Jump to content

Рой Р. Паркер

Рой Паркер
Рожденный
Рой Р. Паркер
Заголовок Член Национальной академии наук
Альма-матер Университет Карнеги-Меллона (бакалавр)
Калифорнийский университет, Сан-Франциско (доктор философии)
Известный Заслуженный профессор химии и биохимии
Чех-Лейнванд пожертвовал кафедру биохимии в Университете Колорадо в Боулдере
Научная карьера
Поля Биохимия
Химия
Учреждения Университет Аризоны
Университет Колорадо в Боулдере
Калифорнийский университет, Сан-Франциско
Калифорнийский университет, Сан-Диего
Медицинская школа Массачусетского университета
Медицинский институт Говарда Хьюза
Национальная академия наук
Веб-сайт www .Колорадо .edu /лаборатория /паркергрупп /
Внешние видео
значок видео Рой Паркер, «Улучшение последипломной подготовки» , iBiology
значок видео Рой Паркер, «Жизнь эукариотической мРНК: локализация, трансляция и деградация» , iBiology

Рой Р. Паркер биохимик , который активно занимается наукой с 1970-х годов. В настоящее время он является заслуженным профессором химии и биохимии и заведующим кафедрой биохимии, финансируемым Чехом-Лейнвандом, в Университете Колорадо в Боулдере . На протяжении всей своей жизни Паркер внес огромный вклад в исследования и исследования биохимии. В настоящее время его интересы включают биогенез , функцию и деградацию множества форм РНК у эукариот . Паркер намерен использовать свои исследования, чтобы понять, как различные заболевания и патологии возникают в результате нарушений в РНК. [ 1 ] В 2012 году Паркер был избран членом Национальной академии наук по биохимии. [ 2 ]

Образование

[ редактировать ]

Чтобы начать свою карьеру, Паркер поступил в Университет Карнеги-Меллона в Питтсбурге , штат Пенсильвания , где получил степень бакалавра наук по химии. После окончания Карнеги-Меллона в 1979 году он продолжил работу над докторской диссертацией по генетике у Кристины Гатри в Калифорнийском университете в Сан-Франциско , штат Калифорния в 1985 году . , Калифорнии, Сан-Франциско, и Калифорнийского университета в Сан-Диего . [ 3 ] Позже Паркер был научным сотрудником Аллана Джейкобсона в Медицинской школе Массачусетского университета в Вустере , Массачусетс , с 1988 по 1989 год. [ 4 ]

Паркер открыл свою лабораторию в Университете Аризоны в 1989 году и был профессором молекулярной и клеточной биологии до 2012 года, когда он перешел на должность профессора в Университете Колорадо в Боулдере . [ 4 ] В настоящее время он является заведующим кафедрой биохимии, финансируемым Чехом-Лейнвандом, а также профессором курсов химии и биохимии. Паркер — исследователь Медицинского института Говарда Хьюза (с 1994 г.). [ 1 ]

Научные интересы

[ редактировать ]

Основные направления исследований Паркера включают анализ эукариотической РНК и влияние дефектных типов РНК на биохимические механизмы организма. [ 1 ] Говоря более технически, его лаборатория занимается регуляцией молекул РНК, тем, как это влияет на нормальную физиологию эукариотических клеток и как аберрантная регуляция РНК способствует болезням человека. Его лаборатория использует клетки дрожжей и млекопитающих для изучения хвостов и деталей олиго(U) и олиго(А), тау-белка в биологии РНК и шаперонов РНК.

Ключевые выводы

[ редактировать ]

Важные открытия исследований впервые начались, когда Паркер и его лабораторная группа установили основные пути обмена мРНК эукариот . Эти пути потенциально могут вызывать деградацию и декапирование мРНК . Затем лабораторная группа определила основные нуклеазы , которые способствуют деградации мРНК, а также молекулы, которые помогают облегчить это событие. Некоторые из этих посредников включают декапирующие ферменты , комплексы распада 3'-5' и деаденилазы. В последующие годы Паркер и его коллеги собрали достаточно данных, чтобы сделать вывод, что некоторые белки декапирования и распада являются репрессорами трансляции. Другими словами, Паркер определил, что декапирование и трансляцию можно рассматривать как соперников, поскольку их механизмы противостоят друг другу. Наконец, совсем недавно лабораторная группа обнаружила несколько цитоплазматических гранул мРНП, в первую очередь P-тельца . [ 2 ]

Основные вклады

[ редактировать ]

