Заражение любым из них обычно происходит при употреблении зараженной пищи или воды. [11]
Геном и протеом
[ редактировать ]Геном
[ редактировать ]несколько полных последовательностей генома Доступно для различных штаммов и подвидов Y. pestis : штамм KIM (биовара Y. p. Medievalis ), [12] и штамм CO92 (бивара Y.p. orientalis , полученного из клинического изолята в США). [13] В 2006 году было завершено секвенирование генома штамма биовара Antiqua . [14] Некоторые штаммы непатогенны, например штамм 91001 , последовательность которого была опубликована в 2004 году. [15]
КИМ | СО92 | 91001 | |
---|---|---|---|
длина (п.н.) | 4,600,755 | 4,653,728 | 4,595,065 |
белки, кодируемые | 4,198 | 4,012 | 4,037 |
псевдогены | 54 | 149 | 141 |
тРНК | 73 | 70 | 72 |
Плазмиды
[ редактировать ]Подобно Y. pseudotuberculosis и Y. enterocolitica , Y. pestis является хозяином плазмиды pCD1. Он также содержит две другие плазмиды, pPCP1 (также называемые pPla или pPst) и pMT1 (также называемые pFra), которые не передаются другими видами Yersinia . pFra кодирует фосфолипазу D , которая важна для способности Y. pestis передаваться блохами. [16] pPla кодирует протеазу Pla , которая активирует плазмин у человека-хозяина и является очень важным фактором вирулентности легочной чумы. [17] Вместе эти плазмиды и остров патогенности, называемый HPI, кодируют несколько белков, которые вызывают патогенез, которым Y. pestis известен . Помимо прочего, эти факторы вирулентности необходимы для бактериальной адгезии и инъекции белков в клетку-хозяина, инвазии бактерий в клетку-хозяина (через систему секреции типа III ), а также приобретения и связывания железа, полученного из эритроцитов ( сидерофоры ) . Y. pestis Считается, что произошел от Y. pseudotuberculosis ; исследования ДНК показали, что они схожи на 83%, что достаточно высоко, чтобы считаться одним и тем же видом. В 1981 году было предложено реклассифицировать Y. pestis в подвид Y. pseudotuberculosis , но Судебная комиссия Международного комитета систематической бактериологии отказалась сделать это, поскольку течение болезни Y. pestis сильно отличается от течения Y. pestis. псевдотуберкулез , который обычно вызывает легкую диарею, такая реклассификация может вызвать путаницу. [18]
Протеом
[ редактировать ]комплексный и сравнительный протеомный анализ штамма KIM Y. pestis . В 2006 г. был проведен [19] Анализ был сосредоточен на росте в четырех различных наборах условий, которые были разработаны для моделирования хозяев-блох и млекопитающих. [19]
Малая некодирующая РНК
[ редактировать ]многочисленные бактериальные малые некодирующие РНК Было обнаружено, что выполняют регуляторные функции. Некоторые из них могут регулировать гены вирулентности. Около 63 новых предполагаемых мРНК были идентифицированы посредством глубокого секвенирования мРНК-ома Y. pestis . Среди них был Yersinia -специфичный (также присутствующий у Y. pseudotuberculosis и Y. enterocolitica ) Ysr141 ( малая РНК Yersinia 141). Было показано, что мРНК Ysr141 регулирует синтез эффекторного белка системы секреции типа III (T3SS) YopJ. [20] Yop-Ysc T3SS является важнейшим компонентом вирулентности видов Yersinia . [21] Многие новые мРНК были идентифицированы из Y. pestis, выращенного in vitro и в инфицированных легких мышей, что позволяет предположить, что они играют роль в физиологии и патогенезе бактерий. Среди них предсказано, что sR035 будет спариваться с областью SD и сайтом инициации транскрипции термочувствительного регулятора ymoA, а sR084, как предсказано, будет спариваться с мехом, регулятором поглощения железа . [22]
Патогенез и иммунитет
[ редактировать ]В городском и лесном (лесном) циклах Y. pestis большая часть распространения происходит между грызунами и блохами. В лесном цикле грызун является диким, но в городском грызуном является преимущественно бурая крыса ( Rattus norvegicus ). Кроме того, Y. pestis может распространяться из городской среды и обратно. Передача человеку обычно происходит через укус инфицированных блох. Если заболевание перешло в легочную форму, люди могут передать бактерию другим воздушно-капельным путем; другие, заразившиеся чумой таким образом, в большинстве случаев сами заражаются легочной формой. [23]
Млекопитающие как хозяева
[ редактировать ]Несколько видов грызунов служат основным резервуаром Y. pestis в окружающей среде. Считается, что в степях естественным резервуаром является в основном сурок . Считается, что на западе США несколько видов грызунов являются носителями Y. pestis . Однако ожидаемая динамика заболевания не была обнаружена ни у одного грызуна. Известно, что несколько видов грызунов обладают переменной устойчивостью, что может привести к бессимптомному статусу носителя . [24] Имеющиеся данные указывают на то, что блохи других млекопитающих играют роль во вспышках чумы среди людей. [25]
Недостаток знаний о динамике чумы среди видов млекопитающих также характерен для восприимчивых грызунов, таких как чернохвостая луговая собачка ( Cynomys ludovicianus ), у которой чума может вызвать коллапс колонии, что приводит к массовому воздействию на пищевые сети прерий. [26] Однако динамика передачи инфекции среди луговых собачек не соответствует динамике заблокированных блох; Вместо этого могут иметь значение трупы, незаблокированные блохи или другой переносчик. [27]
Штамм CO92 был выделен от пациента, умершего от пневмонии и заразившегося от зараженной кошки. [13]
В других регионах мира резервуар инфекции четко не идентифицирован, что усложняет программы профилактики и раннего предупреждения. Одним из таких примеров была вспышка в 2003 году в Алжире . [28]
Блохи как вектор
