Пастерелловые
| Пастерелловые | |
|---|---|
 | |
| Гемофилус дукрейи | |
Научная классификация  | |
| Домен: | Бактерии |
| Тип: | Псевдомонадота |
| Сорт: | Гаммапротеобактерии |
| Заказ: | Пастерелла Гаррити и др. 2005 г. |
| Семья: | Пастерелловые Кастеллани и Чалмерс, 1919 год. |
| Роды | |
Актинобацилла | |
Pasteurellaceae составляют большое семейство грамотрицательных бактерий . Большинство представителей живут как комменсалы на слизистых оболочках птиц и млекопитающих, особенно в верхних дыхательных путях. [3] Pasteurellaceae обычно имеют палочковидную форму и представляют собой примечательную группу факультативных анаэробов . Их биохимические характеристики можно отличить от родственных Enterobacteriaceae по наличию оксидазы и от большинства других подобных бактерий по отсутствию жгутиков .
Бактерии семейства Pasteurellaceae были разделены на ряд родов на основе метаболических свойств, но эти классификации, как правило, не являются точным отражением эволюционных взаимоотношений между различными видами. Haemophilus influenzae был первым организмом, геном которого был секвенирован, и его интенсивно изучали с помощью генетических и молекулярных методов. Род Haemophilus является печально известным патогеном человека, вызывающим бактериемию , пневмонию , менингит и шанкроид . Другие патогенные представители семейства Pasteurellaceae включают Aggregatibacter , Mannheimia , Pasteurella и Actinobacillus виды .
Молекулярные признаки и филогенетическое положение
[ редактировать ]Сравнительный анализ геномов Pasteurellaceae выявил большое количество (>20) консервативных сигнатурных инделей (CSI) в различных важных белках, которые уникальным образом присущи всем секвенированным видам/штаммам Pasteurellaceae, но не обнаружены ни у каких других бактерий. На основании многих других CSI, специфичных для подгрупп видов Pasteurellaceae, было предложено разделить семейство как минимум на две клады. [4] Одна предложенная группа включает Aggregatibacter , Pasteurella , Actinobacillus succinogenes , Haemophilus influenzae , Haemophilus somnus и Mannheimia succiniciproducens , а другая включает Actinobacillusminor , Actinobacillus pleuropneumoniae , Haemophilus ducreyi , Haemophilus parasuis и Mannheimia haemolytica . .
Молекулярные сигнатуры в форме CSI также использовались для определения полифилетического распределения трех основных родов внутри семейства Pasteurellaceae: Actinobacillus , Haemophilus и Pasteurella . [5] [6] [7] Эти роды демонстрируют обширную полифилию во всем семействе, однако было обнаружено, что CSI последовательно присущи определенным видам, которые образуют монофилетическую группу внутри каждого соответствующего рода. [5] Распределение CSI соответствует в строгом смысле слова кладам «истинных» видов Actinobacillus , Haemophilus и Pasteurella соответственно. Поскольку они указывают на общее происхождение, было постулировано, что распределение CSI можно использовать для определения родовой принадлежности, при этом виды, не имеющие общего CSI, могут быть переклассифицированы в другой род. Также были обнаружены CSI, специфичные для Aggregatibacter и Mannheimia , двух клинически значимых родов. [5]
Pasteurellales, наряду с Enterobacterales , относятся к последним расходящимся отрядам гаммапротеобактерий . [8] Их отличие от всех других порядков подтверждается наличием нескольких консервативных сигнатурных белков (CSP), которые являются общими для этих двух порядков и отсутствуют у всех других бактерий. [8] Pasteurellales также имеют общие CSP с Enterobacterales, Vibrionales , Aeromonadales и Alteromonadales , что добавляет дополнительное разрешение их эволюционному ветвлению и филогенетическому положению среди большого класса Gammaproteobacteria. [8]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Паркер, Чарльз Томас; Гаррити, Джордж М. (2018). Паркер, Чарльз Томас; Гаррити, Джордж М. (ред.). «Таксономия рода Caviibacterium Adhikary et al. 2018». doi : 10.1601/tx.31260 (неактивен 17 апреля 2024 г.).
{{cite journal}}: Для цитирования журнала требуется|journal=( помощь ) CS1 maint: DOI неактивен с апреля 2024 г. ( ссылка ) - ^ Паркер, Чарльз Томас; Гаррити, Джордж М. (2018). Паркер, Чарльз Томас; Гаррити, Джордж М. (ред.). «Таксономия рода Conservatibacter Adhikary et al. 2018». doi : 10.1601/tx.31262 (неактивен 17 апреля 2024 г.).
{{cite journal}}: Для цитирования журнала требуется|journal=( помощь ) CS1 maint: DOI неактивен с апреля 2024 г. ( ссылка ) - ^ Кокотович, Бранко; Фриис, Нильс Ф; Аренс, Питер (2007). «Mycoplasma alkalescens выявлена при бронхоальвеолярном лаваже крупного рогатого скота в Дании» . Acta Veterinaria Scandinavica . 49 (1): 2. дои : 10.1186/1751-0147-49-2 . ISSN 1751-0147 . ПМЦ 1766361 . ПМИД 17204146 .
- ^ Наушад, HS; Гупта, Р.С. (январь 2012 г.). «Молекулярные сигнатуры (консервативные индели) в белковых последовательностях, специфичных для отряда Pasteurellales и отличающих две его основные клады». Антони ван Левенгук . 101 (1): 105–24. дои : 10.1007/s10482-011-9628-4 . ПМИД 21830122 . S2CID 15114511 .
- ^ Перейти обратно: а б с Наушад С., Адеолу М., Гоэл Н., Хадка Б., Аль-Дахви А., Гупта Р.С. (2015). «Филогеномная и молекулярная демаркация основных членов полифилетических родов пастерелловых актинобацилл, гемофилов и пастерелл» . Инт Джей Геном . 2015 : 198560. дои : 10.1155/2015/198560 . ПМЦ 4363679 . ПМИД 25821780 .
- ^ Олсен I, Дьюхерст Ф.Е., Пастер Б.Дж., Буссе Х.Дж. (2005) Семейство I. Pasteurellaceae. В: Руководство Берджи по систематической бактериологии, изд. 2, том 2, стр. 851–856. Эдс Бреннер DJ, Криг НР, Гэррити GM, Стейли Дж. Т. Спрингер -: Нью-Йорк.
- ^ Дьюхерст Ф.Э., Пастер Б.Дж., Олсен И., Фрейзер Г.Дж. (1992). «Филогения 54 репрезентативных штаммов видов семейства Pasteurellaceae, определенная путем сравнения последовательностей 16S рРНК» . J Бактериол . 174 (6): 2002–2013. дои : 10.1128/jb.174.6.2002-2013.1992 . ПМК 205807 . ПМИД 1548238 .
- ^ Перейти обратно: а б с Гао Б., Мохан Р., Гупта Р.С. (2009). «Филогеномика и белковые сигнатуры, объясняющие эволюционные отношения между гаммапротеобактериями» . Int J Syst Evol Microbiol . 59 (Часть 2): 234–247. дои : 10.1099/ijs.0.002741-0 . ПМИД 19196760 .
| Базы данных органов управления : Национальные |
|---|
