Липидомика дробовика
В липидомике процесс липидомики дробовика (названный по аналогии с секвенированием дробовика ) использует аналитическую химию для исследования биологической функции, значения и последствий изменений в липидах и белковых компонентах, опосредующих метаболизм липидов, транспортировку или биологическую функцию в клетках. [ 1 ] [ 2 ] Липидомике во многом способствовали недавние достижения и новые применения с ионизацией электрораспылением масс-спектрометрии (ESI/MS). [ 3 ]
Липидомика — это область исследований, которая изучает пути и сети клеточных липидов в биологических системах (т. е. липидомах) в больших масштабах. Он включает в себя идентификацию и количественную оценку тысяч молекулярных видов клеточных липидов и их взаимодействий с другими липидами, белками и другими фрагментами in vivo. Исследователи в области липидомики изучают структуры, функции, взаимодействия и динамику клеточных липидов, а также динамические изменения, которые происходят во время патофизиологических возмущений. Липидомические исследования играют важную роль в определении биохимических механизмов процессов заболеваний, связанных с липидами, путем выявления изменений в клеточном метаболизме липидов, их транспортировке и гомеостазе. Двумя основными платформами, используемыми в настоящее время для липидомного анализа, являются ВЭЖХ-МС и липидомика дробового типа.
История
[ редактировать ]Липидомика дробовика была разработана Ричардом В. Гроссом и Сяньлином Ханом с использованием методов внутриисточникового разделения ESI. Отдельные молекулярные виды большинства основных и многих второстепенных классов липидов можно идентифицировать и количественно определить непосредственно из биологических липидных экстрактов без необходимости хроматографической очистки.
Преимущества
[ редактировать ]Липидомика методом дробовика является быстрой, высокочувствительной и может идентифицировать сотни липидов, пропущенных другими методами — и все это с использованием гораздо меньшего образца ткани, чтобы можно было исследовать конкретные клетки или мельчайшие образцы биопсии.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Хан X, Гросс RW (2005). «Липидомика дробовика: масс-спектрометрический анализ с ионизацией электрораспылением и количественный анализ клеточных липидомов непосредственно из сырых экстрактов биологических образцов» . Масс-спектр ред . 24 (3): 367–412. Бибкод : 2005MSRv...24..367H . дои : 10.1002/mas.20023 . ПМИД 15389848 . Архивировано из оригинала 05 января 2013 г.
- ^ Хан X, Гросс RW (апрель 2005 г.). «Липидомика дробовика: многомерный МС-анализ клеточных липидомов». Эксперт Рев Протеомика . 2 (2): 253–64. дои : 10.1586/14789450.2.2.253 . ПМИД 15892569 . S2CID 29752390 .
- ^ Хан X, Гросс RW (июнь 2003 г.). «Глобальный анализ клеточных липидомов непосредственно из сырых экстрактов биологических образцов с помощью масс-спектрометрии ESI: мост к липидомике» . Дж. Липид Рес . 44 (6): 1071–9. doi : 10.1194/jlr.R300004-JLR200 . ПМИД 12671038 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Охота за жирами
- Гросс Р.В., Хан Икс (2007). «Липидомика при диабете и метаболическом синдроме». Липидомика и биоактивные липиды: специализированные аналитические методы и липиды при заболеваниях . Методы энзимологии. Том. 433. стр. 73–90. дои : 10.1016/S0076-6879(07)33004-8 . ISBN 9780123739667 . ПМИД 17954229 .
- Хан X, Ян Дж, Ченг Х, Е Х, Гросс РВ (июль 2004 г.). «К дактилоскопии клеточных липидомов непосредственно из биологических образцов с помощью двумерной масс-спектрометрии с ионизацией электрораспылением». Анальный. Биохим . 330 (2): 317–31. дои : 10.1016/j.ab.2004.04.004 . ПМИД 15203339 .