[ редактировать ]Передача Y. pestis блохами хорошо изучена. [29] Первоначальное заражение Y. pestis переносчиком происходит во время кормления инфицированным животным. Затем несколько белков способствуют поддержанию бактерий в пищеварительном тракте блох, в том числе система хранения гемина и токсин иерсинии мышиный (Ymt). Хотя Ymt очень токсичен для грызунов и когда-то считалось, что он вырабатывается для обеспечения повторного заражения новых хозяев, он необходим для колонизации блох и выживания Y. pestis у блох. [16] [13]
Система хранения гемина играет важную роль в передаче Y. pestis обратно хозяину-млекопитающему. [30] Находясь в насекомом-переносчике, белки, кодируемые генетическими локусами системы хранения гемина, индуцируют образование биопленок в преджелудке , клапане, соединяющем среднюю кишку с пищеводом . [31] [32] Наличие этой биопленки, вероятно, необходимо для стабильного заражения блох. [33] Агрегация в биопленке препятствует питанию, так как образуется масса свернувшейся крови и бактерий (называемая «блоком Бэко» по имени энтомолога А. В. Бако , первого описавшего это явление). [34] Передача Y. pestis происходит во время тщетных попыток блохи питаться. Проглоченная кровь перекачивается в пищевод, где она вытесняет бактерии, застрявшие в преджелудке, которые срыгиваются обратно в кровеносную систему хозяина. [34]
У людей и других восприимчивых хозяев
[ редактировать ]Патогенез, вызванный Y. pestis, инфицированием млекопитающих обусловлен несколькими факторами, включая способность этих бактерий подавлять и избегать нормальных реакций иммунной системы, таких как фагоцитоз и выработка антител . Укусы блох позволяют бактериям проникать через кожный барьер. Y. pestis экспрессирует активатор плазмина , который является важным фактором вирулентности легочной чумы и может разрушаться на сгустках крови, способствуя систематической инвазии. [17] бактерий Многие факторы вирулентности имеют антифагоцитарную природу. Два важных антифагоцитарных антигена , названные F1 (фракция 1) и V или LcrV , важны для вирулентности . [9] Эти антигены вырабатываются бактерией при нормальной температуре тела человека. Более того, Y. pestis выживает и продуцирует антигены F1 и V, находясь в лейкоцитах, таких как моноциты , но не в нейтрофилах . Естественный или индуцированный иммунитет достигается за счет продукции специфических опсонических антител против антигенов F1 и V; антитела против F1 и V индуцируют фагоцитоз нейтрофилов. [35]
Кроме того, система секреции типа III (T3SS) позволяет Y. pestis вводить белки в макрофаги и другие иммунные клетки. Эти белки, инъецированные T3SS, называемые внешними белками Yersinia (Yops), включают Yop B/D, которые образуют поры в мембране клетки-хозяина и связаны с цитолизом . YopO, YopH , YopM, YopT, YopJ и YopE вводятся в цитоплазму клеток-хозяев с помощью T3SS в пору, частично созданную YopB и YopD. [36] Введенные Yops ограничивают фагоцитоз и клеточные сигнальные пути, важные для врожденной иммунной системы , как обсуждается ниже. Кроме того, некоторые штаммы Y. pestis способны вмешиваться в передачу иммунных сигналов (например, предотвращая высвобождение некоторых цитокинов ). [37]
Y. pestis размножается внутри лимфатических узлов , где ему удается избежать разрушения клетками иммунной системы, такими как макрофаги . Способность Y. pestis ингибировать фагоцитоз позволяет ему расти в лимфатических узлах и вызывать лимфаденопатию . YopH представляет собой протеин-тирозинфосфатазу , которая способствует способности Y. pestis уклоняться от клеток иммунной системы. [38] Было показано, что в макрофагах YopH дефосфорилирует p130Cas , Fyb ( FYN- связывающий белок) SKAP-HOM и Pyk , тирозинкиназу, гомологичную FAK . YopH также связывает субъединицу p85 фосфоинозитид-3-киназы , Gab1 , адаптерные белки Gab2 и Vav фактор обмена гуаниновых нуклеотидов . [ нужна ссылка ]
YopE действует как белок, активирующий ГТФазу для членов семейства ГТФаз Rho, таких как RAC1 . YopT представляет собой цистеиновую протеазу , которая ингибирует RhoA путем удаления изопренильной группы , которая важна для локализации белка на клеточной мембране . Предполагается, что YopE и YopT действуют, ограничивая YopB/D-индуцированный цитолиз. [39] Это может ограничить функцию YopB/D по созданию пор, используемых для внедрения Yop в клетки-хозяева, и предотвратить YopB/D-индуцированный разрыв клеток-хозяев и высвобождение клеточного содержимого, которое будет привлекать и стимулировать реакцию иммунной системы. [ нужна ссылка ]
YopJ представляет собой ацетилтрансферазу , которая связывается с консервативной α-спиралью МАРК -киназы . [40] YopJ ацетилирует киназы MAPK по серинам и треонинам , которые в норме фосфорилируются во время активации MAP-киназного каскада . [41] [42] YopJ активируется в эукариотических клетках путем взаимодействия с фитиновой кислотой клетки-мишени (IP6). [43] Это нарушение активности протеинкиназы клетки-хозяина вызывает апоптоз макрофагов, и предполагается, что это важно для установления инфекции и уклонения от иммунного ответа хозяина. YopO представляет собой протеинкиназу, также известную как Yersinia протеинкиназа A (YpkA). YopO является мощным индуктором апоптоза макрофагов человека. [44]
Также было высказано предположение, что бактериофаг Ypφ мог быть ответственен за повышение вирулентности этого организма. [45]
В зависимости от того, какой формой чумы заразился человек, у чумы развивается различное заболевание; однако чума в целом влияет на способность клетки-хозяина взаимодействовать с иммунной системой, мешая организму доставлять фагоцитарные клетки в зону заражения.
