Производство семян и генное разнообразие

Генетическое разнообразие часто является важным фактором, например, применительно к лесным культурам.

Групповое происхождение популяции

Рассмотрите генофонд семенной культуры или другого источника семян вместе с родителями. Генофонд велик, так как в семенном урожае много семян, поэтому генетического дрейфа нет . Вероятность того, что первый ген происходит от генотипа i в семенном саду, равна pi _, а вероятность того, что второй ген происходит от генотипа j, равна _pj . Вероятность того, что эти два гена происходят от садовых генотипов i и j, идентичных по происхождению (IBD), равна θ _ij . Это метод совместного происхождения Малеко. (или «коэффициент родства»; «коэффициент родства» — это аналогичная мера, которую можно вычислить) между генотипами i и j. Вероятность того, что какая-либо пара генов является ВЗК, Θ, можно найти путем сложения всех возможных пар генов от N родителей. Формула группового происхождения (из которой можно получить генное разнообразие) семенных садовых культур:

Θ= $\sum _{i=1}^{N}\sum _{j=1}^{N}$ п _я п _j θ _ij .

Групповое родство семенных культур можно разделить на два термина: один для самородства, а другой для перекрестного родства:

Θ= $\sum _{i=1}^{N}$ п _я ² (1+F _i )/2 + $\sum _{i=1}^{N}$ $\sum _{j=1}^{N}$ p _i p _j θ _ij , последнее суммирование, исключающее j=i.

Давайте рассмотрим простой случай. Если генотипы семенного сада неродственны, второй член равен нулю, если нет инбридинга, первый член становится простым. При отсутствии родства и инбридинга номер статуса (NS _, эффективное число родителей) становится следующим:

Н _С = 1/ $\sum _{i=1}^{N}$ п _я ²

Подобные, но менее развитые выражения использовались ранее много раз, они имеют сходство с концепцией эффективной численности популяции, определенной А. Робертсоном в 1961 году.