Рой Р. Паркер
Рой Паркер | |
---|---|
Рожденный | Рой Р. Паркер |
Заголовок | Член Национальной академии наук |
Альма-матер | Университет Карнеги-Меллона (бакалавр) Калифорнийский университет, Сан-Франциско (доктор философии) |
Известный | Заслуженный профессор химии и биохимии Чех-Лейнванд пожертвовал кафедру биохимии в Университете Колорадо в Боулдере |
Научная карьера | |
Поля | Биохимия Химия |
Учреждения | Университет Аризоны Университет Колорадо в Боулдере Калифорнийский университет, Сан-Франциско Калифорнийский университет, Сан-Диего Медицинская школа Массачусетского университета Медицинский институт Говарда Хьюза Национальная академия наук |
Веб-сайт | www |
Внешние видео | |
---|---|
Рой Паркер, «Улучшение последипломной подготовки» , iBiology | |
Рой Паркер, «Жизнь эукариотической мРНК: локализация, трансляция и деградация» , iBiology |
Рой Р. Паркер — биохимик , который активно занимается наукой с 1970-х годов. В настоящее время он является заслуженным профессором химии и биохимии и заведующим кафедрой биохимии, финансируемым Чехом-Лейнвандом, в Университете Колорадо в Боулдере . На протяжении всей своей жизни Паркер внес огромный вклад в исследования и исследования биохимии. В настоящее время его интересы включают биогенез , функцию и деградацию множества форм РНК у эукариот . Паркер намерен использовать свои исследования, чтобы понять, как различные заболевания и патологии возникают в результате нарушений в РНК. [ 1 ] В 2012 году Паркер был избран членом Национальной академии наук по биохимии. [ 2 ]
Образование
[ редактировать ]Чтобы начать свою карьеру, Паркер поступил в Университет Карнеги-Меллона в Питтсбурге , штат Пенсильвания , где получил степень бакалавра наук по химии. После окончания Карнеги-Меллона в 1979 году он продолжил работу над докторской диссертацией по генетике у Кристины Гатри в Калифорнийском университете в Сан-Франциско , штат Калифорния в 1985 году . , Калифорнии, Сан-Франциско, и Калифорнийского университета в Сан-Диего . [ 3 ] Позже Паркер был научным сотрудником Аллана Джейкобсона в Медицинской школе Массачусетского университета в Вустере , Массачусетс , с 1988 по 1989 год. [ 4 ]
Карьера
[ редактировать ]Паркер открыл свою лабораторию в Университете Аризоны в 1989 году и был профессором молекулярной и клеточной биологии до 2012 года, когда он перешел на должность профессора в Университете Колорадо в Боулдере . [ 4 ] В настоящее время он является заведующим кафедрой биохимии, финансируемым Чехом-Лейнвандом, а также профессором курсов химии и биохимии. Паркер — исследователь Медицинского института Говарда Хьюза (с 1994 г.). [ 1 ]
Научные интересы
[ редактировать ]Основные направления исследований Паркера включают анализ эукариотической РНК и влияние дефектных типов РНК на биохимические механизмы организма. [ 1 ] Говоря более технически, его лаборатория занимается регуляцией молекул РНК, тем, как это влияет на нормальную физиологию эукариотических клеток и как аберрантная регуляция РНК способствует болезням человека. Его лаборатория использует клетки дрожжей и млекопитающих для изучения хвостов и деталей олиго(U) и олиго(А), тау-белка в биологии РНК и шаперонов РНК.