Y. pestis — универсальный убийца. Известно, что помимо грызунов и людей он убивал верблюдов, кур и свиней. [46] Домашние собаки и кошки также восприимчивы к чуме, но кошки с большей вероятностью заболеют при заражении. В любом случае симптомы аналогичны тем, которые испытывают люди, и могут быть смертельными для животного. Люди могут заразиться при контакте с инфицированным животным (мертвым или живым) или вдыхая в воздух инфекционные капли, которые больная собака или кошка откашляла. [47] [48]
Иммунитет
[ редактировать ]Вакцина формалином , инактивированная , была доступна в США для взрослых в 1993 году. [49] подвергаются высокому риску заражения чумой до тех пор, пока Управление по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов не устранит их с рынка . Оно имело ограниченную эффективность и могло вызвать сильное воспаление . Эксперименты по генной инженерии вакцины на основе антигенов F1 и V продолжаются и являются многообещающими. Однако бактерии, лишенные антигена F1, по-прежнему вирулентны, а антигены V достаточно вариабельны, поэтому вакцины, состоящие из этих антигенов, могут не обеспечивать полную защиту. [50] обнаружил Медицинский научно-исследовательский институт инфекционных заболеваний армии США , что экспериментальная вакцина на основе антигена F1/V защищает макак, питающихся крабоедами , но не защищает виды африканских зеленых мартышек . [51] Систематический обзор, проведенный Кокрейновским сотрудничеством, не выявил исследований достаточного качества, чтобы сделать какое-либо заявление об эффективности вакцины. [52]
Изоляция и идентификация
[ редактировать ]В 1894 году два бактериолога, Александр Йерсен из Швейцарии и Китасато Сибасабуро из Японии, независимо выделили в Гонконге бактерию, ответственную за гонконгскую чуму 1894 года . Хотя оба исследователя сообщили о своих выводах, серия запутанных и противоречивых заявлений Китасато в конечном итоге привела к признанию Йерсина основным первооткрывателем организма. Йерсен назвал его Pasteurella pestis в честь Института Пастера , где он работал. В 1967 году его перевели в новый род и переименовали в Yersinia pestis в его честь . Йерсен также отмечал, что крысы поражались чумой не только во время эпидемий чумы, но и часто предшествующих таким эпидемиям у людей и что чума многими местными жителями рассматривалась как болезнь крыс; Жители деревень в Китае и Индии утверждали, что, когда было обнаружено большое количество крыс, вскоре последовали вспышки чумы. [ нужна ссылка ]
В 1898 году французский учёный Поль-Луи Симон (который также приехал в Китай для борьбы с Третьей пандемией) обнаружил переносчика крысиных блох , вызывающего болезнь. Он отметил, что заболевшим людям не обязательно находиться в тесном контакте друг с другом, чтобы заразиться. В провинции Юньнань , Китай, жители бежали из своих домов, как только видели дохлых крыс, а на острове Формоза ( Тайвань ) жители считали, что обращение с дохлыми крысами повышает риск развития чумы. Эти наблюдения заставили его заподозрить, что блохи могут быть промежуточным фактором в передаче чумы, поскольку люди заражались чумой только в том случае, если они контактировали с крысами, умершими менее 24 часов назад. В ставшим уже классическим эксперименте Саймонд продемонстрировал, как здоровая крыса умерла от чумы после того, как на нее перепрыгнули зараженные блохи от крысы, недавно умершей от чумы. [53] Вспышка распространилась на Чайнатаун в Сан-Франциско с 1900 по 1904 год, а затем на Окленд и Ист-Бэй с 1907 по 1909 год. [54] С тех пор он присутствует у грызунов западной части Северной Америки, поскольку страх перед последствиями вспышки для торговли заставил власти скрывать трупы жителей Чайнатауна достаточно долго, чтобы болезнь передалась широко распространенным видам местных грызунов в отдаленных районах. области. [55]
Выделяют три основных штамма: Y.p. antiqua , вызвавшая пандемию чумы в шестом веке; Ю.п. Medievalis , вызвавший Черную смерть и последующие эпидемии во время второй волны пандемии; и Ю.п. orientalis , ответственный за нынешние вспышки чумы. [56]
21 век
[ редактировать ]15 января 2018 года исследователи из Университета Осло и Университета Феррары предположили, что люди и их паразиты (на тот момент скорее всего блохи и вши) были крупнейшими переносчиками чумы. [57] [58]
Древние доказательства ДНК
[ редактировать ]В 2010 году исследователи из Германии, используя данные ПЦР из образцов, полученных от жертв Черной смерти, окончательно установили, что Y. pestis был причиной средневековой Черной смерти . [59]
В 2011 году был опубликован первый геном Y. pestis, выделенный от жертв Черной смерти, и был сделан вывод, что этот средневековый штамм был предком большинства современных форм Y. pestis . [60]
В 2015 году Cell опубликовала результаты исследования древних могил. [61] Плазмиды Y. pestis обнаружены в археологических образцах зубов семи человек бронзового века, в афанасьевской культуре в Сибири, культуре шнуровой керамики в Эстонии, синташтинской культуре в России, унетицкой культуре в Польше и андроновской культуре в Сибирь. [62] В 2018 году были опубликованы данные о возникновении и распространении возбудителя во время упадка неолита (еще 6000 лет назад). [63] Источником доказательств ДНК было место в Швеции, и в качестве вероятного пути распространения были предложены торговые сети, а не миграция населения. Есть данные, позволяющие предположить, что Y. pestis мог возникнуть в Европе, в культуре Кукутени-Триполье , а не в Азии, как принято считать. [63]
