Иммуноглобулин C2-сет-домен
| Иммуноглобулин C2-сет-домен | |||
|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||
| Символ | C2-Set | ||
| Pfam | PF05790 | ||
| InterPro | IPR008424 | ||
| |||
Основная структура молекул иммуноглобулина (Ig) представляет собой тетрамер из двух легких цепочек и двух тяжелых цепей, связанных дисульфидными связями. Существует два типа световых цепей: каппа и лямбда, каждый из которых состоит из постоянного домена (CL) и переменного домена (VL). Существует пять типов тяжелых цепей: альфа, дельта, эпсилон, гамма и му, все это состоит из переменного домена (VH) и трех (в альфа, дельте и гамме) или четырех (в эпсилоне и MU) постоянных доменах (CH1 до CH4). Молекулы IG представляют собой очень модульные белки, в которых переменные и постоянные домены имеют четкие, консервативные паттерны последовательности. Домены в Ig и Ig-подобных молекулах сгруппированы в четыре типа: v-steet (переменная; InterPro : IPR013106 ), C1-SET (Constant-1; InterPro : IPR003597 ), C2-сет (Constant-2; InterPro : IPR008424 ) и I-SET (промежуточный; интерпрос : IPR013098 ). [ 1 ] Структурные исследования показали, что эти домены имеют общую основную конструкцию по бета-сандвиче грекового ключа, с типами, различающимися по количеству прядей на бета-листах, а также в их последовательности. [ 2 ] [ 3 ]
Иммуноглобулиноподобные домены, которые связаны как в последовательности, так и в структуре, могут быть обнаружены в нескольких разнообразных белках Семьи. Ig-подобные домены участвуют в различных функциях, включая распознавание клеток , рецепторы клеточной поверхности, мышечную структуру и иммунную систему. [ 4 ]
C2-SET-домены , которые представляют собой Ig-подобные домены, напоминающие домен постоянного антитела. Домены C2-SET обнаружены главным образом в CD2-антигенах T-клеток млекопитающих CD2 (кластер дифференцировки 2), CD4 и CD80, а также в молекулах адгезии клеток сосудов сосудов (VCAM) и межклеточной (ICAM).
CD2 опосредует адгезию Т-клеток посредством его эктодомена и сигнальной трансдукции, использующей его цитоплазматический хвост 117-аминокислот. [ 5 ] CD2 демонстрирует структурное и функциональное сходство с африканским вирусом свиней (ASFV) LMW8-DR, белком, который участвует в адгезии клеток-клеток и модуляции иммунного ответа, предполагая Возможная роль в патогенезе инфекции ASFV. [ 6 ] CD4 является основным рецептором для ВИЧ-1. CD4 имеет четыре иммуноглобулиноподобные домены во внеклеточной области, которые имеют одну и ту же структуру, но могут отличаться по последовательности. Некоторые внеклеточные домены могут быть вовлечены в димеризацию. [ 7 ]
Человеческие белки, содержащие этот домен
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Смит Д.К., Сюэ Х (1997). «Профили последовательности иммуноглобулина и иммуноглобулиноподобных доменов». J. Mol. Биол . 274 (4): 530–545. doi : 10.1006/jmbi.1997.1432 . PMID 9417933 .
- ^ Потпов V, Соболев V, Эдельман М., Кистер А., Гелфанд I (2004). «Распознавание белка белка: сопоставление ядер домена и границ раздела у иммуноглобулинов и других сэндвич-подобных белков». J. Mol. Биол . 342 (2): 665–679. doi : 10.1016/j.jmb.2004.06.072 . PMID 15327963 .
- ^ Кларк Дж., Фаулер С.Б. (2001). «Сопоставление пути складывания домена иммуноглобулина: структурные детали из анализа значений PHI и перемещения переходного состояния» . Структура 9 (5): 355–366. doi : 10.1016/s0969-2126 (01) 00596-2 . PMID 11377196 .
- ^ Chothia C, Teichmann SA (2000). «Белки суперсемейства иммуноглобулина у Caenorhabditis elegans». J. Mol. Биол . 296 (5): 1367–83. Citeseerx 10.1.1.327.6917 . doi : 10.1006/jmbi.1999.3497 . PMID 10698639 .
- ^ Reinherz EL, Yang H (2001). «Динамический рекрутирование человеческого CD2 в липидные рафты. Связь с трансдукцией сигнала Т -клеток» . Дж. Биол. Химический 276 (22): 18775–18785. doi : 10.1074/jbc.m009852200 . PMID 11376005 .
- ^ Kutish GF, Rock DL, Afonso CL, Borca MV, Irusta P, Carrillo C, Brun A, Sussman M (1994). «Африканский ген вируса свиной лихорадки с сходством с поверхностным антигеном Т-лимфоцитов CD2 опосредует гемадсорбцию». Вирусология . 199 (2): 463–468. doi : 10.1006/viro.1994.1146 . PMID 7907198 .
- ^ Sanejouand YH (2004). «Обмена домена CD4 при димеризации». Белки . 57 (1): 205–12. doi : 10.1002/prot.20197 . PMID 15326605 .