Набор инструментов для спинного мозга
 | Эта статья нуждается в дополнительных цитатах для проверки . ( июль 2016 г. ) |
| Разработчик(и) | НейроПоли |
|---|---|
| Стабильная версия | 3.0.3 / 26 апреля 2017 г |
| Репозиторий | github |
| Написано в | Питон |
| Операционная система | Линукс , Мак ОС Х |
| Размер | 140 МБ |
| Доступно в | Английский |
| Тип | Цифровая визуализация |
| Лицензия | Лицензия MIT |
Набор инструментов для исследования спинного мозга (SCT) [1] представляет собой набор инструментов анализа, оптимизированных для спинного мозга изображений , полученных с помощью магнитно-резонансной томографии . Основные функции включают сегментацию, регистрацию и расчет анатомических показателей.
Функции
[ редактировать ]- Propseg Автоматическая сегментация спинного мозга. [2]
- Шаблон PAM50 представляет собой анатомический шаблон спинного мозга, который покрывает весь спинной мозг и ствол мозга и доступен для контрастирования МРТ в Т1, Т2 и Т2* режиме. Шаблон PAM50 включает вероятностную сегментацию белого вещества, серого вещества, спинномозговой жидкости, а также вероятностные атласы субрегионов серого вещества и путей белого вещества. [3] [4] Шаблон также включает сегментацию уровней позвоночника для автоматической оценки показателей в определенных местах. [5]
- Атлас белого вещества, включающий 29 масок частичного объема, из которых состоят участки материи. [6]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Де Леенер Б., Леви С., Дюпон С.М., Фонов В.С., Стиков Н., Луи Коллинз Д. и др. SCT: Spinal Cord Toolbox, программное обеспечение с открытым исходным кодом для обработки данных МРТ спинного мозга. Нейровизуализация. 2017;145: 24–43. doi:10.1016/j.neuroimage.2016.10.009
- ^ Де Леенер Б., Коэн-Адад Дж., Кадури С. Автоматическая сегментация спинного мозга и позвоночного канала в сочетании с маркировкой позвонков. Медицинская визуализация, транзакции IEEE (в печати). DOI: 10.1109/TMI.2015.2437192
- ^ Фонов В., Ле Тротер А., Тасо М., Де Леенер Б., Левек Г., Бенаму М., Сдика М., Бенали Х., Прадат П.Ф., Коллинз Д.Л., Калло В., Коэн-Адад Дж. Структура интегрированной МРТ среднего показателя спинного мозга белое и серое вещество: шаблон MNI-Poly-AMU. Нейроизображение 2014. DOI: 10.1016/j.neuroimage.2014.08.057.
- ^ Де Леенер Б., Фонов В., Коллинз Д.Л., Калло В., Стиков Н., Коэн-Адад Дж. PAM50: Мультимодальный шаблон ствола головного мозга и спинного мозга, совместимый с пространством ICBM152. Материалы 25-го ежегодного собрания ISMRM, Гонолулу, США. 2017.
- ^ Кадотт Д.В., Кадотт А., Коэн-Адад Дж., Флит Д., Ливне М., Микулис Д., Фелингс М.Г. Разрешение анатомической изменчивости шейного отдела спинного мозга человека: решение, облегчающее расширенную визуализацию нейронов. Материалы 22-го ежегодного собрания ISMRM, Милан, Италия, 2014: 1719.
- ^ Леви С., Бенаму М., Нааман С., Рейнвилл П., Калло В., Коэн-Адад Дж. Атлас белого вещества спинного мозга человека с оценкой эффекта частичного объема. Нейровизуализация. 2015;119: 262–271. doi:10.1016/j.neuroimage.2015.06.040
 | Эта научная статья о программном обеспечении незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |
 | Эта медицинская диагностическая статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |