Беркли Мадонна
| Оригинальный автор(ы) | Роберт Мэйси и Джордж Остер |
|---|---|
| Стабильная версия | Версия 10.2.6 / 2021-02-28 |
| Написано в | С, Ява |
| Операционная система | Windows, МакОС |
| Платформа | ПК, Макинтош |
| Тип | Математическое программное обеспечение |
| Лицензия | Собственный |
| Веб-сайт | www |
Berkeley Madonna — пакет программного обеспечения для математического моделирования, разработанный в Калифорнийском университете в Беркли Робертом Мейси и Джорджем Остером . Он численно решает обыкновенные дифференциальные уравнения и разностные уравнения , изначально разработанные для выполнения STELLA . программ [1] [2]
Его сила заключается в относительно простом синтаксисе для определения дифференциальных уравнений в сочетании с простым, но мощным пользовательским интерфейсом. В частности, Berkeley Madonna предоставляет возможность размещения параметров на ползунке, который, в свою очередь, может перемещаться пользователем для изменения значения. Такая визуализация позволяет быстро оценить, подходит ли конкретный класс модели для описания данных, подлежащих анализу и моделированию, а затем легко передать модели другим специалистам, например лицам, принимающим медицинские решения.
Использование
[ редактировать ]Он стал стандартом при разработке и распространении фармакометрических моделей, описывающих концентрацию лекарственного средства и ее влияние на разработку лекарств. [3] [4] а также моделирование физиологических процессов. [5] Сообщество пользователей существует в форме группы пользователей LinkedIn. [6] с более чем 750 участниками (февраль 2023 г.).
Использование моделирования системной динамики распространилось и на другие области, такие как системная физика, эпидемиология, [7] здоровье окружающей среды, [8] и популяционная экология. [9]
Версии
[ редактировать ]Существует две версии Berkeley Madonna: бесплатная версия со слегка ограниченным функционалом и лицензионная версия, зарегистрированная на частных лиц.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Мейси, Роберт; Остер. Джордж; Занли, Тим (28 декабря 2009 г.). Руководство пользователя Berkeley Madonna. Архивировано 26 февраля 2015 г. в Wayback Machine Калифорнийском университете . Кафедра молекулярной и клеточной биологии. Беркли, Калифорния.
- ^ Марколин, Фрэнк; Грейб, Майкл; Наяк, Смита; Занли, Тим; Остер, Джордж; Мэйси, Роберт (28 февраля 2021 г.). Руководство пользователя Berkeley Madonna, версия 10.2.6 Berkeley Madonna, Inc., Олбани, Калифорния 94706.
- ^ Краузе, А; Лоу, Пи Джей (28 мая 2014 г.). «Визуализация и связь фармакометрических моделей с Мадонной Беркли» . CPT: Фармакометрика и системная фармакология . 3 (5): 113. doi : 10.1038/psp.2014.13 . ПМК 4055786 . ПМИД 24872204 . стр. 1–20.
- ^ Марколин, Ф; Фурт, Дж; Наяк, С; Грабе, М; Мейси, Род-Айленд (15 октября 2021 г.). «Беркли Мадонна Версия 10 – Пакет моделирования для решения математических моделей» . CPT: Фармакометрика и системная фармакология . 11 (3): 290–301. дои : 10.1002/psp4.12757 . ПМЦ 8923725 . ПМИД 35064965 . стр. 290-301.
- ^ Чжун, Х.; Уэйд, С.М.; Вульф, ПиДжей; Линдерман, Джей Джей; Трейнор-младший; Нойбиг, Р.Р. (2003). «Модель пространственной фокусировки сигналов G-белка» . Журнал биологической химии . 278 (9): 7278–7284. дои : 10.1074/jbc.m208819200 . ПМИД 12446706 .
- ^ «Группа LinkedIn Беркли Мадонна» . LinkedIn.com . Проверено 8 февраля 2023 г.
- ^ Винницкий, Эмилия; Уайт, Ричард (13 мая 2010 г.). Введение в моделирование инфекционных заболеваний . Издательство Оксфордского университета. ISBN 978-0-19-856576-5 .
- ^ Робсон, МГ; Тоскано, Вашингтон (2007). Оценка риска для здоровья окружающей среды . Джон Уайли и сыновья. ISBN 9780787988593 .
- ^ Веллер, Флориан; Шерли, Ричард Б.; Уоллер, Лорен Дж.; Людиня, Катрин; Гельденхейс, Деон; Шеннон, Линн Дж.; Жарр, Астрид (2016). «Моделирование системной динамики находящихся под угрозой исчезновения популяций африканских пингвинов на островах Дайер и Роббен, Южная Африка». Экологическое моделирование . 327 : 44–56. Бибкод : 2016EcMod.327...44W . doi : 10.1016/j.ecolmodel.2016.01.011 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- «Беркли-Мадонна. Реализация модели Икеды» . стр. 582–585. (требуется подписка)