Источник эталонного теста колокализации
 | |
| Содержание | |
|---|---|
| Описание | Бесплатный источник эталонных изображений для проверки колокализации в флуоресцентной микроскопии исследованиях |
| Контакт | |
| Авторы | Вадим Зинчук , Йонг Ву , Ольга Гроссенбахер-Зинчук |
| Дата выпуска | 2012 |
| Доступ | |
| Формат данных | Формат файла изображения с тегами без потерь (TIFF) |
| Веб-сайт | www |
| Разнообразный | |
| Лицензия | Бесплатно |
| Версия | 1.1.1 |
Источник тестов колокализации ( CBS ) — это бесплатная коллекция загружаемых изображений для тестирования и подтверждения степени колокализации маркеров в любых исследованиях флуоресцентной микроскопии . Колокализация — это визуальное явление, когда две интересующие молекулы связаны с одними и теми же структурами в клетках и потенциально имеют общие функциональные характеристики. [1] [2] [3]
CBS предоставляет исследователям справочные инструменты для проверки результатов количественных измерений колокализации. [4] Он служит специализированной биоизображений информатической базой данных , состоящей из компьютерно-моделированных изображений с точно известными (заранее заданными) значениями колокализации. Они были созданы с использованием алгоритма моделирования изображений . Эти тестовые изображения можно загрузить как наборами, так и по отдельности. Рассчитывая и сравнивая значения коэффициентов на своих изображениях с эталонными изображениями, исследователи могут подтвердить результаты количественных исследований колокализации. Использование изображений CBS было описано в ряде исследований. [5] [6] [7] [8]
Примеры
[ редактировать ]Исследователи могут предоставить примеры пользовательских изображений, когда эталонные изображения использовались для проверки их колокализации. Представленные изображения затем размещаются на сайте CBS вместе с описанием их свойств и значений коэффициентов, таких как коэффициент корреляции Пирсона (Rr) , коэффициент перекрытия (R) и других. Шаблон для отправки информации о пользовательских изображениях можно скачать с сайта CBS.
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Болте С и Кордельер Ф.П. (2006). «Экскурсия по анализу субклеточной колокализации в световой микроскопии». Дж. Микроск 224:213–232.
- ^ Комо JW и др. (2006). «Руководство по точным измерениям колокализации с помощью флуоресцентной микроскопии». Биофиз Дж 91:4611–4622.
- ^ Зинчук В. и Гроссенбахер-Зинчук О. (2009). «Последние достижения в количественном анализе колокализации: фокус на нейробиологии». Prog Histochem Cytochem 44:125-172.
- ^ Мандерс Э и др. (1993). «Измерение колокализации объектов на двухцветных конфокальных изображениях». J Microsc Oxford 169: 375–382.
- ^ Ву Ю и др. (2010). «Количественное определение пространственных белково-белковых корреляций во флуоресцентной конфокальной микроскопии». Биофиз Дж 98:493-504.
- ^ Зинчук В и др. (2011). «Количественная оценка пространственных корреляций флуоресцентных маркеров с использованием усиленного снижения фона с помощью оценки индекса близости белков и коэффициентов корреляции». Нат Проток 6:1554-1567.
- ^ Зинчук В. и Гроссенбахер-Зинчук О. (2011). «Количественный анализ колокализации изображений конфокальной флуоресцентной микроскопии». клеточной биологии Curr Protoc Блок 4.19. Архивировано 28 ноября 2009 г. в Wayback Machine.
- ^ Зинчук В и др. (2013). «Преодоление разрыва между качественными и количественными результатами колокализации в исследованиях флуоресцентной микроскопии». Sci Rep 3: 1365 doi: 10.1038/srep01365.