Хеликобактер

Хеликобактер
	Сканирующая электронная микрофотография бактерий Helicobacter bilis .
Научная классификация
Домен:	Бактерии
Тип:	Кампилобактерия
Сорт:	«Кампилобактерии»
Заказ:	Кампилобактерии
Семья:	Хеликобактерии
Род:	Хеликобактер ; Гудвин и др. 1989 год
Типовой вид
	Хеликобактер пилори ; (Маршалл и др., 1985) Гудвин и др. 1989 год
Разновидность
	Посмотреть текст
Синонимы
	« Gastrospirillum » McNulty et al. 1989 год ;

Хеликобактер — род грамотрицательных обладающих бактерий, характерной спиралевидной формой. Первоначально их считали представителями рода Campylobacter , но в 1989 году Goodwin et al. опубликовали достаточные основания для обоснования нового названия рода Helicobacter . ^[2] Род Helicobacter насчитывает около 35 видов. ^[3]^[4]^[5]

Некоторые виды обитают в слизистой оболочке верхних отделов желудочно-кишечного тракта , а также в млекопитающих и печени некоторых птиц . ^[6] Наиболее широко известным видом рода является H. pylori , которым инфицировано до 50% человеческой популяции. ^[5] Он также служит типовым видом рода. Некоторые штаммы этой бактерии патогенны для человека, так как они тесно связаны с язвенной болезнью , хроническим гастритом , дуоденитом и раком желудка .

Виды Helicobacter способны процветать в очень кислом млекопитающих желудке , производя большое количество фермента уреазы , который локально повышает pH примерно с 2 до более биосовместимого диапазона от 6 до 7. ^[7] Бактерии, принадлежащие к этому роду, обычно чувствительны к антибиотикам, таким как пенициллин , являются микроаэрофильными (оптимальная концентрация кислорода от 5 до 14%) капнофилами и быстро передвигают свои жгутики . ^[8]^[9]

Молекулярные подписи

Сравнительный геномный анализ позволил идентифицировать 11 белков, уникальных для Helicobacteraceae. Из этих белков семь обнаружены у всех видов семейства, а остальные четыре не обнаружены ни в одном Helicobacter штамме и являются уникальными для Wollinella . слиянию генов rpoB и rpoC в этом семействе. Кроме того, редкое генетическое событие привело к характерному для них ^[10]

не относящиеся к H. pylori Виды,

Недавно новые желудочные ( H. suis и H. baculiformis ) и энтерогепатические ( H. equorum были зарегистрированы ) виды. H. pylori имеет первостепенное значение для медицины, но в клинических образцах человека были обнаружены виды, не относящиеся к H. pylori , которые в природе обитают у млекопитающих (кроме человека) и птиц. Они охватывают две группы (желудочную и энтерогепатическую) с различной органной специфичностью. Важно отметить, что некоторые виды, такие как H. hepaticus, H. mustelae и, возможно, H. bilis , обладают канцерогенным потенциалом для животных. Они содержат множество генов вирулентности и могут вызывать заболевания не только у животных, но и у людей. Желудочные виды, такие как H. suis (чаще всего) , H. felis, H. bizzozeronii и H. salomonis, были связаны с хроническим гастритом и пептической язвой у людей и, что важно, с более высоким риском MALT-лимфомы по сравнению с H. pylori. .

Энтерогепатические виды, например, H. hepaticus, H. bilis и H. ganmani , были обнаружены с помощью ПЦР , но до сих пор не выделены из образцов пациентов с гепатобилиарными заболеваниями. Более того, они могут быть связаны с болезнью Крона и язвенным колитом . Значение птичьих хеликобактеров ( H. pullorum, H. anseris и H. brantae) также широко оценивалось. H. cinaedi и H. canis могут вызывать тяжелые инфекции, в основном у пациентов с ослабленным иммунитетом при контакте с животными. Короче говоря, роль этих видов в ветеринарии и медицине человека становится все более признанной. несколько других тем, таких как изоляция еще некультивируемых видов, устойчивость к антибиотикам и схемы лечения инфекций, патогенеза и возможного канцерогенеза у людей. Необходимо оценить ^[3]

