Хеликобактер
Хеликобактер | |
---|---|
![]() | |
Сканирующая электронная микрофотография бактерий Helicobacter bilis . | |
Научная классификация ![]() | |
Домен: | Бактерии |
Тип: | Кампилобактерия |
Сорт: | «Кампилобактерии» |
Заказ: | Кампилобактерии |
Семья: | Хеликобактерии |
Род: | Хеликобактер Гудвин и др. 1989 год [1] |
Типовой вид | |
Хеликобактер пилори (Маршалл и др., 1985) Гудвин и др. 1989 год | |
Разновидность | |
Посмотреть текст | |
Синонимы | |
|
Хеликобактер — род грамотрицательных обладающих бактерий, характерной спиралевидной формой. Первоначально их считали представителями рода Campylobacter , но в 1989 году Goodwin et al. опубликовали достаточные основания для обоснования нового названия рода Helicobacter . [2] Род Helicobacter насчитывает около 35 видов. [3] [4] [5]
Некоторые виды обитают в слизистой оболочке верхних отделов желудочно-кишечного тракта , а также в млекопитающих и печени некоторых птиц . [6] Наиболее широко известным видом рода является H. pylori , которым инфицировано до 50% человеческой популяции. [5] Он также служит типовым видом рода. Некоторые штаммы этой бактерии патогенны для человека, так как они тесно связаны с язвенной болезнью , хроническим гастритом , дуоденитом и раком желудка .
Виды Helicobacter способны процветать в очень кислом млекопитающих желудке , производя большое количество фермента уреазы , который локально повышает pH примерно с 2 до более биосовместимого диапазона от 6 до 7. [7] Бактерии, принадлежащие к этому роду, обычно чувствительны к антибиотикам, таким как пенициллин , являются микроаэрофильными (оптимальная концентрация кислорода от 5 до 14%) капнофилами и быстро передвигают свои жгутики . [8] [9]
Молекулярные подписи
[ редактировать ]Сравнительный геномный анализ позволил идентифицировать 11 белков, уникальных для Helicobacteraceae. Из этих белков семь обнаружены у всех видов семейства, а остальные четыре не обнаружены ни в одном Helicobacter штамме и являются уникальными для Wollinella . слиянию генов rpoB и rpoC в этом семействе. Кроме того, редкое генетическое событие привело к характерному для них [10]
не относящиеся к H. pylori Виды,
[ редактировать ]Недавно новые желудочные ( H. suis и H. baculiformis ) и энтерогепатические ( H. equorum были зарегистрированы ) виды. H. pylori имеет первостепенное значение для медицины, но в клинических образцах человека были обнаружены виды, не относящиеся к H. pylori , которые в природе обитают у млекопитающих (кроме человека) и птиц. Они охватывают две группы (желудочную и энтерогепатическую) с различной органной специфичностью. Важно отметить, что некоторые виды, такие как H. hepaticus, H. mustelae и, возможно, H. bilis , обладают канцерогенным потенциалом для животных. Они содержат множество генов вирулентности и могут вызывать заболевания не только у животных, но и у людей. Желудочные виды, такие как H. suis (чаще всего) , H. felis, H. bizzozeronii и H. salomonis, были связаны с хроническим гастритом и пептической язвой у людей и, что важно, с более высоким риском MALT-лимфомы по сравнению с H. pylori. .
Энтерогепатические виды, например, H. hepaticus, H. bilis и H. ganmani , были обнаружены с помощью ПЦР , но до сих пор не выделены из образцов пациентов с гепатобилиарными заболеваниями. Более того, они могут быть связаны с болезнью Крона и язвенным колитом . Значение птичьих хеликобактеров ( H. pullorum, H. anseris и H. brantae) также широко оценивалось. H. cinaedi и H. canis могут вызывать тяжелые инфекции, в основном у пациентов с ослабленным иммунитетом при контакте с животными. Короче говоря, роль этих видов в ветеринарии и медицине человека становится все более признанной. несколько других тем, таких как изоляция еще некультивируемых видов, устойчивость к антибиотикам и схемы лечения инфекций, патогенеза и возможного канцерогенеза у людей. Необходимо оценить [3]
H. heilmannii sensu lato
[ редактировать ]Helicobacter heilmannii sensu lato (т.е. H. heilmanni sl ) представляет собой группу не относящихся к H. pylori видов Helicobacter, , которые в качестве части определения принимают сходство с H. pylori , связанное с развитием воспаления желудка, язв желудка, [11] язвы двенадцатиперстной кишки, [12] рак желудка, не являющийся лимфомой, и экстранодальная маргинальная В-клеточная лимфома желудка у людей и животных. [11] В большинстве клинических исследований не были идентифицированы точные виды H. heilmanii , связанные с этими заболеваниями, поэтому эти виды были обозначены как H. heilmanni sl. Однако исследовательские исследования выявили эти виды у некоторых пациентов с указанными H. heilmanni sl -ассоциированными заболеваниями верхних отделов желудочно-кишечного тракта. заболевания. Видами H. heilmani, выявленными к настоящему времени в желудке людей с указанными заболеваниями верхних отделов желудочно-кишечного тракта, являются: Helicobacter bizzozeronii , Helicobacter felis , Helicobacter salomonis , Helicobacter suis и Helicobacter heilmannii ss. [11] Важно признать связь H. heilmannii sensu lato с этими заболеваниями верхних отделов желудочно-кишечного тракта , особенно с экстранодальной лимфомой маргинальной зоны желудка, поскольку некоторые из них успешно лечатся с использованием схем лечения на основе антибиотиков, направленных против провоцирующего H. heilmannii. sensu lato виды. [13] Заболевания человека, связанные с H. heilmanni sl, по-видимому, передаются от домашних и сельскохозяйственных животных, поэтому считаются зоонозными заболеваниями . [11]
Филогения
[ редактировать ]Принятая в настоящее время таксономия основана на Списке названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN). [1] и Национальный центр биотехнологической информации (NCBI) [14]
на основе 16S рРНК ДП _08_2023 [15] [16] [17] | 120 однокопийных маркерных белков на основе GTDB 08-RS214 [18] [19] [20] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
Неопределенные типы сидений:
- « Ca. H. bovis» De Groote et al. 1999 год
- « H. callitrichis » Won et al. 2007 год
- « Ca. H. cebus» Gueneau de Novoa et al. 2001а
- H. ibis Lopez-Cantillo et al. 2023 год
- « H. muricola » Won et al. 2002 г.
