Институт моделирования заболеваний

Институт моделирования заболеваний (IDM) — это институт, входящий в состав отдела глобального здравоохранения Фонда Билла и Мелинды Гейтс . Основанная в 2008 году как часть Global Good Fund, некоммерческой дочерней компании Intellectual Ventures (IV), финансируемой Биллом и Мелиндой Гейтс, компания IDM в середине 2020 года перешла в Фонд Гейтса. ^{[ 1 ]}

IDM специализируется на математическом моделировании инфекционных заболеваний и других количественных исследованиях в области глобального здравоохранения . Его модели включают малярию, полиомиелит, корь, COVID-19. ^{[ 2 ]} и ВИЧ (с EMOD). IDM публикует исходный код своих стабильных моделей. ^{[ 3 ]}^{[ 4 ]} В то время как в IV институт располагался в Белвью, штат Вашингтон . После вспышки COVID-19 в штате Вашингтон IDM перешла на полностью удаленную работу без физических офисов. В конечном итоге он переедет в главный офис Фонда Гейтса в Сиэтле . ^{[ нужна ссылка ]}

Программное обеспечение для моделирования заболеваний

EMOD — это групповое программное обеспечение для индивидуального моделирования заболеваний (а не компартментальная модель), первоначально имеющее код c. 2005. Он был выпущен для общественности как программное обеспечение с открытым исходным кодом . Программное обеспечение может моделировать малярию, ВИЧ, туберкулез, корь, денге, полиомиелит и брюшной тиф. ^{[ 5 ]}

В 2020 году IDM разработала специальную модель на основе агентов COVID-19 под названием «Covasim». Первоначально он использовался для консультирования по принятию решений во время пандемии COVID-19 в Орегоне и штате Вашингтон . ^{[ 2 ]}^{[ 6 ]} завоевание национального внимания. ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]} Covasim, написанный на Python , имеет открытый исходный код и используется независимыми исследователями по всему миру. ^{[ 9 ]}

Ссылки

^ Чейни, Кэтрин (3 декабря 2020 г.). «Фонд Гейтса занимается моделированием заболеваний» . Девекс . Проверено 30 декабря 2020 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б Сэнди Даутон (15 марта 2020 г.). «Насколько масштабной станет вспышка коронавируса? Этот учёный из Бельвью это выясняет» . Сиэтл Таймс .
^ Итон и др. 2015
^ Росс Рейнольдс (14 марта 2014 г.). «Улучшение борьбы с инфекционными заболеваниями» (аудио) . Сиэтл: КУОУ-FM .
^ Берштей и др. 2018 .
^ Тесс Риски (31 марта 2020 г.). «Насколько серьезной станет вспышка в Орегоне? Это зависит от того, у каких экспертов вы спросите» . Неделя Уилламетта . Два надежных исследования показывают разные результаты лечения COVID-19 в Орегоне.
^ Тодд Бишоп; Тейлор Сопер (15 апреля 2020 г.): «Поскольку число случаев заболевания COVID в штате Вашингтон продолжает падать, вот данные, лежащие в основе действующего приказа «оставаться дома» , Geekwire
^ Джиллиан Фридман (3 апреля 2020 г.). «Коронавирус: как побеждает Западное побережье и чему может научиться Юта» . Новости Дезерета . Солт-Лейк-Сити.
^ Керр, Клифф; Мистри, Дина; и др. (2021). «Covasim: агентная модель динамики и вмешательств в отношении COVID-19». medRxiv 10.1101/2020.05.10.20097469v1 .

Источники

Джеффри В. Итон; Николя Бакаэр; Анна Берштейн; Валентина Камбиано; Энн Кори; Роб Э. Доррингтон; и др. (октябрь 2015 г.), «Оценка эпидемических прогнозов с использованием данных недавнего исследования ВИЧ в Южной Африке: анализ проверки десяти математических моделей эпидемиологии ВИЧ в эпоху антиретровирусной терапии», The Lancet , 3 (10): e598–e608, doi : 10.1016/S2214-109X(15)00080-7 , HDL : 10044/1/33879 , PMID 26385301
Берштейн, Анна; Жерарден, Жалин; Бриденбекер, Дэниел; Лортон, Кристофер В.; Блудоу, Джонатан; Бейкер, Роберт С; Шабо-Кутюр, Гийом; Чен, Е; Фишл, Томас; Фрей, Курт; Голд, Джиллиан С; Ху, Хао; Иззо, Аманда С; Кляйн, Дэниел Дж; Лукачевич, Деян; Маккарти, Кевин А; Миллер, Джоэл С; Уэдраого, Андре Лин; Перкинс, Т. Алекс; Стейнкраус, Джеффри; тен Босх, Квирин А; Тин, Хун-Фу; Титова Светлана; Вагнер, Брэдли Дж; Велкхофф, Филип А; Венгер, Эдвард А; Висвелл, Кристиан Н. (2018), «Внедрение и применение EMOD, индивидуальной платформы моделирования множества заболеваний», Pathogens and Disease , 76 (5), doi : 10.1093/femspd/fty059 , ISSN 2049-632X , PMC 6067119 , PMID 29986020

Внешние ссылки

Официальный сайт
EMOD на GitHub
COVID-19 Глава 11: Моделирование , этот подкаст убьет вас , 4 мая 2020 г., интервью с доктором Майком Фамуларе из Института моделирования заболеваний, записанное 29 апреля 2020 г., начало в 28:30

Эта статья о COVID-19 незавершена . пандемии Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[1] Чейни, Кэтрин (3 декабря 2020 г.). «Фонд Гейтса занимается моделированием заболеваний» . Девекс . Проверено 30 декабря 2020 г.

[Doughton2020-2] Перейти обратно: ^а ^б Сэнди Даутон (15 марта 2020 г.). «Насколько масштабной станет вспышка коронавируса? Этот учёный из Бельвью это выясняет» . Сиэтл Таймс .

[FOOTNOTEEatonBacaërBershteynet_al.2015-3] Итон и др. 2015

[KUOW2014-4] Росс Рейнольдс (14 марта 2014 г.). «Улучшение борьбы с инфекционными заболеваниями» (аудио) . Сиэтл: КУОУ-FM .

[FOOTNOTEBershteynGerardinBridenbeckerLorton2018-5] Берштей и др. 2018 .

[Riski2020-6] Тесс Риски (31 марта 2020 г.). «Насколько серьезной станет вспышка в Орегоне? Это зависит от того, у каких экспертов вы спросите» . Неделя Уилламетта . Два надежных исследования показывают разные результаты лечения COVID-19 в Орегоне.

[Bishop2020-7] Тодд Бишоп; Тейлор Сопер (15 апреля 2020 г.): «Поскольку число случаев заболевания COVID в штате Вашингтон продолжает падать, вот данные, лежащие в основе действующего приказа «оставаться дома» , Geekwire

[Friedman2020-8] Джиллиан Фридман (3 апреля 2020 г.). «Коронавирус: как побеждает Западное побережье и чему может научиться Юта» . Новости Дезерета . Солт-Лейк-Сити.

[9] Керр, Клифф; Мистри, Дина; и др. (2021). «Covasim: агентная модель динамики и вмешательств в отношении COVID-19». medRxiv 10.1101/2020.05.10.20097469v1 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]