Последовательная ходьба

Последовательное блуждание — это метод, который можно использовать для решения различных 2D- спектров ЯМР . В 2D-эксперименте перекрестные пики должны быть соотнесены с правильными ядрами. С помощью последовательного обхода можно соотнести правильные ядра с их перекрестными пиками. Назначенные кросспики могут дать ценную информацию, например, о пространственных взаимодействиях между ядрами.

, в NOESY ДНК Например каждый нуклеотид имеет свой собственный химический сдвиг. В общем, A расположены ниже по течению, T — выше по течению, а C и G — промежуточные. Каждый нуклеотид имеет протоны на сахаре дезоксирибозы, которые можно присвоить с помощью последовательного обхода. Для этого необходимо обнаружить первый нуклеотид в последовательности. Знание последовательности ДНК помогает, но в целом первый нуклеотид можно определить, используя следующие правила.

1. 2' и 2" протоны нуклеотида появятся в его столбце, а также в столбце следующего нуклеотида в последовательности. Например, в последовательности CATG в столбце для С свой 2' и 2" протоны будут видны, но ни один из других нуклеотидов. Для А будут видны собственные 2' и 2" протоны, а также протоны С.

2. Метильные группы нуклеотида указаны в столбце для нуклеотида, содержащего метильную группу, а также для нуклеотида, предшествующего ей. Например, в CATG A и T будут содержать метильный пик, соответствующий метильной группе T, а G - нет.

Как только первый нуклеотид найден, вы определяете, какой нуклеотид находится рядом с ним, поскольку он должен содержать 2'- и 2'-протоны предыдущего нуклеотида. Это делается путем «прогулки» по спектру. Затем этот процесс повторяется последовательно до тех пор, пока не будет найден первый нуклеотид. все нуклеотиды присвоены.