Ключевые выводы
[ редактировать ]Важные открытия исследований впервые начались, когда Паркер и его лабораторная группа установили основные пути обмена мРНК эукариот . Эти пути потенциально могут вызывать деградацию и декапирование мРНК . Затем лабораторная группа определила основные нуклеазы , которые способствуют деградации мРНК, а также молекулы, которые помогают облегчить это событие. Некоторые из этих посредников включают декапирующие ферменты , комплексы распада 3'-5' и деаденилазы. В последующие годы Паркер и его коллеги собрали достаточно данных, чтобы сделать вывод, что некоторые белки декапирования и распада являются репрессорами трансляции. Другими словами, Паркер определил, что декапирование и трансляцию можно рассматривать как соперников, поскольку их механизмы противостоят друг другу. Наконец, совсем недавно лабораторная группа обнаружила несколько цитоплазматических гранул мРНП, в первую очередь P-тельца . [ 2 ]
Основные вклады
[ редактировать ]Помимо публикации сотен исследовательских статей в научных журналах , Паркер поддерживает образование студентов по всей стране. Некоторые из его выступлений опубликованы в Интернете. Они сосредоточены на таких темах, как улучшение подготовки выпускников и «Жизнь эукариотической мРНК: локализация, трансляция и деградация». Эти видеолекции публикуются в Интернете для обучения студентов и других ученых. [ 4 ]
Публикации
[ редактировать ]За время своего образования и карьеры Паркер опубликовал 165 оригинальных статей, 77 глав и обзоров. Некоторые из его наиболее цитируемых публикаций и открытий включают следующее: [ 3 ]
«Функция гена PEP4 необходима для экспрессии нескольких вакуолярных гидролаз в Saccharomyces Cerevisiae» (1982) Первая оригинальная публикация Паркера была в 1982 году, где он работал с двумя другими учеными, Зубенко и Джонсом, над исследованием роли гена PEP4 на дрожжах S. cerevisiae . [ 5 ]
Путь обмена как стабильных, так и нестабильных мРНК в дрожжах: доказательства необходимости деаденилирования» (1993). Целью этого исследования было проследить пути, участвующие в обмене мРНК в дрожжах. Для этого Паркер и Декер провели эксперименты на четырех генах, анализируя деградацию возникающих транскриптов. Они обнаружили связь между скоростью деаденилирования мРНК и стабильностью олиго(А) с периодом полураспада мРНК. Более конкретно, они изучили влияние вторичных структур РНК и поняли, что после деаденилирования те, у кого нет 5'-последовательности, начали агрегировать. Оценив эти результаты, они пришли к выводу, что деаденилирование способствует изменениям мРНК, создавая путь распада мРНК. [ 6 ]
«Деградация мРНК у эукариот» (1995). В этом исследовании Паркер и Билман исследовали различные пути деградации до нескольких подтипов мРНК. Они предлагают доказательства того, что существует связь между скоростью распада и путями обмена мРНК. Сделав выводы на основе многочисленных наблюдений и исследований в этом исследовании, Паркер и Билман надеялись точно определить генетические продукты, которые контролируют нуклеолитические события и способствуют путям деградации. [ 7 ]
«Обмен мРНК в дрожжах, которому способствует элемент нестабильности MATalpha1» (1996) В 1996 году Паркер и Капонигро проанализировали скорость распада мРНК в дрожжах, удалив компонент элемента нестабильности MATalpha1 и наблюдая за эффектами. [ 8 ]
«Распознавание мРНК дрожжей как «содержащих нонсенс» приводит как к ингибированию трансляции мРНК, так и к деградации мРНК: последствия для контроля декэппинга мРНК» (1999). В этой статье исследовались промоторы для декэппинга и то, как промоторы препятствуют трансляции и разрушению мРНК. [ 9 ]
