Кронобактер Саказаки
| Кронобактер Саказаки | |
|---|---|
| |
| Кронобактер Саказаки | |
Научная классификация 
| |
| Домен: | Бактерии |
| Тип: | Псевдомонадота |
| Сорт: | Гаммапротеобактерии |
| Заказ: | Энтеробактерии |
| Семья: | Энтеробактерии |
| Род: | Кронобактер |
| Разновидность: | С. саказакии
|
| Биномиальное имя | |
| Кронобактер Саказаки (Фармер и др., 1980 г.) [ 1 ]
| |
Cronobacter sakazakii , который до 2007 года назывался Enterobacter sakazakii , [ 2 ] [ 3 ] представляет собой условно патогенную грамотрицательную - палочковидную , патогенную бактерию которая может жить в очень сухих местах, что также известно как ксеротолерантность. C. sakazakii использует ряд генов, чтобы пережить высыхание. [ 4 ] и эта ксеротолерантность может быть штаммоспецифичной. [ 5 ] Большинство случаев C. sakazakii приходится на взрослых, но старшего возраста с низкой массой тела при рождении недоношенные новорожденные и дети наибольшему риску подвержены . Возбудитель является редкой причиной инвазивной инфекции у младенцев с исторически высоким уровнем смертности (40–80%). [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ] [ 9 ]
У младенцев он может вызывать бактериемию , менингит и некротический энтероколит . Большинство случаев неонатальной инфекции C. sakazakii были связаны с использованием сухой детской смеси. [ 7 ] [ 9 ] при этом некоторые штаммы способны выживать в высушенном состоянии более двух лет. [ 10 ] Однако не все случаи были связаны с загрязненной детской смесью. В ноябре 2011 года несколько партий Kotex тампонов были отозваны из-за заражения Cronobacter ( E. sakazakii ). В одном исследовании возбудитель был обнаружен в 12% полевых овощей и 13% гидропонных овощей. [ 11 ] [ 12 ]
Все Cronobacter виды , за исключением C. condimenti , ретроспективно были связаны с клиническими случаями инфекции как у взрослых, так и у младенцев. Однако мультилокусное типирование последовательностей [ 13 ] показало, что большинство случаев неонатального менингита за последние 30 лет в 6 странах были связаны только с одной генетической линией вида Cronobacter sakazakii, называемой «тип последовательности 4» или «ST4», [ 14 ] и поэтому этот клон, по-видимому, вызывает наибольшую озабоченность в отношении детских инфекций.
Бактерия распространена повсеместно: ее выделяют из различных сред и продуктов питания; большинство случаев Cronobacter встречается у взрослого населения. Однако основное внимание привлекла связь с порошкообразными смесями, загрязненными изнутри или снаружи. По данным мультилокусного анализа последовательностей (MLSA), род возник ~40 млн лет назад , а наиболее клинически значимый вид, C. sakazakii , был различим ~15-23 млн лет назад. [ 15 ]
Таксономия
[ редактировать ]E. sakazakii был определен в 1980 году JJ Farmer III et al . [ 1 ] Гибридизация ДНК-ДНК показала, что E. sakazakii на 53–54% связан с видами двух разных родов: Enterobacter и Citrobacter . Однако разнообразные биогруппы внутри E. sakazakii были описаны , и Фармер и др. предположили, что они могут представлять разные виды, и для уточнения потребовались дальнейшие исследования. [ 1 ]
Таксономические взаимоотношения между штаммами E. sakazakii изучены с использованием полноразмерного секвенирования гена 16S рРНК , гибридизации ДНК-ДНК, мультилокусного секвенирования (MLST), f- AFLP , автоматического риботипирования . Это привело к классификации E. sakazakii как нового рода Cronobacter в составе Enterobacteriaceae , первоначально включавшего четыре названных вида в 2007 году. Таксономия была расширена до пяти названных видов в 2008 году, а совсем недавно (2011 г.) до семи названных видов. [ 2 ] [ 3 ] [ 16 ]
Первоначальными четырьмя названными видами в 2007 году были Cronobacter sakazakii (включающий два подвида), C. turicensis , C. muytjensii и C. dublinensis (включающий три подвида), а также неназванный вид, называемый геномовидом I Cronobacter. Таксономия была пересмотрена в 2008 году и теперь включают пятый названный вид C. Malonaticus , который в 2007 году считался подвидом C. sakazakii . В 2012 году геномотип I Cronobacter был официально переименован в Cronobacter Universalis , а седьмой вид был описан под названием Cronobacter condimenti .