Данные ДНК, опубликованные в 2015 году, указывают на то, что люди, зараженные Y. pestis , 5000 лет назад в Евразии бронзового века . [61] но генетические изменения, которые сделали его очень опасным, произошли только около 4000 лет назад. [64] Высоковирулентная версия, способная передаваться блохами через грызунов, людей и других млекопитающих, была обнаружена у двух особей, связанных со срубной культурой из Самарской области в России, примерно 3800 лет назад, и у особи железного века из Капана , Армения, примерно из 2900 лет назад. [64] [61] по крайней мере две линии Y. pestis . Это указывает на то, что в бронзовом веке в Евразии циркулировали [64] Бактерия Y. pestis имеет относительно большое количество нефункционирующих генов и три «неуклюжие» плазмиды, что позволяет предположить ее происхождение менее 20 000 лет назад. [46] Один такой штамм был идентифицирован примерно 4000 лет назад («линия LNBA» (линия позднего неолита и бронзового века)) в западной Британии, что указывает на то, что эта легко заразная форма распространилась из Евразии на дальние северо-западные окраины Европы. [65]
В 2016 году бактерия Y. pestis была идентифицирована по ДНК в зубах, найденных на строительной площадке Crossrail в Лондоне . Человеческие останки оказались жертвами Великой лондонской чумы , продолжавшейся с 1665 по 1666 год. [66]
В 2021 году исследователи обнаружили 5000-летнюю жертву Y. pestis , старейшего из известных в мире видов, среди останков охотников-собирателей на современной границе Латвии и Эстонии. [67]
Между 5300 и 4900 YBP население неолитических фермеров в Северной Европе претерпело заметное сокращение. Не установлено, было ли это результатом спада в сельском хозяйстве или заражения Y. pestis среди населения. Исследование неолитических могил в Дании и западной Швеции, проведенное в 2024 году, пришло к выводу, что чума была достаточно широко распространена, чтобы стать причиной упадка численности населения. [68]
События
[ редактировать ]В период с 1970 по 2020 год в США было зарегистрировано 496 случаев. Случаи были обнаружены преимущественно в Нью-Мексико, Аризоне, Колорадо, Калифорнии, Орегоне и Неваде. [69]
В 2008 году чума обычно встречалась в странах Африки к югу от Сахары и на Мадагаскаре, на территории которых приходилось более 95% зарегистрированных случаев. [8]
В сентябре 2009 года смерть Малкольма Касадабана , молекулярной генетики профессора Чикагского университета , была связана с его работой над ослабленным лабораторным штаммом Y. pestis . [70] Было высказано предположение, что гемохроматоз стал предрасполагающим фактором смерти Касадабана от этого ослабленного штамма, использованного для исследования. [71]
3 ноября 2019 года в больнице пекинского района Чаоян было диагностировано два случая легочной чумы , что вызвало опасения по поводу вспышки. Пациентом был мужчина средних лет с лихорадкой, который жаловался на затрудненное дыхание в течение примерно десяти дней вместе со своей женой с аналогичными симптомами. [72] Полиция изолировала отделение неотложной помощи в больнице и установила контроль над китайскими агрегаторами новостей. [72] 18 ноября был зарегистрирован третий случай заболевания у 55-летнего мужчины из Лиги Силингол , одного из двенадцати монгольских автономных районов в Северном Китае. Пациент получил лечение, а 28 бессимптомных контактов были помещены в карантин. [73]
В июле 2020 года чиновники усилили меры предосторожности после того, как случай бубонной чумы был подтвержден в Баяннуре Китая , городе в автономном районе Внутренняя Монголия . Пациента поместили на карантин и назначили лечение. По сообщению китайской газеты Global Times , был также расследован второй предполагаемый случай, и было объявлено предупреждение уровня 3, действующее до конца года. Он запретил охоту и поедание животных, которые могут быть переносчиками чумы, и призвал общественность сообщать о подозрительных случаях. [74]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Ахтман, Марк; Цурт, Керстин; Морелли, Джованна; Торреа, Габриэла; Гиюль, Энни; Карниэль, Элизабет (23 ноября 1999 г.). «Yersinia pestis, возбудитель чумы, является недавно появившимся клоном Yersinia pseudotuberculosis» . Труды Национальной академии наук . 96 (24): 14043–14048. Бибкод : 1999PNAS...9614043A . дои : 10.1073/pnas.96.24.14043 . ISSN 0027-8424 . ПМК 24187 . ПМИД 10570195 .
- ^ МакНелли, Алан; Томсон, Николас Р.; Рейтер, Сандра; Рен, Брендан В. (март 2016 г.). « Добавить, перемешать и уменьшить»: виды Yersinia как модельные бактерии для эволюции патогенов» (PDF) . Обзоры природы Микробиология . 14 (3): 177–190. дои : 10.1038/nrmicro.2015.29 . ISSN 1740-1534 . ПМИД 26876035 . S2CID 21267985 .
- ^ Райан, Кей Джей; Рэй, CG, ред. (2004). Медицинская микробиология Шерриса (4-е изд.). МакГроу Хилл. стр. 484–88 . ISBN 978-0-8385-8529-0 .
- ^ Йерсен, Александр (1894). «Бубонная чума в Гонконге» . Анналы Института Пастера (на французском языке). 8 :662–67.
- ^ Бокемюль, Дж (апрель 1994 г.). «100 лет после открытия возбудителя чумы — важность и почитание Александра Йерсена во Вьетнаме сегодня». Иммунитет и инфекция . 22 (2): 72–5. ПМИД 7959865 .
- ^ Ховард-Джонс, Н. (1973). «Был ли Сибасабуро Китасато одним из первооткрывателей чумной бациллы?». Перспективы биологии и медицины . 16 (2): 292–307. дои : 10.1353/pbm.1973.0034 . ПМИД 4570035 . S2CID 31767623 .
- ^ «Часто задаваемые вопросы по чуме» . CDC. 15 ноября 2021 г.
- ^ Jump up to: а б «Чума» , Центры по контролю и профилактике заболеваний, октябрь 2017 г. В данную статью включен текст из этого источника, находящегося в свободном доступе .
- ^ Jump up to: а б Коллинз FM (1996). барон С; и др. (ред.). Пастерелла , Иерсиния и Францицелла . В: Медицинская микробиология Барона (4-е изд.). унив. Техасского медицинского отделения. ISBN 978-0-9631172-1-2 .