«Декепирование и распад информационной РНК происходят в цитоплазматических процессинговых телах» (2003). В 2003 году Паркер и Шет в этой публикации сосредоточились на деаденилировании, декепировании и экзонуклеолитическом распаде. Они изучили модели дрожжей и предложили модель, согласно которой Р-тельца являются местами деградации в клетке и содержат промежуточные продукты деградации мРНК. Обладая этой информацией, они пришли к выводу, что мРНК перемещаются между полисомами и Р-тельцами, и это критический аспект метаболизма мРНК в цитоплазме. [ 10 ]
«Цитоплазматическая деградация пре-мРНК и промежуточных РНК с дефектом сплайсинга» (2003). В этой публикации Хиллерен и Паркер обнаружили, что накопление определенных промежуточных продуктов в Dbr1p-зависимом пути указывает на то, что тот же путь регулирует сплайсинг пре-мРНК . [ 11 ]
«Общая репрессия трансляции с помощью активаторов декапирования мРНК» (2005) Коллер и Паркер в этом исследовании выделили активаторы механизмов декапирования. Эти активаторы декапирования ингибируют трансляцию и стимулируют образование P-телец. Используя методы окрашивания для идентификации активности активаторов декэппинга, они успешно пришли к выводу, что существует механизм, который сигнализирует мРНК о декэппинге и, следовательно, ограничивает прохождение мРНК через трансляцию. [ 12 ]
«Движение эукариотических мРНК между полисомами и цитоплазматическими процессинговыми телами» (2005). В этой статье Паркер и двое других ученых, Бренгес и Тейшейра, продемонстрировали, что мРНК мигрируют между полисомами и цитоплазматическими процессинговыми телами как форма упаковки мРНК. [ 13 ]
«Эндонуклеолитическое расщепление мРНК эукариот с остановкой при элонгации трансляции» (2006) Дома и Паркер определили процесс безостановочного распада , посредством которого специальные белки способны различать остановленную трансляцию мРНК, а затем инициировать процесс эндонуклеолитического расщепления. [ 14 ]
«P-тела и контроль трансляции и деградации мРНК» (2007). Эта публикация посвящена эукариотам и образованию P-тельц из-за агрегаций мРНК, которые не подверглись трансляции. P-тельца связаны с материнскими и нейрональными гранулами мРНК. Эта связь привела к раскрытию взаимосвязи между полисомами и мРНК внутри Р-телец в отношении цитоплазматической активности мРНК. Главный вывод Паркера и Шета из этой публикации заключается в том, что трансляция ингибируется и распад усиливается, когда специфичные для мРНК регуляторные факторы, такие как микроРНК и RISC, взаимодействуют с P-тельцами. [ 15 ]
«Эукариотические стрессовые гранулы: все тонкости трансляции» (2009 г.) В центре внимания данной публикации – образование стрессовых гранул в результате реакции организма на стресс , которая препятствует осуществлению трансляции. Паркер и Бьюкен исследовали, что стрессовые гранулы вызывают множество проблем с формами РНК, особенно мРНК, делая их менее стабильными и препятствуя их трансляции. Они смогли прийти к выводу, что стрессовые гранулы могут взаимодействовать с Р-тельцами, оказывая еще более вредное воздействие на функцию мРНК. [ 16 ]
«Развитие навыков в последипломном образовании» (2012 г.) В этой уникальной статье не обсуждаются биохимические процессы, а скорее исследуется влияние надлежащего образования в области биохимии. Паркер демонстрирует повышенный процент отсева среди студентов, получающих ученую степень, и анализирует необходимые шаги и навыки, приобретенные студентом для достижения успеха. [ 17 ]
«Анализ двухцепочечной РНК из микробных сообществ идентифицирует двухцепочечные РНК вирусоподобные элементы» (2014) Декер и Паркер предположили на основе этой публикации, что исследование двухцепочечных РНК потенциально может привести к множеству открытий о генетике вирусов и вирусов. другие микробы . [ 18 ]
«Связь между соседними парами кодонов и стабильностью мРНК» (2017). В 2017 году Харигая и Паркер обнаружили связь между стабильностью мРНК и парами кодонов, которые подавляют определенные функции кодон-опосредованной регуляции генов. [ 19 ]
