Ромми Амаро
Ромми Э. Амаро | |
|---|---|
| Рожденный | |
| Альма-матер | Университет Иллинойса в Урбана-Шампейн |
| Награды | Президентская премия за раннюю карьеру ученым и инженерам , 2010 г. Женщина года 78-го округа Сан-Диего , 2015 г. Национальный преподаватель химии ACS Kavli , 2016 г. Премия Корвина Ханша, Общество Ханш-Фуджита , 2016 г. Специальная премия ACM Гордона Белла за COVID19 , 2020 г. |
| Научная карьера | |
| Поля | Вычислительная биофизика |
| Учреждения | Калифорнийский университет, Сан-Диего |
| Диссертация | Исследование структуры и функции IGP-синтазы |
| Докторантура | Зайда Люти-Шультен |
| Веб-сайт | амаролаб |
Ромми Э. Амаро — профессор , заведующий кафедрой химии и биохимии и директор Национального ресурса биомедицинских вычислений Калифорнийского университета в Сан-Диего . Ее исследования сосредоточены на разработке вычислительных методов в биофизике для применения в разработке лекарств . [1] [2]
Ранняя жизнь и образование
[ редактировать ]Амаро выросла в Чикаго и получила степень бакалавра в химического машиностроения Университете Иллинойса в Урбана-Шампейн (UIUC) в 1999 году. Она проработала два года инженером-исследователем в Kraft Foods, прежде чем вернуться в UIUC для обучения в аспирантуре; она получила докторскую степень. получил степень по химии в 2005 году за работу с Заидой Люти-Шультен над вычислительной биофизикой . Во время работы в аспирантуре она также помогала в создании Центра макромолекулярного моделирования и биоинформатики Национального института здравоохранения (NIH) . После окончания учебы она стала научным сотрудником Эндрю Маккаммона в Калифорнийском университете в Сан-Диего по постдокторской стипендии NIH Kirschstein-National Research Service Award (NRSA) . [1] [3] [4]
Академическая карьера
[ редактировать ]Амаро присоединился к профессорско-преподавательскому составу Калифорнийского университета в Ирвине в 2009 году, частично занимая кафедры фармацевтических наук, информатики и химии. В 2010 году она получила премию директора НИЗ «Новый новатор» и президентскую премию за раннюю карьеру для ученых и инженеров в 2010 году. [1] Она вернулась в UCSD в 2012 году на факультет химии и биохимии. С 2014 по 2020 год она была директором Национального ресурса биомедицинских вычислений UCSD. [1] [5] Она работала содиректором Ресурса данных о дизайне лекарств (D3R). [6]
В работе Амаро подчеркивается полезность вычислений на графическом процессоре для разработки методов молекулярного моделирования . В 2013 году она получила исследовательский грант от NVIDIA на продолжение разработки платформы CUDA . [7] [8]
Амаро также активно занимается общественной деятельностью и научными коммуникациями; Старшеклассница, под руководством которой она была наставником, выиграла конкурс Siemens в области математики, науки и технологий в 2013 году, Google Science Fair в 2013 году и конкурс Intel Science Talent Search в 2014 году . [9]
Избранные публикации
[ редактировать ]- Бол Т.Э., Ионг П., Ли Дж.К., Ли Т., Канканала Дж., Ши К., Демир О., Курахаши К., Амаро Р.Э., Ван З., Айхара Х. «Субстрат-связывающая крышка УДФ-диацилглюкозаминпирофосфатазы LpxH очень гибкая, легкое связывание субстрата и высвобождение продукта», J Biol Chem , 2018 , Vol. 293, выпуск 21, 7969-798 [10]