H. heilmannii sensu lato

Helicobacter heilmannii sensu lato (т.е. H. heilmanni sl ) представляет собой группу не относящихся к H. pylori видов Helicobacter, , которые в качестве части определения принимают сходство с H. pylori , связанное с развитием воспаления желудка, язв желудка, ^[11] язвы двенадцатиперстной кишки, ^[12] рак желудка, не являющийся лимфомой, и экстранодальная маргинальная В-клеточная лимфома желудка у людей и животных. ^[11] В большинстве клинических исследований не были идентифицированы точные виды H. heilmanii , связанные с этими заболеваниями, поэтому эти виды были обозначены как H. heilmanni sl. Однако исследовательские исследования выявили эти виды у некоторых пациентов с указанными H. heilmanni sl -ассоциированными заболеваниями верхних отделов желудочно-кишечного тракта. заболевания. Видами H. heilmani, выявленными к настоящему времени в желудке людей с указанными заболеваниями верхних отделов желудочно-кишечного тракта, являются: Helicobacter bizzozeronii , Helicobacter felis , Helicobacter salomonis , Helicobacter suis и Helicobacter heilmannii ss. ^[11] Важно признать связь H. heilmannii sensu lato с этими заболеваниями верхних отделов желудочно-кишечного тракта , особенно с экстранодальной лимфомой маргинальной зоны желудка, поскольку некоторые из них успешно лечатся с использованием схем лечения на основе антибиотиков, направленных против провоцирующего H. heilmannii. sensu lato виды. ^[13] Заболевания человека, связанные с H. heilmanni sl, по-видимому, передаются от домашних и сельскохозяйственных животных, поэтому считаются зоонозными заболеваниями . ^[11]

Филогения

Принятая в настоящее время таксономия основана на Списке названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN). ^[1] и Национальный центр биотехнологической информации (NCBI) ^[14]

на основе 16S рРНК ДП _08_2023 ^[15]^[16]^[17]

120 однокопийных маркерных белков на основе GTDB 08-RS214 ^[18]^[19]^[20]

Волинелла

Хеликобактер

Х. вальдивиенсис

Х. Ганмани

	H. mesocricetum

	Х. родентиум

Х. энгидрае

Х. холецистус

H. brantae

	Х. паметенсис

	Х. кайзериенсис

Х. гусь

	Х. анатоликус

	Х. ласки

Х. канис

Х. скорость

	H. canicola Kawamura et al. 2016 год

	Х. Синеди

	Х. гепатикус

	Х. трогонтум

	Х. японский

	Х. муридарум

Х. тифлоний

	H. mastomyrinus Shen et al. 2006 г.

	Х. апри Занони и др. 2016 год

	H. equirum Moyaert et al. 2007 год

	H. kumamotonensis Kawamura et al. 2023 год

Х. куры

	Х. канадский

	H. colisuis Gruntar et al. 2022 год

Х. турецкий

	Х. сурки

	Х. макакаэ

Х. Гималайский

Х. феннеллиае

	Х. Яачи

	Х. сагини

Х. позолоченный

	H. monodelphidis Shen et al. 2020 год

	Х. дидельфидарум

Х. ацинонихис

H. pylori

	Х. киты

	H. delphinicola Segawa et al. 2021 год

Ветчина

Х. лабаценсис

Х. биззозерони

Х. фелис

	Х. Саломон

	Х. киногастрикус

Х. бакулиформис

H. ailurogastricus

Х. хейльманни

	Яйцо из муки

	Х. лиса

Волинелла

Псевдохеликобактер

	« Helicobacter burdigalensis » Berthenet et al. 2019 год

	Helicobacter valdiviensis Колладо, Хара и Гонсалес 2014 г.

	Helicobacter turcicus Айдын и др. 2022 год

	« Helicobacter winghamensis » Melito et al.

	Helicobacter ganmani Robertson et al. 2001 г.

	« P. Rodentium » (Шен и др., 1997) Уэйт, Чувочина и Гугенгольц, 2019 г.

	Helicobacter apodemus Jeon et al. 2015 год

	Helicobacter mesocricetus Simmons et al. 2000 г.

