Аркобактер
| Аркобактер | |
|---|---|
| Научная классификация | |
| Домен: | |
| Тип: | |
| Сорт: | « Кампилобактерии »
|
| Заказ: | |
| Семья: | |
| Род: | Аркобактер Вандамм и др. 1991 год
|
| Типовой вид | |
| Аркобактер нитрофигилис (McClung et al. 1983) Vandamme et al. 1991 год
| |
| Разновидность [ 1 ] | |
|
Посмотреть текст | |
Arcobacter — род грамотрицательных спиралевидных бактерий типа Campylobacterota . [ 2 ] Он демонстрирует необычайно широкий диапазон сред обитания, а некоторые виды могут быть патогенами для человека и животных . [ 2 ] [ 3 ] Виды рода Arcobacter встречаются как в животных, так и в природных источниках, что делает его уникальным среди Campylobacterota. [ 4 ] В настоящее время этот род состоит из пяти видов: A. Butzleri , A. Cryaerophilus , A. Skirrowii , A. nitrofigilis и A. sulfidicus , хотя недавно было описано несколько других потенциально новых видов из различных сред. [ 4 ] [ 5 ] Три из этих пяти известных видов являются патогенными. [ 5 ] Представители этого рода были впервые выделены в 1977 году из абортированных плодов крупного рогатого скота. Это аэротолерантные кампилобактер- подобные организмы, ранее классифицированные как Campylobacter . [ 6 ] Род Arcobacter , по сути, был создан совсем недавно, в 1992 году. [ 7 ] Хотя они похожи на этот другой род, виды Arcobacter могут расти при более низких температурах, чем Campylobacter , а также на воздухе, чего Campylobacter не может. [ 6 ]
Название Arcobacter происходит от латинского arcus, означающего «лук», и греческого bacter, означающего «стержень», и его следует понимать как означающее «дугообразный стержень» или «изогнутый стержень». Это отсылка к характерной изогнутой форме, которой Arcobacter . обладает большинство клеток [ 8 ]
Филогения
[ редактировать ]Принятая в настоящее время таксономия основана на Списке названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN). [ 9 ] и Национальный центр биотехнологической информации (NCBI) [ 10 ]
| на основе 16S рРНК ДП _08_2023 [ 11 ] [ 12 ] [ 13 ] | 120 однокопийных маркерных белков на основе GTDB 08-RS214 [ 14 ] [ 15 ] [ 16 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
Неопределенные типы сидений:
- « A. hispanicus » Перес-Каталунья и др. 2018b существительное. обнаженная.
- « A. peruensis » Callbeck et al. 2019 год
- " A. ponticus " Каталония 2018 г.
- « А. Салис » Каталония 2018 г.
- « Ca. A. sulfidicus» Wirsen et al. 2002 г.