Этимология
[ редактировать ]Первое документально подтвержденное выделение того, что впоследствии стало известно как Cronobacter sakazakii, произошло из банки с сухим молоком в 1950 году, хотя эти организмы, вероятно, существовали уже миллионы лет. В 1980 году Джон Дж. Фармер III предложил название Enterobacter sakazakii для так называемого «желтопигментированного E. cloacae» в честь японского бактериолога Риичи Саказаки . В течение следующих десятилетий E. sakazakii был вовлечен во множество случаев менингита и сепсиса среди младенцев, часто в сочетании с сухой детской смесью. В 2007 году был создан род Cronobacter для включения биогруппы E. sakazakii с C. sakazakii в качестве типового вида. Род был назван в честь Кроноса , титана из греческих мифов, который пожирал своих детей, когда они рождались. [ 17 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Перейти обратно: а б с Фармер Джей-Джей III, Эсбери Массачусетс, Хикман Ф.В., Бреннер DJ (1980). « Enterobacter sakazakii : новый вид Enterobacteriaceae, выделенный из клинических образцов» . Int J Syst Bacteriol . 30 (3). Исследовательская группа Enterobacteriaceae (США): 569–84. дои : 10.1099/00207713-30-3-569 .
- ^ Перейти обратно: а б Иверсен С; Муллейн Н; Барбара Маккарделл; и др. (2008). «Cronobacter gen. nov., новый род для размещения биогрупп Enterobacter sakazakii, а также предложение Cronobacter sakazakii gen. nov. com. nov., C. malonaticus sp. nov., C. turicensis sp. nov., C. muytjensii sp., C. dublinensis sp., Геновид 1 Cronobacter, а также C. dublinensis subsp nov. и C. dublinensis subsp nov.» (PDF) . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 58 (6): 1442–7. дои : 10.1099/ijs.0.65577-0 . ПМИД 18523192 . S2CID 6609941 . Архивировано из оригинала (PDF) 7 февраля 2020 г.
- ^ Перейти обратно: а б Джозеф; и др. (2011). « Cronobacter condimenti sp. nov., выделенный из мяса с пряностями, и Cronobacter Universalis sp. nov., новое видовое обозначение для геномотипа 1 Cronobacter sp., выделенного из инфекции ног, воды и пищевых ингредиентов» . Int J Syst Evol Microbiol . 62 (Часть 6): 1277–83. дои : 10.1099/ijs.0.032292-0 . ПМИД 22661070 .
- ^ Срикумар С., Цао Ю., Ян К., Ван Хорд К., Нгуен С., Куни С., Гопинатх Г.Р., Талл Б.Д., Сивасанкаран С.К., Ленер А., Стефан Р., Фэннинг С. (январь 2019 г.). «Обзор транскрипции ксеротолерантности Cronobacter sakazakii SP291 на основе секвенирования РНК» . Прикладная и экологическая микробиология . 85 (3). Бибкод : 2019ApEnM..85E1993S . дои : 10.1128/АЕМ.01993-18 . ПМК 6344630 . ПМИД 30446557 .
- ^ Цао Й., Девер К., Ван Хорд К., Сивасанкаран С.К., Нгуен С.В., Макори Г., Найтани А., Гопинатх Г.Р., Талл Б., Ленер А., Стефан Р., Шрикумар С., Фэннинг С. (ноябрь 2021 г.). «Изменения в транскрипционном ландшафте обеспечивают различную толерантность к высыханию у клинических Cronobacter sakazakii» . Прикладная и экологическая микробиология . 87 (24): e0083021. Бибкод : 2021ApEnM..87E.830C . дои : 10.1128/AEM.00830-21 . ПМЦ 8612285 . ПМИД 34644165 .