«По всему транскриптому сравнение стрессовых гранул и P-телец показывает, что трансляция играет важную роль в разделении РНК» (2019) Матени, Рао и Паркер совместно определили, что трансляция является чрезвычайно важным процессом в формировании P-тельц и стрессовых гранул. , который часто подавляется во время стресса. [ 20 ]
Почести и награды
[ редактировать ]Паркер получил множество наград и наград, в том числе следующие: [ 3 ]
- 2018 г., заслуженный профессор, Университет Колорадо в Боулдере. [ 21 ]
- 2018, Лекции Ады Дойзи по биохимии, Университет Иллинойса в Урбане [ 22 ]
- 2018 г., основной докладчик, конференция Ionis/Nature по биологии РНК в Ла-Хойе, Калифорния. [ 23 ]
- 2018, серия лекций для почетных гостей, Институт биохимии Макса Планка, Германия [ 24 ]
- 2018 г., основной докладчик, симпозиум Центра биомедицины РНК, Мичиганский университет. [ 25 ]
- 2018 г., основной докладчик, 3-й Международный симпозиум по мозговому штурму, Университет Флориды. [ 3 ]
- 2017 г., основной докладчик, симпозиум SFB, Регенсбург. [ 3 ]
- 2017 г., основной докладчик, 2-й Международный симпозиум по стрессовым гранулам, Гейдельберг. [ 3 ]
- 2017 г., основной докладчик, Город надежды, Дуарте, Калифорния. [ 3 ]
- 2017, основной докладчик, конференция EMBO, Барга, Италия. [ 26 ]
- 2012 г., член Национальной академии наук. [ 3 ]
- 2012 г., основной докладчик, FASEB. [ 3 ]
- 2011 г., основной докладчик, EMBL. [ 3 ]
- 2010 г., научный сотрудник Американской академии искусств и наук. [ 3 ]
- 2010 г., президент Общества РНК. [ 3 ]
- 2006 г., основной докладчик, совещание по контролю перевода, Cold Spring Harbor Labs. [ 3 ]
- 2005 г., основной докладчик, совещание по переводу и контролю, Гейдельберг, Германия. [ 3 ]
- 2005 г., основной докладчик, семинар EMBO, Швейцария. [ 3 ]
- 2005, Метод продления исследований во времени (MERIT) , Национальные институты здравоохранения. [ 3 ]
- 2003 г., научный сотрудник Галилео, Университет Аризоны. [ 27 ]
- 2003 г., профессор Риджентс, Университет Аризоны. [ 3 ]
- 2002 г., основной докладчик на конференции FASEB по посттранскрипционной регуляции. [ 3 ]
- 2000 г., основной докладчик, Мичиганская конференция RNA. [ 3 ]
- 1994 г., следователь, Медицинский институт Говарда Хьюза. [ 3 ]
- 1990, ученый, Searle Scholars. [ 28 ]
- 1979, Регентская стипендия, Калифорнийский университет в Сан-Франциско. [ 3 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с «Рой Паркер, доктор философии». Наши учёные . Медицинский институт Говарда Хьюза. Проверено 5 марта 2020 г. https://www.hhmi.org/scientists/roy-parker .
- ^ Jump up to: а б «Рой Паркер». Справочник участников . Национальная академия наук. Проверено 4 марта 2020 г. http://www.nasonline.org/member-directory/members/20027268.html.
- ^ Jump up to: а б с д и ж г час я дж к л м н тот п д р с т в «Паркер, Рой». Эксперты ТС . Университет Колорадо в Боулдере. Проверено 6 марта 2020 г. https://experts.colorado.edu/display/fisid_151440 .
- ^ Jump up to: а б с «Рой Паркер». Спикеры . iБиология. Проверено 5 марта 2020 г. https://www.ibiology.org/speakers/roy-parker/.
- ^ Джонс, Элизабет В.; Зубенко Георгий С.; Паркер, Рой Р. (декабрь 1982 г.). «Функция гена PEP4 необходима для экспрессии нескольких вакуолярных гидролаз в Saccharomyces cerevisiae». Генетика . 102 (4): 665–677.
- ^ Декер, Кэролайн Дж.; Паркер, Рой (12 апреля 1993 г.). «Путь обмена как стабильных, так и нестабильных мРНК в дрожжах: доказательства необходимости деаденилирования». Гены и развитие . 7 : 1632–1643. дои : 10.1101/gad.7.8.1632
- ^ Билман, Клэр А.; Паркер, Рой (21 апреля 1995 г.). «Деградация мРНК у эукариот». Клетка . 81 (2): 179–183. дои : 10.1016/0092-8674(95)90326-7
- ^ Капонигро, Джордано; Паркер, Рой (1 ноября 1996 г.). «Обмен мРНК в дрожжах, которому способствует элемент нестабильности MATalpha1». Исследования нуклеиновых кислот . 24 (21): 4304-4312. дои : 10.1093/нар/24.21.4304
- ^ Мулрад, Дениз; Паркер, Рой (ноябрь 1999 г.). «Признание мРНК дрожжей как «содержащих нонсенс» приводит как к ингибированию трансляции мРНК, так и к деградации мРНК: значение для контроля декаппирования мРНК». Молекулярная биология клетки . 10 (11): 3971-3978. дои : 10.1091/mbc.10.11.3971