Патогенность
[ редактировать ]За последнее десятилетие благодаря усовершенствованию методов изоляции виды Arcobacter были обнаружены как патогены как для животных, так и для человека. [ 6 ] До сих пор мало что известно о механизмах патогенности и потенциальных факторах вирулентности Arcobacter spp. [ 17 ] Поскольку рутинная диагностика этих бактерий не проводилась, глобальная распространенность инфекции Arcobacter недооценена, а точные пути передачи неизвестны. [ 18 ] Некоторые данные указывают на то, что домашний скот может быть значительным резервуаром Arcobacter , и за последние несколько лет присутствию этих организмов в сырых мясных продуктах, а также в поверхностных и грунтовых водах уделяется все больше внимания. [ 17 ] У людей A.butzleri и реже A.ryaerophilus вызывают энтерит и иногда бактериемию . [ 6 ] Симптомы инфекции A.butzleri включают диарею, сопровождающуюся болью в животе, тошноту, рвоту или лихорадку. [ 6 ] Исследования пациентов, инфицированных A.butzleri, показали, что без лечения симптомы сохранялись в течение очень разного времени: от двух дней до нескольких недель. [ 7 ] Когда проводилась противомикробная терапия, инфекция была уничтожена в течение нескольких дней, и все штаммы, участвовавшие в исследовании, оказались чувствительными к назначенным антибиотикам. [ 7 ] Третий вид, A.skirrowii , также недавно был выделен от пациента с хронической диареей. [ 6 ] Хотя микробиологические и клинические особенности Arcobacter еще не четко определены, первоначальные исследования A. Butzleri позволяют предположить, что эти бактерии демонстрируют сходные микробиологические и клинические характеристики с C. jejuni , но в большей степени связаны с стойкой водянистой диареей, чем с кровавой диареей. связанный с C. jejuni . [ 6 ] Недавние исследования показывают, что A.butzleri индуцирует дисфункцию эпителиального барьера за счет изменений в белках плотных соединений и индукции эпителиального апоптоза . [ 18 ] Судя по этой модели, вирулентность A. Butzleri имеет две фазы. Сначала наблюдался первоначальный эффект на плотные контакты, за которым следовал поздний эффект на цитотоксичность из-за некроза и индукции апоптоза. [ 18 ]
Непатогенные штаммы
[ редактировать ]A. nitrofigilis — азотфиксирующая бактерия, выделенная из корней солончакового растения Spartina alterniflora . [ 5 ] A. sulfidicus — облигатный микроаэрофил, окисляющий сульфиды и являющийся автотрофным продуцентом нитчатой серы . [ 5 ] Большие популяции этой бактерии образуют маты из твердых белых серных нитей. [ 19 ] Эти маты полезны для закрепления бактерий на каменистых поверхностях перед лицом текущих подземных гидротермальных жидкостей, а также служат важным ковровым покрытием вокруг гидротермальных источников , которое привлекает других животных в это место и побуждает их селиться и расти. [ 19 ] Один интересный потенциальный новый вид Arcobacter , получивший обозначение LA31BT, был выделен из воды, собранной в гиперсоленой лагуне. [ 4 ] Предварительная характеристика, основанная на анализе последовательности гена 16S рРНК, показала, что LA31BT на 94% идентична A. nitrofigilis , типовому виду рода, а таксономические исследования подтвердили филогенетическую принадлежность штамма LA31BT к роду Arcobacter . [ 4 ] Однако другие аналитические методы показали, что LA31BT отличается от всех известных видов Arcobacter . Наиболее примечательно и интересно то, что LA31BT оказался облигатным галофилом , признак, не обнаруженный среди признанных Arcobacter . видов [ 4 ]
Другой необычный вид Arcobacter , обозначенный штаммом CAB, был выделен из морских отложений и, как было обнаружено, обладает способностью к росту за счет восстановления перхлората . Это единственный представитель Campylobacterota в чистой культуре, обладающий этим редким метаболизмом. [ 20 ] Было обнаружено, что в отличие от большинства видов Arcobacter , CAB расщепляет углеводы, включая фруктозу и катехин , а его клеткам часто не хватает характерной кривизны, типичной для рода Arcobacter . [ 20 ]
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ «ЛПСН бактерио.нет» . Архивировано из оригинала 5 августа 2018 года . Проверено 18 марта 2016 г.
- ^ Jump up to: а б Мэдиган Т. и др. (2009) Биология микроорганизмов Брока , 12-е издание. Сан-Франциско: Pearson Education
- ^ Миллер, В.Г.; Паркер, Коннектикут; Рубенфилд, М.; Мендз, Г.Л.; Вестен, ММСМ; Ассери, Д.В.; Штольц, Дж. Ф.; Бинньюис, ТТ; Халлин, ПФ; Ван, Г.; Малек, Дж.А.; Рогосин А.; Станкер, Л.Х.; Мандрелл, RE (2007). Фэрхед, Сесиль (ред.). «Полная последовательность генома и анализ Epsilonproteobacterium Arcobacter Butzleri » . ПЛОС ОДИН . 2 (12): е1358. Бибкод : 2007PLoSO...2.1358M . дои : 10.1371/journal.pone.0001358 . ПМК 2147049 . ПМИД 18159241 .