- ^ Штакебрандт, Эрко; Дворкин, Мартин; Фалькоу, Стэнли; Розенберг, Юджин; Карл-Хайнц Шляйфер (2005). Прокариоты: Справочник по биологии бактерий: Том 6: Протеобактерии: подкласс гамма . Берлин: Шпрингер. ISBN 978-0-387-25499-9 .
- ^ Пария, Южная Каролина (2023). «Иерсиния, Пастерелла и Францицелла». Учебник микробиологии и иммунологии . Сингапур: Спрингер. ISBN 978-981-19-3315-8 .
- ^ Дэн В., Берланд В., Планкетт Г., Бутин А., Мэйхью Г.Ф., Лисс П. и др. (август 2002 г.). «Последовательность генома Yersinia pestis KIM» . Журнал бактериологии . 184 (16): 4601–11. дои : 10.1128/JB.184.16.4601-4611.2002 . ПМЦ 135232 . ПМИД 12142430 .
- ^ Jump up to: а б с Паркхилл Дж., Рен Б.В., Томсон Н.Р., Титбол Р.В., Холден М.Т., Прентис М.Б. и др. (октябрь 2001 г.). «Последовательность генома Yersinia pestis, возбудителя чумы» . Природа . 413 (6855): 523–7. Бибкод : 2001Natur.413..523P . дои : 10.1038/35097083 . ПМИД 11586360 .
- ^ Чейн П.С., Ху П., Малфатти С.А., Раднедж Л., Лаример Ф., Вергез Л.М. и др. (июнь 2006 г.). «Полная последовательность генома штаммов Yersinia pestis Antiqua и Nepal516: свидетельства редукции генов в новом патогене» . Журнал бактериологии . 188 (12): 4453–63. дои : 10.1128/JB.00124-06 . ПМК 1482938 . ПМИД 16740952 .
- ^ Jump up to: а б Сун, Цзюньчжун; Ван, Ли; Хань, Чжан, Цзяньго; Чжоу, Дуншэн; Пан, Синь (2004-06-30). последовательность авирулентного . ДНК pestis 91001 « Полная генома штамма для исследования , » Yersinia человека
- ^ Jump up to: а б Хиннебуш Б.Дж., Рудольф А.Е., Черепанов П., Диксон Дж.Е., Шван Т.Г., Форсберг А. (апрель 2002 г.). «Роль мышиного токсина Yersinia в выживании Yersinia pestis в средней кишке переносчика блох». Наука 296 (5568): 733–5. Бибкод : 2002Sci...296..733H . дои : 10.1126/science.1069972 . ПМИД 11976454 . S2CID 34770234 .
- ^ Jump up to: а б Латем В.В., Прайс П.А., Миллер В.Л., Голдман В.Е. (январь 2007 г.). «Протеаза, активирующая плазминоген, специфически контролирует развитие первичной легочной чумы». Наука . 315 (5811): 509–13. Бибкод : 2007Sci...315..509L . дои : 10.1126/science.1137195 . ПМИД 17255510 . S2CID 39881239 .
- ^ Чжижен Ци; Юджун Цуй. «Глава 3 Таксономия Yersinia pestis». Ин Ян, Р.; Анисимов А. (ред.). Yersinia pestis: ретроспектива и перспектива . Спрингер. дои : 10.1007/978-94-024-0890-4_3 . ISBN 978-94-024-0890-4 .
- ^ Jump up to: а б Хиксон К.К., Адкинс Дж.Н., Бейкер С.Е., Мур Р.Дж., Хроми Б.А., Смит Р.Д. и др. (ноябрь 2006 г.). «Идентификация кандидатов в биомаркеры у Yersinia pestis с использованием полуколичественной протеомики всего организма». Журнал исследований протеома . 5 (11): 3008–17. дои : 10.1021/pr060179y . ПМИД 17081052 .
- ^ Скиано Калифорния, Ку Дж.Т., Шипма М.Дж., Колфилд А.Дж., Джафари Н., Латем В.В. (май 2014 г.). «Полногеномный анализ малых РНК, экспрессируемых Yersinia pestis, идентифицирует регулятор системы секреции Yop-Ysc типа III» . Журнал бактериологии . 196 (9): 1659–70. дои : 10.1128/JB.01456-13 . ПМЦ 3993326 . ПМИД 24532772 .
- ^ Корнелис Г.Р., Боланд А., Бойд А.П., Геуйен С., Ириарте М., Нейт С. и др. (декабрь 1998 г.). «Плазмида вирулентности иерсинии, геном антихозяина» . Обзоры микробиологии и молекулярной биологии . 62 (4): 1315–52. дои : 10.1128/MMBR.62.4.1315-1352.1998 . ПМК 98948 . ПМИД 9841674 .
- ^ Ян Ю, Су С, Мэн Х, Цзи Икс, Цюй Ю, Лю Цз и др. (2013). «Определение экспрессии мРНК с помощью секвенирования РНК в Yersinia pestis, выращенной in vitro и во время инфекции» . ПЛОС ОДИН . 8 (9): е74495. Бибкод : 2013PLoSO...874495Y . дои : 10.1371/journal.pone.0074495 . ПМК 3770706 . ПМИД 24040259 .
- ^ Инглесби, Томас В.; Деннис, Дэвид Т. (3 мая 2000 г.). «Чума как биологическое оружие. Управление медициной и общественным здравоохранением». Журнал Американской медицинской ассоциации . 283 (17). дои : 10.1001/jama.283.17.2281 .
- ^ Мейер К.Ф. (август 1957 г.). «Естественная история чумы и орнитоза» . Отчеты общественного здравоохранения . 72 (8): 705–19. дои : 10.2307/4589874 . JSTOR 4589874 . ПМК 2031327 . ПМИД 13453634 .