- Гайеб З., Лю С., Гатиака С., Чиу М., Ян Х., Шао С., Фехер В.А., Уолтерс В.П., Кун Б., Рудольф М.Г., Берли С.К., Гилсон М.К., Амаро RE "D3R Grand Challenge 2: слепое предсказание белка-лиганда позы, рейтинги сходства и относительные свободные энергии связывания.», J Comput Aided Mol Des , 2018 , Vol. 32, Выпуск 1, 1-20 [10]
- Джаггер Б.Р., Ли К.Т., Амаро Р.Э. «Количественное ранжирование кинетики связывания лигандов с использованием многомасштабного подхода к моделированию этапов», J Phys Chem Lett , 2018 , Vol. 9, выпуск 17, 4941-4948 [10]
- Мулеро MC, Шахаби С., Ко М.С., Шиффер Дж.М., Хуанг Д.Б., Ван В.Ю., Амаро Р.Э., Хаксфорд Т., Гош Г. «Белковые кофакторы необходимы для высокоаффинного связывания ДНК с помощью субъединицы ядерного фактора κB RelA», Биохимия , 2018 , Том. 57, выпуск 20, 2943–2957 гг. [10]
- Саламанго DJ, Беккер Дж.Т., Макканн Дж.Л., Ченг А.З., Демир О., Амаро Р.Э., Браун В.Л., Шабан Н.М., Харрис Р.С. «Детерминанты субклеточной локализации APOBEC3H определяют почтовый индекс для нацеливания на ВИЧ-1 для ограничения.», Mol Cell Biol , 2018 [10]
- Саламанго DJ, Макканн Дж.Л., Демир О., Браун В.Л., Амаро Р.Э., Харрис Р.С. «Ядерная локализация APOBEC3B требует двух различных поверхностей N-концевых доменов», J Mol Biol , 2018 , Vol. 430, выпуск 17, 2695–2708. [10]
- Ричардс С., Альбин Дж.С., Демир О., Шабан Н.М., Луенгас Э.М., Лэнд А.М., Андерсон Б.Д., Холтен Дж.Р., Андерсон Дж.С., Харки Д.А., Амаро Р.Э., Харрис Р.С. «Интерфейс связывания между человеческим APOBEC3F и Vif ВИЧ-1, выявленный генетическими методами» и вычислительные подходы», Cell Rep , 2015 , Vol. 13, выпуск 9, 1781-8 [10]
- Роберт Д. Мальмстрем, Александр П. Корнев, Сьюзен С. Тейлор и Ромми Э. Амаро «Аллостерия через компьютерный микроскоп: активация цАМФ канонического сигнального домена», Nature Communications , 2015 , Vol. 6, 8588 [10]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Перейти обратно: а б с д «Доктор Ромми Амаро» . Лаборатория Амаро . Проверено 11 октября 2015 г.
- ^ «Ромми Амаро» . Факультет UCSD . Проверено 11 октября 2015 г.
- ^ Гоуз, Тиа (1 февраля 2012 г.). «Ромми Амаро: исследователь белка» . Ученый . Проверено 11 октября 2015 г.
- ^ «Амаро Лаборатория» . amarolab.ucsd.edu . Проверено 12 июля 2020 г.
- ^ «Национальный ресурс биомедицинских вычислений получил 9 миллионов долларов финансирования от национальных институтов здравоохранения» . Калифорнийский институт телекоммуникаций и информационных технологий . 27 августа 2014 года . Проверено 11 октября 2015 г.
- ^ «D3R | Добро пожаловать…» Drugdesigndata.org . Проверено 31 августа 2022 г.
- ^ Фокс, Тиффани (6 января 2013 г.). «Ромми Амаро: расчет лекарства от рака на настольных «суперкомпьютерах» » . Калифорнийский институт телекоммуникаций и информационных технологий . Проверено 11 октября 2015 г.
- ^ Остин, Лиз (11 декабря 2013 г.). «Фонд NVIDIA выдает грант в размере 200 тысяч долларов на борьбу с раком «Вычислите лекарство»» . Блог NVIDIA . Проверено 11 октября 2015 г.
- ^ Зверина, Ян (6 мая 2014 г.). «Подросток, обучаемый профессорами Калифорнийского университета в Сан-Диего, выигрывает научные премии в размере 250 000 долларов» . Центр новостей Калифорнийского университета в Сан-Диего . Проверено 11 октября 2015 г.
- ^ Перейти обратно: а б с д и ж г час «Амаро, Ромми» . www-chem.ucsd.edu . Проверено 7 марта 2020 г.