Рохит Паппу

Рохит Паппу
Рохит Паппу
Национальность	Американский
Альма-матер	Университет Тафтса , Колледж Св. Иосифа, Бангалор
Известный	Внутренне неупорядоченные белки , Болезнь Хантингтона , Сворачивание белков , Биомолекулярный конденсат
	Научная карьера
Поля	Биофизика
Учреждения	Вашингтонский университет в Сент-Луисе , Университет Джонса Хопкинса
Докторантура	Дэвид Л. Уивер

Рохит Паппу — биофизик-вычислитель и теоретик индийского происхождения. Он является заслуженным профессором инженерных наук Джина К. Бира и директором Центра науки и техники живых систем (CSELS) Вашингтонского университета в Сент-Луисе .

Образование и карьера

Паппу учился на бакалавриате по физике, математике и электронике в колледже Св. Иосифа в Бангалоре . Он получил степень магистра в области физики твердого тела в 1992 году и степень доктора философии. получил степень бакалавра биологической физики в 1996 году, оба в Университете Тафтса , где он работал над теоретическими аспектами сворачивания белков. Он провел два года в качестве постдокторанта в Вашингтонском университете в Сент-Луисе у Джея Пондера, а затем с 1998 по 2001 год он был научным сотрудником у Джорджа Роуза в Университете Джонса Хопкинса . Он присоединился к Вашингтонскому университету в Сент-Луисе в качестве доцента биомедицинской инженерии в 2001 году, стал доцентом в 2007 году и профессором в 2011 году. В 2015 году он был назначен профессором инженерных наук Эдвина Х. Мерти и Джином К. Биром. Заслуженный профессор осенью 2021 года. ^{[ 1 ]}^{[ самостоятельно опубликованный источник? ]}

Исследовать

Паппу использует теоретические, вычислительные и экспериментальные подходы для изучения внутренне неупорядоченных белков в контексте нормальной клеточной функции и нейродегенеративных заболеваний (в частности, болезни Хантингтона). ^{[ 2 ]}). Он внес большой вклад в понимание движущих сил, связанных с агрегацией белков, и того, как линейная аминокислотная последовательность неупорядоченных белков определяет их конформационное поведение, уделяя особое внимание роли полярных и заряженных аминокислот. ^{[ 3 ]}^{[ 4 ]}^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}^{[ 8 ]} Вместе с научным сотрудником Рахулом Дасом Паппу обнаружил, что формирование паттерна заряженных остатков оказывает большое влияние на конформационный ансамбль неупорядоченного белка. ^{[ 9 ]} Совсем недавно его работа была сосредоточена на физике полимеров и биологических фазовых переходах, чтобы понять теоретические и молекулярные основы, которые управляют внутриклеточным фазовым разделением. ^{[ 10 ]}^{[ 11 ]}^{[ 12 ]}

Паппу был назван членом Американской ассоциации содействия развитию науки (AAAS) в 2013 году. ^{[ 13 ]} а в 2016 году был избран научным сотрудником Американского института медицинской и биологической инженерии (AIMBE) за « выдающийся вклад в белковую инженерию и дизайн, а также молекулярные основы нейродегенерации благодаря достижениям в области вычислительной биологии ». ^{[ 14 ]} В 2019 году Паппу был назван членом Биофизического общества за « гениальное внедрение подходов физики полимеров и молекулярного моделирования для характеристики внутренне неупорядоченных белков », а также стипендиатом Меркатора Немецкого научного фонда (Deutsche Forschungsgemeinschaft). ^{[ 15 ]}^{[ 16 ]}