	« P. canadensis » (Fox et al. 2002) Уэйт, Чувочина и Гугенгольц 2019

	« P. pullorum » (Стэнли и др., 1995) Уэйт, Чувочина и Гугенгольц, 2019 г.

Хеликобактер

H. saguini Shen et al. 2017 год

	H. aurati Patterson et al. 2002 г.

	H. muridarum Lee et al. 1992 год

H. Didelphidarum Shen et al. 2020 год

H. trogontum Mendes et al. 1996 год

	H. bilis Fox et al. 1997 год

	« H.rappini » Dewhirst et al. 2000 г.

H. engilae Shen et al. 2020 год

	H. kayseriensis Aydin et al. 2022 год

	H. pametensis Dewhirst et al. 1994 г.

H. brantae Fox et al. 2006 г.

	« Ca.H.avistercoris » Gilroy et al. 2021 год

	H. cholecystus Franklin et al. 1997 год

	« Ca. H. avicola» Gilroy et al. 2021 год

	H. Himalayansis Hu et al. 2015 год

« H. labetoulli » Berthenet et al. 2019 год

	H. cinaedi (Totten et al. 1988) Vandamme et al. 1991 год

	« H. magdeburgensis » Traverso et al. 2010 год

Х. Яачи Шен и др. 2017 год

H. hepaticus Fox et al. 1994 г.

H. marmotae Fox et al. 2006 г.

	H. japonicus corrig. Шен и др. 2017 год

	H. typhlonius Франклин и др. 2002 г.

H. fennelliae (Totten et al. 1988) Vandamme et al. 1991 год

	H. macacae Fox et al. 2013 год

	H. canis Stanley et al. 1994 г.

H. гусь Fox et al. 2006 г.

	H. anatolicus Aydin et al. 2023 год

	H. mustelae (Fox et al. 1988) Goodwin et al. 1989 год

Х. кит Harper et al. 2006 г.

	H. acinonychis corrig. Итон и др. 1993 год

	H. pylori (Marshall et al. 1985) Goodwin et al. 1989 год

	H. bizzozeronii Hanninen et al. 1996 год

	H. mehlei Gruntar et al. 2020 год

Х. ам Баеле и др. 2008 год

	H. ailurogastricus Joosten et al. 2017 год

	H. heilmannii Smet et al. 2012 год

	H. cynogastricus Van den Bulck et al. 2006 г.

	H. felis Paster et al. 1991 год

H. salomonis Jalava et al. 1997 год

H. baculiformis Baele et al. 2008 год

	H. labacensis Gruntar et al. 2020 год

	H. fox Gruntar et al. 2020 год

Неопределенные типы сидений:

« Ca. H. bovis» De Groote et al. 1999 год
« H. callitrichis » Won et al. 2007 год
« Ca. H. cebus» Gueneau de Novoa et al. 2001а
H. ibis Lopez-Cantillo et al. 2023 год
« H. muricola » Won et al. 2002 г.
« H. peregrinus » Coldham et al. 2004 г.
« H. suncus » Goto et al. 1998 год
« H. tursiopsae » Gueneau de Novoa et al. 2001б
« H. vulpecula » Coldham et al. 2004 г.