Помимо публикации сотен исследовательских статей в научных журналах , Паркер поддерживает образование студентов по всей стране. Некоторые из его выступлений опубликованы в Интернете. Они сосредоточены на таких темах, как улучшение подготовки выпускников и «Жизнь эукариотической мРНК: локализация, трансляция и деградация». Эти видеолекции публикуются в Интернете для обучения студентов и других ученых. [ 4 ]

Публикации

[ редактировать ]

За время своего образования и карьеры Паркер опубликовал 165 оригинальных статей, 77 глав и обзоров. Некоторые из его наиболее цитируемых публикаций и открытий включают следующее: [ 3 ]

«Функция гена PEP4 необходима для экспрессии нескольких вакуолярных гидролаз в Saccharomyces Cerevisiae» (1982) Первая оригинальная публикация Паркера была в 1982 году, где он работал с двумя другими учеными, Зубенко и Джонсом, над исследованием роли гена PEP4 на дрожжах S. cerevisiae . [ 5 ]

Путь обмена как стабильных, так и нестабильных мРНК в дрожжах: доказательства необходимости деаденилирования» (1993). Целью этого исследования было проследить пути, участвующие в обмене мРНК в дрожжах. Для этого Паркер и Декер провели эксперименты на четырех генах, анализируя деградацию возникающих транскриптов. Они обнаружили связь между скоростью деаденилирования мРНК и стабильностью олиго(А) с периодом полураспада мРНК. Более конкретно, они изучили влияние вторичных структур РНК и поняли, что после деаденилирования те, у кого нет 5'-последовательности, начали агрегировать. Оценив эти результаты, они пришли к выводу, что деаденилирование способствует изменениям мРНК, создавая путь распада мРНК. [ 6 ]

«Деградация мРНК у эукариот» (1995). В этом исследовании Паркер и Билман исследовали различные пути деградации до нескольких подтипов мРНК. Они предлагают доказательства того, что существует связь между скоростью распада и путями обмена мРНК. Сделав выводы на основе многочисленных наблюдений и исследований в этом исследовании, Паркер и Билман надеялись точно определить генетические продукты, которые контролируют нуклеолитические события и способствуют путям деградации. [ 7 ]

«Обмен мРНК в дрожжах, которому способствует элемент нестабильности MATalpha1» (1996) В 1996 году Паркер и Капонигро проанализировали скорость распада мРНК в дрожжах, удалив компонент элемента нестабильности MATalpha1 и наблюдая за эффектами. [ 8 ]

«Распознавание мРНК дрожжей как «содержащих нонсенс» приводит как к ингибированию трансляции мРНК, так и к деградации мРНК: последствия для контроля декэппинга мРНК» (1999). В этой статье исследовались промоторы для декэппинга и то, как промоторы препятствуют трансляции и разрушению мРНК. [ 9 ]

«Декепирование и распад информационной РНК происходят в цитоплазматических процессинговых телах» (2003). В 2003 году Паркер и Шет в этой публикации сосредоточились на деаденилировании, декепировании и экзонуклеолитическом распаде. Они изучили модели дрожжей и предложили модель, согласно которой Р-тельца являются местами деградации в клетке и содержат промежуточные продукты деградации мРНК. Обладая этой информацией, они пришли к выводу, что мРНК перемещаются между полисомами и Р-тельцами, и это критический аспект метаболизма мРНК в цитоплазме. [ 10 ]

«Цитоплазматическая деградация пре-мРНК и промежуточных РНК с дефектом сплайсинга» (2003). В этой публикации Хиллерен и Паркер обнаружили, что накопление определенных промежуточных продуктов в Dbr1p-зависимом пути указывает на то, что тот же путь регулирует сплайсинг пре-мРНК . [ 11 ]

«Общая репрессия трансляции с помощью активаторов декапирования мРНК» (2005) Коллер и Паркер в этом исследовании выделили активаторы механизмов декапирования. Эти активаторы декапирования ингибируют трансляцию и стимулируют образование P-телец. Используя методы окрашивания для идентификации активности активаторов декэппинга, они успешно пришли к выводу, что существует механизм, который сигнализирует мРНК о декэппинге и, следовательно, ограничивает прохождение мРНК через трансляцию. [ 12 ]

«Движение эукариотических мРНК между полисомами и цитоплазматическими процессинговыми телами» (2005). В этой статье Паркер и двое других ученых, Бренгес и Тейшейра, продемонстрировали, что мРНК мигрируют между полисомами и цитоплазматическими процессинговыми телами как форма упаковки мРНК. [ 13 ]

