Список программ прогнозирования вторичной структуры белков
Список известных программ прогнозирования вторичной структуры белков
| Имя | Описание метода | Тип | Связь | Первоначальный выпуск |
|---|---|---|---|---|
| РапторX-SS8 | прогнозировать вторичную структуру как с 3, так и с 8 состояниями, используя условные нейронные поля из PSI-BLAST профилей | Веб-сервер/загружаемый | сервера загрузка | 2011 |
| GOR | Теория информации/ байесовский вывод | Множество реализаций | Basic GOR GOR V | 2002 (GOR V) |
| Джпред | нескольких нейронных сетей Назначение из профилей PSI-BLAST и HMMER . Прогнозирует вторичную структуру и доступность растворителя. | Веб-сервер | сервер и API | 1998 |
| PredictProtein | Профильная нейронная сеть | Веб-сервер | сервер | 1992 |
| ПСИПРЕД | прямого распространения две нейронные сети , которые выполняют анализ выходных данных, полученных от PSI-BLAST | Веб-сервер | сервер | 1999 |