- ^ Jump up to: а б с д и Доначи, Стюарт (2005). « Arcobacter halophilus sp. nov., первый облигатный галофил рода Arcobacter » . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 55 (Часть 3): 1271–1277. дои : 10.1099/ijs.0.63581-0 . ПМИД 15879267 .
- ^ Jump up to: а б с д Фера, Монтана (2004). «Обнаружение видов Arcobacter в прибрежной среде Средиземного моря» . Прикладная и экологическая микробиология . 70 (3): 1271–1276. Бибкод : 2004ApEnM..70.1271F . дои : 10.1128/АЕМ.70.3.1271-1276.2004 . ПМЦ 368354 . ПМИД 15006743 .
- ^ Jump up to: а б с д и ж г Новые инфекционные заболевания cdc.gov. Архивировано 5 ноября 2009 г. в Wayback Machine.
- ^ Jump up to: а б с Прузе-Молеон, Валери (2006). « Arcobacter Butzleri : недооцененный энтеропатоген» . Новые инфекционные заболевания . 12 (2): 307–309. дои : 10.3201/eid1202.050570 . ПМК 3373082 . ПМИД 16494760 .
- ^ П. Вандамм; Э. Фальсен; Р. Россау; Б. Хосте; П. Сегерс; Р. Титгат и Дж. Де Лей (январь 1991 г.). «Пересмотр таксономии Campylobacter , Helicobacter и Wolinella : исправление родовых описаний и предложение Arcobacter gen. nov» . Международный журнал систематической бактериологии . 41 (1): 88–103. дои : 10.1099/00207713-41-1-88 . ПМИД 1704793 .
- ^ АС Парте; и др. «Аркобактер» . Список названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN) . Проверено 9 сентября 2023 г.
- ^ Сэйерс; и др. «Аркобактер» . База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Проверено 9 сентября 2023 г.
- ^ «ЛТП» . Проверено 20 ноября 2023 г.
- ^ «Дерево LTP_all в формате Ньюика» . Проверено 20 ноября 2023 г.
- ^ «Примечания к выпуску LTP_08_2023» (PDF) . Проверено 20 ноября 2023 г.
- ^ «Выпуск GTDB 08-RS214» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
- ^ "bac120_r214.sp_label" . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
- ^ «История таксонов» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
- ^ Jump up to: а б Ленер, А.; Тасара, Т.; Стефан, Р. (июль 2005 г.). «Соответствующие аспекты видов Arcobacter как потенциальных патогенов пищевого происхождения». Межд. J. Пищевая микробиол . 102 (2): 127–35. doi : 10.1016/j.ijfoodmicro.2005.03.003 . ПМИД 15982771 .
- ^ Jump up to: а б с Бакер, Роланд (2009). « Arcobacter Butzleri вызывает дисфункцию барьера в клетках кишечника HT-29/B6» . Журнал инфекционных болезней . 200 (5): 756–764. дои : 10.1086/600868 . ПМИД 19604116 .
- ^ Jump up to: а б Вирсен, Карл. «Жизнь процветает глубоко под морским дном?» . Океанографический институт Вудс-Хоул.
- ^ Jump up to: а б Карлстрем, Шарлотта И.; Ван, Оувей; Мельник, Райан А.; Бауэр, Стефан; Ли, Джойс; Энгельбректсон, Анна; Коутс, Джон Д. (2013). «Физиологическое и генетическое описание диссимиляционного восстановления перхлората новой морской бактерией Arcobacter sp., штамм CAB» . мБио . 4 (3): e00217-13. дои : 10.1128/mBio.00217-13 . ПМЦ 3656443 . ПМИД 23695836 .
