Кампилобактерии
| Кампилобактерии | |
|---|---|
 | |
| кампилобактерии жеюни Бактерии | |
Научная классификация  | |
| Домен: | Бактерии |
| Тип: | Кампилобактерия |
| Сорт: | «Кампилобактерии» Уэйт и др. 2017 год |
| Заказ: | Кампилобактерии Гаррити и др. 2006 г. |
| Семьи и роды | |
| |
Campylobacterales — отряд Campylobacterota составляют подраздел эпсилон , который вместе с небольшим семейством Nautiliaceae . Они грамотрицательны . Большинство видов микроаэрофилы . [1]
Молекулярные подписи
[ редактировать ]Сравнительный геномный анализ позволил идентифицировать 49 белков, которые однозначно встречаются практически у всех видов отряда Campylobacterales. Кроме того, были идентифицированы две консервативные сигнатурные индели , которые вместе с белками служат молекулярными маркерами порядка. Инделы представляют собой вставку из трех аминокислот в белке B системы Uvr ABC и делецию двух аминокислот в фенилаланил-тРНК-синтетазе . [2]
Филогения
[ редактировать ]Принятая в настоящее время таксономия основана на Списке названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN). [3] и Национальный центр биотехнологической информации (NCBI) [4]
| на основе 16S рРНК ДП _08_2023 [5] [6] [7] | 120 однокопийных маркерных белков на основе GTDB 08-RS214 [8] [9] [10] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
Неназначенные роды:
- « Флексиспира » Брайнер, 1987 г.
- « Candidatus Thioturbo » Muyzer et al. 2005 г.
- « Тиофрактор » Макита и др. 2012 год
- «Thiobarbaceae» Assié et al. 2020 год
- « Candidatus Thiobarba » Assie et al. 2020 год
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Гаррити, Джордж М.; Бреннер, Дон Дж.; Криг, Ноэль Р.; Стейли, Джеймс Т. (ред.) (2005). Руководство Берджи по систематической бактериологии, том второй: протеобактерии, часть C: альфа-, бета-, дельта- и эпсилонпротеобактерии. Нью-Йорк, Нью-Йорк: Спрингер. ISBN 978-0-387-24145-6 .
- ^ Гупта, RS (2006). Молекулярные сигнатуры (уникальные белки и консервативные индели), специфичные для эпсилон-протеобактерий. БМК Геномика. 7:167.
- ^ АС Парте; и др. «Кампилобактерии» . Список названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN) . Проверено 9 сентября 2023 г.
- ^ Сэйерс; и др. «Кампилобактерии» . База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Проверено 9 сентября 2023 г.
- ^ «ЛТП» . Проверено 20 ноября 2023 г.
- ^ «Дерево LTP_all в формате Ньюика» . Проверено 20 ноября 2023 г.
- ^ «Примечания к выпуску LTP_08_2023» (PDF) . Проверено 20 ноября 2023 г.
- ^ «Выпуск GTDB 08-RS214» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
- ^ "bac120_r214.sp_label" . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
- ^ «История таксонов» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
 | Эта Campylobacterota статья, связанная с , незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |