✖


Jump to content

Внутренний цикл

Edit links

Внутренние петли (также называемые внутренними петлями) в РНК обнаруживаются там, где двухцепочечная РНК разделяется из-за отсутствия спаривания оснований Уотсона-Крика-Франклина между нуклеотидами . Внутренние петли отличаются от стеблевых петель тем, что они расположены в середине участка двухцепочечной РНК. Неканонические остатки приводят к искажению двойной спирали из-за раскручивания, расслоения и перекручивания.

Внутренние петли можно классифицировать как симметричные или асимметричные, с некоторыми асимметричными внутренними петлями, также известными как выпуклости. Многие важные структурные мотивы состоят из внутренних петель, таких как С-образная петля, [1] стыковочное колено, [2] кинк-повороты (к-поворот), [3] [4] прямой угол, [5] петли сарцина/рицина (также называемые мотивами выпуклого G), [6] [7] [8] мотив скручивания [9] и мотив внутренней петли UAA/GAN. [10]

См. также

[ редактировать ]

Ссылки

[ редактировать ]
  1. ^ Лескут, А; Леонтис, НБ; Массир, К; Вестхоф, Э (2005). «Рекуррентные структурные мотивы РНК, матрицы изостеричности и выравнивание последовательностей» . Исследования нуклеиновых кислот . 33 (8): 2395–409. дои : 10.1093/nar/gki535 . ПМЦ   1087784 . ПМИД   15860776 .
  2. ^ Леманн, Дж; Жоссине, Ф; Готре, Д. (1 мая 2013 г.). «Универсальный структурный мотив РНК, соединяющий локоть тРНК с рибосомой, лидерами РНКазы P и Т-бокса» . Исследования нуклеиновых кислот . 41 (10): 5494–502. дои : 10.1093/нар/gkt219 . ПМЦ   3664808 . ПМИД   23580544 .
  3. ^ Кляйн, диджей (2001). «Излом-поворот: новый мотив вторичной структуры РНК» . Журнал ЭМБО . 20 (15): 4214–4221. дои : 10.1093/emboj/20.15.4214 . ISSN   1460-2075 . ПМК   149158 . ПМИД   11483524 .
  4. ^ Шредер, КТ; Макфи, ЮАР; Уэлле, Дж; Лилли, DM (август 2010 г.). «Структурная база данных мотивов k-поворота в РНК» . РНК . 16 (8): 1463–8. дои : 10.1261/rna.2207910 . ПМК   2905746 . ПМИД   20562215 .
  5. ^ Грабов, WW; Чжуан, З; Суонк, З.Н.; Ши, Дж. Э.; Джагер, Л. (23 ноября 2012 г.). «Мотив под прямым углом (RA): преобладающий структурный образец рибосомальной РНК, обнаруженный в интронах группы I» . Журнал молекулярной биологии . 424 (1–2): 54–67. дои : 10.1016/j.jmb.2012.09.012 . ПМЦ   3488136 . ПМИД   22999957 .
  6. ^ Jump up to: а б с Шевчак, А.А.; Мур, П.Б. (17 марта 1995 г.). «Петля сарцин/рицин, модульная РНК» . Журнал молекулярной биологии . 247 (1): 81–98. дои : 10.1006/jmbi.1994.0124 . ПМИД   7897662 .
  7. ^ Леонтис, НБ; Вестхоф, Э. (30 октября 1998 г.). «Общий мотив организует структуру многоспиральных петель в 16 S и 23 S рибосомальных РНК». Журнал молекулярной биологии . 283 (3): 571–83. дои : 10.1006/jmbi.1998.2106 . ПМИД   9784367 .
  8. ^ Мур П.Б. (1999). «Структурные мотивы в РНК». Анну. Преподобный Биохим . 68 : 287–300. doi : 10.1146/annurev.biochem.68.1.287 . ПМИД   10872451 .
  9. ^ Jump up to: а б Чжун, К; Чжан, С. (февраль 2012 г.). «Кластеризация структурных мотивов РНК в рибосомальных РНК с использованием вторичного структурного выравнивания» . Исследования нуклеиновых кислот . 40 (3): 1307–17. дои : 10.1093/nar/gkr804 . ПМК   3273805 . ПМИД   21976732 .
  10. ^ Jump up to: а б Ли, Джей Си; Гутелл, Р.Р.; Рассел, Р. (28 июля 2006 г.). «Мотив внутренней петли UAA/GAN: новый структурный элемент РНК, который образует межцепочечный стек AAA и третичные взаимодействия дальнего действия». Журнал молекулярной биологии . 360 (5): 978–88. дои : 10.1016/j.jmb.2006.05.066 . ПМИД   16828489 .
Retrieved from "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Internal_loop&oldid=1192510778"
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 576f06f0b49bb98f36de25f1cf57be79__1703867880
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/57/79/576f06f0b49bb98f36de25f1cf57be79.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Internal loop - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)