- ^ фон Рейн К.Ф., Вебер Н.С., Темпест Б., Барнс А.М., Польша Дж.Д., Бойс Дж.М., Залма В. (октябрь 1977 г.). «Эпидемиологические и клинические особенности вспышки бубонной чумы в Нью-Мексико». Журнал инфекционных болезней . 136 (4): 489–94. дои : 10.1093/infdis/136.4.489 . ПМИД 908848 .
- ^ Паули Дж.Н., Бускирк С.В., Уильямс Э.С., Эдвардс У.Х. (январь 2006 г.). «Эпизоотика чумы у чернохвостой луговой собачки (Cynomys ludovicianus)» . Журнал болезней дикой природы . 42 (1): 74–80. дои : 10.7589/0090-3558-42.1.74 . ПМИД 16699150 . S2CID 9716200 .
- ^ Уэбб К.Т., Брукс К.П., Гейдж К.Л., Антолин М.Ф. (апрель 2006 г.). «Классическая передача через блох не приводит к эпизоотиям чумы у луговых собачек» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 103 (16): 6236–41. Бибкод : 2006PNAS..103.6236W . дои : 10.1073/pnas.0510090103 . ПМЦ 1434514 . ПМИД 16603630 .
- ^ Бертерат Э., Бехуча С., Чуграни С., Разик Ф., Дюшемен Ж.Б., Хути Л. и др. (октябрь 2007 г.). «Возрождение чумы в Алжире через 50 лет, 2003 г.» . Новые инфекционные заболевания . 13 (10): 1459–62. дои : 10.3201/eid1310.070284 . ПМЦ 2851531 . ПМИД 18257987 .
- ^ Чжоу Д., Хан Ю, Ян Р. (январь 2006 г.). «Молекулярные и физиологические данные о передаче, вирулентности и этиологии чумы». Микробы и инфекции . 8 (1): 273–84. дои : 10.1016/j.micinf.2005.06.006 . ПМИД 16182593 .
- ^ Хиннебуш Б.Дж., Перри Р.Д., Шван Т.Г. (июль 1996 г.). «Роль локуса хранения гемина (hms) Yersinia pestis в передаче чумы блохами». Наука . 273 (5273): 367–370. Бибкод : 1996Sci...273..367H . дои : 10.1126/science.273.5273.367 . ПМИД 8662526 . S2CID 37512575 .
- ^ Эриксон Д.Л., Уотерфилд Н.Р., Вадивалоо В., Лонг Д., Фишер Э.Р., Френч-Констант Р., Хиннебуш Б.Дж. (ноябрь 2007 г.). «Острая оральная токсичность Yersinia pseudotuberculosis для блох: последствия для эволюции трансмиссивной передачи чумы» . Клеточная микробиология . 9 (11): 2658–66. дои : 10.1111/j.1462-5822.2007.00986.x . ПМИД 17587333 . S2CID 36769530 .
- ^ Джарретт К.О., Дик Э., Ишервуд К.Е., Ойстон П.С., Фишер Э.Р., Уитни А.Р. и др. (август 2004 г.). «Передача Yersinia pestis от инфекционной биопленки блох-переносчиков» . Журнал инфекционных болезней . 190 (4): 783–92. дои : 10.1086/422695 . ПМИД 15272407 .
- ^ Эриксон Д.Л., Джарретт К.О., Рен Б.В., Хиннебуш Б.Дж. (февраль 2006 г.). «Различия серотипов и отсутствие образования биопленок характеризуют инфекцию Yersinia pseudotuberculosis, вызванную блохами-переносчиками Xenopsylla cheopis Yersinia pestis» . Журнал бактериологии . 188 (3): 1113–9. дои : 10.1128/jb.188.3.1113-1119.2006 . ПМЦ 1347331 . ПМИД 16428415 .
- ^ Jump up to: а б Хиннебуш Б.Дж., Эриксон Д.Л. (2008). « Биопленка Yersinia pestis у блох-переносчиков и ее роль в передаче чумы». В Ромео Т (ред.). Бактериальные биопленки . Актуальные темы микробиологии и иммунологии. Том. 322. Спрингер. стр. 229–248. дои : 10.1007/978-3-540-75418-3_11 . ISBN 978-3-540-75417-6 . ПМЦ 3727414 . ПМИД 18453279 .
- ^ Сальерс А.А., Уитт Д.Д. (2002). Бактериальный патогенез: молекулярный подход (2-е изд.). АСМ Пресс. стр. 207–212.
- ^ Вибуд Г.И., Блиска Дж.Б. (2005). «Внешние белки иерсинии: роль в модуляции сигнальных реакций и патогенеза клетки-хозяина». Ежегодный обзор микробиологии . 59 (№1): 69–89. дои : 10.1146/annurev.micro.59.030804.121320 . ПМИД 15847602 .
- ^ Демер, Кристиан Э.; Дюсюрже, Оливье (3 апреля 2019 г.). «Yersinia pestis и чума: обновленный взгляд на эволюцию, детерминанты вирулентности, иммунную подрывную деятельность, вакцинацию и диагностику» . Гены и иммунитет . 20 . дои : 10.1038/s41435-019-0065-0 . ПМК 6760536 . Проверено 14 июня 2024 г.
- ^ де ла Пуэрта М.Л., Тринидад А.Г., дель Кармен Родригес М., Богец Х., Санчес Креспо М., Мустелин Т. и др. (февраль 2009 г.). Бозза П. (ред.). «Характеристика новых субстратов, на которые воздействует тирозинфосфатаза Yersinia YopH» . ПЛОС ОДИН . 4 (2): е4431. Бибкод : 2009PLoSO...4.4431D . дои : 10.1371/journal.pone.0004431 . ПМЦ 2637541 . ПМИД 19221593 .
- ^ Мехиа Э., Блиска Ж.Б., Вибуд Г.И. (январь 2008 г.). «Иерсиния контролирует доставку эффекторов типа III в клетки-хозяева, модулируя активность Rho» . ПЛОС Патогены . 4 (1): e3. doi : 10.1371/journal.ppat.0040003 . ПМК 2186360 . ПМИД 18193942 .
