Внехромосомный массив

Внехромосомный массив — это метод мозаичного анализа в генетике . Это космида , содержащая два функционирующих ( дикого типа ) тесно связанных гена : представляющий интерес ген и мозаичный маркер . Такой массив вводится в клетки зародышевой линии , которые уже содержат мутантные (в частности, утратившие функцию ) аллели всех трех генов в своей хромосомной ДНК . Космида, которая неправильно упакована во время митоза , иногда присутствует только в одной дочерней клетке после клеточного деления. Дочерняя клетка, содержащая массив, экспрессирует интересующий ген; ячейка, в которой отсутствует массив, этого не делает.

Маркер мозаики представляет собой ген, который демонстрирует видимое изменение фенотипа между функционирующими и нефункционирующими аллелями. Например, ncl-1 , расположенный в хромосомной ДНК, имеет более крупное ядрышко, чем аллель дикого типа, которая присутствует в массиве. Таким образом, клетки, которые имеют более крупные ядрышки, обычно не сохраняют внехромосомный массив.

является Интересующий ген целью мозаичного анализа. Клетки, лишенные внехромосомного массива, также лишены интересующего функционального гена. Клетки, которые нормально развиваются без массива, не нуждаются в интересующем гене для нормального функционирования. Говорят, что клетки, которые не развиваются нормально, нуждаются в этом гене. Таким способом можно идентифицировать те клеточные линии, которым требуется определенный ген.

Внехромосомные массивы заменяют более ранний метод, включающий дублированный фрагмент хромосомы, называемый свободной дупликацией . Последний метод требовал, чтобы интересующий ген и мозаичный маркер были тесно связаны при дупликации; первый допускает свободный выбор мозаичного маркера и гена-мишени.

Ссылки

Миллер Л.М., Уоринг Д.А., Ким С.К. (1996). Анализ мозаики с использованием внехромосомной матрицы ncl-1 (+) показывает, что lin-31 действует в клетках Pn.p во время развития вульвы Caenorhabditis elegans . Генетика 143 (3): 1181-1191.