«Эндонуклеолитическое расщепление мРНК эукариот с остановкой при элонгации трансляции» (2006) Дома и Паркер определили процесс безостановочного распада , посредством которого специальные белки способны различать остановленную трансляцию мРНК, а затем инициировать процесс эндонуклеолитического расщепления. [ 14 ]

«P-тела и контроль трансляции и деградации мРНК» (2007). Эта публикация посвящена эукариотам и образованию P-тельц из-за агрегаций мРНК, которые не подверглись трансляции. P-тельца связаны с материнскими и нейрональными гранулами мРНК. Эта связь привела к раскрытию взаимосвязи между полисомами и мРНК внутри Р-телец в отношении цитоплазматической активности мРНК. Главный вывод Паркера и Шета из этой публикации заключается в том, что трансляция ингибируется и распад усиливается, когда специфичные для мРНК регуляторные факторы, такие как микроРНК и RISC, взаимодействуют с P-тельцами. [ 15 ]

«Эукариотические стрессовые гранулы: все тонкости трансляции» (2009 г.) В центре внимания данной публикации – образование стрессовых гранул в результате реакции организма на стресс , которая препятствует осуществлению трансляции. Паркер и Бьюкен исследовали, что стрессовые гранулы вызывают множество проблем с формами РНК, особенно мРНК, делая их менее стабильными и препятствуя их трансляции. Они смогли прийти к выводу, что стрессовые гранулы могут взаимодействовать с Р-тельцами, оказывая еще более вредное воздействие на функцию мРНК. [ 16 ]

«Развитие навыков в последипломном образовании» (2012 г.) В этой уникальной статье не обсуждаются биохимические процессы, а скорее исследуется влияние надлежащего образования в области биохимии. Паркер демонстрирует повышенный процент отсева среди студентов, получающих ученую степень, и анализирует необходимые шаги и навыки, приобретенные студентом для достижения успеха. [ 17 ]

«Анализ двухцепочечной РНК из микробных сообществ идентифицирует двухцепочечные РНК вирусоподобные элементы» (2014) Декер и Паркер предположили на основе этой публикации, что исследование двухцепочечных РНК потенциально может привести к множеству открытий о генетике вирусов и вирусов. другие микробы . [ 18 ]

«Связь между соседними парами кодонов и стабильностью мРНК» (2017). В 2017 году Харигая и Паркер обнаружили связь между стабильностью мРНК и парами кодонов, которые подавляют определенные функции кодон-опосредованной регуляции генов. [ 19 ]

«По всему транскриптому сравнение стрессовых гранул и P-телец показывает, что трансляция играет важную роль в разделении РНК» (2019) Матени, Рао и Паркер совместно определили, что трансляция является чрезвычайно важным процессом в формировании P-тельц и стрессовых гранул. , который часто подавляется во время стресса. [ 20 ]

Почести и награды

[ редактировать ]

Паркер получил множество наград и наград, в том числе следующие: [ 3 ]