- ^ Хао Й.Х., Ван Й., Бердетт Д., Мукерджи С., Кейтани Г., Голдсмит Э., Орт К. (январь 2008 г.). Кобе Б. (ред.). «Структурные требования для ингибирования Yersinia YopJ путей MAP-киназы» . ПЛОС ОДИН . 3 (1): e1375. Бибкод : 2008PLoSO...3.1375H . дои : 10.1371/journal.pone.0001375 . ПМК 2147050 . ПМИД 18167536 .
- ^ Мукерджи С., Кейтани Дж., Ли Й., Ван Й., Болл Х.Л., Голдсмит Э.Дж., Орт К. (май 2006 г.). «Иерсиния YopJ ацетилирует и ингибирует активацию киназы, блокируя фосфорилирование». Наука . 312 (5777): 1211–4. Бибкод : 2006Sci...312.1211M . дои : 10.1126/science.1126867 . ПМИД 16728640 . S2CID 13101320 .
- ^ Миттал Р., Пик-Чью С.Ю., МакМахон Х.Т. (декабрь 2006 г.). «Ацетилирование остатков петли активации MEK2 и I каппа B киназы (IKK) с помощью YopJ ингибирует передачу сигналов» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 103 (49): 18574–9. Бибкод : 2006PNAS..10318574M . дои : 10.1073/pnas.0608995103 . ПМЦ 1654131 . ПМИД 17116858 .
- ^ Миттал Р., Пик-Чью С.Ю., Шаде Р.С., Валлис Ю., МакМахон Х.Т. (июнь 2010 г.). «Ацетилтрансферазная активность бактериального токсина YopJ иерсинии активируется эукариотической клеткой-хозяином инозитолгексакисфосфатом» . Журнал биологической химии . 285 (26): 19927–34. дои : 10.1074/jbc.M110.126581 . ПМЦ 2888404 . ПМИД 20430892 .
- ^ Пак Х, Теджа К., О'Ши Джей Джей, Сигел Р.М. (май 2007 г.). «Эффекторный белок Yersinia YpkA индуцирует апоптоз независимо от деполимеризации актина» . Журнал иммунологии . 178 (10): 6426–34. дои : 10.4049/jimmunol.178.10.6426 . ПМИД 17475872 .
- ^ Дербиз А., Шеналь-Франсиск В., Пуйо Ф., Файоль С., Прево М.С., Медиг С. и др. (февраль 2007 г.). «Горизонтально приобретенный нитчатый фаг способствует патогенности чумной бациллы» . Молекулярная микробиология . 63 (4): 1145–57. дои : 10.1111/j.1365-2958.2006.05570.x . ПМИД 17238929 . S2CID 30862265 .
- ^ Jump up to: а б Келли Дж (2005). Великая смертность: интимная история Черной смерти (1-е изд.). Лондон [ua]: Четвертая власть. п. 35. ISBN 978-0007150694 .
- ^ «Кошки – здоровые домашние животные, здоровые люди» . Центры по контролю и профилактике заболеваний. 13 мая 2016 г. Проверено 25 ноября 2016 г.
- ^ «Собаки – здоровые домашние животные, здоровые люди» . Центры по контролю и профилактике заболеваний. 21 февраля 2020 г. Проверено 30 июня 2020 г.
- ^ Лист, The Pink (21 ноября 1994 г.). «GREER LABORATORIES ОДОБРЕНА ВАКЦИНА ОТ БУБОНИЧЕСКОЙ ЧУМЫ» . Розовый лист .
- ^ Велкос С., Питт М.Л., Мартинес М., Фридлендер А., Фогель П., Таммариелло Р. (май 2002 г.). «Определение вирулентности штаммов Yersinia pestis с дефицитом пигментации и активатора пигментации/плазминогена на моделях легочной чумы, отличных от человека, на приматах и мышах». Вакцина . 20 (17–18): 2206–14. дои : 10.1016/S0264-410X(02)00119-6 . ПМИД 12009274 .
- ^ Питт М.Л. (13 октября 2004 г.). Нечеловеческие приматы как модель легочной чумы (PDF) . Семинар по моделям животных и коррелятам защиты для вакцин против чумы, Гейтерсбург, Мэриленд. Центр оценки и исследований биологических препаратов (Управление по контролю за продуктами и лекарствами, Департамент здравоохранения и человеческих ресурсов). стр. 222–248. Архивировано из оригинала (PDF) 25 декабря 2004 года.
- ^ Джефферсон Т., Демичели В., Пратт М. (2000). Джефферсон Т. (ред.). «Вакцины для профилактики чумы» . Кокрановская база данных систематических обзоров . 1998 (2): CD000976. дои : 10.1002/14651858.CD000976 . ПМК 6532692 . ПМИД 10796565 . Искусство. № CD000976.
- ^ «Чума» . Ассоциация Amicale Sante Navale et d'Outremer. Архивировано из оригинала 4 сентября 2012 года.
- ^ «В этот день: начинается вспышка бубонной чумы в Сан-Франциско» . В поисках Дульсинеи. 27 мая 2011 года . Проверено 25 ноября 2017 г.
- ^ Чейз, М. (2004). Берберийская чума: Черная смерть в викторианском Сан-Франциско . Случайные домашние торговые книги в мягкой обложке.
- ^ Ахтман М., Цурт К., Морелли Г., Торреа Г., Гиюль А., Карниэль Э. (ноябрь 1999 г.). «Yersinia pestis, возбудитель чумы, является недавно появившимся клоном Yersinia pseudotuberculosis» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 96 (24): 14043–8. Бибкод : 1999PNAS...9614043A . дои : 10.1073/pnas.96.24.14043 . ПМК 24187 . ПМИД 10570195 .
