еврокарбдб
EuroCarbDB — это финансируемая ЕС инициатива по созданию программного обеспечения и стандартов для систематического сбора углеводных структур и их экспериментальных данных, которая была прекращена в 2010 году из-за отсутствия финансирования. Проект включал базу данных известных структур углеводов и экспериментальных данных, в частности данных масс-спектрометрии , ВЭЖХ и ЯМР , доступ к которым осуществляется через веб-интерфейс. [1] который обеспечивает просмотр, поиск и внесение структур и данных в базу данных. В рамках проекта также создается ряд сопутствующих биоинформатических инструментов для исследователей углеводов:
- GlycanBuilder, Java-апплет для рисования гликановых структур.
- GlycoWorkbench, автономное Java-приложение для полуавтоматического анализа и аннотирования масс-спектров гликанов.
- GlycoPeakfinder, веб-приложение для расчета состава гликанов на основе массовых данных
Каноническая онлайн-версия EuroCarbDB размещалась Европейским институтом биоинформатики по адресу www.ebi.ac.uk. [2] до 2012 года, а затем Relax.organ.su.se. [3]
Код EuroCarb с тех пор был включен и расширен UniCarb-DB. [4] который также включает в себя работу несуществующей базы данных GlycoSuite .
Ссылки
[ редактировать ]- ^ [1] [ постоянная мертвая ссылка ]
- ^ [2] [ постоянная мертвая ссылка ]
- ^ Маасс, Мэтт Харрисон, Алессио Черони, Мэтью Кэмпбелл, Хирен Джоши, Магнус Лундборг, Кай. «Домашняя страница EuroCarbDB» . расслабиться.орган.су.се .
{{cite web}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ «ЮниКарб-ДБ» . unicarb-db.biomedicine.gu.se . Архивировано из оригинала 25 октября 2016 г. Проверено 12 августа 2019 г.