Ссылки

^ http://pappulab.wustl.edu/people.html#rohit Рохит Паппу, резюме
^ «Цель борьбы с болезнью Хантингтона — 4,5 миллиона долларов в виде грантов НИЗ | Источник | Вашингтонский университет в Сент-Луисе» . 12 мая 2016 г.
^ Крик, СЛ; Ерш, К.М.; Гарай, К.; Фриден, К.; Паппу, Р.В. (2013). «Разоблачение роли N- и C-концевых фланкирующих последовательностей экзона 1 хантингтина как модуляторов агрегации полиглутамина» . Труды Национальной академии наук . 110 (50): 20075–80. Бибкод : 2013PNAS..11020075C . дои : 10.1073/pnas.1320626110 . ПМЦ 3864320 . ПМИД 24282292 .
^ Виталис, Андреас; Паппу, Рохит В. (2011). «Оценка вклада гетерогенного распределения олигомеров в механизмы агрегации полиглутаминовых пептидов» . Биофизическая химия . 159 (1): 14–23. дои : 10.1016/j.bpc.2011.04.006 . ПМК 3166968 . ПМИД 21530061 .
^ Дас, Рахул К; Рафф, Кирстен М; Паппу, Рохит V (2015). «Связь информации, закодированной последовательностью, с формой и функцией внутренне неупорядоченных белков» . Современное мнение в области структурной биологии . 32 : 102–12. дои : 10.1016/j.sbi.2015.03.008 . ПМК 4512920 . ПМИД 25863585 .
^ Мао, АХ; Крик, СЛ; Виталис, А.; Чикойн, CL; Паппу, Р.В. (2010). «Чистый заряд на остаток модулирует конформационные ансамбли внутренне неупорядоченных белков» . Труды Национальной академии наук . 107 (18): 8183–8. Бибкод : 2010PNAS..107.8183M . дои : 10.1073/pnas.0911107107 . ПМЦ 2889596 . ПМИД 20404210 .
^ Крик, СЛ; Джаяраман, М.; Фриден, К.; Ветцель, Р.; Паппу, Р.В. (2006). «Флуоресцентная корреляционная спектроскопия показывает, что мономерные молекулы полиглутамина образуют коллапсированные структуры в водных растворах» . Труды Национальной академии наук . 103 (45): 16764–9. Бибкод : 2006PNAS..10316764C . дои : 10.1073/pnas.0608175103 . ПМК 1629004 . ПМИД 17075061 .
^ Хоулхаус, Алекс С.; Гарай, Канчан; Лайл, Николас; Виталис, Андреас; Паппу, Рохит В. (2015). «Количественные оценки различного вклада амидов основной цепи полипептида по сравнению с группами боковых цепей в расширение цепи посредством химической денатурации» . Журнал Американского химического общества . 137 (8): 2984–95. дои : 10.1021/ja512062h . ПМЦ 4418562 . ПМИД 25664638 .
^ Дас, РК; Паппу, Р.В. (2013). «На конформацию внутренне неупорядоченных белков влияет линейное распределение последовательностей противоположно заряженных остатков» . Труды Национальной академии наук . 110 (33): 13392–7. Бибкод : 2013PNAS..11013392D . дои : 10.1073/pnas.1304749110 . ПМЦ 3746876 . ПМИД 23901099 .
^ Брангвинн, Клиффорд П.; Томпа, Питер; Паппу, Рохит В. (2015). «Полимерная физика внутриклеточных фазовых переходов». Физика природы . 11 (11): 899–904. Бибкод : 2015NatPh..11..899B . дои : 10.1038/nphys3532 . S2CID 4643961 .
^ Ферич, Марина; Вайдья, Нилеш; Хармон, Тайлер С.; Митреа, Диана М.; Чжу, Лянь; Ричардсон, Тиффани М.; Кривацкий, Ричард В.; Паппу, Рохит В.; Брангвинн, Клиффорд П. (2016). «Сосуществующие жидкие фазы лежат в основе ядрышковых субкомпартментов» . Клетка . 165 (7): 1686–97. дои : 10.1016/j.cell.2016.04.047 . ПМК 5127388 . ПМИД 27212236 .
^ Пак, Чи В.; Косно, Мартина; Хоулхаус, Алекс С.; Падрик, Шэй Б.; Миттал, Анурадха; Али, Рустам; Юнус, Али А.; Лю, Дэвид Р.; Паппу, Рохит В.; Розен, Майкл К. (2016). «Детерминанты последовательности внутриклеточного разделения фаз путем комплексной коацервации неупорядоченного белка» . Молекулярная клетка . 63 (1): 72–85. doi : 10.1016/j.molcel.2016.05.042 . ПМЦ 4973464 . ПМИД 27392146 .
^ http://news.wustl.edu/news/Pages/26215.aspx , Два преподавателя WUSTL названы стипендиатами AAAS. 25 ноября 2013 г.
^ https://engineering.wustl.edu/news/Pages/Three-biomedical-engineering-professors-elected-as-AIMBE-Fellows-.aspx , 21 января 2016 г.
^ https://engineering.wustl.edu/news/2019/Pappu-awarded-Mercator-Fellowship-from-DFG.html , Паппу получил стипендию Меркатора от DFG.
^ https://www.biophysicals.org/news-room/bps-announces-2019-society-fellows , BPS объявляет стипендиатов Общества 2019 года

Внешние ссылки

Официальный сайт

[1] ttp://pappulab.wustl.edu/people.html#rohit Рохит Паппу, резюме

[2] «Цель борьбы с болезнью Хантингтона — 4,5 миллиона долларов в виде грантов НИЗ | Источник | Вашингтонский университет в Сент-Луисе» . 12 мая 2016 г.

[3] Крик, СЛ; Ерш, К.М.; Гарай, К.; Фриден, К.; Паппу, Р.В. (2013). «Разоблачение роли N- и C-концевых фланкирующих последовательностей экзона 1 хантингтина как модуляторов агрегации полиглутамина» . Труды Национальной академии наук . 110 (50): 20075–80. Бибкод : 2013PNAS..11020075C . дои : 10.1073/pnas.1320626110 . ПМЦ 3864320 . ПМИД 24282292 .