См. также

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б АС Парте; и др. «Хеликобактер» . Список названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN) . Проверено 9 сентября 2023 г.
^ Гудвин К.С., Армстронг Дж.А., Чилверс Т. и др. (1989). «Перенос Campylobacter pylori и Campylobacter mustelae в Helicobacter gen. nov. как Helicobacter pylori com. nov. и Helicobacter mustelae com. nov. соответственно» . Межд. Дж. Сист. Бактериол . 39 (4): 397–405. дои : 10.1099/00207713-39-4-397 .
^ Jump up to: ^а ^б Боянова Л, изд. (2011). Хеликобактер пилори . Кайстер Академик Пресс . ISBN 978-1-904455-84-4 .
^ Вандам П., Фальсен Э., Россак Р. и др. (1991). «Пересмотр таксономии Campylobacter , Helicobacter и Wolinella : исправление родовых описаний и предложение Arcobacter gen. nov» . Межд. Дж. Сист. Бактериол . 41 (1): 88–103. дои : 10.1099/00207713-41-1-88 . ПМИД 1704793 .
^ Jump up to: ^а ^б Ямаока, Ю., изд. (2008). Helicobacter pylori: молекулярная генетика и клеточная биология . Кайстер Академик Пресс. ISBN 978-1-904455-31-8 . [1] .
^ Райан, Кей Джей; Рэй, CG, ред. (2004). Медицинская микробиология Шерриса (4-е изд.). МакГроу Хилл. ISBN 0-8385-8529-9 .
^ Данн Б.Е., Коэн Х., Блазер М.Дж. (1 октября 1997 г.). «Хеликобактер пилори» . Клин Микробиол Ред . 10 (4): 720–741. дои : 10.1128/cmr.10.4.720 . ПМК 172942 . ПМИД 9336670 .
^ Хуа Дж.С., Чжэн П.Ю., Хо Б. (1999). «Видовая дифференциация и идентификация рода Helicobacter » . Всемирный журнал гастроэнтерологии . 5 (1): 7–9. дои : 10.3748/wjg.v5.i1.7 . ПМК 4688506 . ПМИД 11819372 .
^ Ржавчина; и др. (2008). «Жгутики Helicobacter, подвижность и хемотаксис» . Helicobacter pylori: молекулярная генетика и клеточная биология (Ямаока Ю., ред.) . Кайстер Академик Пресс. ISBN 978-1-904455-31-8 . [2] .
^ Захарова Н.; Пастер Би Джей; Уэсли И.; Дьюхерст FE; Берг Д.Э.; Северинов КВ (1999). «Слитые и перекрывающиеся гены rpoB и rpoC у Helicobacters, Campylobacters и родственных бактерий» . J Бактериол . 181 (12): 3857–3859. дои : 10.1128/JB.181.12.3857-3859.1999 . ПМК 93870 . ПМИД 10368167 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д Бенто-Миранда М., Фигейредо К. (декабрь 2014 г.). «Helicobacter heilmannii sensu lato: обзор инфекции у человека» . Всемирный журнал гастроэнтерологии . 20 (47): 17779–87. дои : 10.3748/wjg.v20.i47.17779 . ПМЦ 4273128 . ПМИД 25548476 .
^ Иванчак Б, Бьернат М, Иванчак Ф, Грабинска Дж, Матусевич К, Госциняк Г (апрель 2012 г.). «Клинические аспекты инфекции Helicobacter heilmannii у детей с диспепсическими явлениями». Журнал физиологии и фармакологии . 63 (2): 133–6. ПМИД 22653899 .
^ Менар А., Смет А. (сентябрь 2019 г.). «Обзор: Другие виды Helicobacter». Хеликобактер . 24 (Приложение 1): e12645. дои : 10.1111/hel.12645 . ПМИД 31486233 .
^ Сэйерс; и др. «Хеликобактер» . База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Проверено 9 сентября 2023 г.
^ «ЛТП» . Проверено 20 ноября 2023 г.
^ «Дерево LTP_all в формате Ньюика» . Проверено 20 ноября 2023 г.
^ «Примечания к выпуску LTP_08_2023» (PDF) . Проверено 20 ноября 2023 г.
^ «Выпуск GTDB 08-RS214» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
^ "bac120_r214.sp_label" . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
^ «История таксонов» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.

Внешние ссылки

Геномы Helicobacter и соответствующая информация в PATRIC , Ресурсном центре биоинформатики, финансируемом NIAID.
Список видов Helicobacter со ссылками на информацию о последовательности.
Helicobacter в Bac Dive - база метаданных бактериального разнообразия

[LPSN-1] Jump up to: ^а ^б АС Парте; и др. «Хеликобактер» . Список названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN) . Проверено 9 сентября 2023 г.

[2] Гудвин К.С., Армстронг Дж.А., Чилверс Т. и др. (1989). «Перенос Campylobacter pylori и Campylobacter mustelae в Helicobacter gen. nov. как Helicobacter pylori com. nov. и Helicobacter mustelae com. nov. соответственно» . Межд. Дж. Сист. Бактериол . 39 (4): 397–405. дои : 10.1099/00207713-39-4-397 .