- ^ Хантер, Кэтрин Дж.; Петросян, Микаэл; Форд, Анри Р.; Прасадарао, Немани В. (28 апреля 2017 г.). «Enterobacter sakazakii: новый патоген у младенцев и новорожденных» . Хирургические инфекции . 9 (5): 533–539. дои : 10.1089/sur.2008.006 . ISSN 1096-2964 . ПМК 2579942 . ПМИД 18687047 .
- ^ Перейти обратно: а б Центры по профилактике заболеваний (CDC) (апрель 2002 г.). «Инфекции Enterobacter sakazakii, связанные с использованием сухих детских смесей - Теннесси, 2001». ММВР. Еженедельный отчет о заболеваемости и смертности . 51 (14): 297–300. ПМИД 12002167 . Бесплатный полный текст
- ^ Лай К.К. (март 2001 г.). «Инфекции Enterobacter sakazakii среди новорожденных, младенцев, детей и взрослых. Отчеты о случаях заболевания и обзор литературы» . Лекарство . 80 (2): 113–22. дои : 10.1097/00005792-200103000-00004 . ПМИД 11307587 . S2CID 7515008 .
- ^ Перейти обратно: а б Боуэн AB, Брейден CR (август 2006 г.). «Инвазивная болезнь Enterobacter sakazakii у детей раннего возраста» . Новые инфекционные заболевания . 12 (8): 1185–9. дои : 10.3201/eid1208.051509 . ПМЦ 3291213 . ПМИД 16965695 .
- ^ Кабилла-Бэррон Дж., Форсайт С. (2007). «Сухой стресс и время выживания Enterobacter sakazakii и других Enterobacteriaceae в обезвоженной детской смеси». Журнал защиты пищевых продуктов . 13 : 467–472.
- ^ Уэда, Сигэко (01 января 2017 г.). «Наличие видов Cronobacter в сушеных продуктах, свежих овощах и почве» . Наука биоконтроля . 22 (1): 55–59. дои : 10.4265/био.22.55 . ISSN 1884-0205 . ПМИД 28367871 .
- ^ «Отзыв FDA тампонов Kotex» . ТОО «Сигер Вайс». 16 ноября 2011 г. Архивировано из оригинала 5 сентября 2014 г. Проверено 29 февраля 2012 г.
- ^ Болдуин; и др. (2009). «Мультилокусное типирование последовательностей Cronobacter sakazakii и Cronobacter Malonaticus выявляет стабильные клональные структуры с клиническим значением, которые не коррелируют с биотипами» . БМК Микробиология . 9 : 223. дои : 10.1186/1471-2180-9-223 . ПМК 2770063 . ПМИД 19852808 .
- ^ Джозеф и Форсайт (2011). «Ассоциация Cronobacter sakazakii ST4 с неонатальными инфекциями» . Новые инфекционные заболевания . 17 (9): 1713–5. дои : 10.3201/eid1709.110260 . ПМК 3322087 . ПМИД 21888801 .
- ^ Джозеф С., Сонбол Х., Харири С., Десаи П., Макклелланд М., Форсайт С.Дж. (сентябрь 2012 г.). «Разнообразие рода Cronobacter, выявленное методом мультилокусного типирования последовательностей» . Журнал клинической микробиологии . 50 (9): 3031–9. дои : 10.1128/JCM.00905-12 . ПМЦ 3421776 . ПМИД 22785185 .
- ^ Иверсен С., Ленер А., Муллейн Н., Бидлас Э., Клинверк И., Маругг Дж., Фэннинг С., Стефан Р., Йостен Х (2007). «Таксономия Enterobacter sakazakii: предложение нового рода Cronobacter gen. nov. и описания Cronobacter sakazakii comb. nov nov., Cronobacter dublinensis sp . Эволюционная биология BMC . 7 (1): 64. Бибкод : 2007BMCEE...7...64I . дои : 10.1186/1471-2148-7-64 . ПМК 1868726 . ПМИД 17439656 . Бесплатный полный текст
- ^ Генри, Ронни (ноябрь 2018 г.). «Этимология: Cronobacter sakazakii» . Экстренное заражение Dis . 24 (11): 2124. doi : 10.3201/eid2411.et2411 . ПМК 6199989 .