[4] Виталис, Андреас; Паппу, Рохит В. (2011). «Оценка вклада гетерогенного распределения олигомеров в механизмы агрегации полиглутаминовых пептидов» . Биофизическая химия . 159 (1): 14–23. дои : 10.1016/j.bpc.2011.04.006 . ПМК 3166968 . ПМИД 21530061 .

[5] Дас, Рахул К; Рафф, Кирстен М; Паппу, Рохит V (2015). «Связь информации, закодированной последовательностью, с формой и функцией внутренне неупорядоченных белков» . Современное мнение в области структурной биологии . 32 : 102–12. дои : 10.1016/j.sbi.2015.03.008 . ПМК 4512920 . ПМИД 25863585 .

[6] Мао, АХ; Крик, СЛ; Виталис, А.; Чикойн, CL; Паппу, Р.В. (2010). «Чистый заряд на остаток модулирует конформационные ансамбли внутренне неупорядоченных белков» . Труды Национальной академии наук . 107 (18): 8183–8. Бибкод : 2010PNAS..107.8183M . дои : 10.1073/pnas.0911107107 . ПМЦ 2889596 . ПМИД 20404210 .

[7] Крик, СЛ; Джаяраман, М.; Фриден, К.; Ветцель, Р.; Паппу, Р.В. (2006). «Флуоресцентная корреляционная спектроскопия показывает, что мономерные молекулы полиглутамина образуют коллапсированные структуры в водных растворах» . Труды Национальной академии наук . 103 (45): 16764–9. Бибкод : 2006PNAS..10316764C . дои : 10.1073/pnas.0608175103 . ПМК 1629004 . ПМИД 17075061 .

[8] Хоулхаус, Алекс С.; Гарай, Канчан; Лайл, Николас; Виталис, Андреас; Паппу, Рохит В. (2015). «Количественные оценки различного вклада амидов основной цепи полипептида по сравнению с группами боковых цепей в расширение цепи посредством химической денатурации» . Журнал Американского химического общества . 137 (8): 2984–95. дои : 10.1021/ja512062h . ПМЦ 4418562 . ПМИД 25664638 .

[9] Дас, РК; Паппу, Р.В. (2013). «На конформацию внутренне неупорядоченных белков влияет линейное распределение последовательностей противоположно заряженных остатков» . Труды Национальной академии наук . 110 (33): 13392–7. Бибкод : 2013PNAS..11013392D . дои : 10.1073/pnas.1304749110 . ПМЦ 3746876 . ПМИД 23901099 .

[10] Брангвинн, Клиффорд П.; Томпа, Питер; Паппу, Рохит В. (2015). «Полимерная физика внутриклеточных фазовых переходов». Физика природы . 11 (11): 899–904. Бибкод : 2015NatPh..11..899B . дои : 10.1038/nphys3532 . S2CID 4643961 .

[11] Ферич, Марина; Вайдья, Нилеш; Хармон, Тайлер С.; Митреа, Диана М.; Чжу, Лянь; Ричардсон, Тиффани М.; Кривацкий, Ричард В.; Паппу, Рохит В.; Брангвинн, Клиффорд П. (2016). «Сосуществующие жидкие фазы лежат в основе ядрышковых субкомпартментов» . Клетка . 165 (7): 1686–97. дои : 10.1016/j.cell.2016.04.047 . ПМК 5127388 . ПМИД 27212236 .

[12] Пак, Чи В.; Косно, Мартина; Хоулхаус, Алекс С.; Падрик, Шэй Б.; Миттал, Анурадха; Али, Рустам; Юнус, Али А.; Лю, Дэвид Р.; Паппу, Рохит В.; Розен, Майкл К. (2016). «Детерминанты последовательности внутриклеточного разделения фаз путем комплексной коацервации неупорядоченного белка» . Молекулярная клетка . 63 (1): 72–85. doi : 10.1016/j.molcel.2016.05.042 . ПМЦ 4973464 . ПМИД 27392146 .

[13] ttp://news.wustl.edu/news/Pages/26215.aspx , Два преподавателя WUSTL названы стипендиатами AAAS. 25 ноября 2013 г.

[14] ttps://engineering.wustl.edu/news/Pages/Three-biomedical-engineering-professors-elected-as-AIMBE-Fellows-.aspx , 21 января 2016 г.

[15] ttps://engineering.wustl.edu/news/2019/Pappu-awarded-Mercator-Fellowship-from-DFG.html , Паппу получил стипендию Меркатора от DFG.

[16] ttps://www.biophysicals.org/news-room/bps-announces-2019-society-fellows , BPS объявляет стипендиатов Общества 2019 года

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]