Helicobacter Typhlonius
| Helicobacter Typhlonius | |
|---|---|
Научная классификация 
| |
| Домен: | Бактерии |
| Филум: | Campylobacterota |
| Сорт: | "Campylobacteria" |
| Заказ: | Campylobacterales |
| Семья: | Helicobacteraceae |
| Род: | Helicobacter |
| Разновидность: | Х. Тайфлоний
|
| Биномиальное название | |
| Helicobacter Typhlonius Франклин и др. 2001
| |
Helicobacter Typhlonius -это грамотрицательная бактерия и оппортунистический патоген, обнаруженный в роде Helicobacter . [ 1 ] Только 35 известных видов находятся в этом роде, который был описан в 1982 году. [ 2 ] [ 1 ] H. Typhlonius имеет небольшое количество близких родственников, в том числе Helicobacter muridarum , Helicobacter Trogontum и Helicobacter Hepaticus , причем последний является самым близким относительным и гораздо более распространенным. [ 1 ]
Таксономия
[ редактировать ]Helicobacter Typhlonius является одним из 35 известных видов Helicobacter . [ 2 ] Ранее он был назван Helicobacter sp. штамм MIT 97-6910 Fox et al. , но был изменен на его нынешнее имя Franklin et al. После обнаружения генетически и морфологически идентичного организма, который вызывает пролиферативный тифлоколит, также известный как раздраженное заболевание кишечника . [ 3 ] [ 1 ] Некоторые близкие родственники H. typhlonius включают H. Muridarum, H. Trogontum, H. Hepaticus и H. pylori . [ 1 ]
Морфология и физиология
[ редактировать ]Helicobacter Typhlonius является подвижным из -за его одиночного жгутика . [ 1 ] Он имеет спиральную морфологию , а его размер составляет от 0,3 до 2,0 до 3,0 мкм. [ 1 ] Он способен к аммиака ассимиляции , продукции мочевины и фосфорибозилпирофосфата . биосинтезу [ 1 ] H. Typhlonius также является уреазой -негативным, который, как известно, помогает в выживании и пролиферации микробов в кислых желудочных средах. [ 1 ] Кроме того, он может расти только в микроаэробных условиях (очень небольшое количество кислорода), а не в аэробных или анаэробных условиях. [ 1 ]
Открытие
[ редактировать ]Helicobacter Typhlonius был выделен из фекалий мышей с ослабленным иммунитетом Джеймсом Дж. Фокс и Крейгом Л. Франклина в двух отдельных лабораториях в 1999 году. [ 4 ] Мыши страдали от синдрома раздраженного кишечника, который был вызван H. typhlonius , но механизм инфекции был неизвестен. [ 1 ] Полимеразной цепной реакции (ПЦР) использовали для копирования последовательности ДНК бактерий, которые необходимо изучить. [ 1 ] ПЦР была идеальным методом из -за уникальной промежуточной последовательности генома , которая легко распознается с помощью ПЦР. [ 5 ] Затем последовательности были проанализированы с использованием программного пакета анализа последовательности (пакет Wisconsin, версия 10.0; Genetics Computer Group, Inc., Мэдисон, WIS.). [ 1 ] Биохимические результаты тестов ПЦР, а также фенотипические результаты испытаний всех остальных 32 известных видов Helicobacter были сопоставлены с результатами, приведенными недавно изолированными видами. [ 1 ] После наблюдения за результатами и объявления H. typhlonius новым видом Helicobacter , было создано новое филогенетическое дерево для рода Helicobacter . [ 1 ]
Геномика
[ редактировать ]Полный геном определяли с использованием секвенирования в реальном времени в режиме реального времени в 2015 году Frank et al. Используя иерархическую процесс сборки генома, последовательности были собраны в одно длинное чтение. [ 2 ]
Геном H. typhlonius составляет 1 920 000 пар оснований в длину, [ 2 ] с 2117 генами кодирования белка и 43 генами РНК с GC-контентом 38,8%. [ 2 ] По сравнению с другими членами рода Helicobacter, такими как H. hepaticus и H. pylori , H. Typhlonius имеет больший геном. [ 2 ] Кроме того, H. Typhlonius имеет GC-контент, который похож на H. hepaticus . [ 2 ] В то время как примерно 75% генов, кодирующих белок, было разделено между H. hepaticus и H. typhlonius были идентифицированы 468 уникальных генов, кодирующих белок , в H. typhlonius , которые составляют около 2% его всего генома. [ 2 ]
Кроме того, геном содержит отдельный остров патогенности с более низким GC-контентом и окруженный повторами. [ 2 ] Этот остров составляет около 650 000 пар оснований и ставит под угрозу 75 генов, кодирующих белок, которые включают систему секреции типа IV , которая отвечает за секретирование токсинов для помощи в вирулентности . [ 2 ]
Метаболизм
[ редактировать ]Helicobacter Typhlonius - это микроаэрофил , способный к окислительному фосфорилированию , используя кислород в качестве терминального акцептора электронов . [ 6 ] У этого вида ферментация пирувата ацетил и -КоА в ацетат возможна при отсутствии кислорода. [ 6 ] Кроме того, расщепление углеводов включает в себя как сахарозу , так и маннозу , а аминокислотную деградацию включает цитруллин , аспартат , глутамат и глутамин . [ 6 ] H. Typhlonius также способен к биосинтезу аргинина через цикл мочевины . [ 6 ]
