Семейство доменов Yip1

Семейство доменов Yip1 представляет собой группу белков, участвующих в регуляции секреторного трафика у эукариот . Семья состоит из четырех членов у дрожжей и девяти членов у человека. Члены семьи имеют общую архитектуру, содержащую пять трансмембранных доменов .

Эволюция

Члены семейства доменов Yip1 обнаружены у всех эукариот. ^{[ 1 ]} Почкующиеся дрожжи Saccharomyces cerevisiae имеют четыре члена семейства доменов Yip1: Yif1p, Yip1p, Yip4p и Yip5p. ^{[ 1 ]} Аминокислотная последовательность членов семейства доменов Yip делит их на две группы, называемые α-субъединицами и β-субъединицами. α-субъединицы – в дрожжах Yip1p и Yip4p – более тесно связаны друг с другом, чем с β-субъединицами Yip5p и Yif1p. У млекопитающих обе группы расширены за счет α-субъединиц YipF4, YipF5, YipF6 и YipF7; а также β-субъединицы Yif1A , Yif1B, YipF1, YipF2 и YipF3. ^{[ 1 ]}

Функция

Члены семейства доменов Yip1 локализуются в аппарате Гольджи, где они взаимодействуют друг с другом, образуя комплексы, участвующие в транспортировке грузов внутри аппарата Гольджи и/или между эндоплазматической сетью и Гольджи. ^{[ 2 ]} Члены семейства доменов Yip1 широко распространены по всему организму, за исключением YipF7, обнаруживаемого преимущественно в скелетных мышцах и языке , тогда как YipF1A преимущественно находится в печени . ^{[ 2 ]} Внутри клетки разные члены семейства Yip имеют несколько разную локализацию: YipF5, YipF7, Yif1A и Yif1B (у дрожжей Yip1p и Yif1p) на краю эндоплазматической сети и аппарате Гольджи; YipF3 и YipF4 в цис-Гольджи ; и YipF1, YipF2 и Yipf6 (у дрожжей Yip4p и Yip5p) в транс-Гольджи . ^{[ 1 ]}

YipF1 был условно нокаутирован у мышей без видимого эффекта. ^{[ 3 ]}

Нефункциональная версия YipF6 усугубляла воспаление кишечника у мышей и иногда приводила к спонтанному воспалительному заболеванию кишечника. ^{[ 4 ]}

Структура

Каждый белок семейства доменов Yip1 содержит пять трансмембранных доменов, N-конец которых обращен в цитозоль , а С-конец - в просвет аппарата Гольджи . ^{[ 1 ]} Считается, что члены семейства доменов Yip1 взаимодействуют с партнером, при этом две молекулы каждого партнера образуют активный тетрамерный комплекс с 20 трансмембранными сегментами. ^{[ 1 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж Шайк С., Пандей Х., Тирумаласетти С.К., Накамура Н. (2019). «Характеристики и функции семейства доменов Yip1 (YIPF), многопролетных трансмембранных белков, в основном локализованных в аппарате Гольджи» . Front Cell Dev Biol . 7 : 130. дои : 10.3389/fcell.2019.00130 . ПМЦ 6682643 . ПМИД 31417902 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Эттвуд М.М., Шиот Х.Б. (2021). «Характеристика пяти трансмембранных белков: с акцентом на семейства доменов Tweety, Сидерофлексин и YIP1» . Front Cell Dev Biol . 9 : 708754. doi : 10.3389/fcell.2021.708754 . ПМЦ 8327215 . ПМИД 34350187 .
^ Гердин А.К. (2010). «Программа генетики мышей Сэнгера: высокопроизводительная характеристика нокаутных мышей». Акта офтальмологическая . 88 (С248). дои : 10.1111/j.1755-3768.2010.4142.x . S2CID 85911512 .
^ Мореско, Ева Мари Ю.; Брандл, Катерина (январь 2013 г.). «Связь мембранного транспорта и кишечного гомеостаза» . Тканевые барьеры . 1 (1): e23119. дои : 10.4161/тисб.23119 . ПМЦ 3875636 . ПМИД 24665373 .

[Shaik2019-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж Шайк С., Пандей Х., Тирумаласетти С.К., Накамура Н. (2019). «Характеристики и функции семейства доменов Yip1 (YIPF), многопролетных трансмембранных белков, в основном локализованных в аппарате Гольджи» . Front Cell Dev Biol . 7 : 130. дои : 10.3389/fcell.2019.00130 . ПМЦ 6682643 . ПМИД 31417902 .

[Attwood2021-2] Перейти обратно: ^а ^б Эттвуд М.М., Шиот Х.Б. (2021). «Характеристика пяти трансмембранных белков: с акцентом на семейства доменов Tweety, Сидерофлексин и YIP1» . Front Cell Dev Biol . 9 : 708754. doi : 10.3389/fcell.2021.708754 . ПМЦ 8327215 . ПМИД 34350187 .

[mgp_reference-3] Гердин А.К. (2010). «Программа генетики мышей Сэнгера: высокопроизводительная характеристика нокаутных мышей». Акта офтальмологическая . 88 (С248). дои : 10.1111/j.1755-3768.2010.4142.x . S2CID 85911512 .

[4] Мореско, Ева Мари Ю.; Брандл, Катерина (январь 2013 г.). «Связь мембранного транспорта и кишечного гомеостаза» . Тканевые барьеры . 1 (1): e23119. дои : 10.4161/тисб.23119 . ПМЦ 3875636 . ПМИД 24665373 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]