  • 2018 г., заслуженный профессор, Университет Колорадо в Боулдере. [ 21 ]
  • 2018, Лекции Ады Дойзи по биохимии, Университет Иллинойса в Урбане [ 22 ]
  • 2018 г., основной докладчик, конференция Ionis/Nature по биологии РНК в Ла-Хойе, Калифорния. [ 23 ]
  • 2018, серия лекций для почетных гостей, Институт биохимии Макса Планка, Германия [ 24 ]
  • 2018 г., основной докладчик, симпозиум Центра биомедицины РНК, Мичиганский университет. [ 25 ]
  • 2018 г., основной докладчик, 3-й Международный симпозиум по мозговому штурму, Университет Флориды. [ 3 ]
  • 2017 г., основной докладчик, симпозиум SFB, Регенсбург. [ 3 ]
  • 2017 г., основной докладчик, 2-й Международный симпозиум по стрессовым гранулам, Гейдельберг. [ 3 ]
  • 2017 г., основной докладчик, Город надежды, Дуарте, Калифорния. [ 3 ]
  • 2017, основной докладчик, конференция EMBO, Барга, Италия. [ 26 ]
  • 2012 г., член Национальной академии наук. [ 3 ]
  • 2012 г., основной докладчик, FASEB. [ 3 ]
  • 2011 г., основной докладчик, EMBL. [ 3 ]
  • 2010 г., научный сотрудник Американской академии искусств и наук. [ 3 ]
  • 2010 г., президент Общества РНК. [ 3 ]
  • 2006 г., основной докладчик, совещание по контролю перевода, Cold Spring Harbor Labs. [ 3 ]
  • 2005 г., основной докладчик, совещание по переводу и контролю, Гейдельберг, Германия. [ 3 ]
  • 2005 г., основной докладчик, семинар EMBO, Швейцария. [ 3 ]
  • 2005, Метод продления исследований во времени (MERIT) , Национальные институты здравоохранения. [ 3 ]
  • 2003 г., научный сотрудник Галилео, Университет Аризоны. [ 27 ]
  • 2003 г., профессор Риджентс, Университет Аризоны. [ 3 ]
  • 2002 г., основной докладчик на конференции FASEB по посттранскрипционной регуляции. [ 3 ]
  • 2000 г., основной докладчик, Мичиганская конференция RNA. [ 3 ]
  • 1994 г., следователь, Медицинский институт Говарда Хьюза. [ 3 ]
  • 1990, ученый, Searle Scholars. [ 28 ]
  • 1979, Регентская стипендия, Калифорнийский университет в Сан-Франциско. [ 3 ]
  1. ^ Jump up to: а б с «Рой Паркер, доктор философии». Наши учёные . Медицинский институт Говарда Хьюза. Проверено 5 марта 2020 г. https://www.hhmi.org/scientists/roy-parker .
  2. ^ Jump up to: а б «Рой Паркер». Справочник участников . Национальная академия наук. Проверено 4 марта 2020 г. http://www.nasonline.org/member-directory/members/20027268.html.
  3. ^ Jump up to: а б с д и ж г час я дж к л м н тот п д р с т в «Паркер, Рой». Эксперты ТС . Университет Колорадо в Боулдере. Проверено 6 марта 2020 г. https://experts.colorado.edu/display/fisid_151440 .
  4. ^ Jump up to: а б с «Рой Паркер». Спикеры . iБиология. Проверено 5 марта 2020 г. https://www.ibiology.org/speakers/roy-parker/.
  5. ^ Джонс, Элизабет В.; Зубенко Георгий С.; Паркер, Рой Р. (декабрь 1982 г.). «Функция гена PEP4 необходима для экспрессии нескольких вакуолярных гидролаз в Saccharomyces cerevisiae». Генетика . 102 (4): 665–677.
  6. ^ Декер, Кэролайн Дж.; Паркер, Рой (12 апреля 1993 г.). «Путь обмена как стабильных, так и нестабильных мРНК в дрожжах: доказательства необходимости деаденилирования». Гены и развитие . 7 : 1632–1643. дои : 10.1101/gad.7.8.1632
  7. ^ Билман, Клэр А.; Паркер, Рой (21 апреля 1995 г.). «Деградация мРНК у эукариот». Клетка . 81 (2): 179–183. дои : 10.1016/0092-8674(95)90326-7
  8. ^ Капонигро, Джордано; Паркер, Рой (1 ноября 1996 г.). «Обмен мРНК в дрожжах, которому способствует элемент нестабильности MATalpha1». Исследования нуклеиновых кислот . 24 (21): 4304-4312. дои : 10.1093/нар/24.21.4304
  9. ^ Мулрад, Дениз; Паркер, Рой (ноябрь 1999 г.). «Признание мРНК дрожжей как «содержащих нонсенс» приводит как к ингибированию трансляции мРНК, так и к деградации мРНК: значение для контроля декаппирования мРНК». Молекулярная биология клетки . 10 (11): 3971-3978. дои : 10.1091/mbc.10.11.3971
  10. ^ Шет, Уджвал; Паркер, Рой (2 мая 2003 г.). «Декепирование и распад информационной РНК происходят в цитоплазматических процессинговых телах». Наука . 300 (5620): 805-808. дои : 10.1126/science.1082320