- ^ Шет, Уджвал; Паркер, Рой (2 мая 2003 г.). «Декепирование и распад информационной РНК происходят в цитоплазматических процессинговых телах». Наука . 300 (5620): 805-808. дои : 10.1126/science.1082320
- ^ Хиллерен, Патрисия Дж.; Паркер, Рой (1 декабря 2003 г.). «Цитоплазматическая деградация дефектных по сплайсингу пре-мРНК и промежуточных продуктов». Молекулярная клетка . 12 (6): 1453–1465. дои : 10.1016/S1097-2765(03)00488-X
- ^ Коллер, Джефф; Паркер, Рой (23 сентября 2005 г.). «Общая репрессия трансляции активаторами декапирования мРНК». Клетка . 122 (6): 875–886. дои : 10.1016/j.cell.2005.07.012
- ^ Бренге, Мюриэль; Тейшейра, Даниэла; Паркер, Рой (21 октября 2005 г.). «Перемещение эукариотических мРНК между полисомами и цитоплазматическими процессинговыми телами». Наука . 310 (5747): 486-489. дои : 10.1126/science.1115791
- ^ Дома, Минакши К.; Паркер, Рой (23 марта 2006 г.). «Эндонуклеолитическое расщепление эукариотических мРНК с остановкой элонгации трансляции». Природа . 440 (7083): 561–564. дои : 10.1038/nature04530
- ^ Паркер, Рой; Шет, Уджвал (9 марта 2007 г.). «P-тела и контроль трансляции и деградации мРНК». Молекулярная клетка . 25 (5): 635–646. doi :10.1016/j.molcel.2007.02.011
- ^ Бьюкен, Росс Дж.; Паркер, Рой (24 декабря 2009 г.). «Эукариотические стрессовые гранулы: все тонкости трансляции». Молекулярная клетка . 36 (6): 932–941. doi :10.1016/j.molcel.2009.11.020
- ↑ Паркер, Рой (25 мая 2012 г.). «Повышение квалификации в последипломном образовании». Молекулярная клетка . 46 (4): 377–381. doi :10.1016/j.molcel.2012.05.003
- ^ Декер, Кэролайн Дж.; Паркер, Рой (8 мая 2014 г.). «Анализ двухцепочечной РНК из микробных сообществ идентифицирует вирусоподобные элементы двухцепочечной РНК». Отчеты по ячейкам . 7 (3): 898-906. дои : 10.1016/j.celrep.2014.03.049
- ^ Харигая, Юрико; Паркер, Рой (10 мая 2017 г.). «Связь между соседними парами кодонов и стабильностью мРНК». БМК Геномика . 18 (364): 704. doi :10.1186/s12864-017-3749-8
- ^ Мэтени, Тайлер; Рао, Бхалчандра С.; Паркер, Рой (25 ноября 2019 г.). «По всему транскриптому сравнение стрессовых гранул и P-тел показывает, что трансляция играет важную роль в разделении РНК». Молекулярно-клеточная биология . 39 (24): 313–319. дои : 10.1128/MCB.00313-19
- ^ «6 преподавателей CU Boulder стали заслуженными профессорами». CU Боулдер сегодня . Университет Колорадо в Боулдере. Проверено 10 апреля 2020 г. https://www.colorado.edu/today/2018/09/14/6-cu-boulder-faculty-members-become-distinguished-professors.
- ^ «Лекции Ады Дойзи по биохимии». Кафедра биохимии. Университет Иллинойса в Урбана-Шампейн. Проверено 10 апреля 2020 г. https://mcb.illinois.edu/departments/biochemistry/doisy .
- ^ «РНК на скамейке и у кровати». Инвесторы и СМИ . Ионис Фармасьютикалс. Проверено 10 апреля 2020 г. https://ir.ionispharma.com/events/event-details/ionis-pharmaceuticals-nature-structural-molecular-biology-nature-biotechnology.
- ^ «Семинары и симпозиумы». Институт биохимии Макса Планка . Макс-Планк-Гезельшафт. Проверено 10 апреля 2020 г. https://www.biochem.mpg.de/en/seminars .
- ^ «30 марта 2018 г., 3-й ежегодный симпозиум Центра биомедицины РНК UM». Центр биомедицины РНК . Мичиганский университет. Проверено 10 апреля 2020 г. https://rna.umich.edu/2018-symposium/.
- ^ «Локализация РНК и локальная трансляция». Спикеры . Конференция ЭМБО. Проверено 10 апреля 2020 г. https://meetings.embo.org/event/17-rna-localisation .
- ^ «Научный колледж ЮА выбирает первых стипендиатов кружка Галилео». Новости ЮА. Университет Аризоны. Проверено 10 апреля 2020 г. https://uanews.arizona.edu/story/ua-college-science-chooses-first-galileo-circle-fellows.
- ^ «Рой Р. Паркер». Лауреаты. Программа стипендий Сирла. Проверено 10 апреля 2020 г. https://www.searlescholars.net/people/roy-r-parker.