Betatorquevirus

Betatorquevirus
Классификация вирусов
(не вмешательство):	Вирус
Семья:	Anelloviridae
Род:	Betatorquevirus

Betatorquevirus - это род вирусов Anelloviridae в семействе II , в группе в классификации Балтимора . Род BetatorQuevirus включает в себя все «крутящие мини -вирусы Teno» (TTMV), пронумерованный от 1 до 38 в 38 видах.

Таксономия

Род содержит следующий вид: ^{[ 1 ]}

Первоначальное обнаружение

Обнаружение TTMV, как и исходное изолят вируса Teno Teno (TTV), было случайным. После того, как TTV был выделен в 1997 году от японского пациента, праймеры были созданы для более подробного изучения TTV. TTV-специфические праймеры, используемые в ПЦР образцов плазмы человека, дали последовательности, которые частично соответствовали последовательностям TTV, но были заметно короче. ^{[ 2 ]}^{[ 3 ]} В конечном итоге TTV имел геном 3,6–3,9 т.п.н., в то время как TTMV имеет геном 2,8–2,9 кб. Другой TT-подобный вирус, позже изолированный в 2007 году, Torque Teno Midi Virus или TTMDV, имеет геном 3,2 КБ. ^{[ 3 ]}

Геном и капсид

TTMV разделяет сходные морфологические особенности с другими человеческими анелловирусами. Капсид имеет t = 1 икосаэдрическую симметрию. ^{[ 2 ]} Вирион не имеет липидной конверты и, таким образом, «обнаженным», что делает его чрезвычайно простым вирусом. По оценкам, вирион имеет чуть менее 30 нм в диаметре. ^{[ 2 ]}^{[ 3 ]}

Геном круглый и изготовлен из одноцепочечной ДНК негативной полярности. Это 2,86–2,91 килобазы в длину. ^{[ 2 ]} Анелловирусы известны тем, что имеют 3 или 4 перекрывающихся вложенных открытых кадров чтения; TTMV имеет 3 ORF, которые перекрываются. ^{[ 2 ]}^{[ 4 ]} ORF-2 и ORF-3 перекрываются с ORF-1 на противоположных концах. Для TTMV ORF-1 составляет около 663 остатков, а ORF-2-около 91 остатка. ^{[ 2 ]} Существует высоко консервативная область 130-нт вниз по течению от коробки Tata. ^{[ 3 ]}

Филогения и распространение

TTMV очень расходится. ^{[ 2 ]}^{[ 3 ]} Первое филогенетическое дерево, созданное из геномных последовательностей TTMV, выявило большой кластер штаммов; ORF-1 имел расхождения более 42% на уровне нуклеотидов и более 67% на уровне аминокислот. ^{[ 2 ]}

TTMV также очень распространен, как и другие человеческие анелловирусы. Последующие исследования после того, как он был обнаружен, дало распространенность ДНК TTMV среди доноров крови составляет 48-72%. ^{[ 3 ]} Скорее всего, он может заразить широкий спектр тканей, так как он был выделен из различных жидкостей и тканей тела, включая слюну, фекалии, плазму/сыворотку, PBMC , костное мозг, селезенку, поджелудочную железу, почки, нервная ткань, лимфатические узлы, сперма, сперма, и шейки матки. ^{[ 2 ]}^{[ 3 ]} Его точный механизм передачи неизвестен, но считается возможным, передаваемые крови, сексуальными, фекально-оральными и респираторными путями. ^{[ 2 ]}

Недавние исследования показали, что у людей могут быть множественные инфекции вирусов ТТ. ^{[ 3 ]}^{[ 4 ]}

Клинический

Хотя TTV потенциально связаны с DIAES, и их патогенность обсуждается с момента их открытия, TTMV в настоящее время не известна как явная причина любого заболевания человека. ^{[ 2 ]} TTMV был изолирован из ряда парапнемонических эмпиемы . ^{[ 5 ]} Однако его клиническое значение остается неясным.

Ссылки

^ «Таксономия вируса: выпуск 2020 года» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Март 2021 г. Получено 23 мая 2021 года .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон ^глин ^час ^я ^Дж ^k Спандола, Соня; Cimponiu, dănuţ; Берка, Лавиния Мариана; Михэска, Григор (апрель 2015 г.). «Анелловирусы человека: обновление молекулярного, эпидемиологического и клинического внешнего вида» . Архив вирусологии . 160 (4): 893–908. Два : 10.1007/S00705-015-2363-9 . PMID 25680568 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон ^глин ^час Окамото, Х (2009). «История открытий и патогенность вирусов ТТ». ТТ вирусы . Текущие темы в области микробиологии и иммунологии. Тол. 331. С. 1–20. doi : 10.1007/978-3-540-70972-5_1 . ISBN 978-3-540-70971-8 Полем PMID 19230554 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Чжан, Ю (6 мая 2016 г.). «Новые виды крутящего момента мини -вирус (TTMV) в ткани десны от пациентов с хроническим периодонтитом» . Научные отчеты . 6 (26739): 26739. Bibcode : 2016natsr ... 626739Z . doi : 10.1038/srep26739 . PMC 4879676 . PMID 27221159 .
^ Galmès J, Li Y, Rajoharison A, Ren L, Dollet S, Richard N, Vernet G, Javouhey E, Wang J, Telles JN, Pranhos-Baccalà G (2012) Потенциальное значение нового крутящего мини Дети. Евро вдыхание j

Внешние ссылки

ICTV Virus Taxonomy9 2009
Таксономия Uniprot
Анелловирус в Национальной библиотеке медицинской библиотеки США медицинские заголовки (сетка)
ICTVDB
Вирус: Betatorquevirus

[1] «Таксономия вируса: выпуск 2020 года» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Март 2021 г. Получено 23 мая 2021 года .

[Spandole-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон ^глин ^час ^я ^Дж ^k Спандола, Соня; Cimponiu, dănuţ; Берка, Лавиния Мариана; Михэска, Григор (апрель 2015 г.). «Анелловирусы человека: обновление молекулярного, эпидемиологического и клинического внешнего вида» . Архив вирусологии . 160 (4): 893–908. Два : 10.1007/S00705-015-2363-9 . PMID 25680568 .

[Okamoto-3] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон ^глин ^час Окамото, Х (2009). «История открытий и патогенность вирусов ТТ». ТТ вирусы . Текущие темы в области микробиологии и иммунологии. Тол. 331. С. 1–20. doi : 10.1007/978-3-540-70972-5_1 . ISBN 978-3-540-70971-8 Полем PMID 19230554 .

[Zhang-4] Jump up to: ^а ^{беременный} Чжан, Ю (6 мая 2016 г.). «Новые виды крутящего момента мини -вирус (TTMV) в ткани десны от пациентов с хроническим периодонтитом» . Научные отчеты . 6 (26739): 26739. Bibcode : 2016natsr ... 626739Z . doi : 10.1038/srep26739 . PMC 4879676 . PMID 27221159 .

[Galmès2012-5] Galmès J, Li Y, Rajoharison A, Ren L, Dollet S, Richard N, Vernet G, Javouhey E, Wang J, Telles JN, Pranhos-Baccalà G (2012) Потенциальное значение нового крутящего мини Дети. Евро вдыхание j

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]