  11. ^ Хиллерен, Патрисия Дж.; Паркер, Рой (1 декабря 2003 г.). «Цитоплазматическая деградация дефектных по сплайсингу пре-мРНК и промежуточных продуктов». Молекулярная клетка . 12 (6): 1453–1465. дои : 10.1016/S1097-2765(03)00488-X
  12. ^ Коллер, Джефф; Паркер, Рой (23 сентября 2005 г.). «Общая репрессия трансляции активаторами декапирования мРНК». Клетка . 122 (6): 875–886. дои : 10.1016/j.cell.2005.07.012
  13. ^ Бренге, Мюриэль; Тейшейра, Даниэла; Паркер, Рой (21 октября 2005 г.). «Перемещение эукариотических мРНК между полисомами и цитоплазматическими процессинговыми телами». Наука . 310 (5747): 486-489. дои : 10.1126/science.1115791
  14. ^ Дома, Минакши К.; Паркер, Рой (23 марта 2006 г.). «Эндонуклеолитическое расщепление эукариотических мРНК с остановкой элонгации трансляции». Природа . 440 (7083): 561–564. дои : 10.1038/nature04530
  15. ^ Паркер, Рой; Шет, Уджвал (9 марта 2007 г.). «P-тела и контроль трансляции и деградации мРНК». Молекулярная клетка . 25 (5): 635–646. doi :10.1016/j.molcel.2007.02.011
  16. ^ Бьюкен, Росс Дж.; Паркер, Рой (24 декабря 2009 г.). «Эукариотические стрессовые гранулы: все тонкости трансляции». Молекулярная клетка . 36 (6): 932–941. doi :10.1016/j.molcel.2009.11.020
  17. Паркер, Рой (25 мая 2012 г.). «Повышение квалификации в последипломном образовании». Молекулярная клетка . 46 (4): 377–381. doi :10.1016/j.molcel.2012.05.003
  18. ^ Декер, Кэролайн Дж.; Паркер, Рой (8 мая 2014 г.). «Анализ двухцепочечной РНК из микробных сообществ идентифицирует вирусоподобные элементы двухцепочечной РНК». Отчеты по ячейкам . 7 (3): 898-906. дои : 10.1016/j.celrep.2014.03.049
  19. ^ Харигая, Юрико; Паркер, Рой (10 мая 2017 г.). «Связь между соседними парами кодонов и стабильностью мРНК». БМК Геномика . 18 (364): 704. doi :10.1186/s12864-017-3749-8
  20. ^ Мэтени, Тайлер; Рао, Бхалчандра С.; Паркер, Рой (25 ноября 2019 г.). «По всему транскриптому сравнение стрессовых гранул и P-тел показывает, что трансляция играет важную роль в разделении РНК». Молекулярно-клеточная биология . 39 (24): 313–319. дои : 10.1128/MCB.00313-19
  21. ^ «6 преподавателей CU Boulder стали заслуженными профессорами». CU Боулдер сегодня . Университет Колорадо в Боулдере. Проверено 10 апреля 2020 г. https://www.colorado.edu/today/2018/09/14/6-cu-boulder-faculty-members-become-distinguished-professors.
  22. ^ «Лекции Ады Дойзи по биохимии». Кафедра биохимии. Университет Иллинойса в Урбана-Шампейн. Проверено 10 апреля 2020 г. https://mcb.illinois.edu/departments/biochemistry/doisy .
  23. ^ «РНК на скамейке и у кровати». Инвесторы и СМИ . Ионис Фармасьютикалс. Проверено 10 апреля 2020 г. https://ir.ionispharma.com/events/event-details/ionis-pharmaceuticals-nature-structural-molecular-biology-nature-biotechnology.
  24. ^ «Семинары и симпозиумы». Институт биохимии Макса Планка . Макс-Планк-Гезельшафт. Проверено 10 апреля 2020 г. https://www.biochem.mpg.de/en/seminars .
  25. ^ «30 марта 2018 г., 3-й ежегодный симпозиум Центра биомедицины РНК UM». Центр биомедицины РНК . Мичиганский университет. Проверено 10 апреля 2020 г. https://rna.umich.edu/2018-symposium/.
  26. ^ «Локализация РНК и локальная трансляция». Спикеры . Конференция ЭМБО. Проверено 10 апреля 2020 г. https://meetings.embo.org/event/17-rna-localisation .
  27. ^ «Научный колледж ЮА выбирает первых стипендиатов кружка Галилео». Новости ЮА. Университет Аризоны. Проверено 10 апреля 2020 г. https://uanews.arizona.edu/story/ua-college-science-chooses-first-galileo-circle-fellows.
  28. ^ «Рой Р. Паркер». Лауреаты. Программа стипендий Сирла. Проверено 10 апреля 2020 г. https://www.searlescholars.net/people/roy-r-parker.
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 7474039b2c9679c06edb7ca2c807cc91__1722386880
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/74/91/7474039b2c9679c06edb7ca2c807cc91.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Roy R. Parker - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)