- « H. peregrinus » Coldham et al. 2004 г.
- « H. suncus » Goto et al. 1998 год
- « H. tursiopsae » Gueneau de Novoa et al. 2001б
- « H. vulpecula » Coldham et al. 2004 г.
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б АС Парте; и др. «Хеликобактер» . Список названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN) . Проверено 9 сентября 2023 г.
- ^ Гудвин К.С., Армстронг Дж.А., Чилверс Т. и др. (1989). «Перенос Campylobacter pylori и Campylobacter mustelae в Helicobacter gen. nov. как Helicobacter pylori com. nov. и Helicobacter mustelae com. nov. соответственно» . Межд. Дж. Сист. Бактериол . 39 (4): 397–405. дои : 10.1099/00207713-39-4-397 .
- ^ Jump up to: а б Боянова Л, изд. (2011). Хеликобактер пилори . Кайстер Академик Пресс . ISBN 978-1-904455-84-4 .
- ^ Вандам П., Фальсен Э., Россак Р. и др. (1991). «Пересмотр таксономии Campylobacter , Helicobacter и Wolinella : исправление родовых описаний и предложение Arcobacter gen. nov» . Межд. Дж. Сист. Бактериол . 41 (1): 88–103. дои : 10.1099/00207713-41-1-88 . ПМИД 1704793 .
- ^ Jump up to: а б Ямаока, Ю., изд. (2008). Helicobacter pylori: молекулярная генетика и клеточная биология . Кайстер Академик Пресс. ISBN 978-1-904455-31-8 . [1] .
- ^ Райан, Кей Джей; Рэй, CG, ред. (2004). Медицинская микробиология Шерриса (4-е изд.). МакГроу Хилл. ISBN 0-8385-8529-9 .
- ^ Данн Б.Е., Коэн Х., Блазер М.Дж. (1 октября 1997 г.). «Хеликобактер пилори» . Клин Микробиол Ред . 10 (4): 720–741. дои : 10.1128/cmr.10.4.720 . ПМК 172942 . ПМИД 9336670 .
- ^ Хуа Дж.С., Чжэн П.Ю., Хо Б. (1999). «Видовая дифференциация и идентификация рода Helicobacter » . Всемирный журнал гастроэнтерологии . 5 (1): 7–9. дои : 10.3748/wjg.v5.i1.7 . ПМК 4688506 . ПМИД 11819372 .
- ^ Ржавчина; и др. (2008). «Жгутики Helicobacter, подвижность и хемотаксис» . Helicobacter pylori: молекулярная генетика и клеточная биология (Ямаока Ю., ред.) . Кайстер Академик Пресс. ISBN 978-1-904455-31-8 . [2] .
- ^ Захарова Н.; Пастер Би Джей; Уэсли И.; Дьюхерст FE; Берг Д.Э.; Северинов КВ (1999). «Слитые и перекрывающиеся гены rpoB и rpoC у Helicobacters, Campylobacters и родственных бактерий» . J Бактериол . 181 (12): 3857–3859. дои : 10.1128/JB.181.12.3857-3859.1999 . ПМК 93870 . ПМИД 10368167 .
- ^ Jump up to: а б с д Бенто-Миранда М., Фигейредо К. (декабрь 2014 г.). «Helicobacter heilmannii sensu lato: обзор инфекции у человека» . Всемирный журнал гастроэнтерологии . 20 (47): 17779–87. дои : 10.3748/wjg.v20.i47.17779 . ПМЦ 4273128 . ПМИД 25548476 .
- ^ Иванчак Б, Бьернат М, Иванчак Ф, Грабинска Дж, Матусевич К, Госциняк Г (апрель 2012 г.). «Клинические аспекты инфекции Helicobacter heilmannii у детей с диспепсическими явлениями». Журнал физиологии и фармакологии . 63 (2): 133–6. ПМИД 22653899 .
- ^ Менар А., Смет А. (сентябрь 2019 г.). «Обзор: Другие виды Helicobacter». Хеликобактер . 24 (Приложение 1): e12645. дои : 10.1111/hel.12645 . ПМИД 31486233 .
- ^ Сэйерс; и др. «Хеликобактер» . База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Проверено 9 сентября 2023 г.
- ^ «ЛТП» . Проверено 20 ноября 2023 г.
- ^ «Дерево LTP_all в формате Ньюика» . Проверено 20 ноября 2023 г.
- ^ «Примечания к выпуску LTP_08_2023» (PDF) . Проверено 20 ноября 2023 г.
- ^ «Выпуск GTDB 08-RS214» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
- ^ "bac120_r214.sp_label" . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
- ^ «История таксонов» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Геномы Helicobacter и соответствующая информация в PATRIC , Ресурсном центре биоинформатики, финансируемом NIAID.
- Список видов Helicobacter со ссылками на информацию о последовательности.
- Helicobacter в Bac Dive - база метаданных бактериального разнообразия