Популяционный анализ Малликена
Обвинения Малликена возникают в результате анализа населения Малликена. [1] [2] и обеспечивают средства оценки частичных атомных зарядов на основе расчетов, выполняемых методами вычислительной химии , особенно тех, которые основаны на методе молекулярных орбиталей линейной комбинации атомных орбиталей , и обычно используются в качестве переменных в линейной регрессии (QSAR [3] ) процедуры. [4] Метод был разработан Робертом С. Малликеном , в честь которого метод назван. Если коэффициенты базисных функций на молекулярной орбитали равны C μi для μ-й базисной функции на i-й молекулярной орбитали, члены матрицы плотности будут следующими:
для системы с закрытыми оболочками, где каждая молекулярная орбиталь занята дважды. Матрица населения тогда есть условия
– матрица перекрытия базисных функций. Сумма всех членов подведены итоги валовой орбитальный продукт для орбитальных - . Сумма валовых орбитальных продуктов равна N — общему числу электронов. Население Малликена приписывает электронный заряд данному атому A , известному как общая популяция атомов: как сумма по всем орбиталям принадлежащий атому А. Заряд, , затем определяется как разница между количеством электронов на изолированном свободном атоме, которая представляет собой атомный номер и общая численность атомов:
Математические задачи
[ редактировать ]Внедиагональные термины
[ редактировать ]Одной из проблем этого подхода является равное разделение недиагональных членов между двумя базисными функциями. Это приводит к преувеличенному разделению зарядов в молекулах. В модифицированном популяционном анализе Малликена [5] эту проблему можно уменьшить, разделив перекрывающиеся популяции между соответствующими орбитальными популяциями и в соотношении последних. Этот выбор, хотя и произвольный, каким-то образом связывает разделение с разницей электроотрицательности между соответствующими атомами.
плохое определение
[ редактировать ]Другая проблема заключается в том, что заряды Малликена явно чувствительны к выбору базисного набора. В принципе, полный базисный набор молекулы можно составить, поместив большой набор функций на один атом. В схеме Малликена все электроны тогда были бы отнесены к этому атому. Таким образом, метод не имеет полного предела базисного набора, поскольку точное значение зависит от способа приближения к пределу. Это также означает, что обвинения не определены, поскольку нет точного ответа. В результате сходимости базисных наборов зарядов не существует, и разные семейства базисных наборов могут давать совершенно разные результаты.
Эти проблемы можно решить с помощью современных методов расчета суммарных зарядов атомов, таких как электростатический и химический анализ по плотности (DDEC), [6] анализ электростатического потенциала, [7] и анализ естественной популяции. [8]
См. также
[ редактировать ]- Частичный заряд для других методов, используемых для оценки атомных зарядов в молекулах.
- Веса Чиргвина-Коулсона , перекрытие орбит, используемое для расчета популяций Малликена
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Малликен, Р.С. (1955). «Электронный популяционный анализ молекулярных волновых функций LCAO-MO. I». Журнал химической физики . 23 (10): 1833–1840. Бибкод : 1955ЖЧФ..23.1833М . дои : 10.1063/1.1740588 .
- ^ И. Г. Чизмадиа, Теория и практика расчетов МО органических молекул, Elsevier, Амстердам, 1976.
- ^ Лич, Эндрю Р. (2001). Молекулярное моделирование: принципы и приложения . Энглвуд Клиффс, Нью-Джерси: Прентис Холл. ISBN 0-582-38210-6 .
- ^ Олингер, Уильям С.; Филип Э. Клунцингер; Бернард Дж. Деппмайер; Уоррен Дж. Хехре (январь 2009 г.). «Эффективный расчет теплот образования». Журнал физической химии А. 113 (10). Публикации ACS: 2165–2175. Бибкод : 2009JPCA..113.2165O . дои : 10.1021/jp810144q . ПМИД 19222177 .
- ^ Бикельхаупт, FM; ван Эйкема Хоммес, Нью-Джерси; Фонсека Герра, К.; Баерендс, Э.Дж. (1996). «Связь электронной пары углерод-литий в (CH 3 Li) n (n = 1, 2, 4)». Металлоорганические соединения . 15 (13): 2923–2931. дои : 10.1021/om950966x .
- ^ Т.А. Манц; Н. Гэблдон-Лимас (2016). «Введение в анализ атомной популяции DDEC6: часть 1. Теория и методология распределения заряда» . РСК Адв . 6 (53): 47771–47801. дои : 10.1039/c6ra04656h .
- ^ Бренеман, Курт М.; Виберг, Кеннет Б. (1990). «Определение атомно-центрированных монополей по молекулярным электростатическим потенциалам. Необходимость высокой плотности выборки при конформационном анализе формамида». Журнал вычислительной химии . 11 (3): 361. doi : 10.1002/jcc.540110311 .
- ^ А.Э. Рид; РБ Вайншток; Ф. Вайнхольд (1985). «Естественный популяционный анализ». Дж. Хим. Физ . 83 (2): 735–746. Бибкод : 1985ЖЧФ..83..735Р . дои : 10.1063/1.449486 .