- ^ «Не вините крыс: человеческие блохи и вши, скорее всего, разносят черную смерть» . Новости ЦБК .
- ^ Дин К.Р., Крауэр Ф., Валлё Л., Лингьерде О.К., Браманти Б., Стенсет Н.К., Шмид Б.В. (февраль 2018 г.). «Эктопаразиты человека и распространение чумы в Европе во время Второй пандемии» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 115 (6): 1304–1309. Бибкод : 2018PNAS..115.1304D . дои : 10.1073/pnas.1715640115 . ПМК 5819418 . ПМИД 29339508 .
- ^ Хэнш С., Бьянуччи Р., Синьоли М., Раджерисон М., Шульц М., Качки С. и др. (октябрь 2010 г.). «Отдельные клоны Yersinia pestis стали причиной черной смерти» . ПЛОС Патогены . 6 (10): e1001134. дои : 10.1371/journal.ppat.1001134 . ПМЦ 2951374 . ПМИД 20949072 .
- ^ Бос К.И., Шунеманн В.Дж., Голдинг ГБ, Бурбано Х.А., Ваглехнер Н., Кумбс Б.К. и др. (октябрь 2011 г.). «Проект генома Yersinia pestis жертв Черной смерти» . Природа . 478 (7370): 506–10. Бибкод : 2011Natur.478..506B . дои : 10.1038/nature10549 . ПМК 3690193 . ПМИД 21993626 .
- ^ Jump up to: а б с Расмуссен С., Аллентофт М.Э., Нильсен К., Орландо Л., Сикора М., Шегрен К.Г. и др. (октябрь 2015 г.). «Ранние дивергентные штаммы Yersinia pestis в Евразии 5000 лет назад» . Клетка . 163 (3): 571–82. дои : 10.1016/j.cell.2015.10.009 . ПМЦ 4644222 . ПМИД 26496604 . Эта статья содержит цитаты из этого источника, который доступен по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International (CC BY 4.0) .
- ^ Циммер С (22 октября 2015 г.). «В древней ДНК обнаружены свидетельства чумы гораздо раньше, чем было известно ранее» . Нью-Йорк Таймс . ISSN 0362-4331 . Проверено 16 апреля 2020 г.
- ^ Jump up to: а б Раскован Н., Шегрен К.Г., Кристиансен К., Нильсен Р., Виллерслев Э., Десню К., Расмуссен С. (январь 2019 г.). «Появление и распространение базальных линий Yersinia pestis во время упадка неолита» . Клетка . 176 (1–2): 295–305.e10. дои : 10.1016/j.cell.2018.11.005 . ПМИД 30528431 .
- ^ Jump up to: а б с Спироу М.А., Тухбатова Р.И., Ван С.С., Валтуэнья А.А., Ланкапалли А.К., Кондрашин В.В. и др. (июнь 2018 г.). «Анализ геномов Yersinia pestis возрастом 3800 лет предполагает происхождение бубонной чумы в бронзовом веке» . Природные коммуникации . 9 (1): 2234. Бибкод : 2018NatCo...9.2234S . дои : 10.1038/s41467-018-04550-9 . ПМЦ 5993720 . ПМИД 29884871 . Эта статья содержит цитаты из этого источника, который доступен по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International (CC BY 4.0) .
- ^ Свали, Пуджа; и др. (30 мая 2023 г.). «Геномы Yersinia pestis свидетельствуют о чуме, существовавшей в Британии 4000 лет назад» . Природа . 14 (1): 2930. Бибкод : 2023NatCo..14.2930S . дои : 10.1038/s41467-023-38393-w . ПМЦ 10229654 . ПМИД 37253742 .
- ^ «Впервые идентифицирована ДНК бактерий, ответственных за Великую лондонскую чуму 1665 года» . 29 декабря 2022 года. Архивировано из оригинала 10 сентября 2016 года.
- ^ Сусат Дж. (4 сентября 2021 г.). «5000-летний охотник-собиратель уже страдает от Yersinia pestis» . Клетка . 35 (13): 506–10. дои : 10.1016/j.celrep.2021.109278 . ПМИД 34192537 . S2CID 235697166 .
- ^ Зеерсхольм, Фредерик Валер; и др. (10 июля 2024 г.). «Повторяющиеся заражения чумой в шести поколениях неолитических фермеров» . Природа . дои : 10.1038/s41586-024-07651-2 .
- ^ Центры по контролю и профилактике заболеваний (16 ноября 2022 г.). «Наблюдение за чумой | CDC» . Центры по контролю и профилактике заболеваний . Проверено 11 февраля 2023 г.
- ^ Садови, Карлос (19 сентября 2009 г.). «Исследователь из Университета К. умирает после контакта с бактериями чумы» . Центр последних новостей Чикаго . Проверено 3 марта 2010 г.
- ^ Рэндалл Т. (25 февраля 2011 г.). «Смерть от чумы наступила через несколько часов из-за состояния здоровья ученого» .
- ^ Jump up to: а б Ви СЛ (13 ноября 2019 г.). «В Китае диагностирована легочная чума» . Нью-Йорк Таймс . ISSN 0362-4331 . Проверено 13 ноября 2019 г.
- ^ «Бубонная чума: в Китае зарегистрирован третий случай» . Медицинские новости сегодня. 19 ноября 2019 г.
- ^ «Китайская бубонная чума: Внутренняя Монголия принимает меры предосторожности после случая» . Новости Би-би-си. 06.07.2020 . Проверено 6 июля 2020 г.
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Список вариантов штаммов и информация о синонимах (и многое другое) доступны через браузер таксономии NCBI .
- Домашняя страница CDC по чуме
- Ресурсная страница IDSA о чуме : актуальная исчерпывающая информация о патогенезе, микробиологии, эпидемиологии, диагностике и лечении.
- Чума ( Yersinia Pestis ) на Drugs.com
- Уиндем Латем выступает на тему «От легкого к убийственному: как Yersinia pestis эволюционировала, вызывая легочную чуму»