[BoyanovaL-3] Jump up to: ^а ^б Боянова Л, изд. (2011). Хеликобактер пилори . Кайстер Академик Пресс . ISBN 978-1-904455-84-4 .

[4] Вандам П., Фальсен Э., Россак Р. и др. (1991). «Пересмотр таксономии Campylobacter , Helicobacter и Wolinella : исправление родовых описаний и предложение Arcobacter gen. nov» . Межд. Дж. Сист. Бактериол . 41 (1): 88–103. дои : 10.1099/00207713-41-1-88 . ПМИД 1704793 .

[YamaokaY-5] Jump up to: ^а ^б Ямаока, Ю., изд. (2008). Helicobacter pylori: молекулярная генетика и клеточная биология . Кайстер Академик Пресс. ISBN 978-1-904455-31-8 . [1] .

[6] Райан, Кей Джей; Рэй, CG, ред. (2004). Медицинская микробиология Шерриса (4-е изд.). МакГроу Хилл. ISBN 0-8385-8529-9 .

[7] Данн Б.Е., Коэн Х., Блазер М.Дж. (1 октября 1997 г.). «Хеликобактер пилори» . Клин Микробиол Ред . 10 (4): 720–741. дои : 10.1128/cmr.10.4.720 . ПМК 172942 . ПМИД 9336670 .

[8] Хуа Дж.С., Чжэн П.Ю., Хо Б. (1999). «Видовая дифференциация и идентификация рода Helicobacter » . Всемирный журнал гастроэнтерологии . 5 (1): 7–9. дои : 10.3748/wjg.v5.i1.7 . ПМК 4688506 . ПМИД 11819372 .

[Rustetal-9] Ржавчина; и др. (2008). «Жгутики Helicobacter, подвижность и хемотаксис» . Helicobacter pylori: молекулярная генетика и клеточная биология (Ямаока Ю., ред.) . Кайстер Академик Пресс. ISBN 978-1-904455-31-8 . [2] .

[10] Захарова Н.; Пастер Би Джей; Уэсли И.; Дьюхерст FE; Берг Д.Э.; Северинов КВ (1999). «Слитые и перекрывающиеся гены rpoB и rpoC у Helicobacters, Campylobacters и родственных бактерий» . J Бактериол . 181 (12): 3857–3859. дои : 10.1128/JB.181.12.3857-3859.1999 . ПМК 93870 . ПМИД 10368167 .

[pmid25548476-11] Jump up to: ^а ^б ^с ^д Бенто-Миранда М., Фигейредо К. (декабрь 2014 г.). «Helicobacter heilmannii sensu lato: обзор инфекции у человека» . Всемирный журнал гастроэнтерологии . 20 (47): 17779–87. дои : 10.3748/wjg.v20.i47.17779 . ПМЦ 4273128 . ПМИД 25548476 .

[pmid22653899-12] Иванчак Б, Бьернат М, Иванчак Ф, Грабинска Дж, Матусевич К, Госциняк Г (апрель 2012 г.). «Клинические аспекты инфекции Helicobacter heilmannii у детей с диспепсическими явлениями». Журнал физиологии и фармакологии . 63 (2): 133–6. ПМИД 22653899 .

[pmid31486233-13] Менар А., Смет А. (сентябрь 2019 г.). «Обзор: Другие виды Helicobacter». Хеликобактер . 24 (Приложение 1): e12645. дои : 10.1111/hel.12645 . ПМИД 31486233 .

[NCBI-14] Сэйерс; и др. «Хеликобактер» . База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Проверено 9 сентября 2023 г.

[LTP-15] «ЛТП» . Проверено 20 ноября 2023 г.

[16] «Дерево LTP_all в формате Ньюика» . Проверено 20 ноября 2023 г.

[17] «Примечания к выпуску LTP_08_2023» (PDF) . Проверено 20 ноября 2023 г.

[about-18] «Выпуск GTDB 08-RS214» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.

[tree-19] "bac120_r214.sp_label" . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.

[taxon_history-20] «История таксонов» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]

[18]

[19]

[20]