Экология
[ редактировать ]Helicobacter Typhlonius может расти при 37 и 42 ° C, но его нельзя выращивать при 25 ° C или в присутствии 1,5% хлорида натрия. [ 1 ] Типичная спиральная морфология может также превратиться в кокки при выращивании в присутствии 1% глицина, но скорость роста остается прежним. [ 1 ] Оптима роста H. typhlonius происходит в микроаэробных условиях. [ 1 ] Обычно он обнаруживается в желудочно-кишечном тракте иммунодефицитных грызунов и людей и характеризуется последовательной промежуточной парой 166-базой в ее 16S рРНК, которая ранее была обнаружена с помощью анализа последовательности гена 16S рРНК. [ 1 ]
Значение
[ редактировать ]Helicobacter Typhlonius вызывает синдром раздраженного кишечника (СРК) как у людей, так и у животных, поэтому он используется для изучения патогенеза IBS и лечения. Считается, что [ 3 ] [ 1 ] [ 5 ] Наряду с этим, некоторые исследования связали Х. Тайфлония с регуляцией кишечных опухолей. [ 4 ] [ 7 ] Из изучения APC -мутантных мышей исследователи смогли использовать ПЦР -амплификацию для наблюдения определенных сегментов ДНК и сузить причину до двух возможных видов бактерий: Akkermansia muciniphila и H. typhlonius . [ 7 ] Была установлена положительная корреляция между распространенностью этих бактерий и размером опухоли. [ 7 ] вызывает тифлоколит у мышей с ослабленным иммунитетом. Typhlonius Также было обнаружено, что [ 8 ] Тайфлоколит характеризуется воспалением и некрозом слизистой оболочки в кишечном тракте, в частности, тканей кекальной, толстой и небольшой кишечника. [ 9 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а беременный в дюймовый и фон глин час я Дж k л м не а п Q. ведущий с Т Франклин К.Л., Горелик П.Л., Райли Л.К., Дьюирст Ф.Е., Ливингстон Р.С., Уорд Дж. М., Беквит С.С., Фокс Дж. Г. (ноябрь 2001 г.). «Helicobacter Typhlonius sp. Nov., Новые мышиные виды Helicobacter» . Журнал клинической микробиологии . 39 (11): 3920–6. doi : 10.1128/jcm.39.11.3920-3926.2001 . PMC 88465 . PMID 11682508 .
- ^ Jump up to: а беременный в дюймовый и фон глин час я Дж Фрэнк Дж., Дингман С., Шмитц А.М., Воссен Р.Х., из Омбур Г.Дж., Данн Г.Дж., Робанус-Мандай Е.К., Анвар С.А. (2016-01-08). «Полный генм последовательности мориновой патобинты Helicobacter Typhlonius» . Фронтинки по микробиологии . 6 : 1549. DOI : 10 3389/fmicb.2015,01549 . PMC 4705304 . PMID 2679178 .
- ^ Jump up to: а беременный Chichlowski M, Sharp JM, Vanderford DA, Myles MH, Hale LP (декабрь 2008 г.). «Helicobacter Typhlonius и Helicobacter Rodentium по-разному влияют на тяжесть воспаления толстой кишки и неоплазии, связанной с воспалением у мышей с дефицитом IL10» . Сравнительная медицина . 58 (6): 534–41. PMC 2710754 . PMID 19149410 .
- ^ Jump up to: а беременный Чичлоуски, Макия; Хейл, Лаура П. (2009-02-15). «Влияние геликобактерной инфекции на исследования: случай искоренения геликобактер из колоний исследований грызунов» . Сравнительная медицина . 59 (1): 10–17. PMC 2703140 . PMID 19295050 .
- ^ Jump up to: а беременный Scavizzi F, Raspa M (январь 2006 г.). «Helicobacter Typhlonius был обнаружен в половых органах трех штаммов мыши, но не передавал вертикально». Лабораторные животные . 40 (1): 70–9. doi : 10.1258/002367706775404390 . PMID 16460591 . S2CID 9941560 .
- ^ Jump up to: а беременный в дюймовый Kanehisa M, Furumichi M, Tanabe M, Sato Y, Morishima K (январь 2017 г.). «Кегг: новые перспективы на геномы, пути, заболевания и лекарства» . Исследование нуклеиновых кислот . 45 (D1): D353 - D361. doi : 10.1093/nar/gkw1092 . PMC 5210567 . PMID 27899662 .
- ^ Jump up to: а беременный в Dingemanse C, Belzer C, van Hijum SA, Günthel M, Salvatori D, den Dunnen JT, Kuijper EJ, Devilee P, de Vos WM, van Ommen GB, Robanus-Maandag EC (November 2015). "Akkermansia muciniphila and Helicobacter typhlonius modulate intestinal tumor development in mice". Carcinogenesis. 36 (11): 1388–96. doi:10.1093/carcin/bgv120. PMID 26320104.
- ^ Taylor NS, Xu S, Nambiar P, Dewhirst FE, Fox JG (July 2007). "Enterohepatic Helicobacter species are prevalent in mice from commercial and academic institutions in Asia, Europe, and North America". Journal of Clinical Microbiology. 45 (7): 2166–72. doi:10.1128/JCM.00137-07. PMC 1933014. PMID 17507523.
- ^ Barthold, SW; Smith, AL; Lord, PF; Bhatt, PN; Jacoby, RO; Main, AJ (August 1, 1982). "Epizootic coronaviral typhlocolitis in suckling mice". Laboratory Animal Science. 32 (4): 376–83. ISSN 0023-6764. PMID 6292575.